Звездная деятельность

Звездчатая активность — это релаксация или изменение специфичности опосредованного рестриктазой расщепления ДНК , которое может происходить в условиях реакции, существенно отличающихся от оптимальных для фермента. Результатом обычно является расщепление на неканонических сайтах узнавания, а иногда и полная потеря специфичности.

Различия, которые могут привести к образованию звезды, включают низкую ионную силу , высокий уровень pH и высокие (> 5% об. ) глицерина . концентрации ^[1] Последнее условие представляет особый практический интерес, поскольку коммерческие ферменты рестрикции обычно поставляются в буфере , содержащем значительное количество глицерина (обычно 50% по объему), а это означает, что недостаточное разбавление раствора фермента может вызвать звездчатую активность; эта проблема чаще всего возникает во время двойных или множественных дайджестов. Звездная активность может произойти из-за присутствия Mg ²⁺, как это видно в HindIII , например, .

Термин звездная активность был введен Майером. ^[2] который охарактеризовал модифицированную активность EcoRI .

Внешние ссылки

Звездная активность - Биолаборатории Новой Англии
Звездная активность (релаксация специфичности) - Fermentas
Звездная активность ферментов рестрикции – подробный список от TaKaRa
Вэй, Х; Терриен, К; Бланшар, А; Гуань, С; Чжу, Z (2008). «Индекс верности обеспечивает систематическое количественное определение звездообразной активности эндонуклеаз рестрикции ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (9): е50. дои : 10.1093/нар/gkn182 . ПМК 2396408 . ПМИД 18413342 .

Ссылки

^ Робинсон, ЧР; Слайгер, С.Г. (1993). «Молекулярное распознавание, опосредованное связанной водой: механизм звездной активности рестрикционной эндонуклеазы EcoRI». Журнал молекулярной биологии . 234 (2): 302–306. дои : 10.1006/jmbi.1993.1586 . ПМИД 8230215 .
^ Майер, Хьюберт (1978). «Оптимизация EcoRI*-активности эндонуклеазы EcoRI» . ФЭБС Летт . 90 (2): 341–44. дои : 10.1016/0014-5793(78)80400-1 . ПМИД 352725 .

Эта ферментам статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Робинсон, ЧР; Слайгер, С.Г. (1993). «Молекулярное распознавание, опосредованное связанной водой: механизм звездной активности рестрикционной эндонуклеазы EcoRI». Журнал молекулярной биологии . 234 (2): 302–306. дои : 10.1006/jmbi.1993.1586 . ПМИД 8230215 .

[2] Майер, Хьюберт (1978). «Оптимизация EcoRI*-активности эндонуклеазы EcoRI» . ФЭБС Летт . 90 (2): 341–44. дои : 10.1016/0014-5793(78)80400-1 . ПМИД 352725 .

[1]

[2]