Цианофаг Н-1
| Цианофаг Н-1 | |
|---|---|
| Классификация вирусов | |
| Группа: | Группа I ( дцДНК )
|
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Цианомиовирус (предлагается)
|
| Разновидность: | Цианофаг Н-1
|
Цианофаг Н-1 — миовирусный бактериофаг инфицирующий пресноводные нитчатые цианобактерии рода Nostoc , . [ 1 ] Вирус был впервые выделен Кеннетом Адольфом и Робертом Хазелькорном в 1971 году в США из азотфиксирующей цианобактерии Nostoc muscorum . [ 2 ] [ 3 ] Н-1 тесно связан с цианофагом А-1, но лишь отдаленно с другими цианофагами пресноводного или морского происхождения. [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]Вирус имеет многогранную головку диаметром около 61 нм. Сократительный хвост имеет длину 100 нм и прикрепляется к головке через хвостовую капитель. Область шеи несет волокна. Зрелая вирусная частица содержит не менее 19 белков. [ 2 ] [ 4 ] [ 5 ]
Геном
[ редактировать ]Длина линейного двухцепочечного ДНК- генома составляет 64 960 пар оснований – лишь половина размера большинства фагов с сократительными хвостами, длина которых обычно находится в диапазоне 161–231 т.п.н. Он имеет содержание GC 35,4%. Из 91 открытой рамки считывания (ORF) только 33 демонстрируют сходство с другими известными последовательностями. Примечательно, что геном цианофага N1 кодирует функциональный массив CRISPR , который, как предполагается, защищает хозяина от заражения конкурирующими вирусами. [ 1 ]
Жизненный цикл и взаимодействие с хостом
[ редактировать ]Оптимальный pH для адсорбции вируса на N. muscorum составляет 7,6–8,1. Скорость адсорбции снижается с увеличением возраста клеток-хозяев. вируса Латентный период составляет 7 часов, что аналогично цианофагам группы ЛПП-1 . Размер пакета составляет 100 бляшкообразующих единиц на клетку. [ 6 ]
хозяина Для репликации вируса необходим фотосинтез , причем фотосинтез необходим на протяжении всего жизненного цикла, а не в какой-то конкретный момент. Репликация вируса осуществляется за счет циклического фотофосфорилирования и использования запасов углеводов ; активность фотосистемы II не требуется. [ 7 ] [ 8 ] цианофагом N-1 Инфицирование N. muscorum связано с рядом изменений в метаболизме углерода и азота хозяина, включая увеличение концентрации фермента глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы и снижение активности глутаминсинтетазы . [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Ченар С., Вирт Дж. Ф., Саттл Калифорния (2016), «Вирусы, заражающие пресноводную нитчатую цианобактерию ( Nostoc sp.), Кодируют функциональный массив CRISPR и протеобактериальную ДНК-полимеразу B», mBio , 7 (3): e00667-16, doi : 10.1128/mBio.00667-16 , PMC 4916379 , PMID 27302758
- ^ Jump up to: а б Адольф К.В., Хазелькорн Р. (1971), «Выделение и характеристика вируса, поражающего сине-зеленую водоросль Nostoc muscorum », Virology , 46 (2): 200–208, doi : 10.1016/0042-6822(71)90023-7 , PMID 4108613
- ^ Сарма 2012, стр. 420, 423.
- ^ Сарма 2012, стр. 423.
- ^ Адольф К.В., Хазелькорн Р. (1973), «Вирус сине-зеленых водорослей N-1: Физические свойства и разборка на структурные части», Virology , 53 (2): 427–40, doi : 10.1016/0042-6822(73)90222. -5 , ПМИД 4268208
- ^ Сарма 2012, стр. 427, 429.
- ^ Сарма 2012, стр. 430.
- ^ Календарь 2006 г., с. 524
- ^ Сарма 2012, стр. 433.
Источники
- Календарь Р. Бактериофаги ( Oxford University Press ; 2006) ( ISBN 0195148509 )
- Сарма ТА. Справочник по цианобактериям ( CRC Press ; 2012) ( ISBN 1466559411 )