Сухой
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( октябрь 2017 г. ) |
| Сухой | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Сухой | ||
| Пфам | PF07517 | ||
| |||
Белок SecA представляет собой клеточной мембраной ассоциированную с субъединицу бактериального Sec или типа II секреторного пути , системы, которая отвечает за секрецию белков через клеточную мембрану. SecA Внутри этой системы АТФаза образует комплекс транслоказы с каналом SecYEG , тем самым управляя перемещением белкового субстрата через мембрану. [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]SecA представляет собой сложный белок, структура которого состоит из шести охарактеризованных доменов , что может объяснить способность SecA связывать субстраты и перемещать их. Следующие пять доменов, по-видимому, присутствуют во всех белках SecA, структурно проанализированных до сих пор. [ 2 ]
МЕРТВЫЙ моторный домен
[ редактировать ]Этот аминокислотный домен подразделяется на две нуклеотидсвязывающие складки 1 и 2 (NBF1 и NBF2), где АТФ связывается и гидролизуется. Химическая энергия фосфодиэфирных связей приводит к конформационным изменениям, которые передаются другим доменам (особенно доменам HWD и PPXD ), которые, следовательно, механически перемещают пребелок через мембрану. Однако эти конформационные изменения частично регулируются другими доменами протомера, описанными ниже.
С-концевой линкерный домен
[ редактировать ]Способность связываться с SecB шапероном во время посттрансляционной транслокации, рибосомой (как во время посттрансляционной, так и котрансляционной транслокации). [ 3 ] ), а фосфолипидный бислой важен для функционирования SecA и достигается за счет С-концевого линкерного домена. [ 4 ]
Домен спирального крыла (HWD)
[ редактировать ]Расположенный в С-концевой части молекулы, этот домен контактирует с доменами HSD и PPXD. Вероятно, он играет роль в передаче молекулярного конформационного движения, которое он получает от HSD и которое возникает в результате гидролиза АТФ в моторном домене DEAD , в домен PPXD .
Пептидный домен перекрестных связей (PPXD)
[ редактировать ]Поскольку основной функцией SecA является транспортировка пребелка способность фактически связывать пребелок через мембрану, необходимо обеспечить . Домен PPXD выполняет эту функцию при связывании субстрата.
Домен спирального каркаса (HSD)
[ редактировать ]Этот домен расположен в центре протомера SecA и контактирует посредством α-спиральных взаимодействий со всеми остальными субдоменами. Кроме того, он содержит субдомен внутримолекулярного регулятора гидролиза АТФ 1 (IRA1), который, по-видимому, предотвращает нежелательный гидролиз АТФ, когда SecA не связан с SecYEG. Вместе с IRA1 консервативный солевой мостик, называемый Gate 1, может функционировать, предотвращая ненужные конформационные изменения. Ворота 1, по-видимому, функционально соединяют сайт связывания нуклеотидов ( АТФ ) моторного домена DEAD с доменом PPXD , что приводит к регуляции гидролиза АТФ только при пребелковом связывании. Однако было показано, что такое координационное поведение происходит только тогда, когда SecA связан с SecYEG. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ du Plessis DJ, Нувен Н., Дриссен AJ (март 2011 г.). «Сек транслоказа» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1808 (3): 851–65. дои : 10.1016/j.bbamem.2010.08.016 . ПМИД 20801097 .
- ^ Кустерс И., Дриссен А.Дж. (июнь 2011 г.). «SecA, замечательная наномашина» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 68 (12): 2053–66. дои : 10.1007/s00018-011-0681-y . ПМК 3101351 . ПМИД 21479870 .
- ^ Ван, Шуай; Джомаа, Ахмад; Ясколовский, Матеуш; Ян, Цзянь-И.; Бан, Ненад; Шан, Шу-оу (октябрь 2019 г.). «Молекулярный механизм котрансляционного распознавания мембранных белков и нацеливания с помощью SecA» . Структурная и молекулярная биология природы . 26 (10): 919–929. дои : 10.1038/s41594-019-0297-8 . ISSN 1545-9985 . ПМК 6858539 . ПМИД 31570874 .
- ^ Джамшад, Мохаммед; Ноулз, Тимоти Дж; Уайт, Скотт А; Уорд, Дуглас Дж; Мохаммед, Фияз; Рахман, Кази Фахмида; Винн, Макс; Хьюз, Гарет В.; Крамер, Гюнтер; Букау, Бернд; Хубер, Дэймон (27 июня 2019 г.). Хегде, Рамануджан С; Куриян, Джон (ред.). «С-концевой хвост бактериальной транслокационной АТФазы SecA модулирует ее активность» . электронная жизнь . 8 : е48385. doi : 10.7554/eLife.48385 . ISSN 2050-084X . ПМК 6620043 . ПМИД 31246174 .
- ^ Караману С., Гуридис Г., Папанику Е., Сианидис Г., Гелис И., Керамисану Д., Вронту Э., Калодимос К.Г., Эконому А. (июнь 2007 г.). «Препротеин-контролируемый катализ в геликазном моторе SecA» . Журнал ЭМБО . 26 (12): 2904–14. дои : 10.1038/sj.emboj.7601721 . ЧВК 1894763 . ПМИД 17525736 .