Acetoanaerobium Sticklandii

Acetoanaerobium Sticklandii
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Bacillota
Сорт:	Клоррия
Заказ:	Eubacteriales
Семья:	Peptostreptococcaceae
Род:	Acetoanaerobium
Разновидность:	A. Sticklandii
Биномиальное название
	Acetoanaerobium Sticklandii ; (Cityman and McCling 1957) Galperin et al. 2016
Синонимы
	Clostridium Sticklandii Stadtman и McClung 1957

Acetoanaerobium Sticklandii -это анаэробная , подвижная , грамположительная бактерия . Сначала он был изолирован в 1954 году от черной грязи в районе залива Сан -Франциско Т.С. Стадтманом, который также назвал этот вид. ^{[ 2 ]} A. Sticklandii не является патогенным у людей.

Биология и биохимия

Аминокислоты Acetoanaerobium formentii, используя реакцию Stickland , которая объединяет окисление одной аминокислоты и восстановление другой. LH Stickland описал этот процесс в 1934 году. Ферментами в реакции Stickland являются D-пролинредуктаза (акцептор электрона) и глицинеректаза . A. Sticklandii преимущественно использует треонин, аргинин, серин, цистеин, пролин и глицин во время фазы роста и лизина во время стационарной фазы, выводя глютамат, аспартат и аланин. ^{[ Цитация необходима ]}

Селенопротеины можно найти в геноме A. Sticklandii . Один такой селенопротеин, глицинерекредуктаза А была впервые идентифицирована в A. Sticklandii . A. Sticklandii использует в общей сложности восемь из этих селенопротеинов. Один из которых, PRDC, ранее не считался селенопротеином. PRDC, который похож на RNFC у других видов, находится в опероне D-пролинредуктазы. Оперон D-пролинредуктазы отвечает за редуцирующее кольцо расщепления D-пролин в 5-аминовалерат. 5-аминовация выделяется CL. Sticklandii . ^{[ Цитация необходима ]}

Хотя энергосбережение в A. chlectlandii достигается посредством фосфорилирования на уровне субстрата, оно может быть достигнуто и с помощью фосфорилирования электронного транспорта. Комплекс RNF, Na+-зависимая F-АТФаза , V-АТФаза и мембрановая пирофосфатаза служат методами для сохранения энергии посредством фосфорилирования электронов. ^{[ Цитация необходима ]}

На другом интересном примечании A. Sticklandii имеет два пути фиксации углекислого газа, двойные пути, дерево-ljundgahl и глицинсинтазы /глициновая редуктаза. Странно найти оба эти метода фиксации углекислого газа одновременно. Было обнаружено, что только четыре других вида бактерий содержат оба эти пути. Хотя A. Sticklandii обладает способностью использовать оба пути, не было определено, используют ли они оба пути одновременно. ^{[ Цитация необходима ]}

Хотя это считается облигатным анаэробным, A. Sticklandii имеет гены, которые позволяют культивировать бактерию в аэробных условиях. Некоторые из белков, изготовленных A. Sticklandii , которые позволяют восстановить повреждение от воздействия кислорода, включают Mn-супероксиддисмутазу ^{[ 3 ]} и супероксидредуктаза , алкилдропероксидредуктаза, ^{[ 4 ]} Рубритрин , ^{[ 5 ]} Глутатионпероксидазы , селено-пероксиарсин, тиоредоксин-зависимая пероксидаза и сульфоксид редуктазы A и B.

Геном

Acetoanaerobium Sticklandii имеет геном, который состоит из одной круглой хромосомы. На этой хромосоме 2715 461 пара оснований. Из этих пар оснований есть 2573 кодирующих последовательностей, при этом только 2,1% от генома повторяются. A. Sticklandii разделяет наибольшее количество генов, которые гомологичны с Clostridioides difficile (патогенный вид в Peptostreptococcaceae ) и с двумя членами рода щелочи . ^{[ Цитация необходима ]}

Примечания

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Виды страниц : Acetoanaerobium Sticklandii на «LPSN - Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре» . Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур . Получено 2022-10-03 .
^ Fonknechten, n; Chaussonnerie, S; и др. (2010). «Clostridium Sticklandii, специалист по деградации аминокислот: пересмотр его метаболизма через последовательность генома» . BMC Genomics . 11 : 555–567. doi : 10.1186/1471-2164-11-555 . PMC 3091704 . PMID 20937090 .
^ "Скриппс" . Архивировано из оригинала 2012-07-23 . Получено 2012-04-03 .
^ "Sgmjournals" .
^ «Рубритрин» . Архивировано из оригинала 28 августа 1999 года.

Ссылки

Fonknechten, n; Chaussonnerie, S; и др. (2010), "Clostridium Sticklandii, специалист по деградации аминокислот: пересмотр его метаболизма посредством последовательности генома", BMC Genomics , 11 : 555–567, doi : 10.1186/1471-2164-11-555 , PMC 3091704 , PMID 20937090909009011-555, PMC 3091704 , PMID 20937090009010-555, PMC 3091704, PMID 2093709009010-555, PMC 3091704 .
Stadtman, Thressa; McClung, LS (февраль 1957 г.). "Клоридий Саклландий, ноябрь. Спец" . J Бактериол . 73 (2): 218–219. doi : 10.1128/jb.73.2.218-219.1957 . PMC 289777 . PMID 13416172 .
Хао-Пин Чен; Shih-hsiung wu; и др. (2001), «Клонирование, секвенирование, гетерологичная экспрессия, очистка и характеристика аденозилкобаламин-зависимой аминомутазы D-аортинитин из Clostridium pletlandii», Journal of Biological Chemistry , 276 (48): 44744–50, DOI : 10.1074/jbc.m1083655200200 , PMID 11577113

Внешние ссылки

[LPSN-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Виды страниц : Acetoanaerobium Sticklandii на «LPSN - Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре» . Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур . Получено 2022-10-03 .

[2] Fonknechten, n; Chaussonnerie, S; и др. (2010). «Clostridium Sticklandii, специалист по деградации аминокислот: пересмотр его метаболизма через последовательность генома» . BMC Genomics . 11 : 555–567. doi : 10.1186/1471-2164-11-555 . PMC 3091704 . PMID 20937090 .

[3] "Скриппс" . Архивировано из оригинала 2012-07-23 . Получено 2012-04-03 .

[4] "Sgmjournals" .

[5] «Рубритрин» . Архивировано из оригинала 28 августа 1999 года.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]