Домен бактериального белка YopR
| YopR_core | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура основного домена фактора вирулентности Yersinia pestis yopr | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | YopR_core | ||
| Пфам | PF09025 | ||
| ИнтерПро | ИПР013349 | ||
| |||
В молекулярной биологии YopR представляет собой белковый домен, обычно встречающийся у грамотрицательных бактерий, в частности Yersinia , и является основным доменом. Белки III типа секреции в этой статье являются эффекторами системы они называются по-разному . У разных видов , а у Yersinia они обозначены YopR (внешний белок R иерсинии), который кодируется геном YscH (секреция H иерсинии ) . Этот белок Yop необычен тем, что он высвобождается во внеклеточную среду, а не вводится непосредственно в клетку- мишень, как большинство белков Yop . Отличительной чертой машин Yersinia типа III является наличие игл, выступающих из поверхности бактерий. Иглы выполняют две функции: во-первых, как канал экспорта эффекторов в иммунные клетки и, во-вторых, как сенсор.
Функция
[ редактировать ]Таким образом, YopR может играть роль в регуляции секреции типа III. Однако важно отметить, что точная функция домена YopR еще не выяснена, но считается, что YopR участвует в YscF, который развивает иглы. На этот счет существуют две разные гипотезы . Первое объяснение состоит в том, что YopR, возможно, контролирует секрецию YscF, которая влияет на сборку машин типа III. С другой стороны, считается, что YopR непосредственно полимеризует YscF; это объяснение считается менее вероятным, поскольку YopR не связан с очищенными иглами. [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]YopR состоит из пяти альфа-спиралей , четыре из которых собраны в антипараллельный пучок. [ 1 ]
Системы секреции
[ редактировать ], описаны четыре секреции системы У энтеропатогенов животных , таких как Salmonella и Yersinia , с дальнейшим сходством последовательностей у растительных патогенов, таких как Ralstonia и Erwinia . Это полезно для дальнейшей работы с доменом белка YopR , поскольку можно установить сравнительную гомологию последовательностей и структур. [ 2 ] Система секреции типа III представляет большой интерес, поскольку YopR важную роль играет белковый домен . Система секреции типа III транспортирует факторы вирулентности от возбудителя непосредственно в клетку- хозяина , когда бактерия находится в тесном контакте с хозяином.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Шубот Ф.Д., Черри С., Остин Б.П., Тропеа Дж.Е., Во Д.С. (2005). «Кристаллическая структура устойчивого к протеазе основного домена фактора вирулентности Yersinia pestis YopR» . Белковая наука . 14 (6): 1679–83. дои : 10.1110/ps.051446405 . ПМЦ 2253397 . ПМИД 15930010 .
- ^ Хьюек CJ (июнь 1998 г.). «Системы секреции белков III типа у бактериальных возбудителей животных и растений» . Микробиол. Мол. Биол. Преподобный . 62 (2): 379–433. дои : 10.1128/MMBR.62.2.379-433.1998 . ПМК 98920 . ПМИД 9618447 .