ATPC РНК -мотив
ATPC РНК -мотив | |
---|---|
![]() Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности ATPC | |
Идентификаторы | |
Символ | ATPC |
RFAM | RF01067 |
Другие данные | |
РНК тип | Ген |
Домен (ы) | Бактерии |
ТАК | SO: 0001263 |
PDB Структуры | PDBE |
Мотив РНК ATPC представляет собой консервативную РНК -структуру, обнаруженную в определенных цианобактериях . [ 1 ] Это, по -видимому, вездесущему в Prochlorococcus marinus и присутствует во многих видах в роде Synechococcus . РНК всегда обнаруживается в оперон субъединицах, кодирующих , а АТФсинтазы , и она всегда расположена ниже гена, кодирующего субъединицу АТФ -синтазы, и выше по течению от C. гена Это расположение согласуется с цис-регуляторным элементом , но также также с некодирующей РНК , которая транскрибируется генами АТФ-синтазы.
Простые РНК-структуры, называемые стволовыми петлями, были зарегистрированы в АТФ-синтазных оперонах различных цианобактерий, [ 2 ] но не структуры, такие как 3-стемный соединение, которое является основной особенностью мотива РНК ATPC.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). «Идентификация 22 кандидатных структурированных РНК у бактерий с использованием сравнительного конвейера геномики CMfinder» . Нуклеиновые кислоты Res . 35 (14): 4809–4819. doi : 10.1093/nar/gkm487 . PMC 1950547 . PMID 17621584 .
- ^ Кертис С.Е. (1988). «Структура, организация и экспрессия цианобактериальных генов АТФ -синтазы». Фотосинты. Резерв 18 (1–2): 223–244. doi : 10.1007/bf00042986 . PMID 24425167 . S2CID 1114405 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]