Флебовирус
| Флебовирус | |
|---|---|
| |
| |
| Прототипический вирион флебовируса и организация генома. | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Эллиовирицетес |
| Заказ: | Буньявирусы |
| Семья: | фенуивириды |
| Род: | Флебовирус |
| Разновидность | |
Флебовирус — один из двадцати родов семейства Phenuiviridae отряда Bunyavirales . Род насчитывает 66 видов. [ 1 ] Он получил свое название от Phlebotominae , переносчиков членского вида Неаполитанского флебовируса , который, как говорят, в конечном итоге происходит от греческого phlebos , что означает «вена». [ 2 ] Однако правильное слово для «вены» на древнегреческом языке — флепс (φλέψ). [ 3 ]
Вирусология
[ редактировать ]
из РНК с отрицательным смыслом, Флебовирусы — это вирусы с геномом состоящим из трех сегментов. Малый сегмент (S) кодирует вирусный белок N и неструктурный белок NS посредством стратегии амбисенсного кодирования. Сегмент среднего размера (М) кодирует предшественник вирусных гликопротеинов и неструктурные компоненты. Продуктом самого большого сегмента (L) является вирусная РНК-зависимая РНК-полимераза. [ 4 ]
Репликация
[ редактировать ]Флебовирус реплицируется в 7-ступенчатом процессе. Во-первых, клеточное прикрепление осуществляется посредством взаимодействия гликопротеинов с клетками-хозяевами. Примерами этого являются специфичные для дендритных клеток межклеточные адгезионные молекулы-3, не захватывающие интегрин (DC-SIGN), гепарансульфат (HS) или немышечная тяжелая цепь миозина (NMMHC-IIA). Во-вторых, в поздней эндосоме низкий pH вызывает активность слияния в мембране белка Gc. Проникновению вируса Уукуниеми (UUKV) способствует экспрессия мембранного белка 3, ассоциированного с везикулами (VAMP3). Кроме того, слияние вируса лихорадки долины Рифт (RVFV) в поздних эндосомах ингибируется интерферон-индуцируемыми трансмембранными белками 2 и 3 (IFITIM2 и IFITIM3). В-третьих, вирусные и эндосомальные мембраны сливаются, обеспечивая высвобождение вирусных рибонуклеопротеиновых комплексов в цитоплазму (также место вирусной транскрипции и репликации). В-четвертых, белок-предшественник Gn/Gc транслируется в шероховатой эндоплазматической сети (ER). Этот белок-предшественник расщепляется сигнальной пептидазой. Синтез вирусного нуклеопротеина и вирусной полимеразы в цитоплазме сочетается с вновь образующимися геномными РНК (гРНК) рибонуклеиновыми белковыми комплексами (РНП). В-пятых, два шаперона ER, связывающие белок иммуноглобулина (BiP) и кальнексин, необходимы для обеспечения правильного сворачивания GN/Gc. Gn/Gc аналогичным образом катализируются протеин-дисульфид-изомеразой посредством образования дисульфидных связей. В то же время кальретикулин предотвращает экспорт неправильно свернутых Gn/Gc в аппарат Гольджи. В-шестых, правильно свернутые гетеродимеры Gn/Gc транспортируются в аппарат Гольджи. Цитоплазматические хвосты Gn в процессе отпочкования в это время связываются с РНП. В-седьмых, после завершения отпочкования новых вирусных частиц везикулы, содержащие вирус, транспортируются к плазматической мембране и высвобождаются путем экзоцитоза. [ 5 ]
Роль Gn и Gc в проникновении флебовируса
[ редактировать ]Исследование семейства Bunyaviridae показало, что частицы буньявируса плеоморфны. Этот известный факт вызвал некоторое удивление, когда исследования показали, что частицы UUKKV и RVFV имеют сферическую форму и высокоупорядочены. Конфигурация белков Gn и Gc в вирусной оболочке определяет порядок частицы. Оболочка вируса образует икосаэдрическую решетку с числом триангуляции 12. В состав решетки также входят 110 гексаметрических и 12 пентамерных капсомеров. В частности, для RVFV в капсомеры включено 720 гетеродимеров Gn/Gc. В этих случаях Gn образует шипы капсомера, а Gc находится ближе к липидной мембране, помещая ее под нее. Уровень pH, окружающий капсомер, в конечном итоге определяет его форму. Во многом это связано с тем, что протонирование вызывает конформационные изменения Gc, обычно сопровождающие слияние мембран. Была предложена модель сборки оболочки RVFV, состоящая из димеров Gc, расположенных горизонтально относительно вирусной мембраны. Это известно, поскольку эктодомен Gc RVFV кристаллизуется в виде димера. Это противоположно внутренней части вириона буньявирусов, которая не имеет матриксного белка и, следовательно, не имеет определяющей организации. Это означает, что на поверхности вириона белки Gc и Gn должны присутствовать в высокоупорядоченном расположении.
Для начала проникновения частицы флебовируса связываются с различными компонентами плазматической мембраны. Эти компоненты взаимодействуют с вирусными гликопротеинами флебовируса и регулируют эффективность проникновения. Хотя эти компоненты не имеют решающего значения для фактического проникновения самого вируса, рецепторы являются компонентами плазматической мембраны, которые связываются с гликопротеинами и имеют решающее значение для проникновения. У флебовирусов было установлено, что гликан-белковые взаимодействия играют решающую роль в проникновении флебовирусов.
Гепарансульфат (HS) является еще одним важным компонентом прикрепления флебовируса. Это гликозаминогликан (ГАГ), который представляет собой неразветвленный полисахарид, состоящий из дисахаридных повторов, что приводит к созданию протеогликана. Клеточные линии с определенными дефектами гликозилирования были проанализированы и показали, что HS необходим для проникновения RVFV. Это было подтверждено удалением HS с помощью фермента. Взаимодействие HS с вирусными частицами зависит от заряда, и исследования показали, что на белке P78 имеются кластеры основных аминокислот, которые взаимодействуют с отрицательными сульфатными кластерами на HS. Для сравнения: на Gn и Gc не было идентифицировано сайтов связывания HS. Белка P78 много в инфицированных RVFV клетках насекомых, тогда как инфицированные клетки млекопитающих производят значительно меньше белков P78. Белок P78 гораздо эффективнее вырабатывается в RVFV в клетках комаров, поскольку он необходим для распространения вируса у комаров. В целом, клеточная линия сильно зависит от HS при проникновении RVFV.
Компьютерное исследование предоставило доказательства того, что белки Gc флебовируса могут быть белками слияния мембран класса II. Окончательное доказательство этой теории было дано выяснением структуры эктодомена Gc RVFV в его состоянии перед слиянием. Gc имеет три домена, характеристики которых напоминают другие белки класса II. Была обнаружена внутренняя петля слияния, которая является критическим аспектом всех белков класса II. Расположение гистидина в Gc напоминало признак измерения pH, который соответствует характеристикам класса II. Хотя в структуре Gc RVFV и белков класса II было много сходства, граница между доменами I и II в Gc RVFV более жесткая и крупнее, чем у других белков класса II. Кроме того, RVFV Gc имеет больше дисульфидных мостиков, централизованных в разных местах, чем другие сравниваемые белки. Однако его общая структура и функциональность наиболее близко напоминают слитый с мембраной белок класса II по сравнению с любым другим классом.
Следует отметить способность белка Gc определять pH. Активность мембранного слияния белков Gc флебовируса очень зависит от pH, поскольку низкий pH запускает транспорт вирионов в эндолизосомы. Повышение внутривезикулярного pH ингибирует проникновение флебовируса. Однако до сих пор неясно, должны ли белки Gc связываться с рецептором, прежде чем они будут активированы рН, или нет.
После слияния вирусных и эндосомальных мембран геномные сегменты L, M и S (связанные с вирусной полимеразой) высвобождаются в цитоплазму. Это инициирует транскрипцию геномной РНК в мРНК. Вирусные белки начинают трансляцию до завершения транскрипции мРНК. Белки флебовируса Gn и Gc кодируются М-сегментом и подвергаются синтезу. Белок-предшественник Gn/Gc не может быть обнаружен в клетке, уже инфицированной флебовирусом. Это видно только после выраженности М-сегмента. Если присутствуют микросомальные мембраны, предшественник расщепляется, что указывает на расщепление фактором хозяина во время синтеза вирусного белка. Комплекс сигнальной пептидазы в мембране ЭР отвечает за расщепление предшественника. Этот предшественник затем транслоцируется в просвет ЭР, в который вставляются два гидрофобных домена с третьим расщепленным гидрофобным доменом между ними. [ 6 ]
Новая группа патогенов, передающихся членистоногими
[ редактировать ]Флебовирусы представляют собой арбовирусы, таксономически разделенные на вирусы, передающиеся клещами и двукрылыми. Москиты Phlebotomus являются основным источником флебовирусов, передающихся двукрылыми, за исключением вируса лихорадки Рифт-Валли (RVFV связан с комарами и имеет большее разнообразие переносчиков). Поддержание вирусов в основном осуществляется через виды-переносчики посредством вертикальной (трансовариальной) передачи. Обеспокоенность по поводу возможного заноса ЛДРВ в восприимчивые районы возросла в связи с растущим распространением видов-переносчиков. Потенциальные последствия этого распространения могут привести к огромным экономическим потерям из-за нанесения вреда домашнему скоту.
Идентифицированы два новых представителя флебовирусов как возбудителей травматических заболеваний человека. В сельских районах Китая SFTSV, передающийся клещами, был выявлен в результате увеличения случаев лихорадочного заболевания в сочетании с тромбоцитопенией, лейкеноцитопенией, полиорганной дисфункцией и высоким уровнем смертности. После этого открытия о SFTSV сообщили также в Японии и Корее. В Северной Америке был аналогичный случай, который, как выяснилось, был вызван вирусом Хартленд, передающимся клещами. Эти два открытия изменили представление о влиянии клещевых флебовирусов на здоровье населения. Эти открытия привели к переклассификации вируса Бханджа (BHAV) в группу клещевых флебовирусов. Сообщалось о новых ассоциациях флебовирусных заболеваний в Средиземноморском регионе. Примеры включают, среди прочего, вирус москитной лихорадки Турции, вирус Адрии, вирус Гранады, вирус Аданы и вирус Медджерды.
Вирус Тоскана имеет высокий уровень вертикальной передачи, что было продемонстрировано на москитах при экспериментальном заражении. Это говорит о том, что роль позвоночных-хозяев возрастает, несмотря на то, что в природе они поддерживаются в основном москитами. Москит — это название любого вида или рода летающих кровососущих двукрылых, обитающих в песчаных районах. Например, «москит» в США относится к слепням или членам семейства Ceratopogonidae. В других частях мира «москит» относится к членам подсемейства Phlebotominae в пределах Psychodidae. Два из трех основных родов, Phlebotomus и Sergentomyia, были обнаружены в Старом Свете и содержат известные виды, передающие вирусные патогены. Третий род обнаружен в Новом Свете и называется Lutzomyia. Другими примерами являются мокрецы, или Austrosimulium, черная муха, обитающая в Новой Зеландии.
Результатом действия многих из этих вирусов является своего рода лихорадка. Лихорадка Паппатачи, или лихорадка Флеботомуса, представляет собой легкую трехдневную лихорадку, похожую на грипп и имеющую быстрое начало. Они наиболее распространены в эндемичных районах в летние месяцы, особенно в августе, когда москиты активны. Еще более серьезными случаями являются вирус Тоскана, вызывающий менингит у людей, и вирус лихорадки Рифт-Валли, вызвавший широко распространенные эпидемии среди домашнего скота в Африке. [ 7 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Следующие двенадцать вирусов связаны с болезнями человека: флебовирус Аленкер , [ 8 ] Вирус племянника , [ 9 ] флебовирус Кандиру , [ 10 ] Вирус Чагрес , Неаполитанский флебовирус москитной лихорадки , флебовирус Пунта Торо , вирус лихорадки Рифт-Валли , сицилийский флебовирус , тосканский флебовирус , вирус Уукуниеми , бандавирус Хартленд [ 11 ] (первый клещевой флебовирус, который, как известно, вызывает заболевание в Западном полушарии, обнаружен в 2009 году) и вирус москита-индюка (обнаружен в Китае в 2011 году). [ 12 ] Они вызывают симптомы, варьирующиеся от кратковременных самоограничивающихся лихорадок, таких как лихорадка паппатачи , до энцефалита и смертельной вирусной геморрагической лихорадки . [ нужна ссылка ]
Таксономия
[ редактировать ]Флебовирус происходит от Phlebotominae, который является таксоном переносчиков неаполитанского флебовируса москитов. Название происходит от греческого корня флебос, что означает «вена». Серологическая перекрестная реактивность ранее определяла виды этого рода. Изменение правил классификации было вызвано трудностью обнаружения нового флебовируса в серологических исследованиях. В результате виды вирусов теперь определяются на 95% или более идентично в аминокислотных последовательностях соответствующих РНК-зависимых РНК-плимеразы (RdRp). В настоящее время род насчитывает 67 видов. Основными переносчиками некоторых вирусов являются другие гематофаги-членистоногие. Примеры этого включают комаров, вызывающих вирус лихорадки Рифт-Валли, и вирус Мукава, который был выделен из клещей, но остается во флебовирусе, несмотря на общий переход клещевых вирусов от флебовируса к уукувирусу. Помимо клещей и комаров, некоторые флебовирусы были выделены у позвоночных, таких как грызуны в Америке и опоссумы или ленивцы в Африке. Такое широкое разнообразие источников указывает на возможное наличие разнообразных эпидемиологических циклов. [ 13 ]
Признаны следующие виды: [ 1 ]
- Адана флебовирус
- Агуакатный флебовирус
- Алькубе флебовирус
- Аленкер флебовирус
- Флебовирус Амбе
- Флебовирус Анханга
- Флебовирус Арумовота
- Богорийский флебовирус
- Флебовирус Буэнавентуры
- Буджару флебовирус
- Флебовирус какао
- Кампанский флебовирус
- Кандиру флебовирус
- Флебовирус Чагреса
- Флебовирус Кокле
- Флебовирус Корфу
- Флебовирус Дашли
- Флебовирус дурании
- Эхарат флебовируса
- Эмбоссный флебовирус
- флебовирусная фасоль
- Габек флебовирус
- Gordil phlebovirus
- Икоараци флебовирус
- Флебовирус Итаитуба
- Итапоранга флебовирус
- Иксканальный флебовирус
- каримабадский флебовирус
- Kiborgoch phlebovirus
- Флебовирус Ла Глория
- Лара флебовирус
- Летиция флебовирус
- Флебовирус Мальдонадо
- Массилия флебовирус
- Флебовирус Медджерды
- Mona Grita phlebovirus
- У вас флебовирус
- Флебовирус Мунгубы
- Неаполитанский флебовирус
- Нике флебовирус
- Нтепес флебовирус
- Они удалят флебовирус
- Ориксимин флебовирус
- Флебовирус Пенья Бланка
- Флебовирус Пеншурта
- Флебовирусы
- Пунический флебовирус
- Флебовирус Пунта Торо
- Флебовирус лихорадки Рифт-Валли
- Флебовирус Рио-Гранде
- Флебовирус Сент-Флориса
- Саланга флебовирус
- Салехабадский флебовирус
- Салобо-флабовирус
- Сицилийский флебовирус
- Тапара флебовирус
- Тегеранский флебовирус
- Тикофебовирус
- Торос флебовирус
- Тосканский флебовирус
- Флебовирус трех миндалей
- Turuna phlebovirus
- Уриурана флебовирус
- Флебовирус урукури
- Флебовирус виолы
- Флебовирус Зердали
По состоянию на 2015 год внутри флебовируса выделяют четыре генетические группы клещевых флебовирусов: группа SFTS, группа Bhanja, группа Uukniemi, [ 14 ] и группа Кайсоди. [ 15 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 19 мая 2021 г.
- ^ «9-й отчет ICTV (2011 г.) Буньявирусы » . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 31 января 2019 г.
Флебо: относится к флеботоминовым переносчикам вирусов группы москитной лихорадки; Греческое слово «флебос» — «вена».
- ^ Лидделл, Х.Г. и Скотт, Р. (1940). Греко-английский лексикон. Переработано и дополнено сэром Генри Стюартом Джонсом. При содействии Родерика Маккензи. Оксфорд: Кларендон Пресс.
- ^ Модров, Сюзанна; Фальке, Дитрих; Труен, Уве; Шецль, Герман. Молекулярная вирусология . Спрингер. п. 460. ИСБН 978-3-642-20718-1 .
- ^ «Цикл репликации флебовирусов» .
- ^ Шпигель, Мартин; Плегге, Тереза; Пёльманн, Стефан (июль 2016 г.). «Роль гликопротеинов флебовируса в проникновении, сборке и высвобождении вируса» . Вирусы . 8 (7): 202. дои : 10.3390/v8070202 . ISSN 1999-4915 . ПМЦ 4974537 . ПМИД 27455305 .
- ^ Чуасси, Дэвид П.; Марклевиц, Марко; Чепкорир, Эдит; Циркель, Флориан; Ага, Шейла Б.; Тигои, Кэролайн С.; Коскей, Эдит; Дростен, Кристиан; Боргемейстер, Кристиан; Торто, Болдуин; Юнглен, Сандра; Санг, Розмари (апрель 2019 г.). «Флебовирус, ассоциированный с москитами, с доказательствами наличия нейтрализующих антител у людей, Кения» . Новые инфекционные заболевания . 25 (4): 681–690. дои : 10.3201/eid2504.180750 . ISSN 1080-6040 . ПМК 6433041 . ПМИД 30882303 .
- ^ Травасос да Роза А.П., Теш Р.Б., Пиньейру Ф.П., Травасос да Роза Дж.Ф., Петерсон Н.Е. (1983). «Характеристика восьми новых арбовирусов серогруппы флеботомной лихорадки (Bunyaviridae: Phlebovirus) из региона Амазонки в Бразилии» . Являюсь. Ж. Троп. Мед. Хиг . 32 (5): 1164–71. дои : 10.4269/ajtmh.1983.32.1164 . ПМИД 6312820 .
- ^ Весенджак-Хирджан Дж., Калишер CH , Беус И. Мартон Э. Первая естественная клиническая инфекция человека, вызванная вирусом Бханджа, стр. 297–301. 1980. Весенджак-Хирджан Дж., Портерфилд Дж.С., Арсланаги, c.E. (редактор), Арбовирусы в странах Средиземноморья: 6-й симпозиум FEMS. Фишер, Штутгарт, Германия.
- ^ Паласиос, Густаво; Теш, Роберт; Травассос да Роза, Амелия; Савджи, Назир; Сзе, Уилсон; ДЖАЙН, Комал; Серж, Роберт; Гузман, Хильда; Гевара, Каролина; НУНЕС, Марсио; Нуньес-Нето, Хоаким; Кохель, Тадеуш; Хатчинсон, Стивен; ВАСКОНСЕЛОС, Педро; Липкин, Ян (2011). «Характеристика антигенного комплекса Candiru (Bunyaviridae: Phlebovirus), очень разнообразной и реассортируемой группы вирусов, поражающих людей в тропической Америке» . Журнал вирусологии . 85 (8): 3811–20. дои : 10.1128/JVI.02275-10 . ПМК 3126144 . ПМИД 21289119 .
- ^ Сэвидж, HM; Годси, Миссисипи; Ламберт, А; Панелла, Северная Каролина; Буркхальтер, КЛ; Хармон, младший; Лэш, РР; Эшли, округ Колумбия; Николсон, WL (2013). «Первое обнаружение хартленд-вируса (Bunyaviridae: Phlebovirus) у членистоногих, собранных в полевых условиях» . Являюсь. Ж. Троп. Мед. Хиг . 89 (3): 445–52. дои : 10.4269/ajtmh.13-0209 . ПМЦ 3771279 . ПМИД 23878186 .
- ^ Ю, XJ; Лян, МФ; Чжан, Ю.Ю.; Лю, Ю.; Ли, Джей Ди; Солнце, ЮЛ; Чжан, Л.; Чжан, QF; Попов В.Л.; Ли, К.; Цюй, Дж.; Ли, К.; Чжан, Ю.П.; Волосы.; Ву, В.; Ван, К.; Жан, FX; Ван, XJ; Кан, Б.; Ван, Юго-Запад; Ван, КЛ; Цзин, штаб-квартира; Лу, JX; Инь, WW; Чжоу, Х.; Гуань, XH; Лю, Дж. Ф.; Би, ZQ; Лю, Г.Х.; Рен, Дж. (2011). «Лихорадка с тромбоцитопенией, связанная с новым буньявирусом в Китае» . Медицинский журнал Новой Англии . 364 (16): 1523–1532. дои : 10.1056/NEJMoa1010095 . ПМК 3113718 . ПМИД 21410387 .
- ^ Калишер, Чарльз Х.; Кальцолари, Маттиа (май 2021 г.). «Таксономия флебовирусов с акцентом на те, которые передаются москитами» . Вирусы . 13 (5): 918. дои : 10.3390/v13050918 . ISSN 1999-4915 . ПМК 8156068 . ПМИД 34063467 .
- ^ Мацуно, К; Вейзенд, К; Кадзихара, М; Матысяк, К; Уильямсон, Б.Н.; Симунза, М; Мвине, AS; Такада, А; Теш, РБ; Эбихара, Х. (январь 2015 г.). «Комплексное молекулярное обнаружение клещевых флебовирусов приводит к ретроспективной идентификации таксономически неопределенных буньявирусов и открытию нового представителя рода флебовирусов» . Джей Вирол 89 (1): 594–604. дои : 10.1128/JVI.02704-14 . ПМК 4301164 . ПМИД 25339769 .
- ^ Мацуно, К; Вейзенд, К; Кадзихара, М; Матысяк, К; Уильямсон, Б.Н.; Симунза, М; Мвине, AS; Такада, А; Теш, РБ; Эбихара, Х (2015). «Комплексное молекулярное обнаружение клещевых флебовирусов приводит к ретроспективной идентификации таксономически неопределенных буньявирусов и открытию нового представителя рода флебовирусов» . Джей Вирол 89 (1): 594–604. дои : 10.1128/JVI.02704-14 . ПМК 4301164 . ПМИД 25339769 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Гарри CE, Гарри РФ (2004). «Протеомный компьютерный анализ показывает, что карбокси-концевые гликопротеины буньявирусов представляют собой слитый вирусный белок класса II (бета-пенетрены)» . Теория Биол Мед Модель . 1 : 10. дои : 10.1186/1742-4682-1-10 . ПМЦ 535339 . ПМИД 15544707 .
- Курс BS335: Вирусология
- Лю Д.Ю., Теш Р.Б., Травасос Да Роза А.П., Петерс С.Дж., Ян З., Гусман Х., Сяо С.Ю. (2003). «Филогенетические взаимоотношения между представителями рода Phlebovirus (Bunyaviridae) на основе анализа частичной последовательности M-сегмента» . Дж. Генерал Вирол . 84 (Часть 2): 465–73. дои : 10.1099/vir.0.18765-0 . ПМИД 12560581 .
- Вирусная зона : флебовирус.