Yaniv Erlich
Yaniv Erlich | |
|---|---|
Янив Эрлих | |
| Альма-матер | Школа биологических наук Уотсона |
| Научная карьера | |
| Поля | Геномика , Биоинформатика , Генетическая конфиденциальность , Краудсорсинг , |
| Учреждения | Колумбийский университет |
| Докторантура | Грег Хэннон |
| Веб-сайт | https://teamerlich.org/ |
Янив Эрлих — израильского происхождения американский учёный . Ранее он работал доцентом кафедры компьютерных наук в Колумбийском университете и был главным научным сотрудником MyHeritage . [ 1 ] Работа Эрлиха сочетает в себе информатику и геномику .
Биография
[ редактировать ]Эрлих родился в Израиле . Он получил степень бакалавра наук о мозге в 2006 году в Тель-Авивском университете и степень доктора биоинформатики в 2010 году в Школе биологических наук Уотсона в лаборатории Колд-Спринг-Харбор . С 2010 по 2015 год Эрлих был научным сотрудником Института Уайтхеда института Массачусетского технологического . С 2015 по 2019 год он возглавлял лабораторию в Колумбийском университете . вычислительной геномики [ 2 ] С 2020 года по настоящее время он занимает должность генерального директора Eleven Therapeutics. [ 3 ]
Научная работа
[ редактировать ]Краудсорсинг геномной информации
[ редактировать ]Команда Эрлиха опубликовала исследование в журнале Science , в котором сообщалось о краудсорсинге десятков миллионов генеалогических записей с сайта Geni.com . [ 4 ] Команде удалось создать единое генеалогическое древо 13 миллионов человек, которые связаны между собой и охватывают десятки поколений и более чем 600-летнюю историю. [ 5 ] В исследовании использовались данные для анализа генетики долголетия и семейной дисперсии. [ 6 ]
В другом направлении исследований Эрлих и Джо Пикрелл создали веб-сайт под названием DNA.Land для сбора наборов геномных данных участников потребительской геномики. [ 7 ] К ноябрю 2018 года на сайте было собрано более 130 000 наборов данных.
Генетическая конфиденциальность
[ редактировать ]Группа Эрлиха опубликовала несколько исследований на тему генетической конфиденциальности . В 2013 году они сообщили о возможности восстановить фамилию мужчины по его якобы анонимному набору геномных данных, что может привести к выяснению его полной личности. [ 8 ] Этот метод использует совместное наследование фамилий и Y-хромосом в большинстве обществ. Таким образом, сравнивая Y-хромосому интересующего человека с базами данных генетической генеалогии Y-хромосом, в некоторых случаях можно сделать вывод о фамилии. По оценкам команды, 12% мужчин в США могут успешно восстановить фамилию. Команда также продемонстрировала, что после восстановления фамилии основные демографические идентификаторы, такие как возраст и место проживания, могут позволить отследить личность человека. Чтобы продемонстрировать силу техники, они восстанавливают идентичность нескольких 1000 геномов путем вывода фамилий.
В 2014 году Эрлих и Арвинд Нараянан опубликовали обзор методов взлома наборов геномных данных. [ 9 ] Они предсказали, что аутосомный поиск в GEDmatch можно будет использовать для установления личности анонимных людей, как только база пользователей GEDmatch достигнет определенного размера, что действительно произошло в 2018 году, когда сайт использовался для поимки убийцы из Золотого штата .
В 2018 году команда Эрлиха опубликовала исследование в журнале Science, в котором сообщалось, что около 60% жителей США европейского происхождения имеют как минимум троюродного брата в GEDmatch, что теоретически может позволить их идентифицировать. [ 10 ] Через два-три года практически любого человека из этой этнической группы можно будет теоретически отследить с помощью этой методики, если нынешние темпы роста GEDmatch сохранятся. [ 11 ] Команда предложила метод криптографической подписи, чтобы снизить вероятность злоупотреблений, направленных непосредственно на потребительские веб-сайты, при обысках полиции.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Сайт лаборатории Эрлиха» .
- ^ «Спикеры TEDxDanubia» .
- ^ "О нас" . Одиннадцать Терапий . Проверено 16 апреля 2023 г.
- ^ Капланис, Джоанна; Гордон, Ассаф; Шор, Таль; Вайсброд, Омер; Гейгер, Дэн; Уол, Мэри; Гершовиц, Михаил; Маркус, Барак; Шейх, Мона; Гимрек, Мелисса; Бхатия, Гаурав; Макартур, Дэниел Г.; Прайс, Алкес Л.; Эрлих, Янив (2018). «Количественный анализ генеалогических древ в масштабе населения с миллионами родственников» . Наука . 360 (6385): 171–175. Бибкод : 2018Sci...360..171K . дои : 10.1126/science.aam9309 . ПМК 6593158 . ПМИД 29496957 .
- ^ «Краудсорсинг 600 лет истории человечества» . 13 марта 2018 г.
- ^ Хотц, Роберт Ли (март 2018 г.). «ВСЖ» . Уолл Стрит Джорнал .
- ^ «DNA.Land — это платформа для сбора геномов и феноменов в эпоху изобилия генетической информации» .
- ^ Гимрек, Мелисса; Макгуайр, Эми Л.; Голан, Дэвид; Гальперин, Эран; Эрлих, Янив (2013). «Идентификация личных геномов по фамилии» . Наука . 339 (6117): 321–324. Бибкод : 2013Sci...339..321G . дои : 10.1126/science.1229566 . ПМИД 23329047 . S2CID 3473659 .
- ^ Эрлих, Янив; Нарайанан, Арвинд (2014). «Пути нарушения и защиты генетической конфиденциальности» . Обзоры природы Генетика . 15 (6): 409–421. дои : 10.1038/nrg3723 . ПМЦ 4151119 . ПМИД 24805122 .
- ^ Эрлих, Янив; Шор, Таль; Пеэр, Ицик; Карми, Шай (2018). «Вывод идентичности геномных данных с использованием дальнего семейного поиска» . Наука . 362 (6415): 690–694. Бибкод : 2018Sci...362..690E . дои : 10.1126/science.aau4832 . ПМЦ 7549546 . ПМИД 30309907 .
- ^ Мерфи, Хизер (11 октября 2018 г.). «ДНК большинства белых американцев можно идентифицировать с помощью генеалогических баз данных» . Нью-Йорк Таймс .
| Базы данных авторитетного контроля : академики |
|---|
