Сьюзан Дж. Кларк

Сьюзан Джей Кларк
Сьюзан Джей Кларк
Образование	Награды: Австралийский национальный университет, 1978 г. Доктор философии: Университет Аделаиды, 1982 г.
Занятие	Ученый
Заголовок	Профессор
Веб-сайт	https://www.garvan.org.au/people/researchers/susan-clark

Профессор Сьюзен Дж. Кларк FAA FAHMS — австралийский биомедицинский исследователь в области эпигенетики развития и рака. она была избрана членом Австралийской академии наук . В 2015 году ^{[ 1 ]} является старшим научным сотрудником Национального совета по здравоохранению и медицинским исследованиям (NHMRC), директором по исследованиям и главой отдела геномики и эпигенетики в Институте медицинских исследований Гарвана . ^{[ 2 ]} Кларк разработал первый метод бисульфитного секвенирования. ^{[ 3 ]} для анализа метилирования ДНК и использовал его, чтобы установить, что механизм метилирования клеток млекопитающих способен как к поддержанию, так и к метилированию de novo в сайтах CpNpG, и показал, что он наследуется. ^{[ 4 ]} Исследования Кларка продвинули понимание роли метилирования ДНК , некодирующих РНК и микроРНК в эмбриогенезе, перепрограммировании, развитии стволовых клеток и раке, а также привели к идентификации эпигеномных биомаркеров рака. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Кларк является одним из основателей Международного консорциума эпигенома человека (IHEC) и президентом Австралийского эпигенетического альянса (AEpiA) . ^{[ 7 ]}

Образование и значимость исследований

Кларк получила степень бакалавра наук (1-й класс с отличием) в Австралийском национальном университете , Австралийский национальный университет, Австралия, в 1978 году под руководством доктора Кена Рида и доктора Линн Далгарно (которые вместе с доктором Джоном Шайном раскрыли последовательность Шайн-Далгарно ). Она получила докторскую степень (1982) по биохимии в Университете Аделаиды , Южная Австралия, за картирование и секвенирование человека генов гистонов под руководством доктора Джулиана Уэллса. В течение своих постдокторских лет (1983-1988) в биотехнологии Австралии Кларк руководила исследованиями по разработке первой рекомбинантной вакцины в Австралии и эукариотических экспрессии генов человеческого ингибина , IL-3 и GM-CSF .

Будучи руководителем группы отдела регуляции генов в лабораториях Канемацу, Королевской больнице принца Альфреда с 1992 по 2000 год, Кларк разработал высокочувствительные методы, которые позволили секвенировать метилирование ДНК отдельных генов в небольших объемах (<100 клеток) с использованием бисульфита натрия , который преобразует цитозин. остатки к остаткам урацила в одноцепочечной ДНК в условиях, сохраняющих 5-метилцитозин .

В 2000 году Кларк основала группу эпигенетики в Сиднейском онкологическом центре Королевской больницы принца Альфреда и руководила этим отделением до 2004 года. Затем она основала программу эпигенетических исследований в отделении онкологических исследований и в перенесенном Институте медицинских исследований Гарвана и была назначена первый руководитель отдела геномики и эпигенетики в 2015 году. Кларк опубликовал более 650 рукописей, которые способствовали появлению совершенно новой дисциплины. рака эпигеномики .

Признание и награды

2020 г. – член Австралийской академии здравоохранения и медицинских наук. ^{[ 8 ]}
2019 - Премия премьер-министра Нового Южного Уэльса за «Выдающиеся достижения в области медико-биологических наук (клеточные и молекулярные, медицинские, ветеринарные и генетика)». ^{[ 9 ]}
2017 – Фонд Клайва и Веры Рамачиотти: Медаль за выдающиеся достижения 2017 года (50 тысяч долларов) ^{[ 10 ]}
2015 – Роб Сазерленд меняет ситуацию (20 тысяч долларов), Институт рака Нового Южного Уэльса ^{[ 11 ]}
2015 – Премия Надин Уотсон за лекцию ведущему учёному-женщине
2012 – Премия Ротари за профессиональное мастерство ^{[ 12 ]}
2011 - Медаль Виктора Чанга (лектор серии семинаров Барбары Элл)
2010 – Заслуга науке и промышленности, North Shore Times, медаль за 50 лет.
2009 - Премия австралийских ученых «Десять лучших» (NHMRC) за 2009 год. ^{[ 13 ]}
2008 - Премия директора за первую лекцию «Женщины в науке» (WEHI)
2006 г. - Всемирная технологическая премия, финалист 2006 г. в категории «Биотехнологии»: самые инновационные люди в мире науки и технологий в 2006 г.
2006 г. - избран членом Всемирной технологической сети биотехнологий за вклад в эпигенетические технологии.
2004 - Премия Руби Пейн-Скотт женщинам в австралийской науке.
2004 г. - Немецкая научная премия «Biochemisch Analytik Preis» (50 000 евро) за выдающийся вклад в анализ метилирования. С 1970 года этой наградой признаются работы 27 ученых, четверо из которых впоследствии стали лауреатами Нобелевской премии.
2003 - Медаль Джулиана Уэллса за «выдающийся вклад в действие генов и структуру генома», конференция Lorne Genome.

Избранные публикации

Чен, В., Цзэн, Ю.К., Ачингер-Кавецка, Дж., Кэмпбелл, Э., Джонс, А.К., Стюарт, А.Г., ... и Кларк, С.Дж. (2024). Машинное обучение позволяет идентифицировать «горячие точки» мутаций в постоянных сайтах связывания CTCF. Исследование нуклеиновых кислот , gkae530. https://doi.org/10.1093/nar/gkae530
Читти, Дж.Л., Ям, М., Перриман, Л., Паркер, А.Л., Схинас, Дж.Н., Сетарджью, Ю.Ф., ... и Кокс, Т.Р. (2023). Первый в своем классе ингибитор пан-лизилоксидазы нарушает ремоделирование стромы и повышает реакцию на гемцитабин и выживаемость при раке поджелудочной железы. Природа Рака , 4 (9), 1326–1344. https://doi.org/10.1038/s43018-023-00614-y
Пидсли Р., Зотенко Э., Питерс Т.Дж., Лоуренс М.Г., Рисбриджер Г.П., Моллой П., ... и Кларк С.Дж. (2016). Критическая оценка микрочипа Illumina MmethylationEPIC BeadChip для профилирования полногеномного метилирования ДНК. Геномная биология , 17 , 1-17. https://doi.org/10.1186/s13059-016-1066-1
Питерс, Т.Дж., Бакли, М.Дж., Стэтхэм, А.Л., Пидсли, Р., Самарас, К., В. Лорд, Р., ... и Моллой, П.Л. (2015). Идентификация de novo дифференциально метилированных участков в геноме человека. Эпигенетика и хроматин , 8 , 1-16. https://doi.org/10.1186/1756-8935-8-6
Ван Дейк, С.Дж., Моллой, П.Л., Варинли, Х., Моррисон, Дж.Л., и Мюльхауслер, Б.С. (2015). Эпигенетика и ожирение человека. Международный журнал ожирения , 39 (1), 85-97. https://doi.org/10.1038/ijo.2014.34
Виклунд, Э.Д., Брамсен, Дж.Б., Хульф, Т., Дирскьот, Л., Раманатан, Р., Хансен, ТБ, ... и Кларк, С.Дж. (2011). Скоординированная эпигенетическая репрессия семейства миР-200 и миР-205 при инвазивном раке мочевого пузыря. Международный журнал рака , 128 (6), 1327-1334. https://doi.org/10.1002/ijc.25461
Сьюзан Дж. К., Харрисон Дж., Пол С. Л. и Фроммер М. (1994). Высокочувствительное картирование метилированных цитозинов. Исследования нуклеиновых кислот , 22 (15), 2990-2997. https://doi.org/10.1093/nar/22.15.2990

Ссылки

^ Австралийская академия наук (2024 г.). «Австралийская академия наук: Сьюзан Кларк» .
^ «Профессор Сьюзен Кларк» . Гарванский институт медицинских исследований .
^ Сьюзен, Дж. Сиарк; Харрисон, Джанет; Пол, Шерил Л.; Фроммер, Марианна (1994). «Высокочувствительное картирование метилированных цитозинов» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (15): 2990–2997. дои : 10.1093/нар/22.15.2990 . ISSN 0305-1048 . ПМК 310266 . ПМИД 8065911 .
^ Кларк, Сьюзен Дж.; Харрисон, Джанет; Фроммер, Марианна (май 1995 г.). «Метилирование CpNpG в клетках млекопитающих». Природная генетика . 10 (1): 20–27. дои : 10.1038/ng0595-20 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 7647784 . S2CID 8857760 .
^ «Гормональная резистентность при раке молочной железы связана с «перемонтировкой» ДНК » . ScienceDaily . Проверено 22 февраля 2021 г.
^ «Команда CNIO разрабатывает технологию повышения эффективности стволовых клеток в регенеративной медицине» . ЭврекАлерт! . Проверено 22 февраля 2021 г.
^ «Комитет AEpiA | Австралийский эпигенетический альянс» .
^ «Академия выбирает 28 новых членов» . AAHMS — Австралийская академия здравоохранения и медицинских наук . 14 октября 2020 г. Проверено 8 декабря 2020 г.
^ «Победители в категории 2019 года — главный научный сотрудник и инженер Нового Южного Уэльса» . www.chiefscientist.nsw.gov.au . Проверено 30 октября 2019 г.
^ Вечный (2024). «Награды и лауреаты Рамакотти» .
^ Здоровье Нового Южного Уэльса (2015). «Научно-исследовательская премия 2015» .
^ Фонд Ротари (2024 г.). «Доска почета 1982-2013» .
^ НХМРК (2009). «10 лучших научных проектов 2009 года» .

[1] Австралийская академия наук (2024 г.). «Австралийская академия наук: Сьюзан Кларк» .

[2] «Профессор Сьюзен Кларк» . Гарванский институт медицинских исследований .

[3] Сьюзен, Дж. Сиарк; Харрисон, Джанет; Пол, Шерил Л.; Фроммер, Марианна (1994). «Высокочувствительное картирование метилированных цитозинов» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (15): 2990–2997. дои : 10.1093/нар/22.15.2990 . ISSN 0305-1048 . ПМК 310266 . ПМИД 8065911 .

[4] Кларк, Сьюзен Дж.; Харрисон, Джанет; Фроммер, Марианна (май 1995 г.). «Метилирование CpNpG в клетках млекопитающих». Природная генетика . 10 (1): 20–27. дои : 10.1038/ng0595-20 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 7647784 . S2CID 8857760 .

[5] «Гормональная резистентность при раке молочной железы связана с «перемонтировкой» ДНК » . ScienceDaily . Проверено 22 февраля 2021 г.

[6] «Команда CNIO разрабатывает технологию повышения эффективности стволовых клеток в регенеративной медицине» . ЭврекАлерт! . Проверено 22 февраля 2021 г.

[7] «Комитет AEpiA | Австралийский эпигенетический альянс» .

[8] «Академия выбирает 28 новых членов» . AAHMS — Австралийская академия здравоохранения и медицинских наук . 14 октября 2020 г. Проверено 8 декабря 2020 г.

[9] «Победители в категории 2019 года — главный научный сотрудник и инженер Нового Южного Уэльса» . www.chiefscientist.nsw.gov.au . Проверено 30 октября 2019 г.

[10] Вечный (2024). «Награды и лауреаты Рамакотти» .

[11] Здоровье Нового Южного Уэльса (2015). «Научно-исследовательская премия 2015» .

[12] Фонд Ротари (2024 г.). «Доска почета 1982-2013» .

[13] НХМРК (2009). «10 лучших научных проектов 2009 года» .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]