Микромонас

Микромонас
	Микромонас пустилла
Научная классификация
(без рейтинга):	Зеленые растения
Разделение:	Хлорофита
Сорт:	Мамиеллофицеи
Заказ:	Мамиэлла
Семья:	Мамиелловые
Род:	Микромонас ; Мэнтон и Парк, 1960 г.
Разновидность
	Micromonas commoda Baren, Bachy & Worden, 2016 г. ; Micromonas bravo Simon, Foulon & Marin 2017 ; Micromonas Polaris Саймон, Фулон и Марин, 2017 г. ; Micromonas pusilla (Мясник, 1952 г.) Мэнтон и Парк, 1960 г. ;

Micromonas — род зеленых водорослей семейства Mamiellaceae . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Микромонас — широко распространенная празинофитная водоросль, очень маленькая по размеру, подвижная и фототаксическая. ^{[ 3 ]} Прежде чем охарактеризовать и назвать второй вид, Micromonas commoda. ^{[ 4 ]} посредством анализа генома, ^{[ 5 ]} Micromonas pusilla считалась единственным видом этого рода. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Это привело к непропорционально большому количеству исследований, посвященных одному виду, и предположению, что это доминирующий фотосинтезирующий пикоукариот в некоторых морских экосистемах. ^{[ 8 ]} Считалось, что в отличие от многих морских водорослей этот единственный вид широко распространен как в теплых, так и в холодных водах, но секвенирование генома подтвердило данные исследований одного гена. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} что его глобальное распространение действительно отражает присутствие множества видов, занимающих разные ниши в океане. ^{[ 5 ]}^{[ 3 ]}

Некоторые исследования разделили Micromonas pusilla на 3–5 разных клад, несмотря на их сходство по морфологии и среде обитания. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Различное соотношение клад способствует увеличению популяции M. pusilla во всей морской экосистеме, что приводит к гипотезе о возникновении клад на основе занятия ниш и восприимчивости к вирусной инфекции. ^{[ 12 ]} Другие исследования установили наличие по крайней мере семи филогенетически различных видов, глобальный анализ последовательностей которых начинает выявлять четкие различия в океанских регионах, в которых они обитают, при этом лишь некоторые из видов фактически сосуществуют в одной и той же среде. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

Открытие

Micromonas pusilla считается первым изученным пикопланктоном , когда он был обнаружен и назван Chromulina pusilla в 1950-х годах Р. Батчером. ^{[ 16 ]} Позже, в 1960-х годах, электронные микрофотографии, сделанные английскими учеными Ирен Мэнтон и Мэри Парк, предоставили дополнительную информацию о M. pusilla . ^{[ 16 ]}

Морфология и структура клеток

Микромонас — группа мелких одноклеточных грушевидной формы микроводорослей , не имеющих видимой клеточной стенки .<refname="genomes" /> ^{[ 17 ]}^{[ 4 ]} Как и у других представителей этого класса, у них есть одна митохондрия и один хлоропласт , покрывающий почти половину клетки. ^{[ 4 ]}^{[ 18 ]} Они способны плавать благодаря наличию бесчешуйчатого жгутика . ^{[ 4 ]}^{[ 18 ]}^{[ 6 ]} Аксонемное периферические строение жгутика этого рода отличается тем, что микротрубочки не доходят до окончания центральной пары микротрубочек , что позволяет визуально исследовать движение центральной пары. ^{[ 17 ]}^{[ 19 ]}^{[ 16 ]} У Micromonas центральная пара постоянно вращается против часовой стрелки, несмотря на движение других компонентов жгутика . ^{[ 17 ]}^{[ 19 ]}

Хотя размер клеток, форма и место прикрепления жгутика к клетке одинаковы у штаммов и генетических клад, изменение длины соответствующих кончиков волос приводит к разной длине жгутиков внутри рода . ^{[ 6 ]}

Антибиотик

Чувствительность к антибиотикам определяли с использованием одного штамма M. pusilla с целью получения аксенических культур для использования в исследованиях и экспериментах. ^{[ 20 ]} Штамм M.pusilla был протестирован с рядом антибиотиков, чтобы определить возможные эффекты конкретного антибиотика. ^{[ 20 ]}

Сопротивление: ^{[ 20 ]} бензилпенициллин , гентамицин , канамицин , неомицин , стрептомицин.

Чувствительный: ^{[ 20 ]} хлорамфеникол , полимиксин B

Для M. pusilla чувствительность к антибиотику, вероятно, определяется нарушением роста, а не летальным эффектом при воздействии бактерицидных уровней этого конкретного антибиотика. ^{[ 20 ]} Чувствительность других штаммов M. pusilla к этому набору антибиотиков должна быть такой же. ^{[ 20 ]}

Генетика

Эволюционная история

Микромоны рано отошли от линии, которая привела к появлению всех современных наземных растений. Отдельные виды имеют очень похожие последовательности генов 18S рибосомальной РНК , сравнение часто используется для определения микроскопического видообразования, однако <90% различных генов являются общими для двух видов Micromonas , секвенированных в геноме . ^{[ 5 ]} Более заметные различия у них имеются в области V1-V2 генов 16S рибосомальной РНК (расположенной в геноме хлоропластов). ^{[ 14 ]} Более поздние исследования показывают, насколько они различаются по отношению к другим представителям зеленой линии, в частности, наземным растениям и хлорофитным зеленым водорослям. ^{[ 15 ]}

Хотя Micromonas pusilla считалось, что представляет собой один вид, генетические исследования показали, что линии Micromonas разошлись друг от друга еще 65 миллионов лет назад, накопив большое количество генетических различий. Отсутствие морфологической дифференциации означает, что Micromonas pusilla можно рассматривать как загадочный комплекс видов . ^{[ 9 ]}

Изоляция штаммов

Исходный (ы) Micromonas эталонный геном был создан из штамма CCMP1545, выделенного из Северной Атлантики и депонированного в коллекции культур в 1980-х годах, и штамма CCMP2709 (RCC299 до того, как он стал аксеничным и клональным), выделенного в 1998 году из образца экваториальной части Тихого океана. . ^{[ 5 ]} Эти штаммы культивировались на протяжении десятилетий и доступны в Национальном центре морских водорослей и микробиоты (NCMA, США) и в коллекции культур Роскоффа (RCC, Франция).

Клеточные механизмы

Рост и деление клеток

Микромонас размножается бесполым путем делением . ^{[ 17 ]} Было замечено, что M. pusilla демонстрирует изменчивость оптических характеристик, например размера клеток и светорассеяния, в течение дня. ^{[ 21 ]} Наблюдается увеличение этих измерений в период с освещением, за которым следует снижение в период без света. ^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} Это совпадает с данными о том, что протеомные профили изменяются в течение суточного цикла с увеличением экспрессии белков, связанных с пролиферацией клеток , реструктуризацией липидов и клеточных мембран в темноте, когда клетки начинают делиться и становятся меньше. ^{[ 22 ]} Однако уровни экспрессии генов и белков могут различаться в пределах одного и того же метаболического пути . ^{[ 22 ]} Также было высказано предположение, что структура 3'-UTR может играть роль в регуляторной системе. ^{[ 22 ]}

Светособирающая система

Виды Micromonas по-прежнему имеют тот же набор фотосинтетических пигментов, что и представители класса Mamiellophyceae . ^{[ 6 ]} в состав которого входят общие пигменты хлорофилл а и хлорофилл b , ^{[ 23 ]} а также празиноксантин (ксантофилл К), первый каротиноид водорослей , имеющий структуру, имеющую γ-концевую группу. ^{[ 24 ]} Было обнаружено, что большинство его ксантофиллов находятся в окисленном состоянии и имеют сходство с ксантофиллами других важных морских планктонов , таких как диатомовые водоросли, золотые и бурые водоросли и динофлагелляты . ^{[ 25 ]} Кроме того, существует еще один пигмент под названием Chl cCS-170, который можно обнаружить у некоторых штаммов Micromonas и Ostreococcus, обитающих в более глубокой части океана, что может указывать на потенциальную адаптацию к организмам, обитающим в условиях низкой интенсивности освещения. ^{[ 6 ]} однако, по крайней мере, для Ostreococcus эти штаммы обнаруживаются по всей толще воды в круговоротах открытого океана, в том числе в поверхностных водах. ^{[ 26 ]}

Светособирающие комплексы микромонас отличаются от других зеленых водорослей пигментным составом и устойчивостью в неблагоприятных условиях. ^{[ 23 ]} Было показано, что эти белки используют три разных пигмента для сбора света и устойчивы к высоким температурам и присутствию детергентов.

Биосинтез пептидогликана

Хотя хлоропласты , которые, как предполагается, произошли от цианобактерий в результате эндосимбиоза , ^{[ 27 ]} от Micromonas не имеют окружающего слоя пептидогликана , путь биосинтеза пептидогликана оказывается полным у M. pusilla и частичным у M. commoda , с присутствием только некоторых соответствующих ферментов. ^{[ 4 ]} Хотя роль этого пути для Micromonas все еще изучается, это наблюдение показывает происхождение различных видов Micromonas вместе с глаукофитными водорослями которых все еще , хлоропласты покрыты пептидогликаном . ^{[ 4 ]}

Экологическое значение

Микромоны составляют значительную часть пикопланктонной биомассы и продуктивности как в океанических, так и в прибрежных регионах. ^{[ 8 ]} Численность Micromonas увеличилась за последнее десятилетие. Факты показывают, что эти всплески численности вызваны изменением климата, которое более резко ощущается в Арктике. ^{[ 4 ]} Многие виды зеленых водорослей считались исключительно фотосинтезирующими, и, по-видимому, это относится и к Micromonas . Несколько лет назад исследование показало, что Micromonas вели хищнический миксотрофный образ жизни, который мог оказать большое влияние на популяции прокариот в Арктике. ^{[ 28 ]} Из-за большого потребления прокариот микромонами это исследование и другие, основанные на нем, предположили, что это может лежать в основе того, почему фотосинтезирующие пикоэукариоты, по-видимому, увеличиваются в Арктике. ^{[ 28 ]} Однако авторы этого исследования потеряли использованный штамм, а два последующих исследования, проведенных другими лабораториями, не смогли воспроизвести результаты, в результате чего был сделан вывод, что Micromonas , включая M. Polaris , не является хищным миксотрофом. ^{[ 29 ]}^{[ 30 ]}

Вирусная инфекция

Вирусы играют важную роль в балансе морской экосистемы, регулируя состав микробных сообществ, но на их поведение могут влиять несколько факторов, включая температуру, способ заражения и условия хозяина. ^{[ 31 ]}^{[ 32 ]} В настоящее время обнаруживается и изучается все больше вирусов, инфицирующих Micromonas , включая исследования транскрипционных ответов на инфекцию в различных питательных условиях. ^{[ 33 ]}

Micromonas pusilla Вирус

В настоящее время идентифицировано 45 вирусных штаммов, сосуществующих с популяциями M. pusilla . ^{[ 12 ]} Инфекционность вируса зависит от штамма хозяина, доступности света и адсорбции вируса. ^{[ 34 ]}

По оценкам, средняя смертность в день из-за лизиса вируса составляет от 2 до 10% популяции M. pusilla . ^{[ 34 ]}

Реовирус Micromonas pusilla (MpRV): первый изолированный реовирус , поражающий простейших. ^{[ 35 ]} Установлено, что этот вирус крупнее других членов семейства. ^{[ 36 ]}

микромонас полярис Вирус

Это первый фикоднавирус , выделенный из вод полярного океана. ^{[ 37 ]} Он может заразить M. Polaris , полярный экотип Micromonas , приспособившийся к водам с низкой температурой. ^{[ 37 ]}

Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что повышение температуры из-за изменения климата может изменить клональный состав как вируса, так и хозяина. ^{[ 37 ]}

Метаболическая инженерия

С ростом населения в мире растет спрос на диких рыб и водоросли как источник полиненасыщенных жирных кислот (ПНЖК), необходимых для роста и развития, а также поддержания здоровья человека. Недавние исследования изучают альтернативный механизм производства ПНЖК с использованием ацил-КоА Δ6-десатуразы , фермента, присутствующего в M. pusilla , с растениями. Штамм ацил-КоА-Δ6-десатуразы M. pusilla высокоэффективен в пути синтеза полиненасыщенных жирных кислот благодаря его сильному предпочтению связывания с субстратами омега-3 в наземных растениях. ^{[ 38 ]}

Ссылки

^ См . веб-страницу NCBI о Micromonas . Данные, извлеченные из Ресурсы таксономии NCBI , Национальный центр биотехнологической информации , получено 19 марта 2007 г.
^ Micromonas Manton & Parke, 1960, non Borrel, 1902 , Всемирный регистр морских видов, по состоянию на 6 марта 2010 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Геномы двух штаммов водорослей Micromonas демонстрируют удивительное разнообразие. Архивировано 7 июля 2011 г. в Wayback Machine , Alternative Energy Newswire , 10 апреля 2009 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ван Барен, Марийке Дж.; Бачи, Чарльз; Рейстеттер, Эмили Нахас; Пурвин, Сэмюэл О.; Гримвуд, Джейн; Судек, Себастьян; Ю, Ханг; Пуарье, Камилла; Диринк, Томас Дж. (31 марта 2016 г.). «Научно обоснованная геномика зеленых водорослей раскрывает морское разнообразие и наследственные характеристики наземных растений» . БМК Геномика . 17 : 267. дои : 10.1186/s12864-016-2585-6 . ISSN 1471-2164 . ПМЦ 4815162 . ПМИД 27029936 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Уорден, Александра З.; и др. (10 апреля 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–272. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Саймон, Натали; Фулон, Элоди; Грулуа, Дафна; Шесть, Кристоф; Дедевиз, Ив; Латимье, Мари; Галл, Флоренс Ле; Трагин, Марго; Удан, Од (2017). «Пересмотр рода Micromonas Manton et Parke (Chlorophyta, Mamiellophyceae), типового вида M. pusilla (Butcher) Manton & Parke и видов M. commoda van Baren, Bachy и Worden и описание двух новых видов на основе Генетическая и фенотипическая характеристика культивируемых изолятов» (PDF) . Протист . 168 (5): 612–635. дои : 10.1016/j.protis.2017.09.002 . ПМИД 29028580 .
^ Боровицка, Майкл А.; Бердалл, Джон; Рэйвен, Джон А. (21 марта 2016 г.). Физиология микроводорослей . Чам: Springer International. ISBN 9783319249452 . OCLC 945445086 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нет, Ф; Латаса, М; Мари, Д; Кариу, Т; Вало, Д; Саймон, Н. (июль 2004 г.), «Один вид Micromonas pusilla (Prasinophyceae) доминирует над эукариотическим пикопланктоном в западной части Ла-Манша», Applied and Environmental Microbiology , 70 (7): 4064–72, Bibcode : 2004ApEnM..70.4064 N , doi : 10.1128/AEM.70.7.4064-4072.2004 , ISSN 0099-2240 , PMC 444783 , PMID 15240284
^ Перейти обратно: ^а ^б Шлапета, Ян; Лопес-Гарсия, Purificación; Морейра, Дэвид (2006). «Глобальное распространение и древние загадочные виды мельчайших морских эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (1): 23–29. дои : 10.1093/molbev/msj001 . ISSN 1537-1719 . ПМИД 16120798 .
^ Уорден, Аз (2006). «Разнообразие пикоэукариот в прибрежных водах Тихого океана» . Водная микробная экология . 43 : 165–175. дои : 10.3354/ame043165 . ISSN 0948-3055 .
^ Фулон, Элоди; Нет, Фабрис; Жалабер, Фабьен; Кариу, Тьерри; Массана, Рамон; Саймон, Натали (1 сентября 2008 г.). «Разделение экологической ниши у пикопланктонной зеленой водоросли Micromonas pusilla: данные экологических исследований с использованием филогенетических зондов». Экологическая микробиология . 10 (9): 2433–2443. Бибкод : 2008EnvMi..10.2433F . дои : 10.1111/j.1462-2920.2008.01673.x . ПМИД 18537812 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Боду, AC; Лебредончель, Х.; Демер, Х.; Латимье, М.; Эдерн, Р.; Риго-Жалабер, Ф.; Ге, П.; Гийу, Л.; Фулон, Э.; Божец, Ю.; Кариу, Т.; Десдевис, Ю.; Дерелл, Э.; Гримсли, Н.; Моро, Х.; Саймон, Н. (1 октября 2015 г.). «Взаимодействие между генетическими кладами Micromonas и их вирусами в западной части Ла-Манша» (PDF) . Отчеты по экологической микробиологии . 7 (5): 765–773. Бибкод : 2015EnvMR...7..765B . дои : 10.1111/1758-2229.12309 . ПМИД 26081716 .
^ Экманн, Шарлотта А.; Эберле, Джессика С.; Виттмерс, Фабиан; Уилкен, Сюзанна; Бергауэр, Кристин; Пуарье, Камилла; Блюм, Маргарита; Макаревичуте-Фихтнер, Кристе; Хименес, Валерия; Бачи, Чарльз; Вермей, Марк Дж.А.; Уорден, Александра З. (2023). «Состав сообщества эукариотических водорослей в тропических средах от солнечных солеварней до открытого моря» . Границы морской науки . 10 . дои : 10.3389/fmars.2023.1131351 . ISSN 2296-7745 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Штраус, Ян; Чхве, Чан Джэ; Гроун, Джонатан; Виттмерс, Фабиан; Хименес, Валерия; Макаревичуте-Фихтнер, Кристе; Бачи, Чарльз; Джагер, Гуалтьеро Спиро; Пуарье, Камилла; Экманн, Шарлотта; Спеццано, Рашель; Лёшер, Кэролин Р.; Сарма, ВВСС; Махадеван, Амала; Уорден, Александра З. (2023). «Бенгальский залив демонстрирует обильный фотосинтетический пикопланктон и вновь обретенное разнообразие вдоль градиентов солености» . Экологическая микробиология . 25 (11): 2118–2141. Бибкод : 2023EnvMi..25.2118S . дои : 10.1111/1462-2920.16431 . ISSN 1462-2912 . ПМИД 37311449 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Бачи, Чарльз; Виттмерс, Фабиан; Мушоль, Ян; Гамильтон, Мария; Анрисса, Бернар; Уорден, Александра З. (2022). «Связь суши и моря: взгляд на происхождение растений с точки зрения зеленых водорослей» . Ежегодный обзор биологии растений . 73 (1): 585–616. doi : 10.1146/annurev-arplant-071921-100530 . ISSN 1543-5008 . ПМИД 35259927 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ваулот, Даниэль; Эйкрем, Венче; Випрей, Манон; Моро, Эрве (1 августа 2008 г.). «Разнообразие мелкого эукариотического фитопланктона (≤3 мкм) в морских экосистемах» . Обзоры микробиологии FEMS . 32 (5): 795–820. дои : 10.1111/j.1574-6976.2008.00121.x . ПМИД 18564290 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Белл, Питер Р. (2000). Зеленые растения: их происхождение и разнообразие . Хемсли, Алан Р. (2-е изд.). Кембридж, Великобритания: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-64109-8 . OCLC 56124600 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лессер, Майкл, изд. (2011). Достижения морской биологии. Том 60 . Амстердам: Elsevier Academic Press. ISBN 978-0-12-385529-9 . OCLC 761362752 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Омото, Шарлотта К.; Уитман, Джордж Б. (23 апреля 1981 г.). «Функционально значимое вращение центральной пары в примитивном эукариотическом жгутике». Природа . 290 (5808): 708–710. Бибкод : 1981Natur.290..708O . дои : 10.1038/290708a0 . ISSN 1476-4687 . ПМИД 7219555 . S2CID 4354444 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Коттрелл, Мэтью Т.; Саттл, Кертис А. (1 июня 1993 г.). «Производство аксенических культур Micromonas Pusilla (Prasinophyceae) с использованием антибиотика 1». Журнал психологии . 29 (3): 385–387. Бибкод : 1993JPcgy..29..385C . дои : 10.1111/j.0022-3646.1993.00385.x . S2CID 85052488 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ДюРанд, Мишель Д.; Грин, Ребекка Э.; Сосик, Хайди М.; Олсон, Роберт Дж. (1 декабря 2002 г.). «Циферблатные вариации оптических свойств Micromonas Pusilla (Prasinophyceae)1» Журнал психологии . 38 (6): 1132–1142. Бибкод : 2002JPcgy..38.1132D дои : 10.1046/j.1529–8817.2002.02008.x . ISSN 1529-8817 . S2CID 28859691 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Уолтман, Питер Х.; Го, Цзянь; Рейстеттер, Эмили Нахас; Пурвин, Сэмюэл; Ансонг, Чарльз К.; Барен, Марийке Дж. ван; Вонг, Чи-Хонг; Вэй, Цзя-Линь; Смит, Ричард Д. (19 июля 2016 г.). «Идентификация аспектов посттранскрипционной программы, управляющей протеомом зеленой водоросли Micromonas pusilla» . ПЛОС ОДИН . 11 (7): e0155839. Бибкод : 2016PLoSO..1155839W . дои : 10.1371/journal.pone.0155839 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4951065 . ПМИД 27434306 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Вильгельм, К.; Ленарц-Вейлер, И.; Видеманн, И.; Уайлд, А. (1986). «Светособирающая система видов Micromonas (Prasinophyceae): сочетание трех разных видов хлорофилла в одном хлорофилл-белковом комплексе». Психология . 25 (3): 304–312. Бибкод : 1986Phyco..25..304W . дои : 10.2216/i0031-8884-25-3-304.1 .
^ Фосс, Пер; Гиллард, Роберт Р.Л.; Лиаэн-Йенсен, Synnøve (1984). «Празиноксантин — хемосистематический маркер водорослей». Фитохимия . 23 (8): 1629–1633. Бибкод : 1984PChem..23.1629F . дои : 10.1016/s0031-9422(00)83455-x .
^ Рикеттс, Т.Р. (1966). «Каротиноиды фитофлагелляты Micromonas pusilla». Фитохимия . 5 (4): 571–580. Бибкод : 1966PChem...5..571R . дои : 10.1016/s0031-9422(00)83635-3 .
^ Лимардо, Александр Дж.; Судек, Себастьян; Чхве, Чан Джэ; Пуарье, Камилла; Рии, Ёшими М.; Блюм, Маргарита; Рот, Робин; Гуденаф, Урсула; Черч, Мэтью Дж.; Уорден, Александра З. (2017). «Количественная биогеография пикопразинофитов устанавливает распределение экотипов и значительный вклад в морской фитопланктон» . Экологическая микробиология . 19 (8): 3219–3234. Бибкод : 2017EnvMi..19.3219L . дои : 10.1111/1462-2920.13812 . ПМИД 28585420 .
^ Мачида, Марико; Такечи, Кацуаки; Сато, Хироши; Чунг, Сон Джин; Куроива, Харуко; Такио, Сусуму; Секи, Мотоаки; Шинозаки, Кадзуо; Фудзита, Томомичи (25 апреля 2006 г.). «Гены пути синтеза пептидогликана необходимы для деления хлоропластов у мха» . Труды Национальной академии наук . 103 (17): 6753–6758. Бибкод : 2006PNAS..103.6753M . дои : 10.1073/pnas.0510693103 . ПМЦ 1458953 . ПМИД 16618924 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Маккай-Крисберг, Заид М; Сандерс, Роберт В. (октябрь 2014 г.). «Фаготрофия пикоэукариотических зеленых водорослей Micromonas: последствия для Северного Ледовитого океана» . Журнал ISME . 8 (10): 1953–1961. Бибкод : 2014ISMEJ...8.1953M . дои : 10.1038/ismej.2014.16 . ПМК 4184008 . ПМИД 24553471 .
^ Уилкен, Сюзанна; Юнг, Чармейн CM; Гамильтон, Мария; Ходли, Кеннет; Нзонго, Джулиана; Экманн, Шарлотта; Коррочано-Люке, Мария; Пуарье, Камилла; Уорден, Александра З. (2019). «Необходимость учитывать клеточную биологию при характеристике хищных миксотрофов в водной среде» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 374 ): 20190090.doi : ( 1786 10.1098/rstb.2019.0090 . ISSN 0962-8436 . ПМК 6792458 . ПМИД 31587652 .
^ Хименес, Валерия; Бернс, Джон А.; Ле Галль, Флоренция; Нет, Фабрис; Воло, Даниэль (2021). «Нет доказательств фаго-миксотропии у Micromonas Polaris (Mamiellophyceae), доминирующего вида пикофитопланктона в Арктике» . Журнал психологии . 57 (2): 435–446. Бибкод : 2021JPcgy..57..435J . дои : 10.1111/jpy.13125 . ISSN 0022-3646 . ПМИД 33394518 .
^ Демори, Дэвид; Арсеньев, Лора; Саймон, Натали; Шесть, Кристоф; Риго-Жалабер, Фабьен; Мари, Доминик; Ге, Пей; Бигерд, Эстель; Жаке, Стефан (март 2017 г.). «Температура является ключевым фактором во взаимодействии Micromonas и вируса» . Журнал ISME . 11 (3): 601–612. Бибкод : 2017ISMEJ..11..601D . дои : 10.1038/ismej.2016.160 . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 5322312 . ПМИД 28085157 .
^ Маат, Дауве С.; Блейсвейк, Ван; Л, Джудит Д.; Витте, Гарри Дж.; Брюссаард, Корина П.Д. (1 сентября 2016 г.). «Продуцирование вируса у Micromonas pusilla с ограниченным содержанием фосфора стимулируется поставкой различных источников фосфора в естественных низких концентрациях уже в самом начале литического цикла» . ФЭМС Микробиология Экология . 92 (9): фив1 дои : 10.1093/femsec/fiw136 . ISSN 0168-6496 . ПМИД 27316561 .
^ Бачи, Чарльз; Чарльзуорт, Кристина Дж.; Чан, Эми М.; Финке, Ян Ф.; Вонг, Чи-Хонг; Вэй, Цзя-Линь; Судек, Себастьян; Коулман, Морин Л.; Саттл, Кертис А.; Уорден, Александра З. (2018). «Транкрипционные ответы морской зеленой водоросли Micromonas pusilla и инфицирующего празиновируса в различных фосфатных условиях» . Экологическая микробиология . 20 (8): 2898–2912. Бибкод : 2018EnvMi..20.2898B . дои : 10.1111/1462-2920.14273 . ISSN 1462-2912 . ПМИД 29749714 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Коттрелл, Мэтью Т.; Саттл, Кертис А. (1 июня 1995 г.). «Динамика литического вируса, заражающего фотосинтезирующие морские пикофлагелляты Micromonas pusilla» . Лимнология и океанография . 40 (4): 730–739. Бибкод : 1995LimOc..40..730C . дои : 10.4319/lo.1995.40.4.0730 .
^ Брюссаард, CPD; Норделоос, ААМ; Сандаа, Р.-А; Хелдал, М; Братбак, Г (2004). «Обнаружение вируса дцРНК, заражающего морских фотосинтезирующих простейших Micromonas pusilla» . Вирусология . 319 (2): 280–291. дои : 10.1016/j.virol.2003.10.033 . ПМИД 14980488 .
^ Аттуи, Х; Джаафар, FM; Белуше, М; де Микко, П; де Ламбаллери, X; Бруссаард, Cp (май 2006 г.), «Реовирус Micromonas pusilla: новый член семейства Reoviridae, отнесенный к новому предполагаемому роду (Mimoreovirus)» (бесплатный полный текст) , The Journal of General Virology , 87 (Pt 5): 1375– 83, номер домена : 10.1099/vir.0.81584-0 , ISSN 0022-1317 , PMID 16603541
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Маат, Дауве С.; Биггс, Тристан; Эванс, Клэр; ван Блейсвейк, Джудит Д.Л.; ван дер Вель, Николь Н.; Дутил, Лоу Э.; Брюссаард, Корина П.Д. (2 июня 2017 г.). «Характеристика и температурная зависимость вирусов арктической Micromonas Polaris» . Вирусы . 9 (6): 134. дои : 10.3390/v9060134 . ПМК 5490811 . ПМИД 28574420 .
^ Петри, Джеймс Р.; Шреста, Пушкар; Мансур, Магед П.; Николс, Питер Д.; Лю, Цин; Сингх, Суриндер П. (1 мая 2010 г.). «Метаболическая инженерия длинноцепочечных полиненасыщенных жирных кислот омега-3 в растениях с использованием ацил-КоА Δ6-десатуразы с ω3-предпочтением из морской микроводоросли Micromonas pusilla». Метаболическая инженерия . 12 (3): 233–240. дои : 10.1016/j.ymben.2009.12.001 . ПМИД 20004733 .

Внешние ссылки

Гены крошечных водорослей проливают свет на важную роль управления углеродом в мировом океане

[1] См . веб-страницу NCBI о Micromonas . Данные, извлеченные из Ресурсы таксономии NCBI , Национальный центр биотехнологической информации , получено 19 марта 2007 г.

[2] Micromonas Manton & Parke, 1960, non Borrel, 1902 , Всемирный регистр морских видов, по состоянию на 6 марта 2010 г.

[alt2009-3] Перейти обратно: ^а ^б Геномы двух штаммов водорослей Micromonas демонстрируют удивительное разнообразие. Архивировано 7 июля 2011 г. в Wayback Machine , Alternative Energy Newswire , 10 апреля 2009 г.

[:1-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ван Барен, Марийке Дж.; Бачи, Чарльз; Рейстеттер, Эмили Нахас; Пурвин, Сэмюэл О.; Гримвуд, Джейн; Судек, Себастьян; Ю, Ханг; Пуарье, Камилла; Диринк, Томас Дж. (31 марта 2016 г.). «Научно обоснованная геномика зеленых водорослей раскрывает морское разнообразие и наследственные характеристики наземных растений» . БМК Геномика . 17 : 267. дои : 10.1186/s12864-016-2585-6 . ISSN 1471-2164 . ПМЦ 4815162 . ПМИД 27029936 .

[genomes-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Уорден, Александра З.; и др. (10 апреля 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–272. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .

[:3-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Саймон, Натали; Фулон, Элоди; Грулуа, Дафна; Шесть, Кристоф; Дедевиз, Ив; Латимье, Мари; Галл, Флоренс Ле; Трагин, Марго; Удан, Од (2017). «Пересмотр рода Micromonas Manton et Parke (Chlorophyta, Mamiellophyceae), типового вида M. pusilla (Butcher) Manton & Parke и видов M. commoda van Baren, Bachy и Worden и описание двух новых видов на основе Генетическая и фенотипическая характеристика культивируемых изолятов» (PDF) . Протист . 168 (5): 612–635. дои : 10.1016/j.protis.2017.09.002 . ПМИД 29028580 .

[7] Боровицка, Майкл А.; Бердалл, Джон; Рэйвен, Джон А. (21 марта 2016 г.). Физиология микроводорослей . Чам: Springer International. ISBN 9783319249452 . OCLC 945445086 .

[not-8] Перейти обратно: ^а ^б Нет, Ф; Латаса, М; Мари, Д; Кариу, Т; Вало, Д; Саймон, Н. (июль 2004 г.), «Один вид Micromonas pusilla (Prasinophyceae) доминирует над эукариотическим пикопланктоном в западной части Ла-Манша», Applied and Environmental Microbiology , 70 (7): 4064–72, Bibcode : 2004ApEnM..70.4064 N , doi : 10.1128/AEM.70.7.4064-4072.2004 , ISSN 0099-2240 , PMC 444783 , PMID 15240284

[Slapeta-9] Перейти обратно: ^а ^б Шлапета, Ян; Лопес-Гарсия, Purificación; Морейра, Дэвид (2006). «Глобальное распространение и древние загадочные виды мельчайших морских эукариот» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (1): 23–29. дои : 10.1093/molbev/msj001 . ISSN 1537-1719 . ПМИД 16120798 .

[10] Уорден, Аз (2006). «Разнообразие пикоэукариот в прибрежных водах Тихого океана» . Водная микробная экология . 43 : 165–175. дои : 10.3354/ame043165 . ISSN 0948-3055 .

[11] Фулон, Элоди; Нет, Фабрис; Жалабер, Фабьен; Кариу, Тьерри; Массана, Рамон; Саймон, Натали (1 сентября 2008 г.). «Разделение экологической ниши у пикопланктонной зеленой водоросли Micromonas pusilla: данные экологических исследований с использованием филогенетических зондов». Экологическая микробиология . 10 (9): 2433–2443. Бибкод : 2008EnvMi..10.2433F . дои : 10.1111/j.1462-2920.2008.01673.x . ПМИД 18537812 .

[clade-12] Перейти обратно: ^а ^б ^с Боду, AC; Лебредончель, Х.; Демер, Х.; Латимье, М.; Эдерн, Р.; Риго-Жалабер, Ф.; Ге, П.; Гийу, Л.; Фулон, Э.; Божец, Ю.; Кариу, Т.; Десдевис, Ю.; Дерелл, Э.; Гримсли, Н.; Моро, Х.; Саймон, Н. (1 октября 2015 г.). «Взаимодействие между генетическими кладами Micromonas и их вирусами в западной части Ла-Манша» (PDF) . Отчеты по экологической микробиологии . 7 (5): 765–773. Бибкод : 2015EnvMR...7..765B . дои : 10.1111/1758-2229.12309 . ПМИД 26081716 .

[13] Экманн, Шарлотта А.; Эберле, Джессика С.; Виттмерс, Фабиан; Уилкен, Сюзанна; Бергауэр, Кристин; Пуарье, Камилла; Блюм, Маргарита; Макаревичуте-Фихтнер, Кристе; Хименес, Валерия; Бачи, Чарльз; Вермей, Марк Дж.А.; Уорден, Александра З. (2023). «Состав сообщества эукариотических водорослей в тропических средах от солнечных солеварней до открытого моря» . Границы морской науки . 10 . дои : 10.3389/fmars.2023.1131351 . ISSN 2296-7745 .

[10.1111_1462-2920.16431-14] Перейти обратно: ^а ^б Штраус, Ян; Чхве, Чан Джэ; Гроун, Джонатан; Виттмерс, Фабиан; Хименес, Валерия; Макаревичуте-Фихтнер, Кристе; Бачи, Чарльз; Джагер, Гуалтьеро Спиро; Пуарье, Камилла; Экманн, Шарлотта; Спеццано, Рашель; Лёшер, Кэролин Р.; Сарма, ВВСС; Махадеван, Амала; Уорден, Александра З. (2023). «Бенгальский залив демонстрирует обильный фотосинтетический пикопланктон и вновь обретенное разнообразие вдоль градиентов солености» . Экологическая микробиология . 25 (11): 2118–2141. Бибкод : 2023EnvMi..25.2118S . дои : 10.1111/1462-2920.16431 . ISSN 1462-2912 . ПМИД 37311449 .

[10.1146_annurev-arplant-071921-100530-15] Перейти обратно: ^а ^б Бачи, Чарльз; Виттмерс, Фабиан; Мушоль, Ян; Гамильтон, Мария; Анрисса, Бернар; Уорден, Александра З. (2022). «Связь суши и моря: взгляд на происхождение растений с точки зрения зеленых водорослей» . Ежегодный обзор биологии растений . 73 (1): 585–616. doi : 10.1146/annurev-arplant-071921-100530 . ISSN 1543-5008 . ПМИД 35259927 .

[discovery-16] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ваулот, Даниэль; Эйкрем, Венче; Випрей, Манон; Моро, Эрве (1 августа 2008 г.). «Разнообразие мелкого эукариотического фитопланктона (≤3 мкм) в морских экосистемах» . Обзоры микробиологии FEMS . 32 (5): 795–820. дои : 10.1111/j.1574-6976.2008.00121.x . ПМИД 18564290 .

[:0-17] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Белл, Питер Р. (2000). Зеленые растения: их происхождение и разнообразие . Хемсли, Алан Р. (2-е изд.). Кембридж, Великобритания: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-64109-8 . OCLC 56124600 .

[:2-18] Перейти обратно: ^а ^б Лессер, Майкл, изд. (2011). Достижения морской биологии. Том 60 . Амстердам: Elsevier Academic Press. ISBN 978-0-12-385529-9 . OCLC 761362752 .

[:4-19] Перейти обратно: ^а ^б Омото, Шарлотта К.; Уитман, Джордж Б. (23 апреля 1981 г.). «Функционально значимое вращение центральной пары в примитивном эукариотическом жгутике». Природа . 290 (5808): 708–710. Бибкод : 1981Natur.290..708O . дои : 10.1038/290708a0 . ISSN 1476-4687 . ПМИД 7219555 . S2CID 4354444 .

[anti-20] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Коттрелл, Мэтью Т.; Саттл, Кертис А. (1 июня 1993 г.). «Производство аксенических культур Micromonas Pusilla (Prasinophyceae) с использованием антибиотика 1». Журнал психологии . 29 (3): 385–387. Бибкод : 1993JPcgy..29..385C . дои : 10.1111/j.0022-3646.1993.00385.x . S2CID 85052488 .

[:5-21] Перейти обратно: ^а ^б ДюРанд, Мишель Д.; Грин, Ребекка Э.; Сосик, Хайди М.; Олсон, Роберт Дж. (1 декабря 2002 г.). «Циферблатные вариации оптических свойств Micromonas Pusilla (Prasinophyceae)1» Журнал психологии . 38 (6): 1132–1142. Бибкод : 2002JPcgy..38.1132D дои : 10.1046/j.1529–8817.2002.02008.x . ISSN 1529-8817 . S2CID 28859691 .

[:6-22] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Уолтман, Питер Х.; Го, Цзянь; Рейстеттер, Эмили Нахас; Пурвин, Сэмюэл; Ансонг, Чарльз К.; Барен, Марийке Дж. ван; Вонг, Чи-Хонг; Вэй, Цзя-Линь; Смит, Ричард Д. (19 июля 2016 г.). «Идентификация аспектов посттранскрипционной программы, управляющей протеомом зеленой водоросли Micromonas pusilla» . ПЛОС ОДИН . 11 (7): e0155839. Бибкод : 2016PLoSO..1155839W . дои : 10.1371/journal.pone.0155839 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4951065 . ПМИД 27434306 .

[:7-23] Перейти обратно: ^а ^б Вильгельм, К.; Ленарц-Вейлер, И.; Видеманн, И.; Уайлд, А. (1986). «Светособирающая система видов Micromonas (Prasinophyceae): сочетание трех разных видов хлорофилла в одном хлорофилл-белковом комплексе». Психология . 25 (3): 304–312. Бибкод : 1986Phyco..25..304W . дои : 10.2216/i0031-8884-25-3-304.1 .

[24] Фосс, Пер; Гиллард, Роберт Р.Л.; Лиаэн-Йенсен, Synnøve (1984). «Празиноксантин — хемосистематический маркер водорослей». Фитохимия . 23 (8): 1629–1633. Бибкод : 1984PChem..23.1629F . дои : 10.1016/s0031-9422(00)83455-x .

[25] Рикеттс, Т.Р. (1966). «Каротиноиды фитофлагелляты Micromonas pusilla». Фитохимия . 5 (4): 571–580. Бибкод : 1966PChem...5..571R . дои : 10.1016/s0031-9422(00)83635-3 .

[26] Лимардо, Александр Дж.; Судек, Себастьян; Чхве, Чан Джэ; Пуарье, Камилла; Рии, Ёшими М.; Блюм, Маргарита; Рот, Робин; Гуденаф, Урсула; Черч, Мэтью Дж.; Уорден, Александра З. (2017). «Количественная биогеография пикопразинофитов устанавливает распределение экотипов и значительный вклад в морской фитопланктон» . Экологическая микробиология . 19 (8): 3219–3234. Бибкод : 2017EnvMi..19.3219L . дои : 10.1111/1462-2920.13812 . ПМИД 28585420 .

[27] Мачида, Марико; Такечи, Кацуаки; Сато, Хироши; Чунг, Сон Джин; Куроива, Харуко; Такио, Сусуму; Секи, Мотоаки; Шинозаки, Кадзуо; Фудзита, Томомичи (25 апреля 2006 г.). «Гены пути синтеза пептидогликана необходимы для деления хлоропластов у мха» . Труды Национальной академии наук . 103 (17): 6753–6758. Бибкод : 2006PNAS..103.6753M . дои : 10.1073/pnas.0510693103 . ПМЦ 1458953 . ПМИД 16618924 .

[phagotrophy-28] Перейти обратно: ^а ^б Маккай-Крисберг, Заид М; Сандерс, Роберт В. (октябрь 2014 г.). «Фаготрофия пикоэукариотических зеленых водорослей Micromonas: последствия для Северного Ледовитого океана» . Журнал ISME . 8 (10): 1953–1961. Бибкод : 2014ISMEJ...8.1953M . дои : 10.1038/ismej.2014.16 . ПМК 4184008 . ПМИД 24553471 .

[29] Уилкен, Сюзанна; Юнг, Чармейн CM; Гамильтон, Мария; Ходли, Кеннет; Нзонго, Джулиана; Экманн, Шарлотта; Коррочано-Люке, Мария; Пуарье, Камилла; Уорден, Александра З. (2019). «Необходимость учитывать клеточную биологию при характеристике хищных миксотрофов в водной среде» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 374 ): 20190090.doi : ( 1786 10.1098/rstb.2019.0090 . ISSN 0962-8436 . ПМК 6792458 . ПМИД 31587652 .

[30] Хименес, Валерия; Бернс, Джон А.; Ле Галль, Флоренция; Нет, Фабрис; Воло, Даниэль (2021). «Нет доказательств фаго-миксотропии у Micromonas Polaris (Mamiellophyceae), доминирующего вида пикофитопланктона в Арктике» . Журнал психологии . 57 (2): 435–446. Бибкод : 2021JPcgy..57..435J . дои : 10.1111/jpy.13125 . ISSN 0022-3646 . ПМИД 33394518 .

[31] Демори, Дэвид; Арсеньев, Лора; Саймон, Натали; Шесть, Кристоф; Риго-Жалабер, Фабьен; Мари, Доминик; Ге, Пей; Бигерд, Эстель; Жаке, Стефан (март 2017 г.). «Температура является ключевым фактором во взаимодействии Micromonas и вируса» . Журнал ISME . 11 (3): 601–612. Бибкод : 2017ISMEJ..11..601D . дои : 10.1038/ismej.2016.160 . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 5322312 . ПМИД 28085157 .

[32] Маат, Дауве С.; Блейсвейк, Ван; Л, Джудит Д.; Витте, Гарри Дж.; Брюссаард, Корина П.Д. (1 сентября 2016 г.). «Продуцирование вируса у Micromonas pusilla с ограниченным содержанием фосфора стимулируется поставкой различных источников фосфора в естественных низких концентрациях уже в самом начале литического цикла» . ФЭМС Микробиология Экология . 92 (9): фив1 дои : 10.1093/femsec/fiw136 . ISSN 0168-6496 . ПМИД 27316561 .

[33] Бачи, Чарльз; Чарльзуорт, Кристина Дж.; Чан, Эми М.; Финке, Ян Ф.; Вонг, Чи-Хонг; Вэй, Цзя-Линь; Судек, Себастьян; Коулман, Морин Л.; Саттл, Кертис А.; Уорден, Александра З. (2018). «Транкрипционные ответы морской зеленой водоросли Micromonas pusilla и инфицирующего празиновируса в различных фосфатных условиях» . Экологическая микробиология . 20 (8): 2898–2912. Бибкод : 2018EnvMi..20.2898B . дои : 10.1111/1462-2920.14273 . ISSN 1462-2912 . ПМИД 29749714 .

[virus-34] Перейти обратно: ^а ^б Коттрелл, Мэтью Т.; Саттл, Кертис А. (1 июня 1995 г.). «Динамика литического вируса, заражающего фотосинтезирующие морские пикофлагелляты Micromonas pusilla» . Лимнология и океанография . 40 (4): 730–739. Бибкод : 1995LimOc..40..730C . дои : 10.4319/lo.1995.40.4.0730 .

[35] Брюссаард, CPD; Норделоос, ААМ; Сандаа, Р.-А; Хелдал, М; Братбак, Г (2004). «Обнаружение вируса дцРНК, заражающего морских фотосинтезирующих простейших Micromonas pusilla» . Вирусология . 319 (2): 280–291. дои : 10.1016/j.virol.2003.10.033 . ПМИД 14980488 .

[36] Аттуи, Х; Джаафар, FM; Белуше, М; де Микко, П; де Ламбаллери, X; Бруссаард, Cp (май 2006 г.), «Реовирус Micromonas pusilla: новый член семейства Reoviridae, отнесенный к новому предполагаемому роду (Mimoreovirus)» (бесплатный полный текст) , The Journal of General Virology , 87 (Pt 5): 1375– 83, номер домена : 10.1099/vir.0.81584-0 , ISSN 0022-1317 , PMID 16603541

[:9-37] Перейти обратно: ^а ^б ^с Маат, Дауве С.; Биггс, Тристан; Эванс, Клэр; ван Блейсвейк, Джудит Д.Л.; ван дер Вель, Николь Н.; Дутил, Лоу Э.; Брюссаард, Корина П.Д. (2 июня 2017 г.). «Характеристика и температурная зависимость вирусов арктической Micromonas Polaris» . Вирусы . 9 (6): 134. дои : 10.3390/v9060134 . ПМК 5490811 . ПМИД 28574420 .

[38] Петри, Джеймс Р.; Шреста, Пушкар; Мансур, Магед П.; Николс, Питер Д.; Лю, Цин; Сингх, Суриндер П. (1 мая 2010 г.). «Метаболическая инженерия длинноцепочечных полиненасыщенных жирных кислот омега-3 в растениях с использованием ацил-КоА Δ6-десатуразы с ω3-предпочтением из морской микроводоросли Micromonas pusilla». Метаболическая инженерия . 12 (3): 233–240. дои : 10.1016/j.ymben.2009.12.001 . ПМИД 20004733 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]