Остреококк
| Остреококк | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| (без рейтинга): | Зеленые растения |
| Разделение: | Хлорофита |
| Сорт: | Мамиеллофицеи |
| Заказ: | Мамиэлла |
| Семья: | Батикокковые |
| Род: | Остреококк К. Курти и М.-Ж. Кретьенно-Дине (1995) |
| Разновидность | |
Остреококк — род одноклеточных кокковидных или сферических зеленых водорослей, принадлежащих к классу Mamiellophyceae . В него входят выдающиеся представители мирового сообщества пикопланктона , играющего центральную роль в океаническом углеродном цикле .
История
[ редактировать ]Первый представитель рода, O. tauri , был обнаружен в 1994 году при исследовании пикопланктона в лагуне Тау Кортисом и Кретьенно-Дине с использованием проточной цитометрии . [1] Одноклеточные фотосинтезирующие организмы, как правило, поддаются изучению с помощью проточной цитометрии из-за автофлуоресценции , обеспечиваемой хлорофиллом и другими флуорофорами, используемыми клетками для сбора и контроля солнечного света, что позволяет изучать такие пигменты без какого-либо окрашивания клеток. Различные присутствующие пигменты можно различить и идентифицировать по клеткам с помощью проточной цитометрии, что позволяет исследователям сделать вывод о различных видах, присутствующих в образце, и помочь классифицировать любые обнаруженные новые виды. [2] O. tauri был немедленно отнесен к классу Prasinophyceae на основании наличия характерных пигментов хлорофилла и Chlorophyceae. , родственных каротиноидов [1] а также ультраструктуру клетки, и ее положение было позже подтверждено анализом ее 18S рДНК. [3] Молекулярно-филогенетический анализ, основанный на последовательности 18SrДНК, привел к определению нового класса Mamiellophyceae, который содержит Ostreococcus виды , и поместил их в семейство Bathycoccaceae . [4] Mamiellophyceae представляют собой одну из наиболее экологически успешных групп эукариотических фотосинтезирующих пикопланктеров в морской и, вероятно, также в пресноводной среде. Метагеномный [5] и метабаркодирование [6] исследования выявили присутствие других представителей рода Ostreococcus во многих океанических регионах. На сегодняшний день описаны четыре различных вида: O. tauri , O. lucimarinus , [7] О. средиземноморский [8] и О виды. РСС809. [9]
Анатомия
[ редактировать ]Род содержит самые маленькие из известных свободноживущих видов эукариот , средний размер которых составляет 0,8 мкм. [1] Ультраструктура митохондрию клеток этого рода до сих пор характеризовалась поразительной простотой: это кокковидные клетки, лишенные стенки и содержащие один хлоропласт , одну клеточной и одно тельце Гольджи , а также его ядро . [1] Доступна последовательность генома трех представителей этого рода: ядерный геном O. tauri RCC4221 размером 13 Мб, опубликованный в 2006 г. [10] и обновлено в 2014 г.; [11] О. люцимаринус CCMP2514 [7] и штамм RCC809. [9] Проекты метаболических сетей этих двух видов Ostreococcus были реконструированы на основе базы данных KEGG , термодинамически ограничены, элементно сбалансированы и функционально оценены в 2012 году. [12]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Кортис С, Вакер А, Трусселье М, Лотье Ж, Кретьенно-Дине МЖ, Неве Ж, Мачадо С, Клаустр Х (1994). «Маленький эукариотический организм» . Природа . 370 (255). дои : 10.1038/370255a0 . S2CID 4321127 .
- ^ Дэйви, Х.М. и Келл, Д.Б. (1996) «Проточная цитометрия и сортировка клеток гетерогенных микробных популяций: важность анализа отдельных клеток» Microbiological Reviews 60 (4): 641-696
- ^ Кортис, К. и др. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)» J. Phycol. 34 (5): 844–849.
- ^ Марин Б., Мелконян М. (2010). Молекулярная филогения и классификация класса Mamiellophyceae. ноябрь (Chlorophyta) на основе сравнения последовательностей оперонов рРНК, кодируемых ядром и пластидами. Протист . 161(2) :304-36. дои : 10.1016/j.protis.2009.10.002
- ^ Пигано Г., Моро Х. (2007). Скрининг метагенома Саргассова моря на наличие данных для изучения эволюции генома Ostreococcus . Джин . 406 :184-90 дои : 10.1016/j.gene.2007.09.015
- ^ Демир-Хилтон Э и др . (2011). Глобальные закономерности распределения отдельных клад фотосинтетического пикоукариота Ostreococcus . ИСМЕ Дж . 5(7) :1095-107. два : 10.1038/ismej.2010.209
- ^ Перейти обратно: а б Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное представление о парадоксе видообразования планктона. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 104 : 7705–7710. дои : 10.1073/pnas.0611046104
- ^ Субирана Л. и др. (2013). Морфология, пластичность генома и филогения рода ostreococcus позволяют выявить загадочный вид O. mediterraneus sp. ноябрь (Mamiellales, Mamiellophyceae). Протист . 164(5) :643-59. дои : 10.1016/j.protis.2013.06.002
- ^ Перейти обратно: а б «Домой — Ostreococcus sp. RCC809» .
- ^ Дерелл, Э. и др. (2006). «Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri раскрывает множество уникальных особенностей» Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103 : 11647-52.
- ^ Блан-Матье Р. и др. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri разворачивается путем оценки сборок Illumina de novo. БМК Геномика . 15 :1103. дои : 10.1186/1471-2164-15-1103
- ^ Крумхольц Э.В., Ян Х., Вайзенхорн П., Генри К.С., Либурель И.Г. (2012). «Полногеномная реконструкция метаболической сети пиководоросли Ostreococcus » . Журнал экспериментальной ботаники . 63 (6): 2353–2362. дои : 10.1093/jxb/err407 .