Таксономическая обработка
Таксономическая трактовка — это раздел научной публикации, документирующий особенности родственной группы организмов или таксонов . [ 1 ] Методы лечения были строительными блоками предоставления данных о таксонах с момента создания современной систематики растений Линнеем в 1753 году. [ 2 ] и 1758 для животных. [ 3 ] Каждый научно описанный таксон имеет по крайней мере одну таксономическую обработку. В сегодняшней публикации тег таксономической обработки [ 4 ]
используется для разграничения такого раздела. [ 5 ] Это позволяет сделать этот раздел находимыми, доступными, совместимыми и повторно используемыми данными FAIR . Это реализовано в Хранилище литературы по биоразнообразию , где при депонировании обработки (DOI) DataCite постоянный идентификатор цифрового объекта отчеканивается . Сюда входят метаданные о лечении, исходная публикация и другие цитируемые ресурсы, такие как цифры, приведенные в лечении. Этот DOI позволяет связать использование таксономического названия с соответствующими научными данными, предоставленными автором (авторами), как для человеческого, так и для машинного потребления.
Лечение считается данными, поэтому авторские права не применяются. [ 6 ] и, таким образом, могут быть доступны даже из публикаций с закрытым доступом.
Этимология
[ редактировать ]Термин «таксономический подход» был придуман потому, что термин «описание» имеет два значения в видовом или таксономическом описании . Один эквивалентен лечению, второй - подразделу обработок, описывающему таксон, дополняющему диагнозу, исследованному материалу, распространению, сохранению и другим подразделам. [ 7 ]
История
[ редактировать ]Этот термин был введен в ходе национального проекта цифровой библиотеки США NSF. [ 8 ] и получил дальнейшее развитие в Taxpub, [ 9 ] специальная таксономическая версия набора тегов для журнальных статей от Plazi , Национального центра биотехнологической информации и Pensoft Publishers . Прототипом его выступил таксономический журнал ZooKeys . [ 10 ] который принял Taxpub, начиная с его 50-го тома, а затем PhytoKeys . [ 11 ] Taxpub теперь используется журналами, издаваемыми Pensoft Publishers , European Journal of Taxonomy. [ 12 ] Консорциумом европейских таксономических учреждений (CETAF) и Национальным музеем естественной истории, Франция . [ 13 ] ЛечениеБанк [ 14 ] услуга, предоставляемая Plazi для преобразования таксономических публикаций в данные FAIR, обеспечивает доступ к более чем 500 000 таксономических обработок, [ 15 ] включая более 7700 обработок новых описанных видов в 2020 году. [ 16 ] В конечном итоге они станут доступны в BLR после прохождения контроля качества, чтобы избежать артефактов из-за сложного преобразования неструктурированных публикаций, в основном в формате PDF .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Катапано, Терри (2010). «TaxPub: расширение DTD журнала NLM/NCBI Journal Publishing для таксономических описаний» . Материалы конференции Journal Article Tag Suite 2010 . 2010 . дои : 10.5281/zenodo.3484285 .
- ^ Линней, Чарльз (1753). Виды растений: показаны правильно распознанные растения, относящиеся к родам, с видовыми различиями, тривиальными названиями, избранными синонимами, местами рождения, по половой системе . Стокгольм: Лоуренс Сальвиус. дои : 10.5281/zenodo.3931989 .
- ^ Линней, Чарльз (1758). Система природы через три царства природы: по классам, отрядам, родам, видам, с признаками, различиями, синонимами, местами . Стокгольм: Лоуренс Сальвиус. дои : 10.5962/bhl.title.542 .
- ^ Катапано, Терри (2010). «TaxPub: расширение DTD журнала NLM/NCBI Journal Publishing для таксономических описаний» . Материалы конференции Journal Article Tag Suite 2010 . 2010 . дои : 10.5281/zenodo.3484285 .
- ^ Пенев, Любомир; Катапано, Терри; Агости, Донат (2012). «Внедрение TaxPub, расширения NLM DTD для доменной разметки в таксономии, на основе опыта издателя, посвященного биоразнообразию» . Журнальные статьи Tag Suite Conference (JATS-Con), Материалы 2012 г. 2012 . дои : 10.5281/zenodo.804247 .
- ^ Паттерсон, Дэвид Дж.; Эглофф, Вилли; Агости, Донат; Идс, Д; Франц, Нико; Хагедорн, Грегор; Рис, Дж.; Ремсен, Дэвид П. (2012). «Научные названия организмов: атрибуция, права и лицензирование» . Исследовательские заметки BMC . 7 (79): 79. дои : 10.1186/1756-0500-7-79 . ПМЦ 3922623 . ПМИД 24495358 .
- ^ Катапано, Терри (2010). «TaxPub: расширение DTD журнала NLM/NCBI Journal Publishing для таксономических описаний» . Материалы конференции Journal Article Tag Suite 2010 . 2010 . дои : 10.5281/zenodo.3484285 .
- ^ Мориц, Том (2003). «Совместные исследования: Разработка новых приложений цифровых библиотек в контексте базовой онтологии биосистематической информации с использованием энтомологической литературы (муравьев)» . zenodo.org/communities/biosyslit/ . дои : 10.5281/zenodo.580296 . Проверено 9 февраля 2020 г.
- ^ Катапано, Терри. «Такспаб» . Плази . Проверено 27 октября 2009 г.
- ^ Пенев, Любомир; Робертс, Дэйв; Смит, Винс С.; Агости, Донат; Эрвин, Терри (2010). «Таксономия переходит на более высокий уровень: новые издательские инструменты для ускорения исследований биоразнообразия» . ZooKeys (50): 1–4. дои : 10.3897/zookeys.50.543 .
- ^ Кресс, В.; Пенев, Любомир (2011). «Инновационное электронное издание по систематике растений: PhytoKeys и изменения в «Ботанический кодекс», принятые на XVIII Международном ботаническом конгрессе в Мельбурне» . ФитоКлючи (6): 1–4. doi : 10.3897/phytokeys.6.2063 . ПМК 3261036 . ПМИД 22287917 .
- ^ «О журнале» . europeanjournaloftaxonomy.eu . Проверено 26 апреля 2021 г.
- ^ Кот, Эммануэль; Мабилль, Энн; Честер, Хлоя; Роклин, Эммануэль; Деруан, Тьерри; Десаттер-Гранколас, Лора; Лесур, Жозефина; Мерль, Дидье; Робиллард, Тони; Бенишу, Лоуренс (2018). «1802–2018: 220 лет периодической истории в музее» . Адансония . 40 (1): 1. doi : 10.5252/adansonia2018v40a1 .
- ^ «Лечебный Банк» . plazi.org . Проверено 9 февраля 2020 г.
- ^ «Плази: Лечение» . plazi.org . Проверено 26 апреля 2021 г.
- ^ «Новые виды 2020 года в Plazi TreatmentBank» . tb.plazi.org/GgServer/srsStats . Проверено 26 апреля 2021 г.