Геномика хордовых
Геномика хордовых — это исследование эволюции хордовых клады , основанное на сравнении геномов нескольких видов внутри клады. Поле зависит от данных всего генома (вся последовательность ДНК ) организмов. Он использует сравнение блоков синтении , транслокации хромосом и других геномных перестроек, чтобы определить эволюционную историю клады и реконструировать геном вида-основателя.
Результаты
[ редактировать ]Филогения
[ редактировать ]Глубокое разветвление филогении хордовых было выяснено с помощью геномики хордовых. [1] Геномика хордовых показывает, что ланцетники — самая базальная из ныне живущих клад хордовых, а оболочники — сестринская клада краниата .
Синтены
[ редактировать ]Сравнение геномов Lancelet Branchiostoma floridae , рыбы , курицы Gallus Gallus и человека Homo sapiens выявило обширную макросинтению с незначительной или нулевой микросинтенией. То есть во всей кладе Chordate одни и те же гены обнаруживаются сгруппированными рядом друг с другом, хотя порядок генов внутри кластеров перетасован. [2] В геноме человека имеется 135 идентифицируемых сегментов, которые сохраняют синтению с предковым кариотипом хордовых .
Анализ синтении показывает, что у последнего общего предка хордовых было 17 хромосом. [3]
Дублирование генома
[ редактировать ]Многочисленные экспериментальные данные убедительно свидетельствуют о том, что дважды в линии, ведущей к костистым рыбам, предковый геном хордовых был дублирован. [4] [5] [6] [7] Сравнение геномов Lancelet Branchiostoma floridae , Tunicates Ciona интестиналис и Oikopleura dioica , миноги Petromyzon marinus , рыбы Fugu Rubripes и Gasterosteus aculeatus , курицы Gallus Gallus и человека Homo Sapiens подтвердило, что две полногеномные дупликации у человека произошли . Ранняя история клады позвоночных . [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция кариотипа хордовых». Николас Х. Патнэм и др. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция кариотипа хордовых». Николас Х. Патнэм и др. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция кариотипа хордовых». Николас Х. Патнэм и др. Природа 453 1064-1071, (2008)
- ^ «Анализ генов миноги и миксины показывает сложную историю дупликаций генов во время ранней эволюции позвоночных». Х. Экскрива и др. , Мол. Биол. Эвол. 19, 1440–1450 (2002)
- ^ «Дупликация генома костистых рыб Tetraodon nigroviridis выявляет ранний протокариотип позвоночных». О. Жайон и др. , Природа 431, 946-957 (2004)
- ^ «Новые доказательства полногеномной дупликации у происхождения позвоночных с использованием набора генов амфиоксуса и полных геномов животных». Г. Панопулу и др. Геном Рез. 13, 1056–1066 (2003)
- ^ « Анализ генома фугу свидетельствует о дупликации всего генома на ранних этапах эволюции лучепёрых рыб». А. Кристоффелес и др. Мол. Биол. Эвол. 21, 1146-1151 (2004)
- ^ «Геном амфиоксуса и эволюция кариотипа хордовых». Николас Х. Патнэм и др. Природа 453 1064-1071, (2008)
 | Эта хордовым, статья, посвященная незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |