Празинофит
Празинофит Парафилетическая группа хлорофитов. | |
---|---|
Пирамимонас сп. | |
Научная классификация | |
(без рейтинга): | Зеленые растения |
Разделение: | Хлорофита |
Неформальная группа : | Празинофит |
Включенные занятия [1] [2] | |
Исключенные классы (т.е. хлорофиты не считаются празинофитами) | |
Празинофиты — группа одноклеточных зеленых водорослей . [3] К празинофитам относятся преимущественно морские планктонные виды, а также некоторые пресноводные представители. [3] [4] Празинофиты морфологически разнообразны, включая жгутиконосцы с одним-восемью жгутиками и неподвижные (кокковидные) одноклеточные. Клетки многих видов покрыты органическими чешуйками; другие голые. [4] Хорошо изученные роды включают Ostreococcus , считающийся самым маленьким (около 0,95 мкм ) свободноживущим эукариотом . [5] и Micromonas , оба из которых встречаются в морских водах по всему миру. Празинофиты имеют простую клеточную структуру, содержащую один хлоропласт и одну митохондрию . Геномы . относительно малы по сравнению с другими эукариотами (около 12 МБП для Ostreococcus) [6] [7] и 21 Мбит/с для Micromonas [8] ).По крайней мере, один вид, антарктическая форма Pyramimonas gelidicola , способен к фагоцитозу и, следовательно, является миксотрофной водорослью. [9]
Некоторые авторы рассматривают празинофиты как полифилетическую группировку зеленых водорослей разных клад. Поскольку Tetraphytina появилась в составе Prasinophytes, недавно авторы включили ее, сделав ее монофилетической и эквивалентной хлорофитам. [10] [11]
Экология
[ редактировать ]Исследование разнообразия последовательностей фотосинтетических генов ( rbcL ) в Мексиканском заливе показало, что празинофиты особенно распространены при подповерхностном максимуме хлорофилла (SCM). [12] несколько различных экотипов Ostreococcus . и в окружающей среде было обнаружено [13] Считалось, что эти экотипы отличаются в окружающей среде своей адаптацией к интенсивности света. O. lucimarinus был изолирован в условиях яркого освещения. [14] и наблюдается круглый год в прибрежной части северной части Тихого океана. [15] RCC141 считался слабоосвещенным, поскольку он был изолирован из нижней эвфотической зоны . Позже было показано, что эти штаммы или экотипы обитают в разных средах обитания (открытый океан или мезотрофные), и их распространение, по-видимому, не связано с доступностью света. [16] O. tauri был выделен из прибрежной лагуны и, по-видимому, является светополивалентным. Генетические данные показывают, что между обнаруженными различными экотипами существуют явные молекулярные различия. [17]
Празинофиты подвержены заражению крупными двухцепочечными ДНК-вирусами, принадлежащими к роду Prasinovirus семейства Phycodnaviridae . [18] [19] [20] а также реовирус . [21] Подсчитано, что от 2 до 10% популяции Micromonas pusilla лизируется вирусами в день. [22]
Филогения
[ редактировать ]Недавние исследования подтверждают, что празинофиты не являются естественной группой, поскольку являются сильно парафилетичными . [4] [23] [24] [25] Отношения между группами, входящими в состав Chlorophyta, до конца не решены. Кладограмма , полученная Leliaert et al. 2011 год [4] и некоторые модификации согласно Silar 2016, [26] Лелиарт 2016 [27] и Лопес душ Сантос и др. 2017 год [1] показано ниже. Группы , заштрихованные синим цветом, традиционно относят или традиционно относили к Prasinophyceae. [3] ). Было показано, что вид Mesostigma viride является представителем Streptophyta или базальных зеленых водорослей. Остальные относятся к Chlorophyta .
Зеленые водоросли |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
В статье 2020 года Palmophyllophyceae (клад VI празинофитов) помещен в новый тип помимо Chlorophyta и Streptophyta, Prasinodermophyta . [28]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Лопес Дос Сантос А., Поллина Т., Гурвиль П., Корре Э., Мари Д., Гарридо Х.Л., Родригес Ф., Ноэль М.Х., Вало Д., Эйкрем В. (октябрь 2017 г.). «Chloropicophyceae, новый класс пикофитопланктонных празинофитов» . Научные отчеты . 7 (1): 14019. Бибкод : 2017NatSR...714019L . дои : 10.1038/s41598-017-12412-5 . ПМЦ 5656628 . ПМИД 29070840 .
- ^ Линьчжоу Ли; Сунил Кумар Саху; Хаоюань Лианг; Шифэн Чен; Себастьян Виттек; Шу Вонг; Ян; Гейн Ка - Nature Ecology & Evolution 4 ( : 1220–1231 doi : 10.1038 . s41559-020-1221-7 ) . . 9 /
- ^ Jump up to: а б с Сим, С.Д. и Пиенаар, Р.Н. 1993. Класс Prasinophyceae. В Раунде, Ф.Е. и Чепмен, DJ (ред.) Progress in Phycological Research , Vol. 9. Biopress Ltd., Бристоль, стр.281-376.
- ^ Jump up to: а б с д Лелиарт Ф., Вербрюгген Х., Зехман Ф.В. (сентябрь 2011 г.). «В глубину: новые открытия в основе филогении зеленых растений». Биоэссе . 33 (9): 683–92. doi : 10.1002/bies.201100035 . ПМИД 21744372 . S2CID 40459076 .
- ^ Куртис С., Вакер А., Трусселье М., Лотье Ж., Кретьенно-Дине М.Дж., Неве Дж. и др. (1994). «Маленький эукариотический организм» . Природа . 370 (6487): 255. Бибкод : 1994Natur.370..255C . дои : 10.1038/370255a0 .
- ^ Дерель Э, Ферраз К, Ромбаутс С, Рузе П, Уорден А.З., Роббенс С., Партенски Ф, Дегроев С., Эшенье С., Кук Р., Саис Ю., Вуйтс Дж., Джаббари К., Боулер К., Пано О., Пьегу Б., Болл С.Г. , Рал Дж.П., Буже Ф.Ю., Пигано Дж., Де Баетс Б., Пикард А., Дельсени М., Демайль Дж., Ван де Пер Ю., Моро Х. (август 2006 г.). «Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri раскрывает множество уникальных особенностей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (31): 11647–52. Бибкод : 2006PNAS..10311647D . дои : 10.1073/pnas.0604795103 . ПМЦ 1544224 . ПМИД 16868079 .
- ^ Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное представление о парадоксе видообразования планктона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (18): 7705–10. Бибкод : 2007PNAS..104.7705P . дои : 10.1073/pnas.0611046104 . ПМК 1863510 . ПМИД 17460045 .
- ^ Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .
- ^ Миксотрофия антарктической фитофлагелляты Pyramimonas gelidicola (Chlorophyta: Prasinophyceae)
- ^ Теватия Р., Ойлер Г.А. (2 января 2018 г.). «Эволюция DDB1-связывающего WD40 (DWD) у viridiplantae» . ПЛОС ОДИН . 13 (1): e0190282. Бибкод : 2018PLoSO..1390282T . дои : 10.1371/journal.pone.0190282 . ПМЦ 5749748 . ПМИД 29293590 .
- ^ Роквелл, Северная Каролина, Мартин С.С., Ли Ф.В., Мэтьюз С., Лагариас Дж.К. (май 2017 г.). «Фикоцианобилин-хромофор фитохромов водорослей стрептофитов синтезируется с помощью HY2» . Новый фитолог . 214 (3): 1145–1157. дои : 10.1111/nph.14422 . ПМЦ 5388591 . ПМИД 28106912 .
- ^ Ваврик Б., Пол Дж. Х., Кэмпбелл Л., Гриффин Д., Хоучин Л., Фуэнтес-Ортега А., Мюллер-Каргер Ф. (2003). «Вертикальная структура сообщества фитопланктона, связанная с прибрежным шлейфом в Мексиканском заливе» . Серия «Прогресс в области морской экологии» . 251 : 87–101. Бибкод : 2003MEPS..251...87W . дои : 10.3354/meps251087 .
- ^ Гийу Л., Эйкрем В., Кретьенно-Дине М.Дж., Ле Галль Ф., Массана Р., Ромари К., Педрос-Алио К., Воло Д. (июнь 2004 г.). «Разнообразие пикопланктонных празинофитов, оцененное с помощью прямого ядерного секвенирования рДНК SSU образцов окружающей среды и новых изолятов, полученных из океанических и прибрежных морских экосистем». Протист . 155 (2): 193–214. дои : 10.1078/143446104774199592 . ПМИД 15305796 . S2CID 15859454 .
- ^ Уорден А.З., Нолан Дж.К., Паленик Б. (2004). «Оценка динамики и экологии морского пикофитопланктона: важность эукариотического компонента». Лимнология и океанография . 49 (1): 168–179. Бибкод : 2004LimOc..49..168W . дои : 10.4319/lo.2004.49.1.0168 .
- ^ Уорден АЗ (2006). «Разнообразие пикоэукариот в прибрежных водах Тихого океана» (PDF) . Водная микробная экология . 43 (2): 165–175. дои : 10.3354/ame043165 .
- ^ Демир-Хилтон Э., Судек С., Кувелье М.Л., Гентеманн С.Л., Зер Дж.П., Уорден А.З. (июль 2011 г.). «Глобальные закономерности распределения отдельных клад фотосинтетического пикоукариота Ostreococcus» . Журнал ISME . 5 (7): 1095–107. дои : 10.1038/ismej.2010.209 . ПМК 3146286 . ПМИД 21289652 .
- ^ Родригес Ф., Дерель Э., Гийу Л., Ле Галль Ф., Воло Д., Моро Х. (июнь 2005 г.). «Экотипическое разнообразие морских пикоэукариот Ostreococcus (Chlorophyta, Prasinophyceae)». Экологическая микробиология . 7 (6): 853–9. дои : 10.1111/j.1462-2920.2005.00758.x . ПМИД 15892704 .
- ^ Майер Дж. А., Тейлор Ф. Дж. (1979). «Вирус, лизирующий морские нанофлагелляты, «блоха Micromonas ». Природа 281 (5729): 299–301. Бибкод : 1979Природа.281..299М . дои : 10.1038/ 281299a0 S2CID 4269889 .
- ^ Коттрелл, М.Т., Саттл, Калифорния (1991). «Широкое распространение и клональная изменчивость вирусов, вызывающих лизис космополитного эукариотического морского фитопланктера «Micromonas pusilla» » . Серия «Прогресс в области морской экологии» . 78 : 1–9. Бибкод : 1991MEPS...78....1C . дои : 10.3354/meps078001 .
- ^ Беллек Л., Гримсли Н., Дерелл Э., Моро Х., Десдевайс Ю. (апрель 2010 г.). «Численность, пространственное распределение и генетическое разнообразие вирусов Ostreococcus tauri в двух разных средах». Отчеты по экологической микробиологии . 2 (2): 313–21. дои : 10.1111/j.1758-2229.2010.00138.x . ПМИД 23766083 .
- ^ Аттуи Х, Джаафар ФМ, Белуше М, де Микко П, де Ламбаллери Х, Бруссаард КП (май 2006 г.). «Реовирус Micromonas pusilla: новый член семейства Reoviridae, отнесенный к новому предложенному роду (Mimoreovirus) » Журнал общей вирусологии . 87 (Часть 5): 1375–83. дои : 10.1099/ вир.0.81584-0 ПМИД 16603541 .
- ^ Коттрелл, М.Т., Саттл, Калифорния (1 июня 1995 г.). «Динамика литического вируса, заражающего фотосинтезирующие морские пикофлагелляты «Micromonas pusilla» ». Лимнология и океанография . 40 (4): 730–739. Бибкод : 1995LimOc..40..730C . CiteSeerX 10.1.1.517.2324 . дои : 10.4319/lo.1995.40.4.0730 . ISSN 1939-5590 .
- ^ Льюис Л.А., МакКорт Р.М. (октябрь 2004 г.). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–56. дои : 10.3732/ajb.91.10.1535 . ПМИД 21652308 .
- ^ Беккер Б., Марин Б. (май 2009 г.). «Водоросли-стрептофиты и происхождение эмбриофитов» . Анналы ботаники . 103 (7): 999–1004. дои : 10.1093/aob/mcp044 . ПМК 2707909 . ПМИД 19273476 .
- ^ Марин Б. (сентябрь 2012 г.). «Вложенные в Chlorellales или независимый класс? Филогения и классификация Pedinophyceae (Viridiplantae), выявленная с помощью молекулярно-филогенетического анализа полных ядерных и пластид-кодируемых оперонов рРНК». Протист . 163 (5): 778–805. дои : 10.1016/j.protis.2011.11.004 . ПМИД 22192529 .
- ^ Силар, Филипп (2016), «Эукариотические протисты: происхождение, эволюция и биология эукариотических микробов» , HAL Archives-ouvertes : 1–462
- ^ Лелиарт Ф., Тронхольм А., Лемье С., Турмель М., ДеПрист М.С., Бхаттачарья Д., Кароль К.Г., Фредерик С., Зехман Ф.В., Лопес-Баутиста Х.М. (май 2016 г.). «Филогеномный анализ хлоропластов выявил самую глубокую разветвленную линию Chlorophyta, класса Palmophyllophyceae. nov» . Научные отчеты . 6 (1): 25367. Бибкод : 2016NatSR...625367L . дои : 10.1038/srep25367 . ПМК 4860620 . ПМИД 27157793 .
- ^ Линьчжоу Ли; Сунил Кумар Саху; Хаоюань Лианг; Шифэн Чен; Себастьян Виттек; Шу Вонг; Ян; Гейн Ка - Nature Ecology & Evolution 4 ( : 1220–1231 doi : 10.1038 . s41559-020-1221-7 ) . . 9 /