Натринемема

Натринемема
Научная классификация
Домен:	Археи
Королевство:	Erycharchaet
Филум:	Erycharchaet
Сорт:	Halobacteria
Заказ:	Натриевыебалы
Семья:	Натриебасей
Род:	Натринемема ; McGedity et al. 1998
Тип видов
	Натринемема Пеллирубрум ; McGedity et al. 1998
Разновидность
	" N. amidingensis " ; " N. ajinwuensis " ; Н. Алтуненс ; Н. Амилолитикам ; " N. caseinilyticum " ; Н. Эджинорэнс ; Н. Гари ; " N. gelatinilyticum " ; N. Halophilum ; Н. испанский ; Северный ; Н. Лонг ; Н. Махии ; " Н. Марин " ; Н. Паллид ; Н. Пеллирубрум ; Н. Сакхаревитаны ; Н. Салация ; N. Salifodinae ; Н. Салинизоли ; Н. Колбаса ; Н. Соло ; Н. Термотолераны ; Н. Версия ; " Н. Синьцзян " ; " N. Zhouii " ;

Natrinema (общая аббревиатура . Является род Natrialbaceae ) NNM ^{[ 2 ]}

Таксономия

опубликовано 18 видов По состоянию на 2022 год в роде Natrinema . ^{[ 1 ]}

Natrinema связан с родом Haloterrigena , созданным в 1999 году, что приводит к путанице в отношении пределов таксонов, и несколько видов, по -видимому, назначают неверному роду. ^{[ 3 ]} Основываясь на филогеномическом анализе, восемь видов из галотерригены , а также Halopiger Salifodinae были перенесены в Natrinema в 2022 году. ^{[ 4 ]}

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) ^{[ 1 ]} и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). ^{[ 2 ]}

16S RRNA на основе LTP _08_2023 ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

53 маркерные белки на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

	Гало

	Halostagnicola

Натринемема 2

	N. Soli Rasoli et al. 2017

	" N. Zhouii " Hu et al. 2023

Н. Салация

	Н. Эджинорэнс

	N. Longum (Cui et al. 2006) Haba et al. 2022

Натринема 3

	Н. испанский

	Северный

Галотерридена

Натринема 4

" N. Marine " Hu et al. 2023

N. Halophilum

	" N. caseinilyticum " Hu et al. 2023

	" N. gelatinilyticum " Hu et al. 2023

Натринемема

Н. Амилолитикам

	Н. Салинизоли

	N. колбаса Straková et al. 2023

Н. Версия

Н. Гари

	Н. Алтуненс

	Н. Паллид

Н. Пеллирубрум

	Haloterrigena Jeotgali

	Н. Термотолераны

	Н. Махии

	Н. Сакхаревитаны

Натринемема

N. Salifodinae (Zhang et al. 2013) Haba et al. 2022

N. Hallophilum Bao и Al. 2022

	N. Hispanicum (Romano et al. 2007) Haba et al. 2022

	№ Limicchola (Whee et al. 2006) Rinke et al. 2020

	N. Mahii (Ding et al. 2017) Haba et al. 2022

	N. Sacchareasans (Xu et al. 2005) Rinke et al. 2020

	N. Pellirubrum McGedity et al. 1998

	N. thermotolerans (Montalvo-Rodrguez et al. 2000) Rinke et al. 2020

N. Salace Albuquerque et al. 2012

	N. Ejinorense Castillo et al. 2006

	N. Salinisoli Bao et al. 2022

N. Versiforme Xin et al. 2000

N. Amylolyticum Bao et al. 2022

N. Gari Tapingkae et al. 2008

	N. Altunense Xu et al. 2005

	N. Pallidum McGedity et al. 1998

ПРИМЕЧАНИЕ: Недоцененный Натринемема

" N. amidingensis " Liu et al. 2003a
" N. ajinwuensis " Mahansaria et al. 2018
" N. xinjiang " Habdin & Tohty 2005
" N. Zhouii " Hu et al. 2023

Смотрите также

Список родов археи

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в JP Euzéby. "Натринемема" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2023-10-10 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Sayers; и др. "Натринемема" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2023-10-10 .
^ Tindall, BJ (2003). «Таксономические проблемы, возникающие в родах Haloterrigena и Natrinema». Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 53 (Pt 5): 1697–1698. Опубликовано онлайн 28 февраля 2003 г. DOI : 10.1099/ijs.0.02529-0 . PMID 13130070 .
^ де ла Хаба, Рафаэль; Minegishi, Hiroak; Камекура, Масахиро; Shimane, Yasuhiro; Ventosa, Антонио (2021). споры родов Natrinema - Haloterrererigena " Филогеномика Haloarchaea : Границы в микробиологии 12 : 740909. DOI : 10.3389/ fmicb.2021.740909 PMC 8530250 PMID 34690986
^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

Дальнейшее чтение

Научные журналы

Синь H; Itoh t; Чжоу П; Suzuki k; и др. (2000). «Natrinema Versiforme Sp. Nov., Чрезвычайно галофильный археон из Айби Солт -Лейк, Синьцзян, Китай» . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 50 (3): 1297–1303. doi : 10.1099/00207713-50-3-1297 . PMID 10843075 .
Орен А; Ventosa A (2000). «Международный комитет по систематической бактериологии подкомитет по таксономии Halobacteriaceae. Протокол заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия» . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 50 (3): 1405–1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .
McGedity TJ; Gemmell RT; Грант WD (1998). «Предложение нового галобактериального рода Natrinema Gen. Nov., С двумя видами Natrinema pellirubrum nom. Nov. И Natrinema pallidum nom. Nov» . Инт. J. Syst. Бактериол . 48 (4): 1187–1196. doi : 10.1099/00207713-48-4-1187 . PMID 9828420 .
Фэн, Цзе; Ван, Цзянь; Du, Синь; Тан, Вэй; и др. (Март 2014). «Протеомный анализ секретома галоархиона Natrinema sp. J7-2» . Журнал исследований протеома . 13 (3): 1248–1258. doi : 10.1021/pr400728x . PMID 24512091 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}

Научные книги

Gibbons, NE (1974). «Семья В. Halobacteriaceae Fam. Nov.». В Ре -Бьюкенен; Ne gibbons (ред.). Руководство Берджи по определению бактериологии (8 -е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins Co.

Эта статья, связанная с археей, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[LPSN-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в JP Euzéby. "Натринемема" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2023-10-10 .

[NCBI-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Sayers; и др. "Натринемема" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2023-10-10 .

[3] Tindall, BJ (2003). «Таксономические проблемы, возникающие в родах Haloterrigena и Natrinema». Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 53 (Pt 5): 1697–1698. Опубликовано онлайн 28 февраля 2003 г. DOI : 10.1099/ijs.0.02529-0 . PMID 13130070 .

[4] де ла Хаба, Рафаэль; Minegishi, Hiroak; Камекура, Масахиро; Shimane, Yasuhiro; Ventosa, Антонио (2021). споры родов Natrinema - Haloterrererigena " Филогеномика Haloarchaea : Границы в микробиологии 12 : 740909. DOI : 10.3389/ fmicb.2021.740909 PMC 8530250 PMID 34690986

[LTP-5] "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .

[6] «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .

[7] «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .

[about-8] "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[tree-9] "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[taxon_history-10] «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]