белок рецептора цАМФ
| Белок рецептора CAMP | |||
|---|---|---|---|
 Структура белка циклического АМФ-рецептора E. coli . | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | CRP | ||
| Альт. символы | КАП | ||
| ген NCBI | 947867 | ||
| ПДБ | 1И5З | ||
| RefSeq | НП_417816.1 | ||
| ЮниПрот | P0ACJ8 | ||
| |||
Белок рецептора цАМФ ( CRP ; также известный как белок-активатор катаболита , CAP ) является регуляторным белком у бактерий .
Белок
[ редактировать ]CRP Белок связывает циклический аденозинмонофосфат (цАМФ), что вызывает конформационные изменения, позволяющие CRP прочно связываться со специфическим участком ДНК в промоторах генов, которые он контролирует. [1] [2] Затем СРБ активирует транскрипцию посредством прямых белок-белковых взаимодействий с РНК-полимеразой . [1] [2]
Гены, регулируемые CRP, в основном участвуют в энергетическом обмене, например, галактоза , цитрат или система транслокации групп PEP . [3] [4] В Escherichia coli СРБ может регулировать транскрипцию более 100 генов.
Сигналом к активации СРБ является связывание циклического АМФ. Связывание цАМФ с СРБ приводит к передаче сигнала на большие расстояния от N-концевого цАМФ-связывающего домена к С-концевому домену белка, который отвечает за взаимодействие со специфическими последовательностями ДНК. [5]
На CRP-зависимых промоторах «класса I» CRP связывается с участком ДНК, расположенным выше основных элементов промотора, и активирует транскрипцию посредством белок-белковых взаимодействий между «активирующей областью 1» CRP и C-концевым доменом альфа-субъединицы РНК-полимеразы . [1] [2] [6] На CRP-зависимых промоторах «класса II» CRP связывается с участком ДНК, который перекрывает элемент промотора -35, и активирует транскрипцию посредством двух наборов белок-белковых взаимодействий: (1) взаимодействия между «активирующей областью 1» CRP и С-концевой домен альфа-субъединицы РНК-полимеразы и (2) взаимодействие между «активирующей областью 2» CRP и N-концевым доменом альфа-субъединицы РНК-полимеразы . [1] [2] На CRP-зависимых промоторах «класса III» CRP функционирует вместе с одним или несколькими белками -коактиваторами . [1] [2]
На большинстве CRP-зависимых промоторов CRP активирует транскрипцию преимущественно или исключительно посредством механизма «рекрутирования», при котором белок-белковые взаимодействия между CRP и РНК-полимеразой способствуют связыванию РНК-полимеразы с промотором. [1]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Басби С., Эбрайт Р.Х. (1999). «Активация транскрипции белком-активатором катаболита (CAP)». Дж. Мол. Биол . 293 (2): 199–213. дои : 10.1006/jmbi.1999.3161 . ПМИД 10550204 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Лоусон К.Л., Свигон Д., Мураками К.С., Дарст С.А., Берман Х.М., Эбрайт Р.Х. (2004). «Белок-активатор катаболита: связывание ДНК и активация транскрипции» . Курс. Мнение. Структура. Биол . 14 (1): 10–20. дои : 10.1016/j.sbi.2004.01.012 . ПМК 2765107 . ПМИД 15102444 .
- ^ Вейкерт М.Дж., Адхья С. (1993). «Галактозный регулон кишечной палочки» . Мол. Микробиол . 10 (2): 245–51. дои : 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01950.x . ПМИД 7934815 . S2CID 6872903 .
- ^ Ботт М (1997). «Анаэробный метаболизм цитрата и его регуляция у энтеробактерий». Арх. Микробиол . 167 (2–3): 78–88. дои : 10.1007/s002030050419 . ПМИД 9133329 . S2CID 22913073 .
- ^ Попович Н.; Цзэн, С.-Р.; Тонелли, М.; Эбрайт, Р.Х.; Калодимос, К.Г. (2009). «Структурная основа аллостерического контроля цАМФ-белка-активатора катаболитов» . Труды Национальной академии наук . 106 (17): 6927–6932. дои : 10.1073/pnas.0900595106 . ПМЦ 2678429 . ПМИД 19359484 .
- ^ Хадсон, BP; Киспе, Дж.; Лара-Гонсалес, С.; Ким, Ю.; Берман, HM; Арнольд, Э.; Эбрайт, Р.Х.; Лоусон, CL (2009). «Трехмерная ЭМ-структура интактного активатор-зависимого комплекса инициации транскрипции» . Труды Национальной академии наук . 106 (47): 19830–19835. дои : 10.1073/pnas.0908782106 . ПМЦ 2775702 . ПМИД 19903881 .