Электрофореграмма



Электрофореграмма электрофореграммой (также называемая в аналитической технике, в первую , секвенирующей хроматограммой , EPG и электронной граммой ) — это запись или диаграмма, полученная при использовании электрофореза очередь в области судебной биологии , молекулярной биологии и биохимии . [ 1 ] Этот метод отображает точки данных, которые представляют определенное время и интенсивность флуоресценции на различных длинах волн света, чтобы представить профиль ДНК. [ 2 ] [ нужна страница ]
В области генетики электроферограмма представляет собой график размеров фрагментов ДНК, обычно используемый для генотипирования, такого как секвенирование ДНК . [ 3 ] Данные нанесены на график во времени, показанном через пары оснований (bps) по оси x и интенсивность флуоресценции по оси y. Такие графики часто создаются с использованием такого инструмента, как автоматический секвенатор ДНК в сочетании с капиллярным электрофорезом (КЭ). Такие электрофореграммы можно использовать для определения генотипов последовательностей ДНК или генотипов, которые основаны на длине конкретных фрагментов ДНК или количестве коротких тандемных повторов (STR) в определенном локусе, путем сравнения образца с внутренними стандартами размера и данными аллельной лестницы с использованием стандартный размер того же размера. [ 2 ] [ нужна страница ] Эти генотипы можно использовать для:
- генеалогическое тестирование ДНК
- ДНК-тест на отцовство
- Профилирование ДНК
- филогенетика
- популяционная генетика
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Карабибер, Ф (2013). «Алгоритм выравнивания пиков с новыми улучшениями в применении к анализу электрофорограмм» . Журнал биоинформатики и вычислительной биологии . 11 (5): 1350011. doi : 10.1142/S021972001350011X . ПМЦ 4529286 . ПМИД 24131055 .
- ^ Jump up to: а б Батлер, Дж. М. (2015). Продвинутые темы судебно-медицинского типирования ДНК: интерпретация . Эльзевир. .
- ^ Шварц, Х.; Гуттман, А. (1995). Разделение ДНК капиллярным электрофорезом . Бекман.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- PHPH — веб-инструмент для анализа качества электрофореграмм
- Систематические различия в высоте пиков электрофорограммы, сообщаемые разными версиями программного обеспечения GeneScan.
- DYS464 Расхождение интерпретации электрофорограммы с изображениями