Роберт Мюррайя
| Роберт Мюррайя | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Robertmurraya Gupta et al. 2020
|
| Разновидность | |
Информация на основе ЛПСН 2021 | |
Robertmurraya — род преимущественно грамположительных палочковидных бактерий семейства Bacillaceae из отряда Bacillales . [ 1 ] [ 2 ] Типовым видом этого рода является Robertmurraya siralis. [ 3 ]
Члены Robertmurraya ранее были видами, принадлежащими к Bacillus , роду, который, как было признано, демонстрирует обширную полифилию и филогенетическую гетерогенность среди своих членов. [ 4 ] [ 5 ] Было опубликовано множество исследований с попыткой прояснить эволюционные взаимоотношения между видами Bacillus , что привело к созданию многочисленных новых родов, таких как Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus , Virgibacillus и Evansella . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 1 ] Кроме того, в род Bacillus были внесены изменения, включающие только виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . [ 6 ] [ 1 ]
Имя Робертмуррайя было названо в честь канадского микробиолога доктора Роберта Дж. Мюррея из Университета Западного Онтарио за его вклад и лидерство в области бактериальной систематики. [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные характеристики
[ редактировать ]Представители этого рода являются аэробами и встречаются в таких местах, как песчаная почва и человеческий стул. Все представители могут продуцировать эндоспоры, оксидазо-положительные и каталазо-положительные (за исключением Robertmurraya Massiliosenegalensis ). Оптимальная температура роста Робертмуррайи находится в пределах 30-37°С. Анализ последовательностей генома видов Robertmurraya выявил три консервативные сигнатурные индели (CSI) в следующих белках: гипотетический белок, сахаросвязывающий регулятор транскрипции и аспарагинсинтаза (гидролизующая глутамин) , и в большинстве случаев они являются общими исключительно для всех или большинства членов. этого рода. [ 1 ] Эти молекулярные сигнатуры обеспечивают надежные молекулярные средства, позволяющие отличить представителей этого рода от других Bacillaceae . родов и бактерий [ 1 ]
Таксономия
[ редактировать ]Робертмуррайя по состоянию на май 2021 года включает в общей сложности 10 видов с достоверно опубликованными названиями. [ 3 ] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связанный с другими видами Bacillus в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри Bacillus . [ 1 ] Эта модель ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома (GTDB). [ 11 ]
Три недействительно опубликованных вида, «Bacillus coreaensis», «Bacillus dakarensis» и «Bacillus yapensis», также группируются с другими членами Robertmurraya на филогенетических деревьях, а также имеют одни и те же молекулярные маркеры в виде консервативных сигнатурных инделей. (CSI). [ 1 ] Однако их перенос официально не предлагался из-за отсутствия информации о культурных штаммах, указывающей на необходимость будущего пересмотра этого рода по мере обнаружения и присвоения дополнительных геномов и новых видов.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Гупта, Рэдхи С.; Патель, Судип; Шайни, Навнеет; Чен, Шу (01 ноября 2020 г.). «Надежное разграничение 17 различных клад видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, с помощью филогеномики и сравнительного геномного анализа: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. и предложение по исправленному роду Bacillus, ограничивающему его только членами клад Subtilis и Cereus. видов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. дои : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 33112222 .
- ^ Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т.; Гаррити, Джордж М.; Бун, Дэвид Р.; Де Вос, Пол; Гудфеллоу, Майкл; Рейни, Фред А.; Шляйфер, Карл-Хайнц, ред. (2005). Руководство Берджи® по систематической бактериологии . дои : 10.1007/0-387-28022-7 . ISBN 978-0-387-24144-9 .
- ^ Jump up to: а б «Род: Робертмуррайя» . lpsn.dsmz.de. Проверено 30 мая 2021 г.
- ^ Эш, Кэрол; Фэрроу, Джей; Уоллбэнкс, Салли; Коллинз, доктор медицины (28 июня 2008 г.). «Филогенетическая гетерогенность рода Bacillus, выявленная путем сравнительного анализа последовательностей малых субъединиц-рибосомальных РНК» . Письма по прикладной микробиологии . 13 (4): 202–206. дои : 10.1111/j.1472-765x.1991.tb00608.x . ISSN 0266-8254 . S2CID 82988953 .
- ^ Логан, Северная Каролина; Берге, О.; Бишоп, АХ; Буссе, Х.-Ж.; Де Вос, П.; Фрице, Д.; Хейндрикс, М.; Кампфер, П.; Рабинович, Л.; Салкиноя-Салонен, М.С.; Селдин, Л. (30 июня 2009 г.). «Предложенные минимальные стандарты для описания новых таксонов аэробных бактерий, образующих эндоспоры» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (8): 2114–2121. дои : 10.1099/ijs.0.013649-0 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 19567583 .
- ^ Jump up to: а б Патель, Судип; Гупта, Рэдхи С. (01 января 2020 г.). «Филогеномная и сравнительная геномная основа для решения полифилии рода Bacillus: предложение для шести новых родов видов Bacillus, Peribacillus gen. nov., Cytobacillus gen. nov., Mesobacillus gen. nov., Neobacillus gen. nov., Metabacillus gen. ноябрь и Alkalihalobacillus gen . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 406–438. дои : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 31617837 .
- ^ ШИДА, О.; ТАКАГИ, Х.; КАДОВАКИ, К.; КОМАГАТА, К. (1 октября 1996 г.). «Предложение по двум новым родам: Brevibacillus gen. nov. и Aneurinibacillus gen. nov .» Международный журнал систематической бактериологии . 46 (4): 939–946. дои : 10.1099/00207713-46-4-939 . ISSN 0020-7713 . ПМИД 8863420 .
- ^ Визоцки, доктор медицинских наук; Юрщук П.; Фокс, GE; Дейнхард, Г.; Поралла, К. (1 апреля 1992 г.). «Сравнительный анализ последовательностей 16S рРНК (рДНК) Bacillus acidocaldarius, Bacillus acidoterrestris и Bacillus cycloheptanicus и предложение по созданию нового рода Alicyclobacillus gen. nov» . Международный журнал систематической бактериологии . 42 (2): 263–269. дои : 10.1099/00207713-42-2-263 . ISSN 0020-7713 . ПМИД 1374624 .
- ^ Муал, Пунам; Сингх, Нитин Кумар; Верма, Ашиш; Шуман, Питер; Кришнамурти, Шринивасан; Дастагер, Сайед; Майилрадж, Шанмугам (01 мая 2016 г.). «Реклассификация Bacillus isronensis Shivaji et al. 2009 в Solibacillus isronensis com. nov. и исправленное описание рода Solibacillus Кришнамурти и др. 2009» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (5): 2113–2120. дои : 10.1099/ijsem.0.000982 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 26907585 .
- ^ Хейндрикс, М.; Леббе, Л.; Керстерс, К.; Хосте, Б.; Де Вахтер, Р.; Де Вос, П.; Форсайт, Г.; Логан, Северная Каролина (1 июля 1999 г.). «Предложение Virgibacillus proomii sp. nov. и исправленное описание Virgibacillus pantothenticus (Proom and Knight 1950) Heyndrickx et al. 1998» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (3): 1083–1090. дои : 10.1099/00207713-49-3-1083 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 10425765 .
- ^ «ГТДБ — Дерево» . gtdb.ecogenomic.org . Проверено 28 мая 2021 г.