Пластоцианиновое семейство медьсвязывающих белков
| Медьсвязывающие белки, семейство пластоцианинов/азуринов | |||
|---|---|---|---|
 Структура пластоцианина тополя. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Медный переплет | ||
| Пфам | PF00127 | ||
| ИнтерПро | IPR000923 | ||
| PROSITE | PDOC00174 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1plc / SCOPe / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 93 | ||
| белок OPM | 1сфд | ||
| CDD | cd00920 | ||
| |||
Семейство медь-связывающих белков пластоцианин/азурин (или синий (тип 1) медный домен) представляет собой семейство небольших белков, которые связывают один атом меди и характеризуются интенсивной полосой электронного поглощения около 600 нм (см. Медные белки ). [ 2 ] [ 3 ] Наиболее известными представителями этого класса белков являются растительные хлоропластические пластоцианины , которые обмениваются электронами с цитохромом с6, и отдаленно родственные бактериальные азурины , которые обмениваются электронами с цитохромом с551. Это семейство белков также включает амицианин из таких бактерий, как Mmethylobacterium extorquens или Paracoccus versutus (Thiobacillus versutus), которые могут расти на метиламине; аурацианины А и В из Chloroflexus aurantiacus ; [ 4 ] белок синей меди из Alcaligenes faecalis ; купредоксин (CPC) из Cucumis sativus (огурец); пилингов [ 5 ] кусацианин (основной синий белок; плантацианин, CBP) из огурца; галоцианин из Natronomonas pharaonis (Натрономонас фараонис), [ 6 ] мембраносвязанный медь-связывающий белок; псевдоазурин из Pseudomonas; рустицианин из Thiobacillus Ferrooxyans ; [ 7 ] стеллацианин из Rhus vernicifera (японского лакового дерева); умецианин из корней Armoracia Rusticana (Хрен); и аллерген Ra3 из амброзии. Этот белок пыльцы имеет эволюционное родство с вышеуказанными белками, но, по-видимому, утратил способность связывать медь. Хотя в последовательностях всех этих белков существуют значительные расхождения, сайты медных лигандов консервативны.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гасс Дж.М., Бартуник Х.Д., Фриман Х.К. (декабрь 1992 г.). «Точность и точность анализа структуры белка: ограниченное уточнение структуры пластоцианина тополя методом наименьших квадратов с разрешением 1,33 А». Акта Кристаллогр. Б. 48 (6): 790–811. дои : 10.1107/S0108768192004270 . ПМИД 1492962 .
- ^ Клингелеффер DJ, Гасс Дж.М., Роджерс С.Дж., Фриман Х.К., Гарретт Т.П. (1984). «Кристаллическая структура апопластоцианина тополя с разрешением 1,8 А. Геометрия места связывания меди создается полипептидом». Ж. Биол. Хим . 259 (5): 2822–2825. дои : 10.2210/pdb2pcy/pdb . ПМИД 6698995 .
- ^ Хант Л.Т., Райден Л.Г. (1993). «Эволюция сложности белков: синие медьсодержащие оксидазы и родственные белки». Дж. Мол. Эвол . 36 (1): 41–66. дои : 10.1007/BF02407305 . ПМИД 8433378 . S2CID 28527197 .
- ^ Мейер Т.Э., Хан Дж., Макманус Дж.Д., Брюн Д.К., Сандерс-Лёр Дж., Кусанович М.А., Толлин Г., Бланкеншип Р.Э. (1992). «Выделение, характеристика и аминокислотные последовательности аурацианинов, белков синей меди из зеленой фотосинтетической бактерии Chloroflexus aurantiacus». Ж. Биол. Хим . 267 (10): 6531–6540. ПМИД 1313011 .
- ^ Мессершмидт А., Манн К., Тонес У., Мехрабян З., Налбандян Р., Шафер В. (1992). «Аминокислотная последовательность медного белка типа I с необычным С-концевым доменом, богатым серином и гидроксипролином, выделенная из кожуры огурца» . ФЭБС Летт . 314 (3): 220–223. дои : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . ПМИД 1468551 . S2CID 24911765 .
- ^ Остерхельт Д., Маттар С., Шарф Б., Родевальд К., Энгельхард М., Кент С.Б. (1994). «Первичная структура галоцианина, архейного белка синей меди, предполагает наличие липидного якоря для мембранной фиксации». Ж. Биол. Хим . 269 (21): 14939–14945. ПМИД 8195126 .
- ^ Яно Т., Фукумори Ю., Яманака Т. (1991). «Аминокислотная последовательность рустицианина, выделенного из Thiobacillus FerroOXIDANS» . ФЭБС Летт . 288 (1): 159–162. дои : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . ПМИД 1879547 . S2CID 37485952 .