Расширенная публикация
Расширенные публикации или расширенные электронные книги — это форма электронных публикаций для распространения и обмена результатами исследований, первое официальное определение которых датируется 2009 годом. [1] Как и многие формы цифровых публикаций, они обычно имеют уникальный идентификатор (возможно, постоянный идентификатор ) и описательную метаданную . В отличие от традиционных цифровых публикаций (например, статей в формате PDF), расширенные публикации часто предназначены для обслуживания конкретных научных областей и обычно состоят из набора взаимосвязанных частей, соответствующих исследовательским ресурсам нескольких видов (например, наборы данных, видео, изображения, таблицы стилей, услуги, рабочие процессы). , базы данных, презентации) и к текстовым описаниям исследований (например, статьи, главы, разделы, таблицы). Характер и формат таких частей и отношений между ними зависят от области применения и могут сильно различаться от случая к случаю. [2]
Основные мотивы увеличения количества публикаций заключаются в ограниченности традиционной научной литературы для описания всего контекста и результатов исследовательской деятельности. Их цель — выйти «за рамки простого PDF» ( FORCE11 ). инициатива [3] ) и поддерживать ученых с помощью передовых инструментов ИКТ для более всестороннего обмена своими исследованиями, не теряя при этом повествовательного духа «публикации» как средства распространения. Эта тенденция подтверждается несколькими усовершенствованными системами публикаций, разработанными в литературе, предлагающими исследовательским сообществам одну или несколько из следующих функций: упаковка соответствующих исследовательских активов; возможности чтения Web 2.0; Взаимосвязь результатов исследований; Воспроизведение и оценка научных экспериментов.
связанных исследовательских активов
Первое усовершенствование, введенное с целью выйти за рамки обычной оцифровки публикации и исследовать новые возможности цифровой научной коммуникации, вероятно, сопровождало цифровую публикацию (например, файл PDF) дополнительными материалами. В таких сценариях ученые могут делиться пакетами, состоящими из публикаций и дополнительных материалов, чтобы лучше представить гипотезу и результаты исследования, представленные в публикации.
| Расширенная система публикаций | Ссылки |
|---|---|
| Расширенный PDF-файл ReadCube | ReadCube Papers Дополнительные возможности просмотра, [4] Wiley Journals: что такое ReadCube [5] |
| Журналы с дополнительной материальной политикой | Политики Elsevier в отношении дополнительных данных, [6] Журналы SAGE: Руководство для авторов по дополнительным файлам [7] |
| Модульная статья | Кирч, Йост Г. (2002) [8] |
| ЛОР | Гербер А. и Хантер Дж. (2010) [9] |
Возможности чтения Web 2.0 [ править ]
Эта категория подходов фокусируется на расширенных моделях данных публикации, части, метаданные и отношения которых определяются с целью улучшения опыта конечного пользователя при визуализации и обнаружении исследовательских материалов. Эти подходы являются естественным продолжением традиционных публикаций, ориентированных на чтение, и обычно объединяют все инструменты, предоставляемые веб -инфраструктурой и ее источниками данных. [10] В частности, они исследуют возможности:
- структурирование повествовательного текста на взаимосвязанные подчасти;
- повторное использование вселенной веб-ресурсов для обогащения текста;
- включая динамические формы содержания в тексте.
| Расширенная система публикаций | Ссылки |
|---|---|
| Расширенный PDF-файл ReadCube | Wiley Journals: что такое ReadCube [5] |
| Документы D4Science Live | Кандела Л., Кастелли Д., Пагано П. и Сими М. (2005) [11] |
| SciVee | Финк и Борн (2007) [12] |
| PLOS Забытые тропические болезни | Шоттон, Портвин, Клайн и Майлз (2009) [13] |
| Проект ветеранских лент | ван ден Хеувел, ван Хорик, Сандерс, Скальола и Виткамп (2010) [14] |
| Документы Утопии | Эттвуд, Т.К., Келл, Д.Б., Макдермотт, П., Марш, Дж., Петтифер, С.Р., и Торн, Д. (2010) [15] |
| Богатые интернет-публикации | Бреуре, Вурбий и Хугерверф (2011) [16] |
| ПОДОШВА | Фам, Малик, Фостер, Ди Лауро и Монтелла (2012) [17] |
| Статья будущего от Elsevier | Ольберсберг И.Дж., Химан Ф., Коерс Х. и Зудилова-Сейнстра Э. (2012) [18] |
| Книжная полка | Хоппнер (2013) [19] |
исследований Взаимосвязь результатов
Научные сообщества, организации и финансирующие агентства поддерживают инициативы, стандарты и передовой опыт публикации и цитирования наборов данных и публикаций в Интернете . [20] [21] Примеры: DataCite , [22] ЭПИК [23] и КроссРеф , [24] которые устанавливают общие передовые методы присвоения метаданных и постоянных идентификаторов наборам данных и публикациям. Практику публикации и цитирования данных поддерживают исследовательские сообщества, которые считают, что наборы данных должны быть доступны для обнаружения и повторного использования в целях улучшения научной деятельности. [25] [26] В связи с этим было создано несколько усовершенствованных информационных систем публикаций, дающих возможность обогатить публикацию ссылками на соответствующие исследовательские данные, возможно, хранящиеся в хранилищах данных или базах данных по конкретным дисциплинам. Существование связей между литературой и данными способствует обнаружению использованных и произведенных научных данных, усиливает цитирование данных, облегчает повторное использование данных и вознаграждает ценную работу, лежащую в основе процедур управления данными.
| Расширенная система публикаций | Ссылки |
|---|---|
| Расширенный PDF-файл ReadCube | Фентон (2016) [27] |
| ОБЪЕМ | Чунг, Хантер, Лаштабег и Дреннан (2008) [28] |
| CENS ORE Агрегации | Пепе, Майерник, Боргман и Ван де Сомпель (2009) [29] |
| ЕвропаЧВК | Макинтайр и др. (2011) [30] |
| Червячная база | Юк и др. (2012) [31] |
| Проект расширенной публикации IN | Фараче, Францен, Сток, Сесинк и Рабина (2012) [32] |
| БиоЧай | Гарсия и др. (2013) [33] |
| Многопрофильные расширенные публикации OpenAIRE | Хугерверф и др. (2013) [34] |
Воспроизведение и оценка научных экспериментов [ править ]
Ученые должны быть оснащены оборудованием, необходимым для повторения или воспроизведения чужого эксперимента. В расширенных публикациях с исполняемыми частями повествовательные части сопровождаются исполняемыми рабочими процессами с целью воспроизведения и повторения экспериментов.
| Расширенная система публикаций | Ссылки |
|---|---|
| Пакеты научных моделей | Хантер (2006а), [35] Хантер (2006б), [36] Хантер и Чунг (2007) [37] |
| МойЭксперимент ( Объекты исследования ) | Де Рур и др. (2009); [38] Беххофер, Сур, Гэмбл, Гобл и Бьюкен (2010) [39] |
| ОВД | Сичарек и Вишневский (2011) [40] |
| Папье-Маше | Браммер, Кросби, Мэтьюз и Уильямс (2011) [41] |
| Среда создания коллажей | Новаковски и др. (2011) [42] |
| SciCrunch от RRID | Джеффри и др. (2014) [43] |
| ДЕЛИТЬСЯ | Ван Горп и Мазанек (2011) [44] |
Ссылки [ править ]
- ^ Верной-Герритсен, Марьян (2009). Новые стандарты для расширенных публикаций и технологий хранения: обзор технологий . Издательство Амстердамского университета.
- ^ Барди, Алессия; Манги, Паоло (2014). «Расширенные публикации: модели данных и информационные системы» . ЛИБЕР Ежеквартальный журнал . 23 (4). Ассоциация европейских исследовательских библиотек: 240–273. дои : 10.18352/lq.8445 .
- ^ «Инициатива FORCE11» .
- ^ «Как просмотреть и прикрепить файлы дополнений к ссылкам?» . support.readcube.com . Проверено 4 сентября 2019 г.
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «ReadCube — Исследователи — Интернет-библиотека Wiley» . onlinelibrary.wiley.com . Проверено 4 сентября 2019 г.
- ^ «Политика Elsevier в отношении дополнительных данных» .
- ^ «Журналы SAGE: Руководство для авторов по дополнительным файлам» .
- ^ Кирч, Йост Г. (2002). «Новые практики электронных публикаций 2: Новые формы научной статьи» . Изучал издательское дело . 15 (1). Ассоциация издателей ученых и профессиональных обществ: 27–32. дои : 10.1087/095315102753303652 . S2CID 20722855 .
- ^ Гербер, А.; Хантер, Дж. (2010). «Авторство, редактирование и визуализация сложных объектов для литературоведения» . Журнал цифровой информации . 11 (1). ISSN 1368-7506 .
- ^ Янковский, Северо-Запад; Шарнхорст, А.; Татум, К.; Татум, З. (2013). «Расширение научных публикаций: разработка гибридных монографий по гуманитарным и социальным наукам» . Научная и исследовательская коммуникация . 4 (1). дои : 10.22230/src.2013v4n1a40 . hdl : 1887/24801 .
- ^ Кандела, Л.; Кастелли, Д.; Пагано, П.; Сими, М. (2005). «От гетерогенных информационных пространств к виртуальным документам». Цифровые библиотеки: реализация стратегий и обмен опытом . Конспекты лекций по информатике. Том. 3815. с. 11. дои : 10.1007/11599517_2 . ISBN 978-3-540-30850-8 . S2CID 206594203 .
- ^ Финк, Дж. Линн; Борн, Филип Э. (2007). «Переосмысление научной коммуникации в эпоху электронных технологий» . CTWatch ежеквартально . 3 (3).
- ^ Шоттон, Д.; Портвин, К.; Клайн, Г.; Майлз, А. (2009). Борн, Филип Э. (ред.). «Приключения в семантической публикации: образцовые семантические улучшения исследовательской статьи» . PLOS Вычислительная биология . 5 (4): e1000361. Бибкод : 2009PLSCB...5E0361S . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000361 . ПМЦ 2663789 . ПМИД 19381256 .
- ^ ван ден Хеувел, Х.; ван Хорик, Р.; Скальола, СИ; Сандерс, ЕП; Виткамп, П. (2010). «The VeteranTapes: корпус исследований, инструмент обработки фрагментов и расширенные публикации для электронных гуманитарных наук». Труды ЛРЭК . 7-я Международная конференция по языковым ресурсам и оценке (LREC). стр. 2687–2692. hdl : 2066/85921 .
- ^ Эттвуд, Теннесси ; Келл, Д.Б .; Макдермотт, П.; Марш, Дж.; Петтифер, СР ; Торн, Д. (2010). «Документы утопии: связь научной литературы с данными исследований» . Биоинформатика . 26 (18): i568–i574. doi : 10.1093/биоинформатика/btq383 . ПМЦ 2935404 . ПМИД 20823323 .
- ^ Брере, Л.; Ворбидж, Х.; Хугерверф, М. (2011). «Богатые интернет-публикации: «Покажи, что говоришь» » . Журнал цифровой информации . 12 (1).
- ^ Фам, К.; Малик, Т.; Фостер, И.; Лауро, Р.; Монтелла, Р. (2012). «SOLE: Связь исследовательских работ с научными объектами». Происхождение и аннотация данных и процессов . Конспекты лекций по информатике. Том. 7525. стр. 203–208. дои : 10.1007/978-3-642-34222-6_16 . ISBN 978-3-642-34221-9 .
- ^ Зудилова-Сейнстра, Э.; Коерс, Х.; Химан, Ф.; Ольберсберг, Эй-Джей (2012). «Статья будущего от Elsevier, улучшающая взаимодействие с пользователем и интеграцию данных через приложения» . Аналитика: журнал UKSG Journal . 25 : 33–43. дои : 10.1629/2048-7754.25.1.33 .
- ^ Хоппнер, Массачусетс (2012). «Книжная полка NCBI: Книги и документы по наукам о жизни и здравоохранению» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D1251–D1260. дои : 10.1093/nar/gks1279 . ПМК 3531209 . ПМИД 23203889 .
- ^ Рейли, А.; Шаллиер, В.; Шримпф, С.; Смит, Э.; Уилкинсон, М. (2013). «Отчет об интеграции данных и публикаций» . Научная и исследовательская коммуникация . 4 (1).
- ^ Муни, Х.; Ньютон, М. (2012). «Анатомия цитирования данных: обнаружение, повторное использование и признание» . Журнал библиотечного дела и научных коммуникаций . 1 : 1035. дои : 10.7710/2162-3309.1035 .
- ^ «Датацит» . Проверено 27 января 2014 г.
- ^ «EPIC — Европейский консорциум постоянных идентификаторов» . Проверено 28 января 2014 г.
- ^ «КроссРеф» . Проверено 27 января 2014 г.
- ^ Каллаган, С.; Донеган, С.; Пеплер, С.; Торли, М.; Каннингем, Н.; Кирш, П.; Олт, Л.; Белл, П.; Боуи, Р.; Ледбеттер, А.; Лоури, Р.; Монкуаффе, Ж.; Харрисон, К.; Смит-Хэддон, Б.; Уэзерби, А.; Райт, Д. (2012). «Превращение данных в первоклассный научный результат: цитирование и публикация данных центрами экологических данных NERC» . Международный журнал цифрового курирования . 7 : 107–113. дои : 10.2218/ijdc.v7i1.218 .
- ^ Парсонс, Массачусетс; Фокс, Пенсильвания (2013). «Является ли публикация данных правильной метафорой?» . Журнал науки о данных . 12 : WDS32–WDS46. дои : 10.2481/dsj.wds-042 .
- ^ Фентон, Уильям (3 марта 2016 г.). «5 инструментов, которые делают управление цитированием и обмен цитатами менее головной болью» . ПКМАГ . Проверено 4 сентября 2019 г.
- ^ Чунг, К.; Хантер, Дж.; Лаштабег А.; Дреннан, Дж. (2008). «ОБЪЕМ: система публикации и редактирования научных сложных объектов» . Международный журнал цифрового курирования . 3 (2): 4–18. дои : 10.2218/ijdc.v3i2.55 .
- ^ Пепе, А.; Майерник, М.; Боргман, CL; ван де Сомпель, Х. (2009). «Технологии для представления научной практики: данные, жизненные циклы и цепочки создания стоимости» . Журнал Американского общества информатики и технологий .
- ^ Макинтайр, Джоанна Р.; Ананиаду, София; Эндрюс, Стивен; Блэк, Уильям Дж.; Боулдерстон, Ричард; Баттери, Паула; Чаплин, Дэвид; Чевуру, Сандипредди; Кобли, Норман; Коулман, Ли-Энн; Дэйви, Пол; Гупта, Бхарти; Хаджи-Голам, Лесли; Хокинс, Крейг; Хорн, Алан; Хаббард, Саймон Дж.; Ким, Джи-Хьюб; Левин, Ян; Лайт, Вик; Макинтайр, Росс; Мансур, Сами; Мейсон, Линда; Макнот, Джон; Ньюболд, Элизабет; Нобата, Чикаши; Онг, Эрнест; Пиллаи, Шармила; Ребхольц-Шуман, Дитрих; Рози, Хизер; Роуботэм, Роб; Рупп, CJ; Стер, Питер; Воган, Филип (2011). «UKPMC: полнотекстовый ресурс статей по наукам о жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (Проблема с базой данных): D58–D65. дои : 10.1093/нар/gkq1063 . ПМК 3013671 . ПМИД 21062818 .
- ^ Юк, К.; Харрис, ТВ; Биери, Т.; Кабунок, А.; Чан, Дж.; Чен, WJ; Дэвис, П.; де ла Крус, Н.; Дуонг, А.; Фанг, Р.; Ганесан, У.; Гроув, К.; Хау, К.; Кадам, С.; Кишор, Р.; Ли, Р.; Ли, Ю.; Мюллер, Х.-М.; Накамура, К.; Нэш, Б.; Озерский, П.; Паулини, М.; Рачити, Д.; Рангараджан, А.; Шиндельман, Г.; Ши, Х.; Шварц, Э.М.; Энн Тули, М.; Ван Аукен, К.; Ван, Д. (2011). «Worm Base 2012: больше геномов, больше данных, новый веб-сайт» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D735–D741. дои : 10.1093/nar/gkr954 . ПМК 3245152 . ПМИД 22067452 .
- ^ Фараче, диджей; Францен, Дж.; Сток, К.; Сесинк, Л.; Рабина, Д.Л. (2012). «Связывание полнотекстовой серой литературы с основными исследованиями и данными после публикации: проект расширенных публикаций 2011–2012» (PDF) . Серый журнал . 8 (3): 181–189.
- ^ Гарсиа Кастро, Л.; Маклафлин, К.; Гарсия, А. (2013). «Биотея: RDFizing Pub Med Central в поддержку статьи как интерфейса к Сети данных» . Журнал биомедицинской семантики . 4 (Дополнение 1): S5. дои : 10.1186/2041-1480-4-S1-S5 . ПМК 3804025 . ПМИД 23734622 .
- ^ Хугерверф, М. (2009). «Долговечные расширенные публикации» (PDF) . Труды африканской цифровой стипендии и курирования . Проверено 27 января 2014 г.
- ^ Хантер, Джейн (2006). Научные модели: ориентированный на пользователя подход к интеграции научных данных и цифровых библиотек . ВАЛА2006. стр. 1–16 . Проверено 27 января 2014 г.
- ^ Хантер, Дж. (2006). «Пакеты научных публикаций – избирательный подход к распространению и архивированию научных результатов» . Международный журнал цифрового курирования . 1 : 33–52. дои : 10.2218/ijdc.v1i1.4 .
- ^ Хантер, Дж.; Чунг, К. (2007). «Provenance Explorer — графический интерфейс для создания пакетов научных публикаций на основе источников происхождения». Международный журнал цифровых библиотек . 7 (1–2): 99–107. дои : 10.1007/s00799-007-0018-5 . S2CID 18156460 .
- ^ Де Рур, Д .; Гобл, К. ; Стивенс, Р. (2009). «Разработка и реализация виртуальной исследовательской среды myExperiment для социального обмена рабочими процессами» . Компьютерные системы будущего поколения . 25 (5): 561–567. дои : 10.1016/j.future.2008.06.010 . S2CID 3300231 .
- ^ Беххофер, С.; Де Рур, Д.; Гэмбл, М.; Гобл, К.; Бьюкен, И. (2010). «Объекты исследования: на пути к обмену и повторному использованию цифровых знаний» . Предшественники природы . дои : 10.1038/npre.2010.4626.1 .
- ^ Сичарек, Дж.; Вишневский, Б. (2011). «IODA — интерактивная архитектура открытого документа» . Procedia Информатика . 4 : 668–677. дои : 10.1016/j.procs.2011.04.070 .
- ^ Браммер, Греция; Кросби, RW; Мэтьюз, SJ; Уильямс, ТЛ (2011). «Папер-маше: создание динамической воспроизводимой науки» . Procedia Информатика . 4 : 658–667. дои : 10.1016/j.procs.2011.04.069 .
- ^ Новаковски, П.; Цепиела, Э.; Харенжлак, Д.; Кокот, Дж.; Каштельник, М.; Бартыньский, Т.; Мейзнер, Дж.; Дык, Г.; Малавски, М. (2011). «Среда создания коллажей» . Procedia Информатика . 4 : 608–617. дои : 10.1016/j.procs.2011.04.064 .
- ^ Джеффри, Грета; Анита, Бандровски; Дэвис, Бэнкс; Кристофер, Кондит; Амарнатх, Гупта; Стивен, Ларсон; Юэлин, Ли; Ибрагим, Озюрт; Андреа, Стэгг; Патрисия, Ветцель; Луис, Маренко; Перри, Миллер; Риксин, Ван; Гордон, Шепард; Мэриэнн, Мартоне (2014). «SciCrunch: совместная платформа для поиска данных и ресурсов для научных сообществ» . Границы нейроинформатики . 8 . дои : 10.3389/conf.fninf.2014.18.00069 .
- ^ Ван Горп, П.; Мазанек, С. (2011). «ПОДЕЛИТЬСЯ: веб-портал для создания и обмена исполняемыми исследовательскими работами» . Procedia Информатика . 4 : 589–597. дои : 10.1016/j.procs.2011.04.062 .