Jump to content

Сухой

Сухой
Идентификаторы
Символ Сухой
Пфам PF07517
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB3DIN

Белок SecA представляет собой клеточной мембраной ассоциированную с субъединицу бактериального Sec или типа II секреторного пути , системы, которая отвечает за секрецию белков через клеточную мембрану. SecA Внутри этой системы АТФаза образует комплекс транслоказы с каналом SecYEG , тем самым управляя перемещением белкового субстрата через мембрану. [ 1 ]

Структура

[ редактировать ]

SecA представляет собой сложный белок, структура которого состоит из шести охарактеризованных доменов , что может объяснить способность SecA связывать субстраты и перемещать их. Следующие пять доменов, по-видимому, присутствуют во всех белках SecA, структурно проанализированных до сих пор. [ 2 ]

МЕРТВЫЙ моторный домен

[ редактировать ]

Этот аминокислотный домен подразделяется на две нуклеотидсвязывающие складки 1 и 2 (NBF1 и NBF2), где АТФ связывается и гидролизуется. Химическая энергия фосфодиэфирных связей приводит к конформационным изменениям, которые передаются другим доменам (особенно доменам HWD и PPXD ), которые, следовательно, механически перемещают пребелок через мембрану. Однако эти конформационные изменения частично регулируются другими доменами протомера, описанными ниже.

С-концевой линкерный домен

[ редактировать ]

Способность связываться с SecB шапероном во время посттрансляционной транслокации, рибосомой (как во время посттрансляционной, так и котрансляционной транслокации). [ 3 ] ), а фосфолипидный бислой важен для функционирования SecA и достигается за счет С-концевого линкерного домена. [ 4 ]

Домен спирального крыла (HWD)

[ редактировать ]

Расположенный в С-концевой части молекулы, этот домен контактирует с доменами HSD и PPXD. Вероятно, он играет роль в передаче молекулярного конформационного движения, которое он получает от HSD и которое возникает в результате гидролиза АТФ в моторном домене DEAD , в домен PPXD .

Пептидный домен перекрестных связей (PPXD)

[ редактировать ]

Поскольку основной функцией SecA является транспортировка пребелка способность фактически связывать пребелок через мембрану, необходимо обеспечить . Домен PPXD выполняет эту функцию при связывании субстрата.

Домен спирального каркаса (HSD)

[ редактировать ]

Этот домен расположен в центре протомера SecA и контактирует посредством α-спиральных взаимодействий со всеми остальными субдоменами. Кроме того, он содержит субдомен внутримолекулярного регулятора гидролиза АТФ 1 (IRA1), который, по-видимому, предотвращает нежелательный гидролиз АТФ, когда SecA не связан с SecYEG. Вместе с IRA1 консервативный солевой мостик, называемый Gate 1, может функционировать, предотвращая ненужные конформационные изменения. Ворота 1, по-видимому, функционально соединяют сайт связывания нуклеотидов ( АТФ ) моторного домена DEAD с доменом PPXD , что приводит к регуляции гидролиза АТФ только при пребелковом связывании. Однако было показано, что такое координационное поведение происходит только тогда, когда SecA связан с SecYEG. [ 5 ]

  1. ^ du Plessis DJ, Нувен Н., Дриссен AJ (март 2011 г.). «Сек транслоказа» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1808 (3): 851–65. дои : 10.1016/j.bbamem.2010.08.016 . ПМИД   20801097 .
  2. ^ Кустерс И., Дриссен А.Дж. (июнь 2011 г.). «SecA, замечательная наномашина» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 68 (12): 2053–66. дои : 10.1007/s00018-011-0681-y . ПМК   3101351 . ПМИД   21479870 .
  3. ^ Ван, Шуай; Джомаа, Ахмад; Ясколовский, Матеуш; Ян, Цзянь-И.; Бан, Ненад; Шан, Шу-оу (октябрь 2019 г.). «Молекулярный механизм котрансляционного распознавания мембранных белков и нацеливания с помощью SecA» . Структурная и молекулярная биология природы . 26 (10): 919–929. дои : 10.1038/s41594-019-0297-8 . ISSN   1545-9985 . ПМК   6858539 . ПМИД   31570874 .
  4. ^ Джамшад, Мохаммед; Ноулз, Тимоти Дж; Уайт, Скотт А; Уорд, Дуглас Дж; Мохаммед, Фияз; Рахман, Кази Фахмида; Винн, Макс; Хьюз, Гарет В.; Крамер, Гюнтер; Букау, Бернд; Хубер, Дэймон (27 июня 2019 г.). Хегде, Рамануджан С; Куриян, Джон (ред.). «С-концевой хвост бактериальной транслокационной АТФазы SecA модулирует ее активность» . электронная жизнь . 8 : е48385. doi : 10.7554/eLife.48385 . ISSN   2050-084X . ПМК   6620043 . ПМИД   31246174 .
  5. ^ Караману С., Гуридис Г., Папанику Е., Сианидис Г., Гелис И., Керамисану Д., Вронту Э., Калодимос К.Г., Эконому А. (июнь 2007 г.). «Препротеин-контролируемый катализ в геликазном моторе SecA» . Журнал ЭМБО . 26 (12): 2904–14. дои : 10.1038/sj.emboj.7601721 . ЧВК   1894763 . ПМИД   17525736 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0c0c76c0b59e0999d93e1427d50dace5__1713651900
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/0c/e5/0c0c76c0b59e0999d93e1427d50dace5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SecA - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)