ЭкзоКарта
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | База данных экзосомальных белков, РНК и липидов |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Институт молекулярных наук Ла Троба |
| Авторы | Суреш Мативанан |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://www.exocarta.org |
ExoCarta — это база данных экзосомальных белков, РНК и липидов , созданная вручную . [1] [2]
клеточного происхождения Экзосомы представляют собой везикулы , которые присутствуют во многих, а возможно, и во всех биологических жидкостях, включая кровь , мочу и питательную среду клеточных культур . [3] [4] Сообщаемый диаметр экзосом составляет от 30 до 100 нм, что больше, чем у ЛПНП , но намного меньше, чем, например, у эритроцитов . Экзосомы либо высвобождаются из клетки при слиянии мультивезикулярных тел с плазматической мембраной , либо непосредственно из плазматической мембраны. [5] Становится все более очевидным, что экзосомы имеют специализированные функции и играют ключевую роль, например, в коагуляции , межклеточной передаче сигналов и утилизации отходов. [3] Следовательно, растет интерес к клиническому применению экзосом. Экзосомы потенциально могут быть использованы для прогнозирования, терапии и биомаркеров здоровья и болезней.
Биоинформатический анализ экзосом
[ редактировать ]Экзосомы содержат РНК, белки, липиды и метаболиты, что отражает тип клеток происхождения. крупномасштабный анализ, включая протеомику и транскриптомику . Поскольку экзосомы содержат множество биоактивных молекул, включая белки, нуклеиновые кислоты, липиды, сахара и родственные конъюгаты, часто проводится [6] В настоящее время для анализа этих данных используются некоммерческие инструменты, такие как FunRich. [7] может использоваться для идентификации чрезмерно представленных групп молекул.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мативанан, Суреш; Фанер Кэсси Дж; Рид Гэвин Э; Симпсон Ричард Дж. (октябрь 2011 г.). «ExoCarta 2012: база данных экзосомальных белков, РНК и липидов» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D1241–4. дои : 10.1093/nar/gkr828 . ПМК 3245025 . ПМИД 21989406 .
- ^ Мативанан С., Симпсон Р.Дж. (2009). «ExoCarta: сборник экзосомальных белков и РНК». Протеомика . 9 (21): 4997–5000. дои : 10.1002/pmic.200900351 . ПМИД 19810033 . S2CID 22275212 .
- ^ Jump up to: а б ван дер Пол Э; Боинг, АН; Харрисон П; Стерк А; Ньюланд Р. (2012). «Классификация, функции и клиническое значение внеклеточных везикул». Фармакол. Преподобный . 64 (3): 676–705. дои : 10.1124/пр.112.005983 . ПМИД 22722893 . S2CID 7764903 .
- ^ Келлер С; член парламента Сандерсона; Сток А; Альтефогт П. (2006). «Экзосомы: от биогенеза и секреции к биологической функции». Иммунол. Летт . 107 (2): 102–8. дои : 10.1016/j.imlet.2006.09.005 . ПМИД 17067686 .
- ^ Бут АМ; Клык Ю; Фэллон Дж.К.; Ян Дж.М.; Хилдрет Дж. Э.; Гулд С.Дж. (2006). «Экзосомы и кляп ВИЧ отпочковываются от эндосомоподобных доменов плазматической мембраны Т-клеток» . Дж. Клеточная Биол . 172 (6): 932–935. дои : 10.1083/jcb.200508014 . ПМК 2063735 . ПМИД 16533950 .
- ^ Рудрапрасад, Дханвини; Рават, Аадиш; Джозеф, Джовита (01 января 2022 г.). «Экзосомы, внеклеточные везикулы и глаз» . Экспериментальное исследование глаз . 214 : 108892. doi : 10.1016/j.exer.2021.108892 . ISSN 0014-4835 . ПМИД 34896308 . S2CID 245028439 .
- ^ Патан, М; Киртикумар, С; Анг, CS; Гангода, Л; Кек, CY; Уильямсон, Северная Каролина; Мурадов, Д; Зибер, О.М.; Симпсон, Р.Дж.; Салим, А; Бачич, А; Хилл, А; Страуд, окружной прокурор; Райан, Монтана; Агбинья, Дж.И.; Мариадассон, Дж. М.; Берджесс, AW; Мативанан, С. (2015). «Техническое описание: автономный инструмент функционального обогащения и сетевого анализа взаимодействия с открытым доступом». Протеомика . 15 (15): 2597–601. дои : 10.1002/pmic.201400515 . ПМИД 25921073 . S2CID 28583044 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |