Метилоцелла сильвестрис

Метилоцелла сильвестрис
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Альфапротеобактерии
Заказ:	Гифомикробиалы
Семья:	Бейеринкиевые
Род:	Метилоцелла
Разновидность:	М. сильвестрис
Биномиальное имя
	Метилоцелла сильвестрис ; Данфилд и др., 2003 г.

Mmethylocella silvestris — бактерия рода Mmethylocella spp , которая встречается во многих кислых почвах и водно-болотных угодьях. ^{[ 1 ]} Исторически Mmethylocella silvestris кислых лесных почв в Германии и описана как грамотрицательный , аэробный, непигментированный, неподвижный , палочковидный и метанокисляющий факультативный была первоначально выделена из метанотроф . ^{[ 2 ]} Как аэробные метанотрофные бактерии, виды Mmethylocella используют метан (CH ₄ ) и метанол в качестве основного источника углерода и энергии, а также мультисоединения ацетат, пируват, сукцинат, малат и этанол. ^{[ 3 ]} Известно, что они выживали при температуре от 4° до 30°С с оптимальной температурой от 15° до 25°С, но не более 36°С. Они лучше растут в диапазоне pH от 4,5 до 7,0. ^{[ 1 ]} У него отсутствуют интрацитоплазматические мембраны, общие для всех метанокисляющих бактерий, за исключением метилоцелл , но имеется везикулярная мембранная система, соединенная с цитоплазматической мембраной . БЛ2 ^Т (=DSM 15510 ^Т=NCIMB 13906 ^Т) — типовой штамм.

Филогенетический

Данфилд и др. отметили, что Mmethylocella silvestris тесно связана с Mmethylocella palustris K. ^Т, Beijerinckia indica ATCC 9039 и Mmethylocapsa acipihila B2. ^Т с точки зрения филогенетики, что позволяет M. silvestris классифицироваться как метанотроф типа II, который использует сериновый цикл для ассимиляции углерода, но не имеет растворимой метанмонооксигеназы (sMMO) и пропанмонооксигеназы (PrMO). ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]}

Геном

Геном Mmethylocella silvestris секвенирован. Mmethylocella silvestris содержит восемь генов, которые могут кодировать NAD(P)-зависимые алкогольдегидрогеназы (ADH), содержащую пирролохинолинхинон (PQQ) метанолдегидрогеназу (Msil_0471) и PQQ-содержащую ADH с 73% идентичностью xoxF из Mutilobacterium extorquens (Msil_1587). . ^{[ 4 ]} Чен и др. заявили в своей статье, что размер генома составляет 4,3 Мб и имеет сходство с протеобактериями. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Данфилд П.Ф., Хмеленина В.Н., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А., Дедыш С.Н. (сентябрь 2003 г.). «Mmethylocella silvestris sp. nov., новый метанотроф, выделенный из кислого лесного камбисола» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (Часть 5): 1231–1239. дои : 10.1099/ijs.0.02481-0 . ПМИД 13130000 . Проверено 25 июля 2013 г.
^ Jump up to: ^а ^б Чен Ю., Кромби А., Рахман М.Т., Дедыш С.Н., Лисак В., Стотт М.Б. и др. (июль 2010 г.). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Mmethylocella silvestris BL2» . Журнал бактериологии . 192 (14): 3840–1. дои : 10.1128/JB.00506-10 . ПМЦ 2897342 . ПМИД 20472789 .
^ Дедыш Светлана Н.; Книф, Клаудия; Данфилд, Питер Ф. (1 июля 2005 г.). «Виды метилоцелл факультативно метанотрофны» . Журнал бактериологии . 187 (13): 4665–4670. дои : 10.1128/JB.187.13.4665-4670.2005 . ISSN 0021-9193 . ПМЦ 1151763 . ПМИД 15968078 .
^ Jump up to: ^а ^б Бордель, Серджио; Кромби, Эндрю Т.; Муньос, Рауль; Мюррелл, Дж. Колин (16 июля 2020 г.). «Метаболическая модель генома универсального метанотрофа Mmethylocella silvestris» . Заводы по производству микробных клеток . 19 (1): 144. дои : 10.1186/s12934-020-01395-0 . ISSN 1475-2859 . ПМЦ 7364539 . ПМИД 32677952 .

Дальнейшее чтение

Вос П.В., Бреннер Д.Д., Стейли Дж.Т., Бун Д.Р., Гаррити Г.М., Гудфеллоу М., Криг Н.Р., Рейни Ф.А., Шлейфер К.Х. (2005). Руководство Бергиса? Систематической бактериологии, том второй. Протеобактерии. Часть C. Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии . Бостон, Массачусетс: Bergeys Manual Trust. ISBN 0-387-29298-5 .
Дедыш С.Н., Книф С., Данфилд П.Ф. (июль 2005 г.). «Виды метилоцелл факультативно метанотрофны» . Журнал бактериологии . 187 (13): 4665–70. дои : 10.1128/JB.187.13.4665-4670.2005 . ПМЦ 1151763 . ПМИД 15968078 .
Рахман М.Т., Кромби А., Муссар Х., Чен Ю., Мюррел Дж.К. (июнь 2011 г.). «Ацетатное подавление окисления метана с помощью добавок Mmethylocella silvestris в микрокосме торфяной почвы» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (12): 4234–6. дои : 10.1128/АЕМ.02902-10 . ПМК 3131658 . ПМИД 21515721 .
Тайзен А.Р., Али М.Х., Радаевски С., Дюмон М.Г., Данфилд П.Ф., Макдональд И.Р. и др. (ноябрь 2005 г.). «Регуляция окисления метана у факультативного метанотрофа Mmethylocella silvestris BL2» . Молекулярная микробиология . 58 (3): 682–92. дои : 10.1111/j.1365-2958.2005.04861.x . ПМИД 16238619 . S2CID 32124521 .
Чен Ю., Кромби А., Рахман М.Т., Дедыш С.Н., Лисак В., Стотт М.Б. и др. (июль 2010 г.). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Mmethylocella silvestris BL2» . Журнал бактериологии . 192 (14): 3840–1. дои : 10.1128/JB.00506-10 . ПМЦ 2897342 . ПМИД 20472789 .

Внешние ссылки

[pmid13130000-1] Jump up to: ^а ^б ^с Данфилд П.Ф., Хмеленина В.Н., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А., Дедыш С.Н. (сентябрь 2003 г.). «Mmethylocella silvestris sp. nov., новый метанотроф, выделенный из кислого лесного камбисола» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (Часть 5): 1231–1239. дои : 10.1099/ijs.0.02481-0 . ПМИД 13130000 . Проверено 25 июля 2013 г.

[:0-2] Jump up to: ^а ^б Чен Ю., Кромби А., Рахман М.Т., Дедыш С.Н., Лисак В., Стотт М.Б. и др. (июль 2010 г.). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Mmethylocella silvestris BL2» . Журнал бактериологии . 192 (14): 3840–1. дои : 10.1128/JB.00506-10 . ПМЦ 2897342 . ПМИД 20472789 .

[3] Дедыш Светлана Н.; Книф, Клаудия; Данфилд, Питер Ф. (1 июля 2005 г.). «Виды метилоцелл факультативно метанотрофны» . Журнал бактериологии . 187 (13): 4665–4670. дои : 10.1128/JB.187.13.4665-4670.2005 . ISSN 0021-9193 . ПМЦ 1151763 . ПМИД 15968078 .

[:1-4] Jump up to: ^а ^б Бордель, Серджио; Кромби, Эндрю Т.; Муньос, Рауль; Мюррелл, Дж. Колин (16 июля 2020 г.). «Метаболическая модель генома универсального метанотрофа Mmethylocella silvestris» . Заводы по производству микробных клеток . 19 (1): 144. дои : 10.1186/s12934-020-01395-0 . ISSN 1475-2859 . ПМЦ 7364539 . ПМИД 32677952 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]