Метаболическая сеть
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( январь 2014 г. ) |
Метаболическая сеть — это полная совокупность метаболических и физических процессов, определяющих физиологические и биохимические свойства клетки . По существу, эти сети включают в себя химические реакции метаболизма , метаболические пути , а также регуляторные взаимодействия, которые управляют этими реакциями.
С помощью секвенирования полных геномов теперь можно реконструировать сеть биохимических реакций во многих организмах, от бактерий до человека. Некоторые из этих сетей доступны в Интернете:Киотская энциклопедия генов и геномов ( KEGG ), [1] ЭкоЦик , [2] БиоЦик [3] и метаТИГР. [4] Метаболические сети — мощные инструменты для изучения и моделирования метаболизма.
 Одиночные линии: пути, общие для большинства форм жизни. Двойные линии: пути, не встречающиеся у человека (встречаются, например, у растений, грибов, прокариот).  Оранжевые узлы: углеводный обмен .  Фиолетовые узлы: фотосинтез .  Красные узлы: клеточное дыхание .  Розовые узлы: клеточная сигнализация .  Синие узлы: метаболизм аминокислот .  Серые узлы: витаминов и кофакторов . метаболизм  Коричневые узлы: нуклеотидный и белковый обмен.  Зеленые узлы: липидный обмен . |
Использование
[ редактировать ]Метаболические сети можно использовать для выявления сопутствующих заболеваний у больных пациентов. [5] Определенные заболевания, такие как ожирение и диабет , могут присутствовать у одного и того же человека одновременно, причем иногда одно заболевание является значительным фактором риска развития другого заболевания. [6] Сами фенотипы заболеваний обычно являются следствием неспособности клетки расщепляться или производить необходимый субстрат. Однако дефект фермента в одной реакции может повлиять на потоки других последующих реакций. Эти каскадные эффекты объединяют метаболические заболевания, связанные с последующими реакциями, приводящими к сопутствующим эффектам. Таким образом, сети метаболических заболеваний можно использовать, чтобы определить, связаны ли два расстройства из-за их коррелирующих реакций. [5]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Геномнет» . www.genome.ad.jp . Архивировано из оригинала 24 февраля 2009 г. Проверено 01 апреля 2020 г.
- ^ «EcoCyc: Энциклопедия генов и метаболических путей E. coli» . www.ecocyc.org .
- ^ «BioCyc Pathway/Коллекция базы данных генома» . biocyc.org .
- ^ «метаТИГЕР - Дом» . www.bioinformatics.leeds.ac.uk . Архивировано из оригинала 4 марта 2012 г. Проверено 9 июня 2010 г.
- ^ Перейти обратно: а б Ли, Д.-С.; Парк, Дж.; Кей, Калифорния; Кристакис, Н.А.; Олтвай, З.Н.; Барабаси, А.-Л. (2008). «Влияние топологии метаболической сети человека на сопутствующие заболевания» . Труды Национальной академии наук . 105 (29): 9880–9885. дои : 10.1073/pnas.0802208105 . ПМЦ 2481357 . ПМИД 18599447 .
- ^ Росс, Р.; Даньоне, Д.; Джонс, ПиДжей; Смит, Х.; Паддагс, А.; Хадсон, Р.; Янссен, И. (2000). «Снижение ожирения и связанных с ним сопутствующих заболеваний после потери веса, вызванной диетой или потерей веса, вызванной физическими упражнениями, у мужчин. Рандомизированное контролируемое исследование» . Анналы внутренней медицины . 133 (2): 92–103. дои : 10.7326/0003-4819-133-2-200007180-00008 . ПМИД 10896648 . S2CID 13415272 .
 | Эта по молекулярной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |