✖


Jump to content

Оснат Пенн

Edit links

Оснат Пенн ( иврит : Оснат Пенн ), родившийся в 1981 году, [ 1 ] является израильским вычислительным биологом, чья работа фокусируется на молекулярной эволюции, исследованиях клеток и иммуноинформатике. [ 2 ] Она является третьим израильским ученым за три года, чтобы выиграть стипендию ЮНЕСКО-Л'Ореал , которую она получила в 2013 году за свою работу по генетическому происхождению аутизма . [ 3 ] Пенн в настоящее время является научным сотрудником в Университете Вашингтона в Сиэтле , где она работает с 2012 года. [ 4 ] [ 2 ]

Жизнь и работа

[ редактировать ]

Пенн имеет три степени в Университете Тель-Авив в Израиле. Она завершила бакалавр наук в области биологии и информатики, специализируясь на биоинформатике . [ 5 ] Она также получила степень магистра в области молекулярной биологии и докторскую степень. В области вычислительной биологии , как с Департаментом клеточных исследований, так и иммунологии. Ее докторская степень Тезис был назван «Вычислительные методы для анализа последовательностей эволюционной динамики ВИЧ» и контролировался профессором Тель-Авива Тал Пупко. [ 5 ]

Пенн ранее работала в Тель-Авивском университете в качестве ассистента по введению курса в биоинформатику в период с 2006 по 2009 год. Она также преподавала несколько курсов по анализу биоинформатики и биологических последовательностей в Тель-Авиве в период с 2007 по 2011 год. [ 2 ]

Карьера

[ редактировать ]

Пенн отвечал за несколько различных компьютерных программ, разработанных в Университете Тель -Авива , чтобы помочь в биологических исследованиях. [ 2 ] Она разработала руководство, веб -сервер , используемый для оценки баллов доверия выравнивания, при поддержке программы сходящихся технологий. [ 2 ] [ 6 ] Raser, оценка сдвига скорости, используется для проверки специфических для участка сдвигов эволюционных скоростей и определения конкретных сайтов и линий, в которых, вероятно, происходят сдвиги. [ 7 ] Сервер Pepitope используется для картирования эпитопов с использованием выбранных аффинных пептидов . [ 2 ] [ 8 ]

Ее работа с генетическим секвенированием с аутизмом, которая получила ей награду ЮНЕСКО-Льорел и грант в размере 40 000 долларов на дальнейшее обучение, [ 1 ] Работал, чтобы идентифицировать генетические вариации у детей с аутизмом , которые отличались от последовательностей генома у аллистичных родителей. [ 1 ] Это способствовало исследованию генетической сложности аутизма, особенно в случаях, когда нет семейного анамнеза состояния (спорадический аутизм). Ее работа может привести к пренатальному скрининге и ранней диагностике аутизма, а также к развитию генной терапии как интервенционного лечения. [ 9 ]

Публикации

[ редактировать ]

Пенн был опубликован в Cell , [ 10 ] [ 11 ] Исследование генома , [ 12 ] Молекулярная биология и эволюция , [ 13 ] Исследование нуклеиновых кислот , [ 14 ] Систематическая биология , [ 15 ] BMC Эволюционная биология , [ 16 ] PLOS Computational Biology , [ 17 ] Биоинформатика , [ 18 ] Белки , [ 19 ] Медицина генома , [ 20 ] Природа , [ 21 ] Границы в молекулярных биологических науках , [ 22 ] Природа экология и эволюция , [ 23 ] Биология генома , [ 24 ] Американский журнал человеческой генетики [ 25 ] и протеиновая инженерия, проектирование и отбор . [ 26 ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а беременный в «Оснат Зомер-Пенн» . www.jewishvirtuallibrary.org . Получено 2022-11-24 .
  2. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Голова, Оснат Зер. "Osnat Head (Osnate Zer) домашняя страница " www.tau.ac.il Отступление 2022-11-24 .
  3. ^ «Израильский исследователь аутизма выигрывает стипендию ЮНЕСКО» . Algemeiner . 29 марта 2013 года . Получено 26 ноября 2015 года .
  4. ^ "Оснат Пенн" . Eichler Lab . Университет Вашингтона. Архивировано с оригинала 16 июня 2016 года . Получено 26 ноября 2015 года .
  5. ^ Jump up to: а беременный "Eichler Lab" . 2016-06-16. Архивировано с оригинала 2016-06-16 . Получено 2022-11-24 .
  6. ^ «Сервер руководства - веб -сервер для оценки оценки достоверности выравнивания» . Руководство.tau.ac.il . Получено 2022-11-24 .
  7. ^ «Raser - оценка сдвига скорости» . www.tau.ac.il. ​Получено 2022-11-24 .
  8. ^ "Пепитопский сервер" . Pepitope.tau.ac.il . Получено 2022-11-24 .
  9. ^ Шама, Дэвид. «Израильский выигрывает европейский конкурс женских наук» . www.timesofisrael.com . Получено 2022-11-24 .
  10. ^ Бернье, Рафаэль; Голцио, Кристоль; Xiong, Bo; Stessman, Holly A.; Коу, Брэдли П.; Пенн, Оснат; Уизерспун, Кали; Гердтс, Дженнифер; Бейкер, Карл (2014-07-17). «Разрушительные мутации CHD8 определяют подтип аутизма на ранних этапах развития» . Клетка . 158 (2): 263–276. doi : 10.1016/j.cell.2014.06.017 . ISSN   0092-8674 . PMC   4136921 . PMID   24998929 .
  11. ^ Guowens, Wild W.; Sorencent, Staci A.; Бафизадде, Фахиме; Будзилил три; Ли, Брайан Р.; Джаски, команда; Альфин, Лорен; Бейкер, Кэтрин; Элиза; Берри, Кайла; Бергноли, бесплодный; Бикли, Крис; Бомба, жасмин; Браун, Томас; Брупер, Крисс; Каспер, расстояние; КРИЧТОН, Кирштейн; Дейл, как спросил L.; Далли, Рэйчел; де Фраста, Ребекка А.; Ди, Ник; Деста, Стела; Ли, небольшой график; Дотон, Надеза; Эгдорф, Том; Эллингвуд, Лорен; Энстром, Рэйчел; Эспосто, Люк; Фаррелл, Колин; Фэн, Дэвид; Фонг, Оливия; Гала, Рохан; Gameline, Клэр; Гэри, Аманда; Гландон, Александра; Голди, Джефф; Горхам, Мелисса; Грейбак, Лукас; Г, Хонг; Хэдли, Кристиан; Hawrylyctz, Michael J.; Генри, Алекс М. Хилл, Дижон; Хупп, Меди; Сурд, Сара; Ким, Тэ Кьянг; Ким, Лиза; Кролл, Мэтью; Ли, Чанку; Ссылка, карьера E.; Маробер, Марон; Манн, Расти; Максвелл, Мишель; МакГроу, Медея; Макмиллен, Делисса; Мукора, Алиса; Нг, Линдсей; Нг, Лидия; Comed, Kiet; Nicovich, Philip R.; Олдре, Аарон; Парк, Даниэль; Пен, Ханачан; Пенн, Осат; Кухам, спасибо; Пом, Алиса; Попович, Королевский; Его мозг, Лидия; Раджан, Рамкурмар; Рансфорд, Ши; Рейд, Дэвид; Ричинин, Кристина; Робертон, Минанда; Ronnelphone, Kraa; Руис, Аугутин; Сэндман, Дэвид; Смит, Кимберли; Борозд, Джозеф; Потол, Сьюзен М.; Szeper, Аарон; Тиу, Майкл; Торосон, Эми; Тирих, Джессика; Жесткий, Герман; Уэйкман, Уэйн; Уорд, Кейтлин; Уильямс, Грейс; Чжоу, Чжи; Тин, Джонатан Т.; Архипов, Антон; Sülül, Uygar; Lein, ed S.; Кох, Христор; Яо, Зихан; Tacic, Bosilns; Банг, Джим; Мерфи, GBE J.; Зенг, Хонгкуи (ноябрь 2020 г.). «Интегрированная морфоэлектрическая и транскриптомная классификация кортикальных ГАМКергических клеток» . Клетка . 183 (4): 935–953.E19. doi : 10.1016/j.cell.2020.09.057 . PMC   7781065 . PMID   33186530 .
  12. ^ Гелфман, Сахар; Верховой, Дэвид; Пенн, Оснат; Савченко, Анна; Амит, Мааян; Шварц, Шрага; Пупко, Тал; AST, GIL (2012-01-01). «Изменения в структуре экзон -интрона во время эволюции позвоночных влияют на сплайсинг экзонов» . Исследование генома . 22 (1): 35–50. doi : 10.1101/gr.119834.110 . ISSN   1088-9051 . PMC   3246205 . PMID   21974994 .
  13. ^ Прививой, Эяль; Пенн, Оснат; Пупко, Тал (2012-01-01). «Улучшение производительности положительного вывода отбора путем фильтрации ненадежных областей выравнивания» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (1): 1–5. doi : 10.1093/molbev/msr177 . ISSN   0737-4038 . PMID   21772063 .
  14. ^ Пенн, Оснат; Прививой, Эяль; Ашкенази, Хаим; Ландан, Гидди; Граур, Дэн; Пупко, Тал (2010-07-01). «Руководство: веб -сервер для оценки баллов достоверности выравнивания» . Исследование нуклеиновых кислот . 38 (Suppl 2): ​​W23 - W28. doi : 10.1093/nar/gkq443 . ISSN   0305-1048 . PMC   2896199 . PMID   20497997 .
  15. ^ Стерн, Ади; Мейроуз, Итай; Пенн, Оснат; Шаул, Шаул; Гофна, Ури; Пупко, Тал (2010-03-01). «Эволюционный анализ бокового переноса генов в ферментах тимидилатсинтазы» . Систематическая биология . 59 (2): 212–225. doi : 10.1093/sysbio/syp104 . ISSN   1063-5157 . PMC   2826268 . PMID   20525631 .
  16. ^ Бланга-Канфи, Шани; Миранда, Гектор; Пенн, Оснат; Пупко, Тал; Дебри, Рональд В.; Хучон, Дороте (2009-04-02). «Пересмотренная филогения грызунов: анализ шести ядерных генов из всех основных клад грызунов» . BMC Эволюционная биология . 9 (1): 71. doi : 10.1186/1471-2148-9-71 . ISSN   1471-2148 . PMC   2674048 . PMID   19341461 .
  17. ^ Пенн, Оснат; Стерн, Ади; Рубинштейн, Нимрод Д.; Дутейл, Жюльен; Бачарак, Эран; Галтье, Николас; Пупко, Тал (2008-11-07). «Эволюционное моделирование сдвигов скорости выявляет детерминанты специфичности в подтипах ВИЧ-1» . PLOS Comput Biol . 4 (11): E1000214. Bibcode : 2008plscb ... 4e0214p . doi : 10.1371/journal.pcbi.1000214 . PMC   2566816 . PMID   18989394 .
  18. ^ Мейроуз, Итай; Пенн, Оснат; Эрез, Элана; Рубинштейн, Нимрод Д.; Шломи, Томер; Фрейнд, Наталья Тарновицки; Bublil, Erez M.; Руппин, Эйтан; Sharan, Roded (2007-12-01). «Пепитоп: картирование эпитопа из выбранных аффинных пептидов» . Биоинформатика . 23 (23): 3244–3246. doi : 10.1093/bioinformatics/btm493 . ISSN   1367-4803 . PMC   7110138 . PMID   17977889 .
  19. ^ Bublil, Erez M.; Фрейнд, Наталья Тарновицки; Мейроуз, Итай; Пенн, Оснат; Ройтбурд-Берман, Анна; Рубинштейн, Нимрод Д.; Пупко, Тал; Гершони, Джонатан М. (2007-07-01). «Пошаговое предсказание конформационных прерывистых B-клеточных эпитопов с использованием алгоритма мапитопа». Белки: структура, функция и биоинформатика . 68 (1): 294–304. Citeseerx   10.1.1.124.9174 . doi : 10.1002/prot.21387 . ISSN   1097-0134 . PMID   17427229 . S2CID   5322731 .
  20. ^ Чоу, Джули; Дженсен, Мэтью; Амини, Хаджар; Hormozdiari, Farhad; Пенн, Оснат; Шифман, Сагив; Гирираджан, Сантош; Hormozdiari, Fereydoun (2019-10-25). «Расширение генетической основы фенотипов сопутствующей эпилепсии при заболеваниях нервно -развития» . Медицина генома . 11 (1): 65. doi : 10.1186/s13073-019-0678-y . ISSN   1756-994x . PMC   6815046 . PMID   31653223 .
  21. ^ Тасич, Босильжка; Яо, Зезхен; Грейбак, Лукас Т.; Смит, Кимберли А.; Нгуен, Тук Нги; Бертагнолли, Даррен; Голди, Джефф; Гаррен, Эмма; Ecovery, Michael N.; Вишванатан, Сарада; Пенн, Оснат; Баккен, Тригве; Менон, Вилас; Миллер, Джереми; Фонг, Оливия (ноябрь 2018). «Общие и различные транскриптомные типы клеток в неокортикальных областях» . Природа . 563 (7729): 72–78. doi : 10.1038/s41586-018-0654-5 . ISSN   1476-4687 . PMC   6456269 . PMID   30382198 .
  22. ^ Сюэ, Ава Юань; Ди Пизио, Антонелла; Левит, Анат; Ярницкий, Тали; Пенн, Оснат; Пупко, Тал; Niv, Masha Y. (2018). «Независимая эволюция распознавания стрихнина подтипами рецептора горького вкуса» . Границы в молекулярных биологических науках . 5 : 9. doi : 10.3389/fmolb.2018.00009 . ISSN   2296-889X . PMC   5840161 . PMID   29552563 .
  23. ^ Деннис, Меган Y.; Баршмен, Лана; Нельсон, Брэдли Дж.; Пенн, Оснат; Cantilieris, Stuart; Хаддлстон, Джон; Антоначчи, Франческа; Пенвит, Келси; Денман, Лора; Раджа, Арчана; Бейкер, Карл; Марк, Кеннет; Малиг, Мака; Янке, Николетт; Эспиноза, Клаудия (2017-02-17). «Эволюция и популяционное разнообразие человеческих сегментарных дупликаций» . Природа экология и эволюция . 1 (3): 1–10. doi : 10.1038/s41559-016-0069 . HDL : 11586/203935 . ISSN   2397-334X .
  24. ^ Dougherty, Max L.; Nuttle, Ксандер; Пенн, Оснат; Нельсон, Брэдли Дж.; Хаддлстон, Джон; Бейкер, Карл; Баршмен, Лана; Duyzend, Michael H.; Вентура, Марио; Антоначчи, Франческа; Сандстрем, Ричард; Деннис, Меган Y.; Эйхлер, Эван Э. (2017-03-09). «Рождение человеческого нейронного гена путем неполного дублирования и слияния генов» . Биология генома . 18 (1): 49. DOI : 10.1186/S13059-017-1163-9 . ISSN   1474-760x . PMC   5345166 . PMID   28279197 .
  25. ^ Stessman, Holly AF; Williamsen, Marjolein H.; Фенкова, Микаэла; Пенн, Оснат; Горячий, Александр; Xiong, Bo; Ван, Тяньюн; Homezema, Kendra; Fives, Лаура; Птица, Ида; Бруннер, Хан Г.; из Burgt, подстрекатель; Окелон, Шарлотта В.; Письменные дома, янке Х.; Small Wassink-Ruiter, Jolin S. (2016-03-03). «Разрушение или POGZ связаны с белыми интеллектуальными расстройствами диагноза и аудизма» . Американский журнал или человеческая генетика . 98 (3): 541–552. doi : 10,1016/j.ajhg.2016 004 . ISSN   1537-6605 . PMC   4890241 . PMID   2694287 .
  26. ^ Бар-Роговский, Хагит; Стерн, Ади; Пенн, Оснат; Кобл, Ирис; Пупко, Тал; Tawfik, Dan S. (ноябрь 2015). «Оценка точности прогнозирования наследственной реконструкции с помощью библиотечного подхода» . Протеиновая инженерия, дизайн и отбор . 28 (11): 507–518. doi : 10.1093/белок/gzv038 . ISSN   1741-0134 . PMID   26275856 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Osnat_Penn&oldid=1188131853"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 937b2ab1a252ab905e2a51ed5edadd27__1701604140
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/93/27/937b2ab1a252ab905e2a51ed5edadd27.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Osnat Penn - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)