Теория решений Кирквуда – Баффа
Теория решения Кирквуда-Баффа (KB) , разработанная Джоном Г. Кирквудом и Фрэнком П. Баффом , связывает макроскопические (объемные) свойства с микроскопическими (молекулярными) деталями. Используя статистическую механику , теория КБ выводит термодинамические величины из парных корреляционных функций между всеми молекулами в многокомпонентном растворе. [ 1 ] Теория КБ оказывается ценным инструментом для проверки молекулярного моделирования, а также для объяснения механизмов, лежащих в основе различных физических процессов, с молекулярным разрешением. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Например, он имеет множество применений в биологически важных системах. [ 5 ]
Возможен и обратный процесс; Так называемая обратная теория Кирквуда-Баффа (reverse-KB), созданная Арье Бен-Наимом , выводит молекулярные детали на основе термодинамических (объемных) измерений. Это достижение позволяет использовать формализм КБ для формулирования прогнозов относительно микроскопических свойств на основе макроскопической информации. [ 6 ] [ 7 ]
Функция радиального распределения
[ редактировать ]Функция радиального распределения (RDF), также называемая парной функцией распределения или парной корреляционной функцией, является мерой локальной структурированности смеси. RDF между компонентами и расположен на и соответственно определяется как:
где - локальная плотность компонента относительно компонента , количество плотность компонента в массе и – межчастичный радиус-вектор. Из этого также обязательно следует, что:
Предполагая сферическую симметрию , RDF сводится к:
где — расстояние между частицами.
В некоторых случаях полезно количественно оценить межмолекулярные корреляции через свободную энергию. В частности, RDF связана с потенциалом средней силы (PMF) между двумя компонентами следующим образом:
где PMF по сути является мерой эффективного взаимодействия между двумя компонентами раствора.
Интегралы Кирквуда–Баффа.
[ редактировать ]Интеграл Кирквуда – Баффа (KBI) между компонентами и определяется как пространственный интеграл по парной корреляционной функции:
что в случае сферической симметрии сводится к:
KBI, имеющий единицы объема на молекулу, количественно определяет избыток (или недостаток) частиц. вокруг частицы .
Вывод термодинамических величин
[ редактировать ]Двухкомпонентная система
[ редактировать ]Для двухкомпонентной смеси можно вывести различные термодинамические соотношения в терминах соответствующего KBI ( , , и ).
Парциальный мольный объем компонента 1 составляет: [ 1 ]
где - молярная концентрация и, естественно,
Сжимаемость, , удовлетворяет:
где – постоянная Больцмана и это температура.
Производная осмотического давления , , по концентрации компонента 2: [ 1 ]
где – химический потенциал компонента 1.
Производные химических потенциалов по концентрациям при постоянной температуре ( ) и давление ( ) являются:
или, альтернативно, относительно мольной доли:
Коэффициент предпочтительного взаимодействия
[ редактировать ]Относительное предпочтение молекулярной разновидности сольватировать (взаимодействовать) с другой молекулярной разновидностью количественно оценивается с использованием коэффициента предпочтительного взаимодействия: . [ 8 ] Давайте рассмотрим раствор, который состоит из растворителя (воды), растворенного вещества и сорастворителя. Относительное (эффективное) взаимодействие воды с растворенным веществом связано с коэффициентом преимущественной гидратации: , что является положительным, если растворенное вещество «предпочтительно гидратировано». В рамках теории Кирквуда-Баффа и в режиме низкой концентрации сопутствующих веществ коэффициент предпочтительной гидратации равен: [ 9 ]
где — молярность воды, а W, S и C соответствуют воде, растворенному и сорастворенному веществу соответственно.
В наиболее общем случае предпочтительная гидратация является функцией KBI растворенного вещества как с растворителем, так и с сорастворением. Однако при очень простых предположениях [ 10 ] и во многих практических примерах [ 11 ] это сводится к:
Таким образом, единственной функцией релевантности является .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Кирквуд, Дж. Г.; Бафф, ФП. (1951). «Статистическая механическая теория решений. I». Дж. Хим. Физ . 19 (6): 774–777. Бибкод : 1951ЖЧФ..19..774К . дои : 10.1063/1.1748352 .
- ^ Ньюман, К.Э. (1994). «Теория решений Кирквуда – Баффа: вывод и приложения». хим. Соц. Преподобный . 23 : 31–40. дои : 10.1039/CS9942300031 .
- ^ Харрис, Д; Рёсген, Дж. (2008). «Практическое руководство о том, как осмолиты модулируют свойства макромолекул». Биофизические инструменты для биологов: Том 1, методы in vitro . Методы клеточной биологии. Том. 84. Elsevier Academic Press Inc., стр. 679–735. дои : 10.1016/S0091-679X(07)84022-2 . ISBN 9780123725202 . ПМИД 17964947 .
- ^ Вирасингхе, С.; Бэ Джи, М.; Канг, М.; Бентенит, Н.; Смит, ЧП (2010). «Развитие силовых полей на основе микроскопической структуры растворов: подход Кирквуда – Баффа». Моделирование среды растворителей: приложения к моделированию биомолекул . Вайли-ВЧ. стр. 55–76. дои : 10.1002/9783527629251.ch3 . ISBN 9783527629251 .
- ^ Пирс, В.; Канг, М.; Абури, М.; Вирасингхе, С.; Смит, ЧП (2008). «Недавние применения теории Кирквуда-Баффа к биологическим системам» . Клеточная биохимия Биофиз . 50 (1): 1–22. дои : 10.1007/s12013-007-9005-0 . ПМЦ 2566781 . ПМИД 18043873 .
- ^ Бен-Наим, А. (1977). «Обращение теории растворов Кирквуда – Баффа: применение к системе вода-этанол». Дж. Хим. Физ . 67 (11): 4884–4890. Бибкод : 1977JChPh..67.4884B . дои : 10.1063/1.434669 .
- ^ Смит, ЧП (2008). «О процедуре инверсии Кирквуда – Баффа» . Дж. Хим. Физ . 129 (12): 124509. Бибкод : 2008JChPh.129l4509S . дои : 10.1063/1.2982171 . ПМЦ 2671658 . ПМИД 19045038 .
- ^ Парсегян, В.А. (2002). Белково-водные взаимодействия . Международный обзор цитологии. Том. 215. стр. 1–31. дои : 10.1016/S0074-7696(02)15003-0 . ISBN 9780123646194 . ПМИД 11952225 .
{{cite book}}
:|journal=
игнорируется ( помогите ) - ^ Шульгин, И; Рукенштейн, Э. (2005). «Молекулы белка в водном смешанном растворителе: взгляд на теорию флуктуаций» . Дж. Хим. Физ . 123 (21): 054909. Бибкод : 2005JChPh.123e4909S . дои : 10.1063/1.2011388 . ПМИД 16108695 .
- ^ Сапир, Л; Харрис, Д. (2015). «Является ли сила истощения энтропийной? Молекулярное скопление за пределами стерических взаимодействий». Курс. Мнение. Коллоидный интерфейс . 20 : 3–10. дои : 10.1016/j.cocis.2014.12.003 .
- ^ Симидзу, С; Матубаяси, Н. (2014). «Предпочтительная сольватация: разделительная поверхность против избыточных чисел». Дж. Физ. хим. Б. 118 (14): 3922–3930. дои : 10.1021/jp410567c . ПМИД 24689966 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Бен-Наим, А. (2009). Молекулярная теория воды и водных растворов, Часть I: Понимание воды . Всемирная научная. п. 629. ИСБН 9789812837608 .
- Рукенштейн, Э.; Шульгин, ИЛ. (2009). Термодинамика растворов: от газов к фармацевтике и белкам . Спрингер. п. 346. ИСБН 9781441904393 .
- Линерт, В. (2002). Основные моменты взаимодействия растворенного вещества и растворителя . Спрингер. п. 222. ИСБН 978-3-7091-6151-7 .