Конкатемер
Конкатемер — это длинная непрерывная молекула ДНК , содержащая несколько последовательно соединенных копий одной и той же последовательности ДНК. Эти полимерные молекулы обычно представляют собой копии всего генома, концами и разделенные сайтами cos ( белковосвязывающая связанные нуклеотидная последовательность , которая встречается один раз в каждой копии генома). Конкатемеры часто являются результатом репликации по катящемуся кругу и могут наблюдаться на поздней стадии заражения бактерий фагами . Например, если гены в ДНК фага расположены ABC, то в конкатемере гены будут иметь вид ABCABCABCABC и так далее (при условии, что синтез инициирован между генами C и A). В дальнейшем они разрушаются рибозимами . [1]
Было показано, что во время активного заражения некоторые виды вирусов реплицируют свой генетический материал посредством образования конкатемеров. [2] В случае с вирусом герпеса человека-6 весь его геном снова и снова состоит из одной цепи. Эти длинные конкатемеры впоследствии расщепляются рибозимами между областями pac-1 и pac-2 , когда геном упаковывается в отдельные вирионы.
Реплицирующую ДНК бактериофага Т4 метили тритиевым тимидином и исследовали авторадиографией . [3] Наблюдаемые промежуточные соединения репликации ДНК включали кольцевые и разветвленные кольцевые конкатемерные структуры, которые, вероятно, возникли в результате репликации по катящемуся кругу .
Было обнаружено, что при сборке конкатемеров из синтетических олигонуклеотидов повышение концентрации соли до 200 мМ является основным фактором оптимизации из-за ее способности повышать ионную силу, что ускоряет образование конкатемеров. [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Боренштейн, Ронен; Френкель, Низа (2009). «Клонирование генома вируса герпеса человека 6А в искусственные бактериальные хромосомы и исследование промежуточных продуктов репликации ДНК» . Труды Национальной академии наук . 106 (45): 19138–19143. Бибкод : 2009PNAS..10619138B . дои : 10.1073/pnas.0908504106 . ПМЦ 2767366 . ПМИД 19858479 .
- ^ Арбакл, Джесси (2011). «Молекулярная биология латентного периода вируса герпеса-6 человека и интеграции теломер» . Микробы и инфекции . 13 (8–9): 731–741. дои : 10.1016/j.micinf.2011.03.006 . ПМК 3130849 . ПМИД 21458587 .
- ^ Бернштейн Х., Бернштейн С. (июль 1973 г.). «Кольцевые и разветвленные кольцевые соединения как возможные промежуточные соединения в репликации ДНК бактериофага Т4». Дж. Мол. Биол . 77 (3): 355–61. дои : 10.1016/0022-2836(73)90443-9 . ПМИД 4580243 .
- ^ Сунь, Лу; Окерман, Бьёрн (август 2014 г.). «Характеристика самособирающихся конкатемеров ДНК из синтетических олигонуклеотидов» . Журнал вычислительной и структурной биотехнологии . 11 (18): 66–72. дои : 10.1016/j.csbj.2014.08.011 . ПМК 4212282 . ПМИД 25379145 .
Библиография
[ редактировать ]- Оксфордский словарь биохимии и молекулярной биологии, 2-е изд. Р.Л., ред. Издательство Оксфордского университета, 2006. с. 138.
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |