Джеймс Дж. Коллинз
Джеймс Дж. Коллинз | |
|---|---|
 | |
| Рожденный | 26 июня 1965 г. Нью-Йорк , США |
| Образование | Колледж Святого Креста ( бакалавр ) Баллиол-колледж, Оксфорд ( доктор философии ) |
| Известный | Синтетическая биология , Открытие халицина и абаоцина. |
| Супруг |
Мэри МакНотон Коллинз
|
| Награды | Стипендия Макартура (2003) Премия пионера директора НИЗ (2007) Премия Лагранжа (2010). Премия HFSP Накасоне (2015) Премия Габбая (2017) Премия Диксона в области медицины (2020) Премия Макса Дельбрюка (2020) Премия Фейнмана (2023 г.) Лауреат премии Clarivate Citation (2023 г.) |
| Научная карьера | |
| Поля | Биологическая инженерия Биомедицинская инженерия Системная биология Синтетическая биология |
| Учреждения | Массачусетский Институт Технологий Гарвардский университет Бостонский университет Институт Рагона Институт Висса Броуд Институт |
| Тезис | Механика суставов: моделирование нижней конечности (1990) |
| Докторантура | Джон О'Коннор |
Джеймс Джозеф Коллинз (родился 26 июня 1965 г.) - американский биомедицинский инженер и биоинженер , который работает профессором медицинской инженерии и науки Термеера в Массачусетском технологическом институте (MIT), где он также является директором Массачусетского технологического института Абдула Латифа Джамиля. Клиника машинного обучения в здравоохранении .
Коллинз провел исследование, показавшее, что подходы искусственного интеллекта (ИИ) можно использовать для открытия новых антибиотиков, таких как галицин и абауцин . [1] Он является директором проекта «Антибиотики-ИИ» в Массачусетском технологическом институте, который поддерживается The Audacious Project , и является членом программы Гарварда-MIT в области медицинских наук и технологий . Он также является ведущим преподавателем Института биологической инженерии Висса при Гарвардском университете и членом Института Броуда . [2]
Коллинз является одним из основателей области синтетической биологии , и его работа над синтетическими генными цепями и программируемыми клетками привела к разработке новых классов диагностики и терапии, которые повлияли на исследования по обнаружению и лечению инфекций, вызванных новыми патогенами, такими как такие как Эбола, Зика, SARS-CoV-2 и устойчивые к антибиотикам бактерии. Он также является исследователем в области системной биологии , сделавшим открытия, касающиеся действия антибиотиков и возникновения устойчивости к антибиотикам . [3]
Коллинз является членом Национальной инженерной академии , Национальной медицинской академии и Национальной академии наук за вклад в синтетическую биологию и создание генных сетей. В 2023 году он был награжден Clarivate Citation за исследования, которые, скорее всего, получат Нобелевскую премию .
Молодость образование и
Коллинз родился 26 июня 1965 года в Бронксе , затем переехал в Беллероуз, штат Нью-Йорк . [4] Его отец был авиационным инженером, работавшим над проектами НАСА и вооруженных сил. [5] В 10 лет Коллинз переехал со своей семьей в Нью-Гэмпшир после окончания начальной школы. [6] вырос в Нашуа . [7] Впервые у него появился интерес к медицинской технике, когда один из его дедушек ослеп , а другой перенес множественные инсульты . [5]
Первоначально Коллинз намеревался изучать электротехнику на бакалавриате и был принят в Массачусетский технологический институт (MIT) и Политехнический институт Ренсселера (RPI). Вместо этого он решил поступить в Колледж Святого Креста , посчитав атмосферу в колледже более дружелюбной. Позже Коллинз вспоминал: «Я влюбился в это место. Я хотел много работать и получить хорошее образование, но я также хотел развлечься. Я хотел получить обширный опыт и чувствовал, что могу получить его в Holy Cross. ". [3]
В Holy Cross Коллинз был классным руководителем и членом команд по легкой атлетике и кроссу , где он пробежал милю с результатом 4:17. [8] Он также писал для школьной газеты и преподавал в рамках Братства христианской доктрины (CCD). Будучи студентом, он был награжден президентской наградой за волонтерскую службу и в 1986 году был удостоен звания стипендиата Фенвика, что является одной из высших наград колледжа. [9] Коллинз окончил Holy Cross в 1987 году с прощальным словом , получив степень бакалавра искусств (BA) по физике с отличием . [3] Его дипломная работа называлась «Функциональная нервно-мышечная стимуляция: анализ биомеханических и нервно-мышечных основ ходьбы». [10]
После окончания университета Коллинз получил стипендию Родса для изучения медицинской инженерии в Бэллиол-колледже в Оксфорде , где в 1990 году он получил степень доктора философии (D.Phil.). [11] Его диссертация называлась «Механика суставов: моделирование нижней конечности» и проводилась под руководством Джона Дж. О'Коннора. [12]
Карьера [ править ]
Коллинз вернулся в Соединенные Штаты, чтобы поступить на факультет Бостонского университета . Там он основал лабораторию и стал заслуженным профессором университета Уильяма Ф. Уоррена, профессором университета , профессором биомедицинской инженерии, профессором медицины, а также содиректором Центра биодинамики и директором Центра синтетической биологии. В 2008 году Коллинз был назначен исследователем Медицинского института Говарда Хьюза , став первым исследователем из Бостонского университета. [7]
В 2014 году Коллинз стал профессором Массачусетского технологического института. [13] В настоящее время Коллинз является профессором Термеера медицинской инженерии и науки и профессором биологической инженерии в Массачусетском технологическом институте . Коллинз также является одним из основных преподавателей Института биологической инженерии Висса при Гарвардском университете и членом Института Броуда . Коллинз также является руководителем факультета биологических наук в клинике Джамиля Массачусетского технологического института с 2018 года. [14] [15]
Коллинз работал с рядом начинающих компаний, а его изобретения и технологии были лицензированы более чем 25 компаниями, занимающимися биотехнологиями и медицинским оборудованием. Коллинз является научным сооснователем нескольких биотехнологических компаний и некоммерческих организаций.
В 2010 году Коллинз был назначен президентом Бараком Обамой членом президентской комиссии по изучению вопросов биоэтики . [16]
Работа [ править ]
 | Этот раздел может содержать чрезмерное количество цитат . ( Июль 2023 г. ) |
Синтетическая биология [ править ]
Работа Коллинза над синтетическими генными цепями положила начало области синтетической биологии . [17] Он был первым (вместе с Майклом Эловицем и Станисласом Лейблером ), кто показал, что можно использовать биофизические свойства нуклеиновых кислот и белков для создания биологических цепей, которые можно использовать для переподключения и перепрограммирования живых клеток.
В статье, опубликованной в журнале Nature , [18] Коллинз спроектировал и сконструировал генетический тумблер – синтетическую бистабильную сеть регуляции генов – в E. coli. Тумблер образует синтетическую адресную единицу клеточной памяти, имеющую широкие возможности для биофизики, биомедицины и биотехнологии. В том же выпуске журнала Nature Эловиц и Лейблер показали, что можно построить синтетический генетический осциллятор (называемый репрессилятором) в E. coli. [19] Статья Коллинза Nature о генетическом переключателе [18] и статья Еловица и Лейблера в Nature. [19] на репрессиляторе считаются знаковыми произведениями, положившими начало синтетической биологии. [17]
Основываясь на этой работе, Коллинз показал, что синтетические генные сети могут использоваться в качестве регуляторных модулей и взаимодействовать с генетическими схемами микроба для создания программируемых клеток для различных применений. [20] например, синтетические пробиотики, которые будут служить живой диагностикой и живыми терапевтическими средствами для выявления, лечения и профилактики таких инфекций, как холера и C. difficile. [21] [22] Он также разработал и сконструировал риборегуляторы (РНК-переключатели) для восприятия и контроля. [23] [24] [25] [26] [27] [28] микробные аварийные выключатели и генетические счетчики для биосдерживания, [29] [30] [31] синтетический бактериофаг для борьбы с устойчивыми бактериальными инфекциями, [32] [33] генетические коммутаторы для метаболической инженерии, [34] и настраиваемые генетические переключатели для генной и клеточной терапии. [35] [36] [37] Недавно Коллинз разработал лиофилизированные бесклеточные синтетические генные схемы — инновационную платформу, которая составляет основу для недорогих бумажных диагностических тестов на новые патогены (например, Зика, Эбола, SARS-CoV-2, устойчивые к антибиотикам бактерии). ), [38] [39] [40] [41] носимые биосенсоры, [42] и портативное биомолекулярное производство (например, для производства вакцинных антигенов) в развивающихся странах. [43]
В контексте синтетической биологии и регенеративной медицины Коллинз сотрудничал с Дерриком Росси и Джорджем К. Дейли в исследовании с использованием технологии синтетической мРНК для биомедицинских приложений. Команда показала, что синтетическую мРНК можно использовать для высокоэффективного перепрограммирования и редифференцировки стволовых клеток. Эта работа была опубликована в журнале Cell Stem Cell в 2010 году. [44] и Росси использовал эту технологическую платформу синтетической биологии, чтобы основать компанию Moderna . [45]
Коллинз также использовал подходы синтетической биологии (вычислительные и экспериментальные) для выявления и решения важных вопросов биологической физики, касающихся регуляции экспрессии генов и динамики клеток. Коллинз, например, использовал синтетические генные сети для изучения эффектов положительной обратной связи в генетических модулях. [46] [47] роль и происхождение стохастических колебаний в экспрессии генов эукариот, [48] и фенотипические последствия шума экспрессии генов и его влияние на судьбу клеток и стратегии выживания микробов в стрессовых условиях. [49] Важно отметить, что Коллинз также продемонстрировал, как синтетические генные цепи можно использовать для тестирования, проверки и улучшения качественных и количественных моделей регуляции генов. [50] и показали, что биофизическая теория и эксперимент могут быть объединены в подходах «снизу вверх», чтобы получить биологическое понимание сложных процессов регуляции генов. [51]
Антибиотики и антибиотикам к устойчивость
Коллинз также является одним из ведущих исследователей в области системной биологии, используя экспериментально-вычислительные биофизические методы для обратного проектирования и анализа эндогенных генных регуляторных сетей. [52] Коллинз и его коллеги показали, что реверс-инжиниринг генных сетей можно использовать для идентификации мишеней лекарств, биологических медиаторов и биомаркеров заболеваний. [53]
Коллинз и его коллеги обнаружили, используя подходы системной биологии, что все классы бактерицидных антибиотиков вызывают общий путь гибели клеток при окислительном повреждении. [54] Это открытие указывает на то, что воздействие на бактериальные системы, которые устраняют окислительные повреждения, включая реакцию SOS-повреждения ДНК, является жизнеспособным средством повышения эффективности всех основных классов антибиотиков и ограничения возникновения устойчивости к антибиотикам. Эта работа установила механистическую связь между бактериальным метаболизмом и эффективностью антибиотиков, которая была далее развита и подтверждена Коллинзом и его командой в серии последующих исследований. [55]
Коллинз показал, что определенные метаболиты можно использовать, чтобы бактерицидные антибиотики могли искоренить стойкие, толерантные инфекции. [56] Кроме того, Коллинз и его коллеги обнаружили, что сублетальные дозы антибиотиков активируют мутагенез, стимулируя выработку активных форм кислорода, что приводит к множественной лекарственной устойчивости. [57] Коллинз и его коллеги, используя свои системные подходы, также открыли популяционный механизм устойчивости, представляющий собой форму родственного отбора, при котором небольшое количество устойчивых бактериальных мутантов перед лицом антибиотикового стресса может, с некоторыми затратами для себя, обеспечить защиту другие, более уязвимые клетки, повышая способность выживания всего населения в стрессовых условиях. [58]
В 2020 году Коллинз был частью команды — вместе с руководителем факультета клиники Джамиль Массачусетского технологического института профессором Региной Барзилай — которая объявила об открытии посредством глубокого изучения галицина . , первого нового антибиотика за 30 лет, который убивает более 35 мощных бактерий , в том числе противомикробных устойчивый туберкулез , супербактерия C. difficile и две Всемирной организации здравоохранения . бактерии, входящие в тройку самых смертоносных бактерий [59] В 2020 году Коллинз, Барзилай и клиника Джамиля Массачусетского технологического института также получили финансирование в рамках The Audacious Project для создания проекта «Антибиотики-ИИ» и расширения возможностей открытия галицина при использовании ИИ для реагирования на кризис устойчивости к антибиотикам посредством разработки новых классов антибиотиков. антибиотики. [60]
Нелинейная динамика в биологических системах [ править ]
Коллинз также был пионером в разработке и использовании нелинейных динамических подходов для изучения, имитации и улучшения биологических функций. [61] расширение нашей способности понимать и использовать физику живых систем. Коллинз, например, предположил, что входной шум можно использовать для улучшения сенсорных функций и моторного контроля у людей. [62] [63] Он и его коллеги показали, что ощущение прикосновения и контроль равновесия у молодых и пожилых людей, пациентов с инсультом и пациентов с диабетической нейропатией можно улучшить с помощью субсенсорного механического шума. [64] например, через вибрирующие стельки. [65] Эта работа привела к созданию нового класса медицинских устройств для лечения осложнений, возникающих в результате диабетической нейропатии, восстановления функций мозга после инсульта и улучшения баланса пожилых людей.
Награды [ править ]
Научные достижения Коллинза были отмечены многочисленными наградами, в том числе премией Диксона в области медицины , премией Санофи-Института Пастера , премией HFSP Накасоне , премией Макса Дельбрюка , премией Габбая , премией директора НИЗ , премией Медицинского фонда Эллисона. Научная премия в области старения , первая премия Энтони Дж. Дрекселя за выдающиеся достижения , премия Лагранжа от Фонда CRT в Италии, премия Роберта А. Притцкера BMES, премия Promega за исследования в области биотехнологии, а также выбор для Technology Review. журнала первой премии TR100 100 молодые новаторы, которые будут формировать будущее технологий [66] – и Scientific American 50 – 50 лучших выдающихся лидеров в области науки и технологий. [67]
Коллинз является членом Американского физического общества , Института физики и Американского института медицинской и биологической инженерии. В 2003 году он получил премию Фонда Макартуров « Genius Award ». [68] стал первым биоинженером, удостоенным этой чести. [69] В цитате о награде Коллинза отмечалось: «На протяжении своих исследований Коллинз демонстрирует склонность к выявлению абстрактных принципов, лежащих в основе сложных биологических явлений, и к использованию этих концепций для решения конкретных практических проблем». Он также был удостоен звания Матча всех звезд медицины от команды Boston Red Sox и сделал первую подачу на игре Red Sox в Фенуэй-парке. В 2016 году группа Пола Г. Аллена Frontiers Group назвала Коллинза выдающимся следователем Аллена. [70] Коллинз является избранным членом всех трех национальных академий США — Национальной академии наук , Национальной инженерной академии и Национальной медицинской академии . Он также является избранным членом Американской академии искусств и наук , а также членом Национальной академии изобретателей .
Коллинз получил преподавательские награды в Бостонском университете, в том числе премию «Учитель года по биомедицинской инженерии», премию «Профессор года инженерного колледжа», а также Кубок Меткалфа и премию за выдающиеся достижения в преподавании, что является высшей преподавательской наградой, присуждаемой Бостонским университетом. . [71]
В 2023 году Коллинз был назван лауреатом премии Clarivate Citation вместе с Майклом Еловицем и Станисласом Лейблером «за новаторскую работу над синтетическими генными цепями, положившую начало области синтетической биологии». [72]
Личная жизнь [ править ]
Жена Коллинза - Мэри Макнотон Коллинз; они познакомились, когда учились в колледже Святого Креста, и поженились в 1990 году. Она профессор Гарвардской медицинской школы и врач Массачусетской больницы общего профиля . [3] У них двое детей: Кэти, стипендиат Маршалла в Кембриджском университете , и Дэнни, стипендиат Рэйчел Карсон в Университете Дьюка . [73] [74]
Ссылки [ править ]
- ^ Трафтон, Энн (20 декабря 2023 г.). «Используя искусственный интеллект, исследователи Массачусетского технологического института идентифицируют новый класс кандидатов на антибиотики» . Новости МТИ . Массачусетский Институт Технологий . Проверено 6 мая 2024 г.
- ^ Сондерс, Фенелла (6 февраля 2023 г.). «Синтез инженерии и биологии» . Американский учёный . Сигма Си . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д Рирдон, Майкл (зима 2007 г.). «Профиль: Джеймс Дж. Коллинз-младший '87» . Журнал «Святой Крест» . Том. 41, нет. 1. Колледж Святого Креста . п. 80. Архивировано из оригинала 22 августа 2016 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
- ^ Хан, Фирдос Алам (8 мая 2014 г.). Биотехнология в медицинских науках . ЦРК Пресс. ISBN 978-1-4822-2367-5 .
- ^ Перейти обратно: а б Трафтон, Энн (14 ноября 2015 г.). «Перепрограммирование биологии: инженер-биолог Джеймс Коллинз проектирует генетические схемы с новыми функциями» . Новости МТИ . Массачусетский Институт Технологий . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ «Джеймс Коллинз, доктор философии | Выпуск стипендиального колледжа AIMBE 2000 года» . Американский институт медицинской и биологической инженерии . Получено 19 декабря 2023 г. - через Xconomy .
- ^ Перейти обратно: а б Бейкер, Билли (24 ноября 2008 г.). «Работа мечты дает ему свободу исследовать» . Бостон Глобус . п. 16 . Проверено 20 декабря 2023 г.
- ^ Заман, Мухаммед (20 апреля 2020 г.). Биография Сопротивления . Харпер. ISBN 978-0062862976 .
- ^ Брэди 2012 , с. 184.
- ^ «Бывшие ученые, проекты и консультанты Фенвика» . Колледж Святого Креста . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ «Премия Диксона в области медицины вручена выпускнику Баллиола» . Баллиол-колледж, Оксфорд . Оксфордский университет . 28 октября 2020 г. Проверено 4 сентября 2023 г.
- ^ «Диссертация: Механика суставов – моделирование нижней конечности» . Информационная система Оксфордских библиотек . Оксфордский университет . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ «Коллинз удостоен чести Сигмы Си; Марнетт уходит с поста декана» . www.asbmb.org . Проверено 20 декабря 2023 г.
- ^ «Регина Барзилай, Джеймс Коллинз и Фил Шарп присоединяются к руководству новыми усилиями по машинному обучению в здравоохранении» . Новости МТИ . Массачусетский Институт Технологий . 3 октября 2018 г. . Проверено 13 ноября 2020 г.
- ^ "Люди" . J-Клиника . Архивировано из оригинала 30 ноября 2021 года . Проверено 13 ноября 2020 г.
- ^ «Джим Дж. Коллинз, доктор философии | Catalio Capital Management» . www.cataliocapital.com . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ Перейти обратно: а б От редакции: Десять лет синергии , Nature 463, 269-270 (21 января 2010 г.), doi:10.1038/463269b
- ^ Перейти обратно: а б Гарднер, Т.С.; Кантор ЧР; Коллинз Джей-Джей (20 января 2000 г.). «Создание генетического тумблера в Escherichia coli». Природа . 403 (6767): 339–342. Бибкод : 2000Natur.403..339G . дои : 10.1038/35002131 . ПМИД 10659857 . S2CID 345059 .
- ^ Перейти обратно: а б Еловиц М.Б., Лейблер С. (2000). «Синтетическая колебательная сеть регуляторов транскрипции» . Природа . 403 (6767): 335–8. Бибкод : 2000Natur.403..335E . дои : 10.1038/35002125 . ПМИД 10659856 . S2CID 41632754 .
- ^ Кобаяши Х., Каэрн М., Араки М., Чунг К., Гарднер Т.С., Кантор Ч.Р.; и другие. (2004). «Программируемые клетки: взаимодействие природных и инженерных генных сетей» . Proc Natl Acad Sci США . 101 (22): 8414–9. Бибкод : 2004PNAS..101.8414K . дои : 10.1073/pnas.0402940101 . ПМК 420408 . ПМИД 15159530 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Мао Н., Кубильос-Руис А., Кэмерон Д.Э., Коллинз Дж.Дж. (2018). «Пробиотические штаммы обнаруживают и подавляют холеру у мышей» . Научный перевод Мед . 10 (445). doi : 10.1126/scitranslmed.aao2586 . ПМК 7821980 . ПМИД 29899022 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Кубильос-Руис А., Алькантар М.А., Донгиа Н.М., Карденас П., Авила-Пачеко Дж., Коллинз Дж.Дж. (2022). «Разработанное живое биотерапевтическое средство для профилактики дисбиоза, вызванного антибиотиками» . Нат Биомед Инж . 6 (7): 910–921. дои : 10.1038/s41551-022-00871-9 . ПМИД 35411114 . S2CID 248100868 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Айзекс, Ф.Дж.; Дуайер, диджей; Дин, К; Первоушин, Д.Д.; Кантор, ЧР; Коллинз, Джей-Джей (2004). «Сконструированные риборегуляторы обеспечивают посттранскрипционный контроль экспрессии генов». Нат Биотехнология . 22 (7): 823–4 2004. doi : 10.1038/nbt986 . ПМИД 15208640 . S2CID 7289450 .
- ^ Грин А.А., Сильвер П.А., Коллинз Дж.Дж., Инь П. (2014). «Пульсовые переключатели: регуляторы экспрессии генов, разработанные заново» . Клетка . 159 (4): 925–39. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.002 . ПМЦ 4265554 . ПМИД 25417166 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Грин А.А., Ким Дж., Ма Д., Сильвер П.А., Коллинз Дж.Дж., Инь П. (2017). «Сложные вычисления клеточной логики с использованием рибокомпьютерных устройств» . Природа . 548 (7665): 117–121. Бибкод : 2017Natur.548..117G . дои : 10.1038/nature23271 . ПМК 6078203 . ПМИД 28746304 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Ангенент-Мари Н.М., Гаррусс А.С., Соенксен Л.Р., Чёрч Дж., Коллинз Дж.Дж. (2020). «Подход глубокого обучения к программируемым переключателям РНК» . Нат Коммун . 11 (1): 5057. Бибкод : 2020NatCo..11.5057A . дои : 10.1038/s41467-020-18677-1 . ПМЦ 7541447 . ПМИД 33028812 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Чжао Э.М., Мао А.С., де Пуч Х., Чжан К., Типпенс Н.Д., Тан X; и другие. (2022). «РНК-зависимые элементы для эукариотического контроля трансляции» . Нат Биотехнология . 40 (4): 539–545. дои : 10.1038/s41587-021-01068-2 . ПМИД 34711989 . S2CID 240153815 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Гайет Р.В., Илия К., Разави С., Типпенс Н.Д., Лалвани М.А., Чжан К.; и другие. (2023). «Автокаталитическое редактирование оснований для РНК-зависимого контроля трансляции» . Нат Коммун . 14 (1): 1339. Бибкод : 2023NatCo..14.1339G . дои : 10.1038/s41467-023-36851-z . ПМЦ 10008589 . ПМИД 36906659 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Фридланд А.Е., Лу Т.К., Ван X, Ши Д., Черч Дж., Коллинз Дж.Дж. (2009). «Синтетические генные сети, которые имеют значение» . Наука . 324 (5931): 1199–202. Бибкод : 2009Sci...324.1199F . дои : 10.1126/science.1172005 . ПМК 2690711 . ПМИД 19478183 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Каллура Дж.М., Дуайер DJ, Исаакс Ф.Дж., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2010). «Отслеживание, настройка и прекращение микробной физиологии с помощью синтетических риборегуляторов» . Proc Natl Acad Sci США . 107 (36): 15898–903. Бибкод : 2010PNAS..10715898C . дои : 10.1073/pnas.1009747107 . ПМЦ 2936621 . ПМИД 20713708 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Чан КТ, Ли Дж.В., Кэмерон Д.Э., Башор С.Дж., Коллинз Дж.Дж. (2016). « Микробные выключатели «Deadman» и «Passcode» для сдерживания бактерий» . Нат Хим Биол . 12 (2): 82–6. doi : 10.1038/nchembio.1979 . ПМЦ 4718764 . ПМИД 26641934 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Лу Т.К., Коллинз Дж.Дж. (2007). «Диспергирование биопленок с помощью сконструированного ферментативного бактериофага» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (27): 11197–202. Бибкод : 2007PNAS..10411197L . дои : 10.1073/pnas.0704624104 . ЧВК 1899193 . ПМИД 17592147 .
- ^ Лу Т.К., Коллинз Дж.Дж. (2009). «Спроектированные бактериофаги, нацеленные на генные сети, в качестве адъювантов для антибиотикотерапии» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (12): 4629–34. Бибкод : 2009PNAS..106.4629L . дои : 10.1073/pnas.0800442106 . ПМК 2649960 . ПМИД 19255432 .
- ^ Каллура Дж. М., Кантор Ч. Р., Коллинз Дж. Дж. (2012). «Генетический коммутатор для приложений синтетической биологии» . Proc Natl Acad Sci США . 109 (15): 5850–5. Бибкод : 2012PNAS..109.5850C . дои : 10.1073/pnas.1203808109 . ПМЦ 3326468 . ПМИД 22454498 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Динс Т.Л., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2007). «Настраиваемый генетический переключатель на основе РНКи и белков-репрессоров для регулирования экспрессии генов в клетках млекопитающих» . Клетка . 130 (2): 363–72. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.045 . ПМИД 17662949 . S2CID 7960766 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Чо Дж.Х., Коллинз Дж.Дж., Вонг В.В. (2018). «Универсальные химерные антигенные рецепторы для мультиплексного и логического контроля ответов Т-клеток» . Клетка . 173 (6): 1426–1438.e11. дои : 10.1016/j.cell.2018.03.038 . ПМЦ 5984158 . ПМИД 29706540 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Чо Дж.Х., Окума А., Софьян К., Ли С., Коллинз Дж.Дж., Вонг В.В. (2021). «Разработка передовой логики и распределенных вычислений в иммунных клетках CAR человека» . Нат Коммун . 12 (1): 792. Бибкод : 2021NatCo..12..792C . дои : 10.1038/s41467-021-21078-7 . ПМЦ 7862674 . ПМИД 33542232 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Парди К., Грин А.А., Ферранте Т., Кэмерон Д.Е., ДейлиКейзер А., Инь П.; и другие. (2014). «Синтетические генные сети на бумажной основе» . Клетка . 159 (4): 940–54. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.004 . ПМК 4243060 . ПМИД 25417167 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Pardee K, Green AA, Takahashi MK, Braff D, Lambert G, Lee JW; et al. (2016). "Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components". Cell. 165 (5): 1255–1266. doi:10.1016/j.cell.2016.04.059. hdl:1721.1/109241. PMID 27160350. S2CID 3278532.
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) - ^ де Пуч Х., Ли Р.А., Наджар Д., Тан Х., Соекнсен Л.Р., Ангенент-Мари Н.М.; и другие. (2021). «Минимально оснащенный SHERLOCK (miSHERLOCK) для диагностики SARS-CoV-2 и его новых вариантов в местах оказания медицинской помощи на основе CRISPR» . Научный адв . 7 (32). Бибкод : 2021SciA....7.2944D . дои : 10.1126/sciadv.abh2944 . ПМЦ 8346217 . ПМИД 34362739 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Карликов М., да Силва С.Дж.Р., Го Ю., Чичек С., Кроковский Л., Хомм П.; и другие. (2022). «Полевая валидация эффективности бумажных тестов на обнаружение вирусов Зика и чикунгунья в образцах сыворотки» . Нат Биомед Инж . 6 (3): 246–256. дои : 10.1038/s41551-022-00850-0 . ПМЦ 8940623 . PMID 35256758 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Нгуен П.К., Соенксен Л.Р., Донгиа Н.М., Ангенент-Мари Н.М., де Пуч Х., Хуанг А.; и другие. (2021). «Носимые материалы со встроенными синтетическими биологическими датчиками для обнаружения биомолекул» . Нат Биотехнология . 39 (11): 1366–1374. дои : 10.1038/s41587-021-00950-3 . hdl : 1721.1/131278 . ПМИД 34183860 . S2CID 235673261 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Парди К., Сломович С., Нгуен П.К., Ли Дж.В., Донгиа Н., Беррилл Д.; и другие. (2016). «Портативное биомолекулярное производство по требованию» . Клетка . 167 (1): 248–259.e12. дои : 10.1016/j.cell.2016.09.013 . hdl : 1721.1/111574 . ПМИД 27662092 . S2CID 8481521 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Уоррен Л., Манос П.Д., Ахфельдт Т., Ло Й.Х., Ли Х., Лау Ф.; и другие. (2010). «Высокоэффективное перепрограммирование плюрипотентности и направленная дифференцировка клеток человека с помощью синтетической модифицированной мРНК» . Клеточная стволовая клетка . 7 (5): 618–30. дои : 10.1016/j.stem.2010.08.012 . ПМЦ 3656821 . ПМИД 20888316 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Куц, Эрин (4 октября 2010 г.). «ModeRNA, скрытый стартап, поддерживаемый флагманом, представляет новый способ создания стволовых клеток» . Xconomy, Inc.
- ^ Хэсти Дж., Прадинес Дж., Дольник М., Коллинз Дж.Дж. (2000). «Шумовые переключатели и усилители для экспрессии генов» . Proc Natl Acad Sci США . 97 (5): 2075–80. arXiv : физика/0003105 . Бибкод : 2000PNAS...97.2075H . дои : 10.1073/pnas.040411297 . ПМК 15756 . ПМИД 10681449 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Айзекс Ф.Дж., Хэсти Дж., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2003). «Прогнозирование и измерение ауторегуляторного генетического модуля» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (13): 7714–9. Бибкод : 2003PNAS..100.7714I . дои : 10.1073/pnas.1332628100 . ПМК 164653 . ПМИД 12808135 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Блейк В.Дж., К.Эрн М., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2003). «Шум в экспрессии генов эукариот» . Природа . 422 (6932): 633–7. Бибкод : 2003Natur.422..633B . дои : 10.1038/nature01546 . ПМИД 12687005 . S2CID 4347106 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Блейк В.Дж., Балажи Дж., Кохански М.А., Исаакс Ф.Дж., Мерфи К.Ф., Куанг Й.; и другие. (2006). «Фенотипические последствия транскрипционного шума, опосредованного промотором» . Мол Клетка . 24 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2006.11.003 . ПМИД 17189188 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Эллис Т., Ван Х, Коллинз Дж.Дж. (2009). «Построение синтетических генных сетей с предсказанными функциями на основе разнообразия и на основе моделей» . Нат Биотехнология . 27 (5): 465–71. дои : 10.1038/nbt.1536 . ПМК 2680460 . ПМИД 19377462 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Гвидо Нью-Джерси, Ван Х, Адалстейнссон Д., Макмиллен Д., Хэсти Дж., Кантор Ч.Р.; и другие. (2006). «Восходящий подход к регуляции генов» . Природа . 439 (7078): 856–60. Бибкод : 2006Natur.439..856G . дои : 10.1038/nature04473 . ПМИД 16482159 . S2CID 4418558 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Юнг М.К., Тегнер Дж., Коллинз Дж.Дж. (2002). «Обратное проектирование генных сетей с использованием разложения по сингулярным значениям и устойчивой регрессии» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (9): 6163–8. Бибкод : 2002PNAS...99.6163Y . дои : 10.1073/pnas.092576199 . ПМК 122920 . ПМИД 11983907 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Гарднер, Т.С.; ди Бернардо Д; Лоренц Д; Коллинз Джей-Джей (4 июля 2003 г.). «Вывод о генетических сетях и выявление комплекса действий посредством профилирования экспрессии». Наука . 301 (5629): 102–105. дои : 10.1126/science.1081900 . ПМИД 12843395 . S2CID 8356492 .
- ^ Кохански, Массачусетс; Дуайер диджей; Хаете Б; Лоуренс, Калифорния; Коллинз Дж.Дж. (2007). «Общий механизм гибели клеток, вызванной бактерицидными антибиотиками» . Клетка . 130 (5): 797–810. дои : 10.1016/j.cell.2007.06.049 . ПМИД 17803904 . S2CID 1103795 .
- ^ Кохански М.А., Дуайер Д.Д., Вежбовски Дж., Коттарел Дж., Коллинз Дж.Дж. (2008). «Неправильная трансляция мембранных белков и активация двухкомпонентной системы вызывают гибель клеток, опосредованную антибиотиками» . Клетка . 135 (4): 679–90. дои : 10.1016/j.cell.2008.09.038 . ПМК 2684502 . ПМИД 19013277 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Эллисон К.Р., член парламента Бринильдсена, Коллинз Дж.Дж. (2011 г.). «Уничтожение бактерий-персистеров с помощью метаболитов с помощью аминогликозидов» . Природа . 473 (7346): 216–20. Бибкод : 2011Natur.473..216A . дои : 10.1038/nature10069 . ПМК 3145328 . ПМИД 21562562 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Кохански, Массачусетс; ДеПристо Массачусетс; Коллинз Дж.Дж. (2010). «Сублетальное лечение антибиотиками приводит к множественной лекарственной устойчивости посредством радикально-индуцированного мутагенеза» . Молекулярная клетка . 37 (3): 311–320. doi : 10.1016/j.molcel.2010.01.003 . ПМК 2840266 . ПМИД 20159551 .
- ^ Ли, Х.Х.; Молла М.Н.; Кантор ЧР; Коллинз Дж.Дж. (2010). «Бактериальная благотворительность приводит к всеобщему сопротивлению» . Природа . 467 (7311): 82–85. Бибкод : 2010Natur.467...82L . дои : 10.1038/nature09354 . ПМЦ 2936489 . ПМИД 20811456 .
- ^ Стоукс, Джонатан М.; Ян, Кевин; Суонсон, Кайл; Цзинь, Венгун; Кубильос-Руис, Андрес; Донгия, Нина М.; Макнейр, Крейг Р.; Френч, Шон; Карфрэ, Линдси А.; Блум-Акерманн, Зоар; Тран, Виктория М. (20 февраля 2020 г.). «Подход глубокого обучения к открытию антибиотиков» . Клетка . 180 (4): 688–702.e13. дои : 10.1016/j.cell.2020.01.021 . ISSN 1097-4172 . ПМЦ 8349178 . ПМИД 32084340 .
- ^ «Джим Коллинз получает финансирование на использование искусственного интеллекта для открытия лекарств» . Новости Массачусетского технологического института | Массачусетский Институт Технологий . 23 апреля 2020 г. . Проверено 13 ноября 2020 г.
- ^ Коллинз Джей-Джей (1994). «Беспорядочная ходьба во время спокойного стояния» . Преподобный Летт по физике . 73 (5): 764–767. Бибкод : 1994PhRvL..73..764C . дои : 10.1103/PhysRevLett.73.764 . ПМИД 10057531 .
- ^ Коллинз Дж. Дж., Чоу CC, Имхофф Т.Т. (1995). «Стохастический резонанс без настройки» . Природа . 376 (6537): 236–8. Бибкод : 1995Natur.376..236C . дои : 10.1038/376236a0 . ПМИД 7617033 . S2CID 4314968 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Коллинз Дж.Дж., Имхофф Т.Т., Григг П. (1996). «Передача информации с усилением шума в кожных механорецепторах SA1 крысы посредством апериодического стохастического резонанса» . J Нейрофизиология . 76 (1): 642–5. дои : 10.1152/jn.1996.76.1.642 . ПМИД 8836253 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Коллинз Дж.Дж., Имхофф Т.Т., Григг П. (1996). «Тактильное ощущение, усиленное шумом» . Природа . 383 (6603): 770. Бибкод : 1996Natur.383..770C . дои : 10.1038/383770a0 . ПМИД 8893000 . S2CID 3660648 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Приплата, А; Ниеми Дж; Гарри Дж; Липсиц Л.А.; Коллинз Джей-Джей (4 октября 2003 г.). «Вибрирующие стельки и контроль равновесия у пожилых людей». Ланцет . 362 (9390): 1123–1124. дои : 10.1016/S0140-6736(03)14470-4 . ПМИД 14550702 . S2CID 33216209 .
- ^ «1999 Молодой новатор, Джеймс Коллинз» . Обзор технологий. Ноябрь – декабрь 1999 г. Проверено 15 апреля 2007 г.
- ^ «Scientific American 50: победители и участники SA 50» . Научный американец. 21 ноября 2005 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
- ^ «Стипендиаты Макартура, октябрь 2003 г.» . Фонд Джона Д. и Кэтрин Т. Макартуров. Архивировано из оригинала 16 октября 2007 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
- ^ Такер, Ян (21 мая 2011 г.). «Джеймс Коллинз: Ложка сахара помогает лекарству подействовать» . Хранитель . ISSN 0261-3077 . Проверено 22 апреля 2024 г.
- ^ Шанер, Карен (13 апреля 2016 г.). «Джеймс Коллинз назначен выдающимся следователем Аллена 2016 года» . Новости МТИ . Массачусетский Институт Технологий . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ Брик, Триша (весна 2006 г.). «Гений за работой» . Бостония . стр. 20–25. Архивировано из оригинала 19 октября 2012 года . Проверено 12 июня 2009 г.
- ^ «Джеймс Дж. Коллинз удостоен звания лауреата премии» . Гарвард-МТИ, медицинские науки и технологии . 22 сентября 2023 г. . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ «Здравоохранение и науки о жизни: Джеймс Коллинз» . Ирландская Америка . 5 октября 2022 г. . Проверено 19 декабря 2023 г.
- ^ «Герцог-старший стремится к большим вознаграждениям» . Герцог сегодня . 19 октября 2023 г. . Проверено 3 февраля 2024 г.
Дополнительные ссылки [ править ]
- Брэди, Дайан (2012). Братство . Spiegel & Grau (опубликовано 3 января 2012 г.). ISBN 978-0385524742 .
Внешние ссылки [ править ]
- Лаборатория Коллинза при Массачусетском технологическом институте
- Веб-страница факультета Джима Коллинза в Институте Висса Гарвардского университета
| Базы данных авторитетного контроля : академики |
|---|
- 1965 года рождения
- Живые люди
- Ученые из Нью-Йорка
- Американские стипендиаты Родса
- Преподаватели Бостонского университета
- Выпускники Колледжа Святого Креста
- Макартур Феллоуз
- Люди из Нашуа, Нью-Гэмпшир
- Ученые по сложным системам
- Системные биологи
- Синтетические биологи
- Говард Хьюз Медицинские следователи
- Члены Американской академии искусств и наук
- Члены Национальной инженерной академии США
- Члены Национальной академии наук США
- Члены Национальной Медицинской Академии
- Члены Американского физического общества