Whalefall-1 Мотив РНК
Whalefall-1 Мотив РНК | |
---|---|
![]() Консенсусная вторичная структура RNAS Whalefall-1 | |
Идентификаторы | |
Символ | WF-1 |
RFAM | RF01762 |
Другие данные | |
РНК тип | Срна |
Домен (ы) | Кит осени метагеномом |
PDB Структуры | PDBE |
РНК -мотив Whalefall-1 (также называемый WF-1 ) относится к консервативной структуре РНК , которая была обнаружена с использованием биоинформатики . [ 1 ] [ 2 ] Структурно мотив состоит из двух петлей стеблей (см. Диаграмму), второй из которых часто заканчивается Cuug Tetraloop , который является энергетически благоприятной последовательности РНК. РНК Whalefall-1 обнаружены только в ДНК , извлеченной из некультивированных бактерий, обнаруженных на падении кита , то есть, китовую каркас. По состоянию на 2010 год РНК Whalefall-1 не были обнаружены ни в каких известных, культивируемых видах бактерий и, таким образом, являются одним из нескольких РНК, присутствующих в образцах окружающей среды .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
- ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериальных метагеномов» . Природа . 462 (7273): 656–9. Bibcode : 2009natur.462..656W . doi : 10.1038/nature08586 . PMC 4140389 . PMID 19956260 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]