Кинематика — это изучение того, как движутся объекты, механические они или живые. В локомоции животных кинематика используется для описания движения тела и конечностей животного. В конечном итоге цель состоит в том, чтобы понять, как движение отдельных конечностей связано с общим движением животного в окружающей среде. Ниже выделены ключевые кинематические параметры, используемые для количественной оценки движений тела и конечностей для различных способов передвижения животных.
Передвижение на ногах — доминирующая форма наземного передвижения , передвижения по суше. Движение конечностей количественно определяется кинематикой самой конечности (внутриконечная кинематика) и координацией между конечностями (межконечная кинематика). [1] [2]
Рисунок 1. Классификация стоек и переходов передних правых (красных) и левых (синих) ног мухи. Начало стойки (черная точка) происходит на пиках сигнала положения ноги, тогда как начало поворота (голубая точка) происходит на минимумах.
Для количественной оценки кинематики внутри конечностей и координации между конечностями во время ходьбы необходимо изолировать фазы опоры и поворота шагового цикла. [2] [3] [4] [5] Стойка связана с той частью шага, где нога касается земли, тогда как свинг — это когда нога отрывается от земли и движется вперед вдоль тела. Для записи движений ног используется высокоскоростная видеосъемка. Затем методы оценки позы используются для отслеживания ключевых точек на каждой ноге, обычно в суставах ног. [6] [7] [8] [9] После извлечения положений каждой ноги на протяжении всей записи существует несколько способов определения фаз опоры и поворота цикла шагов. Один из подходов включает использование определения пиков и минимумов положений кончиков ног в эгоцентрических координатах и после того, как животное было выровнено по общему курсу (рис. 1). Альтернативно, поворот и стойка могут быть классифицированы как скорости кончиков ног выше и ниже выбранного порога соответственно. В этом случае скорости кончиков ног рассчитываются в аллоцентрических или мировых координатах. После определения фаз поворота и опоры можно рассчитать следующие кинематические и координационные параметры.
Переднее крайнее положение (AEP): крайнее переднее положение ноги (т.е. обычно начало фазы опоры).
Заднее крайнее положение (PEP): самое заднее положение ноги (т.е. обычно начало фазы переноса).
Продолжительность шага: время, прошедшее между двумя приступами позиции.
Частота шагов: обратная длительности шага (т. е. количеству шагов в секунду).
Продолжительность стойки: время, прошедшее между началом стойки и началом поворота.
Продолжительность замаха: время, прошедшее между началом замаха и последующим началом позиции.
Амплитуда шага: расстояние, которое проходит нога во время качания в эгоцентрической системе отсчета.
Длина шага: расстояние от начала позиции до начала позиции в мировой системе отсчета.
Диапазон движений шага: интегрированный путь ноги между началом стойки и смещением замаха.
Углы суставов. Ходьбу также можно оценить количественно посредством анализа углов суставов. [10] [11] [12] Во время передвижения на ногах животное сгибает и разгибает суставы колебательным образом, создавая рисунок угла сустава, который повторяется при каждом шаге. Ниже приведены некоторые полезные анализы угла суставов для характеристики ходьбы:
След угла сустава: след углов, которые сустав демонстрирует во время ходьбы.
Смещение фаз: отставание ноги относительно периода шага эталонной ноги.
Количество ног в стойке: количество ног в стойке в один момент времени.
Сила координации треноги (TCS): специфична для координации между конечностями шестиногих ног. Этот параметр определяет, насколько координация между конечностями напоминает каноническую походку треноги. TCS рассчитывается как отношение общего времени, в течение которого ноги, принадлежащие треноге (т. е. левая передняя, средняя правая и задняя левая ноги или наоборот), находятся вместе, к времени, прошедшему между первой ногой треноги, которая входит в качели и последняя ножка того же штатива, на которой заканчивается качель.
Связь между несколькими углами суставов: относительные углы двух суставов одной ноги или между ногами. Например, угол левого бедренно-большеберцового (коленного) сустава человека, когда правый бедренно-большеберцовый сустав находится в максимально согнутом или разогнутом положении.
Статическая устойчивость: минимальное расстояние от центра масс (ЦМ) до любого края опорного многоугольника, создаваемого ногами в стойке в каждый момент времени. [13] Ходящее животное является статически устойчивым, если у него достаточно ног для формирования опорного многоугольника (т. е. 3 или более), а COM находится внутри опорного многоугольника. Более того, статическая устойчивость максимальна, когда она находится в центре опорного многоугольника. Шаги для расчета статической устойчивости следующие:
Найдите, какие ноги находятся в стойке и расположение центра масс. Обратите внимание: если в стойке меньше трех ног, животное не является статически устойчивым.
Сформируйте опорный многоугольник, создав ребра между этими опорами по часовой стрелке.
Определите, находится ли центр масс внутри или снаружи опорного многоугольника. Алгоритм преобразования лучей — это распространенный подход к определению того, находится ли точка внутри многоугольника. Если центр масс находится за пределами многоугольника, животное статически нестабильно.
Если центр масс находится внутри опорного многоугольника, рассчитайте статическую устойчивость, вычислив минимальное расстояние центра масс до любого края многоугольника.
Динамическая стабильность: определяет степень, в которой отклонения от периодических движений во время ходьбы приведут к нестабильности. [14]
Количественная оценка ходьбы часто включает в себя оценку кинематики отдельных шагов. Дополнительную информацию о методах получения этих данных см. в разделе «Методы исследования». Первая задача — разобрать данные ходьбы на отдельные шаги. Методы анализа отдельных шагов на основе данных ходьбы во многом зависят от процесса сбора данных. На высоком уровне данные о ходьбе должны быть периодическими, при этом каждый цикл отражает движения одного шага, и поэтому шаги можно анализировать на пиках сигнала. Часто бывает полезно сравнить или объединить данные шагов. Одна из трудностей в этом преследовании — разная длина шагов как внутри ног, так и между ними. Существует множество способов согласования шагов. Ниже приведены несколько полезных методов.
Шаг растяжения: шаги различной длительности могут быть растянуты до одинаковой длительности.
шага Фаза : можно вычислить фазу каждого шага, которая количественно определяет, насколько далеко прошла каждая точка данных на шаге. Это нормализует данные по длине шага, позволяя сравнивать данные шагов различной длины. можно Преобразование Гильберта использовать для расчета фазы, однако расчет фазы вручную может быть лучше для выравнивания пикового выравнивания (поворота и начала позиции).
Внедрение UMAP кинематики углов суставов ног у шагающих плодовых мух. Изменчивость отдельных мух проявляется в их четкой группировке (C), однако их модели координации схожи (D). [8]
У плодовых мух шесть ног и по четыре сустава на каждой ноге, причем многие суставы двигаются в разных плоскостях. Таким образом, существует множество кинематических степеней свободы. Таким образом, непрерывную изменчивость моделей координации в зависимости от скорости ходьбы и отдельных мух можно визуализировать с помощью низкоразмерного вложения: [8] используя такие методы, как анализ главных компонентов и UMAP .
Считается, что помимо стабильности, устойчивость походки при ходьбе также важна для определения походки мухи при определенной скорости ходьбы. Устойчивость означает, насколько можно допустить смещение во времени положения ног, прежде чем полет станет статически нестабильным. Например, устойчивая походка может быть особенно важна при движении по неровной местности, поскольку она может вызвать неожиданные нарушения координации ног. В этом случае использование уверенной походки поможет мухе сохранить устойчивость. Анализы показывают, что мухи могут демонстрировать компромисс между наиболее стабильной и наиболее устойчивой походкой при заданной скорости ходьбы. [15]
Кинематические изменения в зависимости от скорости
Многие животные изменяют кинематику ходьбы, регулируя скорость ходьбы. [16] [17] [18] Кинематическим параметром между конечностями, который обычно зависит от скорости, является походка, схема шага по ногам. Хотя некоторые животные чередуют разные походки в зависимости от скорости, [19] другие движутся континуумом походок. [20] Точно так же животные обычно модулируют параметры внутри конечностей в зависимости от скорости. Например, плодовые мухи уменьшают продолжительность стойки и увеличивают длину шага по мере увеличения скорости движения вперед. [21] Важно отметить, что кинематика модулируется не только по скорости движения вперед, но также по скорости вращения и скольжения. [22] В этих случаях часто встречается асимметрия модуляции между левой и правой ногами.
Воздушное передвижение — это форма движения, используемая многими организмами, которая обычно приводится в движение хотя бы одной парой крыльев. Однако у некоторых организмов есть другие морфологические особенности, позволяющие им скользить. Существует множество различных режимов полета, таких как взлет, зависание, парение и приземление. [23] Количественная оценка движений крыльев во время этих режимов полета даст представление о маневрах тела и крыльев, которые необходимы для выполнения такого поведения. [23] Ориентация крыла количественно определяется на протяжении всего цикла полета тремя углами, которые определяются в системе координат относительно основания крыла. [24] [25] Величину этих трех углов часто сравнивают при движении вверх и вниз. [24] [25] [26] [27] Кроме того, кинематические параметры используются для характеристики цикла полета, состоящего из хода вверх и хода вниз. [24] [26] [27] [25] Аэродинамику часто учитывают при количественной оценке движения в воздухе, поскольку аэродинамические силы (например, подъемная сила или сопротивление) могут влиять на летные характеристики. [28] Ключевые параметры из этих трех категорий определяются следующим образом:
Ориентация крыла описывается в системе координат с центром в шарнире крыла. [24] Плоскость xy совпадает с плоскостью штриха, плоскостью, параллельной плоскости, содержащей оба законцовки крыла, и центрированной у основания крыла. [24] Предполагая, что крыло можно смоделировать вектором, проходящим через основание и законцовку крыла, следующие углы описывают ориентацию крыла: [24]
Положение удара: угол, описывающий движение крыльев вперед-назад относительно плоскости удара. Этот угол вычисляется как проекция вектора крыла на плоскость удара.
Отклонение хода: угол, характеризующий вертикальную амплитуду крыльев относительно плоскости хода. Этот угол определяется как угол между вектором крыла и его проекцией на плоскость удара.
Угол атаки: угловая ориентация крыльев (т.е. наклон) относительно плоскости удара. Этот угол вычисляется как угол между вектором поперечного сечения крыла и плоскостью удара.
Число Рейнольдса : отношение сил инерции к силам вязкости. Этот показатель помогает описать, как характеристики крыла меняются в зависимости от размера тела. [28]
Движение в воде невероятно разнообразно, начиная от движений ластами и плавниками. [29] к реактивному движению. [30] Ниже приведены некоторые распространенные методы характеристики плавания:
Реактивное движение состоит из двух фаз - фазы наполнения, во время которой животное заполняет полость водой, и фазы сжатия, когда оно выдавливает воду из полости, чтобы вытолкнуть ее в противоположном направлении. Размер полости можно измерить на этих двух этапах, чтобы сравнить количество воды, проходящей через каждый двигатель. [30]
Документальный фильм, снятый со скоростью 1200 кадров в секунду, используемый для изучения движений гепарда. В конце видео показаны методы, использованные при съемке.
Для изучения локомоции животных используются разнообразные методы и оборудование:
используются, чтобы позволить животным ходить или бегать, оставаясь неподвижными или ограниченными по отношению к внешним наблюдателям. Этот метод облегчает съемку или запись физиологической информации животного (например, во время исследований энергетики). [32] ). Некоторые беговые дорожки состоят из линейного ремня (одинарного). [33] или разрезной ремень [34] ), которые вынуждают животное ходить вперед, в то время как другие допускают вращение на 360 градусов. [35] [36] [34] Немоторизованные беговые дорожки движутся в ответ на самостоятельное передвижение животного, тогда как моторизованные беговые дорожки управляют движением извне и часто используются для измерения выносливости (выносливости) животных. [37] [38]
Привязное передвижение
Животные могут быть зафиксированы на месте, что позволяет им двигаться, оставаясь неподвижными относительно окружающей среды. Привязанных животных можно опускать на беговую дорожку для обучения ходьбе. [36] подвешены в воздухе для изучения полета, [39] или погрузиться в воду, чтобы научиться плаванию. [40]
Плодовая мушка Drosophila melanogaster , привязанная и идущая по сферической беговой дорожке. Замедлено в 6 раз.
Непривязанное передвижение
Животные могут перемещаться по окружающей среде, не удерживаясь на месте, и их движение можно отслеживать для анализа такого поведения. [41] [42] [43] [44] Однако свободно движущихся животных труднее отслеживать в 3D для детального кинематического анализа координации внутри конечностей.
Визуальные арены
передвижение можно продлить и иногда контролировать с помощью визуальной арены, отображающей определенный образец света. Многие животные используют визуальные очереди из своего окружения, чтобы контролировать свое передвижение, поэтому предоставление им псевдооптического потока или контекстно-зависимых визуальных функций может стимулировать и продлевать передвижение. [45] [36] [46] [47]
облицованные фотоэлементами или снятые на видео, пока животные бегут по ним, используются для измерения ускорения и максимальной скорости спринта. [48] [49]
Высокоскоростная видеосъемка
изучение движения всего животного или частей его тела (т. е. кинематика ) обычно достигается путем отслеживания анатомических участков животного и последующей записи видео его движения под разными углами. Традиционно анатомические местоположения отслеживались с помощью визуальных маркеров, наносимых на тело животного. становится все более распространенным использование методов компьютерного зрения Однако для безмаркерной оценки позы .
Оценка позы на основе маркеров: визуальные маркеры необходимо разместить на животном в желаемых интересующих областях. Местоположение каждого маркера определяется для каждого видеокадра, а данные из нескольких представлений интегрируются, чтобы определить положение каждой точки во времени. Затем визуальные маркеры можно аннотировать в каждом кадре вручную. Однако это трудоемкая задача, поэтому для автоматизации обнаружения маркеров часто используются методы компьютерного зрения.
Оценка позы без маркеров: определяемые пользователем части тела необходимо вручную аннотировать в серии кадров для использования в качестве обучающих данных. [6] Затем используются методы глубокого обучения и компьютерного зрения , чтобы узнать расположение частей тела в тренировочных данных. Далее обученная модель используется для прогнозирования расположения частей тела в каждом кадре вновь собранных видеороликов. Полученные данные временного ряда состоят из положений видимых частей тела в каждом кадре видео. Параметры модели можно оптимизировать, чтобы минимизировать ошибку отслеживания и повысить надежность.
Кинематические данные, полученные любым из этих методов, можно использовать для определения основных атрибутов движения, таких как скорость, ускорение, углы суставов, а также последовательность и время кинематических событий. Эти фундаментальные атрибуты можно использовать для количественной оценки различных атрибутов более высокого уровня, таких как физические способности животного (например, его максимальная скорость бега, насколько крутой склон оно может подняться), походка , нейронный контроль передвижения и реакции на изменения окружающей среды. . Это может помочь в формулировании гипотез о животном или его передвижении в целом. Duration: 45 seconds.0:45Одновременное измерение наземных сил (синий) и кинематики, такой как траектории черешка (красный) и схема шагов (желтый) идущих пустынных муравьев в лабораторных условиях, для описания попеременной походки на штативе. Скорость записи: 500 кадров в секунду. Скорость воспроизведения: 10 кадров в секунду. Подходы к оценке позы на основе маркеров и без маркеров имеют свои преимущества и недостатки, поэтому метод, который лучше всего подходит для сбора кинематических данных, может во многом зависеть от исследуемого животного. Методы отслеживания на основе маркеров, как правило, более портативны, чем методы без маркеров, которые требуют точной калибровки камеры. [50] Однако безмаркерные подходы преодолевают некоторые недостатки отслеживания на основе маркеров, поскольку размещение визуальных маркеров на исследуемом животном может быть непрактичным, дорогим или трудоемким. [50] Существует множество общедоступных пакетов программного обеспечения, которые обеспечивают поддержку безмаркерной оценки позы. [6]
представляют собой платформы, обычно часть тропы, которые можно использовать для измерения величины и направления сил при шаге животного. При использовании кинематики и достаточно подробной модели анатомии решения обратной динамики могут определять силы не только при контакте с землей, но и в каждом суставе конечности.
(ЭМГ) — это метод обнаружения электрической активности, возникающей при активации мышц, позволяющий определить, какие мышцы животное использует для данного движения. Это может быть достигнуто либо с помощью поверхностных электродов (обычно у крупных животных), либо с помощью имплантированных электродов (часто провода тоньше человеческого волоса). Более того, интенсивность электрической активности может коррелировать с уровнем мышечной активности, причем большая активность подразумевает (хотя и не однозначно) большую силу.
— это метод, используемый для контроля активности целевых нейронов, которые были генетически модифицированы для реагирования на световые сигналы. Оптогенетическая активация и молчание нейронов могут помочь определить, какие нейроны необходимы для выполнения определенного локомоторного поведения, а также функцию этих нейронов при выполнении такого поведения.
использует пару пьезоэлектрических кристаллов, имплантированных в мышцу или сухожилие, для непрерывного измерения длины мышцы или сухожилия. Это полезно, поскольку кинематика поверхности может быть неточной из-за движения кожи. Аналогично, если эластичное сухожилие расположено последовательно с мышцей, длина мышцы может неточно отражаться углом сустава.
Сухожильные силовые пряжки
Измерьте силу, создаваемую отдельной мышцей, путем измерения напряжения сухожилия. После эксперимента определяется модуль упругости сухожилия, который используется для расчета точной силы, создаваемой мышцей. Однако это можно использовать только для мышц с длинными сухожилиями.
используется в водных и воздушных системах для измерения потока жидкости вокруг и мимо движущегося водного организма, что позволяет выполнять гидродинамические расчеты для определения градиентов давления, скорости и т. д.
позволяет получать рентгеновское видео в реальном времени для точной кинематики движущихся костей. Маркеры, непрозрачные для рентгеновских лучей, позволяют одновременно отслеживать длину мышц.
Многие из вышеперечисленных методов можно комбинировать для улучшения изучения локомоции. Например, исследования часто сочетают ЭМГ и кинематику для определения двигательного паттерна — серии электрических и кинематических событий, которые вызывают данное движение. Оптогенетические возмущения также часто сочетаются с кинематикой для изучения того, как на локомоторное поведение и задачи влияет активность определенной группы нейронов. Наблюдения, полученные в результате оптогенетических экспериментов, могут дать представление о нейронных схемах, лежащих в основе различного локомоторного поведения. В исследованиях также часто собирают высокоскоростные видеоролики с животными на беговой дорожке. Такая установка может обеспечить повышенную точность и надежность при определении позы животного во времени.
Модели передвижения животных важны для получения нового понимания и предположений о том, как кинематика возникает в результате взаимодействия нервной , скелетной и /или мышечной систем , которые в противном случае было бы трудно получить из экспериментов. Ниже приведены типы моделей передвижения животных:
Нейромеханика — это область, которая объединяет биомеханику и нейробиологию для понимания сложных взаимодействий между физической средой, нервной системой, мышечной и скелетной системами, которые, следовательно, приводят к ожидаемому движению тела. [51] Таким образом, нейромеханические модели направлены на имитацию движения с учетом нейронных команд для определенных мышц и того, как эти мышцы связаны со скелетом животного. [52] [53] [54] Ключевыми компонентами нейромеханических моделей являются:
Морфологически точная 3D-модель скелета животного, состоящая из твердых тел (т.е. костей), расположенных натуралистическим образом. В этих моделях необходимо задать свойства каждого твердого тела, такие как масса, длина и ширина. Кроме того, необходимо определить соединения между твердыми телами как по типу (например, шарнир и шар в гнезде), так и по степеням свободы (т. е. как твердые тела движутся относительно друг друга). Последним шагом является присвоение каждому твердому телу объекта-сети, который определяет внешний вид (например, внешнюю поверхность кости) и другие контактные свойства твердых тел. Эти скелетные модели можно построить с помощью различных программ 3D-моделирования, таких как Blender и Opensim Creator .
После построения скелетной модели следующим шагом будет точное определение точек крепления мышц к твердым телам. Это задание имеет решающее значение для того, чтобы твердые тела были четко сформулированы натуралистическим образом. Существует несколько типов мышечных моделей, которые имитируют динамику мышечной активации, сокращения и расслабления, включая модели мышц типа Хилла и типа Экеберга. [53] [55]
Нейронные контроллеры, которые имитируют рекрутирование и активность двигательных нейронов с помощью центральных команд, используются для определения времени и силы активации моделируемых мышц. Существует множество разновидностей этих контроллеров, например модели связанных фазовых генераторов и нейронных сетей.
Среда, включающая физику, необходима для моделирования реалистичного движения нейромеханических моделей, поскольку они подчиняются законам физики. Среды, используемые для физического моделирования, включают Opensim, [56] PyBullet и MuJoCo .
^ Марков Даниил А.; Петрукко, Луиджи; Кист, Андреас М.; Португальский, Рубен (14 сентября 2020 г.). «Внутренняя модель мозжечка калибрует контроллер обратной связи, участвующий в сенсомоторном управлении». bioRxiv 10.1101/2020.02.12.945956 .
^ Демельт, Флориан А.; Мейер, Ребекка; Хинц, Джулиан; Ёсимацу, Такеши; Симачек, Клара А.; Ван, Кун; Баден, Том; Арренберг, Аристидес Б. (23 сентября 2020 г.). «Поведение стабилизации взгляда у рыбок данио анизотропно в разных частях поля зрения». bioRxiv 10.1101/754408 .
Arc.Ask3.Ru Номер скриншота №: 59d81af1f6364ea27636534118cc327f__1712213220 URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/59/7f/59d81af1f6364ea27636534118cc327f.html Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1: Study of animal locomotion - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)