Сайт с тегами последовательностей

Сайт с меткой последовательности (или STS ) представляет собой короткую (от 200 до 500 пар оснований) последовательность ДНК , которая встречается только один раз в геноме и чье местоположение и последовательность оснований известны. ^[1]

Использование

STS можно легко обнаружить с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров . По этой причине они полезны для построения генетических и физических карт на основе данных о последовательностях, полученных из многих различных лабораторий. Они служат ориентирами на развивающейся физической карте генома.

Когда локусы STS содержат генетические полиморфизмы (например, простые полиморфизмы длины последовательности, SSLP , однонуклеотидные полиморфизмы), они становятся ценными генетическими маркерами, т.е. локусами, которые можно использовать для различения индивидуумов.

Они используются в дробовом секвенировании , в частности, для облегчения сборки последовательности .

STS очень полезны для обнаружения микроделеций в некоторых генах. Например, некоторые STS можно использовать при скрининге с помощью ПЦР для выявления микроделеций в азооспермии (AZF) генах у бесплодных мужчин.