Паста домен
| Паста домен | |||
|---|---|---|---|
 Мультипликационное представление пасты домена из Staphylococcus aureus. Вход PDB 3M9G | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Паста | ||
| Pfam | PF03793 | ||
| InterPro | IPR005543 | ||
| УМНЫЙ | Паста | ||
| PROSITE | PDOC51178 | ||
| Краткое содержание | 1rp5 / scope / supfam | ||
| CDD | CD06573 | ||
| |||
Домен пасты представляет собой небольшой белковый домен , который может связываться с бета-лактамной частью различных β-лактамных антибиотиков . [ 1 ] Домен был первоначально обнаружен в 2002 году Йейтсом и его коллегами в качестве области сходства последовательностей, обнаруженной в белках, связывающих пенициллин , и PKNB-подобных киназах, обнаруженных в некоторых бактериях. Название - аббревиатура, полученная из BP и Serine P / T Hreonininine -Kinase SSociated Domain.
Структура
[ редактировать ]Домен пасты принимает структуру, состоящую из альфа-спирали, за которой следуют три бета-пряди . Недавние структурные исследования показывают, что внеклеточная область PKNB ( протеинкиназа B ), которая состоит из четырех пасты, показывает линейное расположение доменов. [ 2 ]
Виды распределение
[ редактировать ]Домены пасты обнаруживаются у различных видов бактерий, включая грамположительные Bacillota и Actinomycetota .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Йейтс С, Финн Р.Д., Бейтман А (сентябрь 2002 г.). «Домен пасты: бета-лактам-связывающий домен». Тенденции Biochem. Наука 27 (9): 438–440. doi : 10.1016/s0968-0004 (02) 02164-3 . PMID 12217513 .
- ^ Barthe P, Mukamolova GV, Roumestand C, Cohen-Gonsaud M (май 2010 г.). «Структура внеклеточного домена пасты PKNB из Mycobacterium tuberculosis предполагает лиганд-зависимую активацию киназы» . Структура 18 (5): 606–15. doi : 10.1016/j.str.2010.02.013 . PMID 20462494 .