Jump to content

ДжинВызов

В области геномики . GeneCalling на открытой платформе мРНК представляет собой метод транскрипционного профилирования [1] Протокол GeneCalling измеряет уровни кДНК , которые коррелируют с уровнями экспрессии генов конкретных транскриптов . С помощью этой технологии исследуются и сравниваются различия между экспрессией генов в здоровых тканях и тканях, чувствительных к заболеваниям или лекарствам. [2] Методика применена для исследования тканей человека. [3] и растительные ткани. [4]

Процесс вызова генов

В протоколе GeneCalling мРНК сначала выделяются из данного образца и обрабатываются на фрагменты для анализа. Обычно это включает синтез и разделение двухцепочечной кДНК из полиА РНК . Затем можно использовать отдельные наборы рестриктаз для расщепления наборов разделенных кДНК и полученных фрагментов, лигированных с мечеными адаптерами для амплификации с помощью ПЦР . Затем продукты ПЦР очищают и подвергают гель -электрофореза на установленной платформе с использованием стационарного лазерного возбуждения и многоцветной системы визуализации устройства с зарядовой связью . [5] Флуоресцентная метка на 5'-конце одного из праймеров для ПЦР позволяет визуализировать фрагменты ПЦР, а кДНК подвергают нескольким изолированным и идентичным рестрикционным расщеплениям для создания объединенного профиля на основе высоты пика и дисперсии. [6] Объединенные профили переваривания препаратов кДНК затем сравнивают для обнаружения дифференциально экспрессируемых фрагментов (например, между нормальной тканью и больной тканью или тканью, реагирующей на лекарственное средство); эти профили сравниваются с помощью различных баз данных, доступных в Интернете, таких как GeneScape. [7]

  1. ^ Кирст, Мэн (1 мая 2005 г.). «Идентификация и характеристика белков деградации, связанных с эндоплазматическим ретикулумом, на которые дифференциально влияет стресс эндоплазматического ретикулума» . Физиология растений . 138 (1): 218–231. дои : 10.1104/стр.105.060087 . ПМК   1104177 . ПМИД   15849299 .
  2. ^ Грин, Синтия Д.; Саймонс, Ян Фредрик; Тайлон, Брюс Э.; Левин, Дэвид А. (апрель 2001 г.). «Открытые системы: панорамный обзор экспрессии генов». Журнал иммунологических методов . 250 (1–2): 67–79. дои : 10.1016/S0022-1759(01)00306-4 . ПМИД   11251222 .
  3. ^ Анализ экспрессии генов с помощью профилирования транскриптов в сочетании с запросом к базе данных генов. Природная биотехнология 17 , 798-803: 1999.
  4. ^ Профиль экспрессии генов флавоноидного пути кукурузы, контролируемых эстрадиол-индуцируемыми факторами транскрипции CRC и P. The Plant Cell 12 , 65-79: 2000
  5. ^ Кляйн, С; из Фужероля, Арканзас; Блейки, П; Хан, Л; Пепе, А; Грин, компакт-диск; Котелянский, В; Джанкотти, ФГ (август 2002 г.). «Альфа-5-бета-1-интегрин активирует NF-каппа-B-зависимую программу экспрессии генов, важную для ангиогенеза и воспаления» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (16): 5912–2 doi : 10.1128/mcb.22.16.5912–5922.2002 . ПМК   133962 . ПМИД   12138201 .
  6. ^ Шимкец, РА; и др. (1999). «Анализ экспрессии генов с помощью профилирования транскриптов в сочетании с запросом к базе данных генов». Нат. Биотехнология . 17 (8): 798–803. дои : 10.1038/11743 . ПМИД   10429247 . S2CID   25463457 .
  7. ^ Гротеволд, Эрих (2003). Функциональная геномика растений . Springer Science & Business Media. п. 386. ИСБН  9781592594139 . Проверено 17 октября 2016 г.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: a6a0d6773495e9ffba3f7e8dc61e8bb9__1669237860
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/a6/b9/a6a0d6773495e9ffba3f7e8dc61e8bb9.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
GeneCalling - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)