Элис Баркан

Элис Баркан
Элис Баркан
Альма-матер	Массачусетский технологический институт (BS) ; Университет Висконсина (доктор философии)
Известный	генетические механизмы в хлоропластах
Награды	Член Американской ассоциации содействия развитию науки (2017 г.) ; Член Национальной академии наук (2020 г.)
	Научная карьера
Поля	Молекулярная биология
Учреждения	Университет Орегона
Докторантура	Джанет Э. Мерц

Элис Баркан — американский молекулярный биолог и профессор биологии в Университете Орегона . Она известна своими работами по регуляции генов хлоропластов и синтезу белка.

Образование

Элис Баркан получила степень бакалавра в Массачусетском технологическом институте .

В 1983 году она защитила докторскую диссертацию. из Университета Висконсина под руководством Джанет Э. Мерц с диссертацией «Характеристика обезьяньего вируса 40 мутантов позднего лидерного региона». ^[2]^[3]^[1]

Карьера и награды

Баркан поступила в Университет Орегона в 1991 году, где в настоящее время является профессором Института молекулярной биологии. ^[4]

Баркан был назван членом Американской ассоциации содействия развитию науки в 2017 году. ^[5]

В 2018 году Баркан получил Премию Лоуренса Богорада за выдающиеся достижения в исследованиях в области биологии растений от Американского общества биологов растений .

Баркан был лауреатом Премии за выдающиеся достижения факультета Университета Орегона за 2018–2019 годы. ^[6]

Баркан был избран членом Национальной академии наук в 2020 году. ^[7] Избрание в Национальную академию – одна из самых высоких наград в научной сфере.

Университет Орегона (UO) наградил Баркан премией за выдающуюся карьеру в 2020 году в знак признания не только ее научных достижений, но и ее карьерного вклада в преподавание, наставничество и лидерство в UO. ^[8]

Исследовать

Исследования Баркана сосредоточены на том, как белки, кодируемые ядром, влияют на хлоропластов экспрессию генов . ^[9]^[10]^[11] В экспериментах ее лаборатории используются мутанты, в первую очередь кукурузы ( Zea mays ), а также Arabidopsis thaliana , для изучения и стабильности мРНК трансляции хлоропластов , а также многих аспектов созревания РНК, включая сплайсинг и редактирование . ^[12]^[13]^[14] Баркан и ее коллеги обнаружили и изучили десятки ядерных генов растений, которые кодируют РНК-связывающие белки хлоропластов, которые напрямую влияют на множество аспектов метаболизма РНК (процессинг, сплайсинг, трансляция, стабильность). ^[15] Большинство белков, кодируемых ядром, которые охарактеризовал Баркан, содержат пентатрикопептидные повторы (PPR). ^[9] Баркан также обнаружил и назвал домен CRM ( сплайсинг РНК хлоропластов и созревание рибосом ), который обнаружен в кодируемых ядром белках, необходимых для сплайсинга РНК хлоропластов. ^[16]^[17] В 2019 году Баркан и его коллеги успешно сконструировали белки PPR, которые связывали определенные последовательности РНК in vivo, создав тем самым систему для создания целевых взаимодействий белок-РНК . ^[18]^[19]

Личная жизнь

Баркан является одним из основателей музыкальной группы Byrdsong Renaissance Consort, с которой она играет на скрипке и блокфлейте. ^[20]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б «Жизнеописание Джанет Мерц, 1984 год» . Репозиторий архивов CSHL. 1984 год . Проверено 24 мая 2019 г.
^ «Алиса Баркан» . Университет Орегона — Институт молекулярной биологии . Проверено 24 мая 2019 г.
^ Диссертация Алисы Баркан . 1983 год . Проверено 17 июля 2019 г. {{cite book}}: |website= игнорируется ( помогите )
^ «Алиса Баркан» . molbio.uoregon.edu . Проверено 14 июня 2020 г.
^ «Шесть преподавателей UO названы стипендиатами AAAS» . Университет Орегона. 20 ноября 2017 года . Проверено 24 мая 2019 г.
^ «Проректор объявляет лауреатов награды за выдающиеся достижения факультета» . О. Вокруг Университет Орегона. 19 июня 2018 г. Проверено 29 декабря 2020 г. .
^ «Выборы НАН 2020» . nasonline.org . Проверено 2 мая 2020 г.
^ «Пять преподавателей получают награды за выдающиеся исследования» . О. Вокруг Университет Орегона. 8 июня 2020 г. Проверено 29 декабря 2020 г. .
^ Jump up to: ^а ^б Баркан, Алиса; Смолл, Ян (29 апреля 2014 г.). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях» . Ежегодный обзор биологии растений . 65 (1): 415–442. doi : 10.1146/annurev-arplant-050213-040159 . ISSN 1543-5008 . ПМИД 24471833 .
^ Уоткинс, Кеннет П.; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Чотевутмонтри, Пракичай; Фризо, Джулия; Тойбнер, Марлен; Белчер, Сьюзен; Руве, Ханнес; Шмитц-Линневебер, Кристиан; Вейк, Клаас Дж. ван; Баркан, Алиса (2020). «Изучение протеома, связанного с мРНК, кодирующей белок реакционного центра D1 Фотосистемы II в хлоропластах растений» . Заводской журнал . 102 (2): 369–382. дои : 10.1111/tpj.14629 . ISSN 1365-313X . ПМИД 31793101 .
^ Чотевутмонтри, Пракичай; Баркан, Алиса (14 июля 2016 г.). Воллман, Фрэнсис-Андре (ред.). «Динамика трансляции хлоропластов во время дифференцировки хлоропластов у кукурузы» . ПЛОС Генетика . 12 (7): e1006106. дои : 10.1371/journal.pgen.1006106 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4945096 . ПМИД 27414025 .
^ Баркан, А. (1 сентября 1988 г.). «Каждый из белков, кодируемых сложной транскрипционной единицей хлоропласта, транслируется как с моноцистронной, так и с полицистронной мРНК» . Журнал ЭМБО . 7 (9): 2637–2644. дои : 10.1002/j.1460-2075.1988.tb03116.x . ISSN 0261-4189 . ПМК 457051 . ПМИД 2460341 .
^ Баркан, А. (1 апреля 1993 г.). «Ядерные мутанты кукурузы с дефектами сборки полисом хлоропластов изменили метаболизм хлоропластной РНК» . Растительная клетка . 5 (4): 389–402. дои : 10.1105/tpc.5.4.389 . ISSN 1040-4651 . ПМК 160279 . ПМИД 12271069 .
^ Дженкинс, Б.Д.; Кулханек, диджей; Баркан, А. (1 марта 1997 г.). «Ядерные мутации, которые блокируют сплайсинг РНК группы II в хлоропластах кукурузы, обнаруживают несколько классов интронов с различными требованиями к факторам сплайсинга» . Растительная клетка . 9 (3): 283–296. дои : 10.1105/tpc.9.3.283 . ISSN 1040-4651 . ПМК 156918 . ПМИД 9090875 .
^ Баркан, Алиса; Гольдшмидт-Клермон, Мишель (7 июня 2000 г.). «Участие ядерных генов в экспрессии генов хлоропластов» . Биохимия . 82 (6): 559–572. дои : 10.1016/S0300-9084(00)00602-7 . ISSN 0300-9084 . ПМИД 10946107 .
^ Остхаймер, Дж.Дж. (1 августа 2003 г.). «Факторы сплайсинга интронов группы II, полученные путем диверсификации древнего РНК-связывающего домена» . Журнал ЭМБО . 22 (15): 3919–3929. дои : 10.1093/emboj/cdg372 . ISSN 1460-2075 . ПМК 169045 . ПМИД 12881426 .
^ де Лонгевиль, Андеоль Фалькон; Смолл, Ян Д.; Лурин, Клэр (2010). «Ядерно-кодируемые факторы сплайсинга, участвующие в сплайсинге РНК в органеллах высших растений» . Молекулярный завод . 3 (4): 691–705. дои : 10.1093/mp/ssq025 . ПМИД 20603383 .
^ Макдермотт, Джеймс Дж.; Уоткинс, Кеннет П.; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Баркан, Алиса (01 августа 2019 г.). «Захват рибонуклеопротеина посредством экспрессии in vivo дизайнерского повторяющегося белка пентатрикопептида в Arabidopsis» . Растительная клетка . 31 (8): 1723–1733. дои : 10.1105/tpc.19.00177 . ISSN 1040-4651 . ПМК 6713294 . ПМИД 31123048 .
^ Рохас, Маргарет; Ю, Циго; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Малига, Пал; Баркан, Алиса (2019). «Сконструированные белки PPR как индуцируемые переключатели для активации экспрессии трансгенов хлоропластов» . Природные растения . 5 (5): 505–511. дои : 10.1038/ s41477-019-0412-1 ISSN 2055-0278 . ПМИД 31036912 . S2CID 139103684 .
^ "Бёрдсонг Ренессанс Консорт" . byrdsongconsort.com . Проверено 14 июня 2020 г.

Внешние ссылки

Публикации Алисы Баркан, проиндексированные Google Scholar
Профиль Института молекулярной биологии Университета Орегона

[MertzCV-1] Jump up to: ^а ^б «Жизнеописание Джанет Мерц, 1984 год» . Репозиторий архивов CSHL. 1984 год . Проверено 24 мая 2019 г.

[2] «Алиса Баркан» . Университет Орегона — Институт молекулярной биологии . Проверено 24 мая 2019 г.

[3] Диссертация Алисы Баркан . 1983 год . Проверено 17 июля 2019 г. {{cite book}}: |website= игнорируется ( помогите )

[4] «Алиса Баркан» . molbio.uoregon.edu . Проверено 14 июня 2020 г.

[5] «Шесть преподавателей UO названы стипендиатами AAAS» . Университет Орегона. 20 ноября 2017 года . Проверено 24 мая 2019 г.

[6] «Проректор объявляет лауреатов награды за выдающиеся достижения факультета» . О. Вокруг Университет Орегона. 19 июня 2018 г. Проверено 29 декабря 2020 г. .

[7] «Выборы НАН 2020» . nasonline.org . Проверено 2 мая 2020 г.

[8] «Пять преподавателей получают награды за выдающиеся исследования» . О. Вокруг Университет Орегона. 8 июня 2020 г. Проверено 29 декабря 2020 г. .

[auto-9] Jump up to: ^а ^б Баркан, Алиса; Смолл, Ян (29 апреля 2014 г.). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях» . Ежегодный обзор биологии растений . 65 (1): 415–442. doi : 10.1146/annurev-arplant-050213-040159 . ISSN 1543-5008 . ПМИД 24471833 .

[10] Уоткинс, Кеннет П.; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Чотевутмонтри, Пракичай; Фризо, Джулия; Тойбнер, Марлен; Белчер, Сьюзен; Руве, Ханнес; Шмитц-Линневебер, Кристиан; Вейк, Клаас Дж. ван; Баркан, Алиса (2020). «Изучение протеома, связанного с мРНК, кодирующей белок реакционного центра D1 Фотосистемы II в хлоропластах растений» . Заводской журнал . 102 (2): 369–382. дои : 10.1111/tpj.14629 . ISSN 1365-313X . ПМИД 31793101 .

[11] Чотевутмонтри, Пракичай; Баркан, Алиса (14 июля 2016 г.). Воллман, Фрэнсис-Андре (ред.). «Динамика трансляции хлоропластов во время дифференцировки хлоропластов у кукурузы» . ПЛОС Генетика . 12 (7): e1006106. дои : 10.1371/journal.pgen.1006106 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 4945096 . ПМИД 27414025 .

[:1-12] Баркан, А. (1 сентября 1988 г.). «Каждый из белков, кодируемых сложной транскрипционной единицей хлоропласта, транслируется как с моноцистронной, так и с полицистронной мРНК» . Журнал ЭМБО . 7 (9): 2637–2644. дои : 10.1002/j.1460-2075.1988.tb03116.x . ISSN 0261-4189 . ПМК 457051 . ПМИД 2460341 .

[:2-13] Баркан, А. (1 апреля 1993 г.). «Ядерные мутанты кукурузы с дефектами сборки полисом хлоропластов изменили метаболизм хлоропластной РНК» . Растительная клетка . 5 (4): 389–402. дои : 10.1105/tpc.5.4.389 . ISSN 1040-4651 . ПМК 160279 . ПМИД 12271069 .

[:3-14] Дженкинс, Б.Д.; Кулханек, диджей; Баркан, А. (1 марта 1997 г.). «Ядерные мутации, которые блокируют сплайсинг РНК группы II в хлоропластах кукурузы, обнаруживают несколько классов интронов с различными требованиями к факторам сплайсинга» . Растительная клетка . 9 (3): 283–296. дои : 10.1105/tpc.9.3.283 . ISSN 1040-4651 . ПМК 156918 . ПМИД 9090875 .

[:4-15] Баркан, Алиса; Гольдшмидт-Клермон, Мишель (7 июня 2000 г.). «Участие ядерных генов в экспрессии генов хлоропластов» . Биохимия . 82 (6): 559–572. дои : 10.1016/S0300-9084(00)00602-7 . ISSN 0300-9084 . ПМИД 10946107 .

[16] Остхаймер, Дж.Дж. (1 августа 2003 г.). «Факторы сплайсинга интронов группы II, полученные путем диверсификации древнего РНК-связывающего домена» . Журнал ЭМБО . 22 (15): 3919–3929. дои : 10.1093/emboj/cdg372 . ISSN 1460-2075 . ПМК 169045 . ПМИД 12881426 .

[17] де Лонгевиль, Андеоль Фалькон; Смолл, Ян Д.; Лурин, Клэр (2010). «Ядерно-кодируемые факторы сплайсинга, участвующие в сплайсинге РНК в органеллах высших растений» . Молекулярный завод . 3 (4): 691–705. дои : 10.1093/mp/ssq025 . ПМИД 20603383 .

[18] Макдермотт, Джеймс Дж.; Уоткинс, Кеннет П.; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Баркан, Алиса (01 августа 2019 г.). «Захват рибонуклеопротеина посредством экспрессии in vivo дизайнерского повторяющегося белка пентатрикопептида в Arabidopsis» . Растительная клетка . 31 (8): 1723–1733. дои : 10.1105/tpc.19.00177 . ISSN 1040-4651 . ПМК 6713294 . ПМИД 31123048 .

[19] Рохас, Маргарет; Ю, Циго; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Малига, Пал; Баркан, Алиса (2019). «Сконструированные белки PPR как индуцируемые переключатели для активации экспрессии трансгенов хлоропластов» . Природные растения . 5 (5): 505–511. дои : 10.1038/ s41477-019-0412-1 ISSN 2055-0278 . ПМИД 31036912 . S2CID 139103684 .

[20] "Бёрдсонг Ренессанс Консорт" . byrdsongconsort.com . Проверено 14 июня 2020 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ
Национальный	Израиль Соединенные Штаты
академики	Google Академика ОРЦИД