Секретныйглобин

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Секретныйглобин
Секретныйглобин
Идентификаторы
Символ	Секретныйглобин
Pfam	PF01099
InterPro	IPR016126
PROSITE	PS51311
Краткое содержание	d1utra_ / scope / supfam
CDD	CD00633
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Секретныеглобины (SCGB) представляют собой семейство небольших альфа-спиртных, дисульфидных , , димерных белков обнаруженных только у млекопитающих. Эта семья ранее была известна как семейство 10-кДа клеток матки/Клара , после двух псевдонимов его основополагающего члена утероглобина.

Структура и функция

Белки в основном альфа-спиральные, а димер образуется антипараллельным образом. Интерфейс димера оснащена полостью, образованной в двух мономерах, которые могут вместить лиганды малого и среднего размера, такие как стероиды и фосфолипиды. ^{[ 1 ]} Связывание и высвобождение могут сочетаться с окислительно -восстановительным состоянием цистинов, то есть присутствие этих дисульфидных связей. ^{[ 2 ]}

Многие имеют нормативные функции.

Классификация

Семья была классифицирована по последовательности гомологии на 6 подсемейства в 2006 году. ^{[ 3 ]} Геномы человека и мыши содержат только первые три семейства, согласно обновлению 2011 года. Не каждая семья монофилетическая. ^{[ 4 ]}

Подсемейство		Группа		Член
Подсемейство		Группа		Символ ^{[ 4 ]}	Имя	Лиганд (ы)
1	UGB	А	UGB	SCGB1A1	Утероглобин (UGB); Бластокинин, CCSP	фосфатидилхолин, фосфатидилинозитол, ПХБ
		Беременный	ABPA -типа	SCGB1B2 (грызун)		В общем: стероидные феромоны
		В		SCGB1C1
		В		SCGB1C2
		Дюймовый	Липофилин A/B.
2		А	Маммаглобин	SCGB2A1	Маммаглобин-B; Липофилин-C
		А	Маммаглобин	SCGB2A2	Маммаглобин-А
		Беременный	Abpbg -like	SCGB2B1 (грызун)		В общем: стероидные феромоны
3	Ug-подобный	А	Ug-подобный	SCGB3A1
3	Ug-подобный	А	Ug-подобный	SCGB3A2

представляет собой три компонента тетрамерного белкового комплекса, построенный из трех липофилинподобных генов в группах 2 и 3. Некоторые источники описывают его как ортолог Простатеин крысы (простатический стероидный белок, связывающий простатический простатический простатический белок) , липофилина. ^{[ 3 ]}

Дополнительные подсемейства

Подсемейства 4 и 6 были первоначально описаны как обнаруженные у человека и мышей, но теперь они рассматриваются как дубликаты существующих групп. Подсемейство 5 не найдено ни в том, чтобы начать с самого начала. ^{[ 3 ]}

Подсемейство 4 ранее включало то, что теперь известно как группа 1B и 2B в группе 4A. Пары генов 1b/2b (ABP) расположены лицом к лицу на хромосоме в «модули», которые были независимо продублированы. ^{[ 4 ]}

Подсемейство 6 должно было включать человека и крыс Ryd5, ^{[ 3 ]} Теперь переназначен SCGB1C1. ^{[ 4 ]}

Предполагалось, что Fel D 1 будет помещен в две подсемейства: цепь 1 в подсемействе 4 и цепь 2 в подсемействе 5. ^{[ 3 ]} Хотя это не упоминается в обновлении 2011 года, MenterPro совпадения предполагают, что CH1 аналогичен 1B и CH2, аналогична 2B. ^{[ 5 ]} Дополнительное вычислительное исследование подтверждает сходство, полностью недействительные подсемейства 4 и 5 полностью. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Umland TC, Swaminathan S, Singh G, Warty V, Furey W, Pletcher J, Sax M (август 1994 г.). «Структура фосфолипид-связывающего белкового комплекса клеток клеток человека в 1,9 в разрешении». Природа структурная биология . 1 (8): 538–45. doi : 10.1038/nsb0894-538 . PMID 7664082 . S2CID 28261246 .
^ Härd T, Barnes HJ, Larsson C, Gustafsson JA, Lund J (ноябрь 1995 г.). «Структура раствора белка-связывающего млекопитающего белка в комплексе с печатной платой». Природа структурная биология . 2 (11): 983–9. doi : 10.1038/nsb1195-983 . PMID 7583672 . S2CID 10369347 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Клуг Дж., Биер Х.М., Бернард А., Чилтон Б.С., Флеминг Т.П., Лерер Р.И. и др. (25 января 2006 г.). «Утероглобин/Клара Клета 10-кДа Семейство белков белков: отчет комитета по номенклатуре». Анналы нью -йоркской академии наук . 923 (1): 348–54. doi : 10.1111/j.1749-6632.2000.tb05549.x . PMID 11193777 . S2CID 38862724 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Джексон Б.К., Томпсон Д.К., Райт М.В., Макэндрюс М., Бернард А., Неберт Д.В., Василиу В. (октябрь 2011 г.). «Обновление суперсемейства генов генов человеческого секрета (SCGB) и пример« эволюционного цветения »генов андроген-связывающих белков в суперсемействе гена SCGB мыши» . Человеческая геномика . 5 (6): 691–702. doi : 10.1186/1479-7364-5-6-691 . PMC 3251818 . PMID 22155607 .
^ «Fel D 1 Цепь 1», Mus musculus , «Fel D 1 Цепь 2», Mus Musculus . InterPro .
^ Durairaj R, Pageat P, Bienboire-Frosini C (2018). «Другая игра кошек и мыши: расшифровка эволюции суперсемейства SCGB и изучение молекулярного сходства основного кошачьего аллергена Fel D 1 и ABP мыши с использованием вычислительных подходов» . Plos один . 13 (5): E0197618. BIBCODE : 2018PLOSO..1397618D . doi : 10.1371/journal.pone.0197618 . PMC 5957422 . PMID 29771985 .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Umland TC, Swaminathan S, Singh G, Warty V, Furey W, Pletcher J, Sax M (август 1994 г.). «Структура фосфолипид-связывающего белкового комплекса клеток клеток человека в 1,9 в разрешении». Природа структурная биология . 1 (8): 538–45. doi : 10.1038/nsb0894-538 . PMID 7664082 . S2CID 28261246 .

[2] Härd T, Barnes HJ, Larsson C, Gustafsson JA, Lund J (ноябрь 1995 г.). «Структура раствора белка-связывающего млекопитающего белка в комплексе с печатной платой». Природа структурная биология . 2 (11): 983–9. doi : 10.1038/nsb1195-983 . PMID 7583672 . S2CID 10369347 .

[cls-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Клуг Дж., Биер Х.М., Бернард А., Чилтон Б.С., Флеминг Т.П., Лерер Р.И. и др. (25 января 2006 г.). «Утероглобин/Клара Клета 10-кДа Семейство белков белков: отчет комитета по номенклатуре». Анналы нью -йоркской академии наук . 923 (1): 348–54. doi : 10.1111/j.1749-6632.2000.tb05549.x . PMID 11193777 . S2CID 38862724 .

[hsa-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Джексон Б.К., Томпсон Д.К., Райт М.В., Макэндрюс М., Бернард А., Неберт Д.В., Василиу В. (октябрь 2011 г.). «Обновление суперсемейства генов генов человеческого секрета (SCGB) и пример« эволюционного цветения »генов андроген-связывающих белков в суперсемействе гена SCGB мыши» . Человеческая геномика . 5 (6): 691–702. doi : 10.1186/1479-7364-5-6-691 . PMC 3251818 . PMID 22155607 .

[5] «Fel D 1 Цепь 1», Mus musculus , «Fel D 1 Цепь 2», Mus Musculus . InterPro .

[6] Durairaj R, Pageat P, Bienboire-Frosini C (2018). «Другая игра кошек и мыши: расшифровка эволюции суперсемейства SCGB и изучение молекулярного сходства основного кошачьего аллергена Fel D 1 и ABP мыши с использованием вычислительных подходов» . Plos один . 13 (5): E0197618. BIBCODE : 2018PLOSO..1397618D . doi : 10.1371/journal.pone.0197618 . PMC 5957422 . PMID 29771985 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]