Натуральные шарики
| Натуральные шарики | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Архея |
| Королевство: | Эвриархеота |
| Сорт: | Галобактерии |
| Заказ: | Натуральные шарики Гупта и др. 2015 год |
| Род [ 1 ] | |
| |
Natrialbales порядок галофильных хемоорганотрофных . архей класса Haloarchaea — [ 2 ] Типовой род этого отряда — Natrialba . [ 1 ]
Название Natrialbales происходит от латинского термина Natriabla, обозначающего типовой род отряда, и суффикса «-ales», окончания, используемого для обозначения отряда. В совокупности Natrialbales относится к отряду, номенклатурным типом которого является род Natrialba.
Биохимические характеристики и молекулярные подписи [ 2 ]
[ редактировать ]Члены являются галофильными хемоорганотрофами и в основном изолированы из среды с высоким содержанием соли, такой как соленые озера, содовые озера и соленые шкуры. Некоторые члены подвижны. Морфология разнообразна, включая палочки, кокки или плеоморфные формы. Большинство представителей этого класса способны оптимально расти при щелочном pH и не содержат газовых пузырьков. Содержание G+C ДНК этого порядка колеблется в пределах 60-70 мол.%.
Этот порядок можно надежно отличить от других порядков внутри типа Euryarchaeota по наличию восьми консервативных сигнатурных белков (CSP) и двух консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в белке рибосомного оперона и небольшом GTP-связывающем белке . [ 2 ]
Историческая систематика и таксономия
[ редактировать ]По состоянию на 2021 год Natrialbales включает одно семейство Natrialbaceae . [ 1 ] Члены этого отряда были выделены из класса Halobacteria, ранее представлявшего собой большую филогенетически неродственную группу видов с отчетливыми биохимическими характеристиками и разными экологическими нишами. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Филогенетические деревья и морфологические/физиологические характеристики, основанные на 16S рРНК, оказались недостаточными для выяснения эволюционных взаимоотношений выше уровня рода внутри класса Halobacteria.
В 2015 году Гупта и др. предложил разделение класса Halobacteria на Halobacteriales , Haloferacales и Natrialbales на основе сравнительного геномного анализа и структуры ветвления различных филогенетических деревьев, построенных на основе нескольких различных наборов данных консервативных белков и последовательностей 16S рРНК. [ 2 ] Молекулярные маркеры, особенно консервативные сигнатурные индели , специфичные для этого отряда, также были идентифицированы как свидетельства, подтверждающие разделение, независимое от филогенетических деревьев. [ 2 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 6 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [ 7 ]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] | 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Примечание: * парафилетические Halobacteriaceae.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Орден: Натриалбалы» . lpsn.dsmz.de. Проверено 12 июля 2022 г.
- ^ Jump up to: а б с д и Гупта, Рэдхи С.; Наушад, Сохаил; Бейкер, Шеридан (01 марта 2015 г.). «Филогеномный анализ и молекулярные признаки класса Halobacteria и двух его основных клад: предложение о разделении класса Halobacteria на исправленный порядок Halobacteriales и два новых порядка: Haloferacales ord. nov. и Natrialbales ord. nov Haloferaceae nov. . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (Pt_3): 1050–1069. дои : 10.1099/ ijs.0.070136-0 ISSN 1466-5026 . ПМИД 25428416 .
- ^ Хирш, Питер (2005), «Dichotomicrobium Hirsch and Hoffman 1989b, 495VP (Эффективная публикация: Hirsch and Hoffman 1989a, 300)» , Руководство Берджи® по систематической бактериологии , Нью-Йорк: Springer-Verlag, стр. 513–518, doi : 10.1007/0-387-29298-5_124 , ISBN 0-387-24145-0 , получено 27 июня 2021 г.
- ^ Грант, Уильям Д.; Камекура, Масахиро; МакДженити, Терри Дж.; Вентоза, Антонио (14 сентября 2015 г.). «Класс галобактерий. ноябрь» . Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .
- ^ Орен, Аарон (01 февраля 2012 г.). «Таксономия семейства Halobacteriaceae: парадигма изменения концепций в систематике прокариот» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (2): 263–271. дои : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 22155757 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Натриалбалес» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Натриалбалес» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2022 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.