Хрисохромулина вирус Эрины

Chrysochromulina ericina virus 01b
	Тонкие срезы клетки из гаптолины Эрикина, зараженная CEV-01B
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Varidnaviria
Королевство:	Bamfordvirae
Филум:	Нуклеоцитовирикота
Сорт:	Мегавирицеты
Заказ:	Имитервиралс
Семья:	Mimiviridae (?)
Вирус:	Chrysochromulina ericina virus 01b

Хрисохромулина вирус Эрины 01b , или просто вирус хрисохромулины Эрикина ( CEV ) - гигантский вирус в семействе Mimiviridae, инфицированных гаптолиной Эриной (ранее назначенный роду Chrysochromulina ^{[ 2 ]}), морской микроводоросли, член хаптофиты . CEV - это вирус дцДНК . ^{[ 1 ]}

История и таксономия

CEV был обнаружен в норвежских прибрежных водах в 1998 году. Затем он был изолирован и охарактеризован. ^{[ 1 ]} Затем считалось, что он принадлежит Phycodnaviridae вместе со всеми другими известными вирусами, заражающими водорослей. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]} Обнаружение мимивируса полифага Акантхамоэба помогло обнаружить, что существуют морские мимивирусы, которые могли бы заразить микроводоросли. ^{[ 4 ]} Позже в Персидском заливе в 2013 году была обнаружена штамм CEV в 2013 году ^{[ 5 ]} и филогенетический анализ некоторых специфических маркеров подтвердил его близость с мимивирусами . ^{[ 3 ]}^{[ 5 ]} В 2015 году CEV был полностью секвенирован, чтобы классифицировать его как Mimiviridae ^{[ 6 ]}

В последнее время была предложена группа Mimiviridae, заражающих микроводоросли, которая будет включать CEV вместе с вирусом вируса Phaeocystis globosa (PGV), заражающим гаптофикуа и aureococcus anophagefferens (AAV), заражающий страмзопий . ^{[ 7 ]}

Структура

CEV имеет диаметр 160 нм. Он имеет икосаэдрическую структуру и нет внешней мембраны. ^{[ 1 ]}

Геном

CEV Геном имеет 473 558 п.н., а низкое содержание GC - 25%. Предполагается, что он будет иметь 512 ORF . ^{[ 6 ]} CEV обладает большим количеством основных генов, таких как основной капсидный белок и ДНК -полимераза B вблизи соответствующих генов PGV. CEV может обладать способностью восстанавливать свою ДНК , как это предполагает присутствие последовательностей MUTS7 и нуклеазы ДНК типа ERCC4 (которые участвуют в репарации ДНК). Этот последний фермент обычно используется для восстановления повреждения ДНК, вызванного ультрафиолетовым светом, который согласуется с средой обитания Mimiviridae, заражающих фотосинтетический хозяин. ^{[ 7 ]} Он также имеет 305 уникальных генов, которые не нашли совпадения в общедоступных базах данных ^{[ 7 ]}

Вирусный цикл

Мало что известно о цикле CEV. Он повторяется в цитоплазме хозяина, а его литический цикл длится от 14 до 19 часов. ^{[ 1 ]} CEV обладает в своем геноме последовательности, кодирующей ДНК-полимеразу , и двух ДНК-зависимости РНК-полимеразы II. Он также имеет двенадцать тРНК , указывающей на важную машину, позволяющую относительно независимой репликации и образования вириона, которое является характерным для Mimiviridae. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Сандаа, Рут-Энн; Худл, Микал; Кастберг, Тонье; Thyrhaug, Runar; Братбак, Гуннар (ноябрь 2001 г.). «Выделение и характеристика двух вирусов с большим размером генома, заражающим хрисохромулину Эрину (Prymnesiophyceae) и Pyramimonas orientalis (prasinophyceae)» . Вирусология . 290 (2): 272–280. doi : 10.1006/viro.2001.1161 . PMID 11883191 .
^ Эдвардсен, согнутый; Eikrem, Wenche; Триндсен, Джан; Sáez, Alberto G.; Проверт, Ян; Медлин, Линда К. (август 2011 г.). (Гаптофхита) " Журнал Phyco 46 (3): 202–2 Bibcode : 20111ejphy . doi : 10.1080/ 09670262.2011.5
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Ларсен, JB; Ларсен, А.; Bratbak, G.; Sandaa, R.-A. (21 марта 2008 г.). «Филогенетический анализ членов семейства вирусов Phycodnaviridae с использованием амплифицированных фрагментов гена основного капсидного белка» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (10): 3048–3057. Bibcode : 2008apenm..74.3048L . doi : 10.1128/aem.02548-07 . PMC 2394928 . PMID 18359826 .
^ Монье, Адам; Larsen, Jens B.; Санда, Рут-Энн; Братбак, Гуннар; Клавери, Жан-Мишель; Профессионал, Хироюки (2008). «Отношения морской мимивива, вероятно, - это вирусы алесологической алге» вирусы » Virology Journal 5 (1): 12. doi : 10.1186/1743-422x- 5-1 2245910PMC 18215256PMID
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Уилсон, Уильям Х.; Гилг, Илана С.; Дуарте, Эми; Огата, Хироюки (октябрь 2014 г.). «Развитие гена репарации несоответствия ДНК, MUT, в качестве диагностического маркера для обнаружения и филогенетического анализа мегавирусов водорослей» . Вирусология . 466–467: 123–128. doi : 10.1016/j.virol.2014.07.001 . PMID 25063474 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Галлот-Лавалле, Люси; Pagarete, António; Legendre, Matthewu; Сантини, Себастьен; Санда, Рут-Энн; Гиммельбауэр, Хайнц; эксперты, Хироюки; Братбак, Гуннар; Клавери, Жан-Мишель (3 декабря 2015 г.). «474-килобаза PAIR Complete Genome Sequence CEV-01B, вирус, заражающий гаптолину (хрисохрулину) Эрину (Pynesusae) » генома Объявления 3 (6). Doi : 10.1128/ genomea.01413-1 PMC 4669402 26634761PMID
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Галлот-Лавалле, Люси; Блан, Гийом; Клавери, Жан-Мишель; Макфадден, Грант (15 июля 2017 г.). «Сравнительная геномика вируса хрисохромулины Эрикины и других микроводолетов, инфицирующих большие вирусы ДНК, подчеркивают их сложные эволюционные отношения с известным семейством Mimiviridae» . Журнал вирусологии . 91 (14). doi : 10.1128/jvi.00230-17 . PMC 5487555 . PMID 28446675 .

[ref2-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Сандаа, Рут-Энн; Худл, Микал; Кастберг, Тонье; Thyrhaug, Runar; Братбак, Гуннар (ноябрь 2001 г.). «Выделение и характеристика двух вирусов с большим размером генома, заражающим хрисохромулину Эрину (Prymnesiophyceae) и Pyramimonas orientalis (prasinophyceae)» . Вирусология . 290 (2): 272–280. doi : 10.1006/viro.2001.1161 . PMID 11883191 .

[ref1-2] Эдвардсен, согнутый; Eikrem, Wenche; Триндсен, Джан; Sáez, Alberto G.; Проверт, Ян; Медлин, Линда К. (август 2011 г.). (Гаптофхита) " Журнал Phyco 46 (3): 202–2 Bibcode : 20111ejphy . doi : 10.1080/ 09670262.2011.5

[ref3-3] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Ларсен, JB; Ларсен, А.; Bratbak, G.; Sandaa, R.-A. (21 марта 2008 г.). «Филогенетический анализ членов семейства вирусов Phycodnaviridae с использованием амплифицированных фрагментов гена основного капсидного белка» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (10): 3048–3057. Bibcode : 2008apenm..74.3048L . doi : 10.1128/aem.02548-07 . PMC 2394928 . PMID 18359826 .

[ref4-4] Монье, Адам; Larsen, Jens B.; Санда, Рут-Энн; Братбак, Гуннар; Клавери, Жан-Мишель; Профессионал, Хироюки (2008). «Отношения морской мимивива, вероятно, - это вирусы алесологической алге» вирусы » Virology Journal 5 (1): 12. doi : 10.1186/1743-422x- 5-1 2245910PMC 18215256PMID

[ref5-5] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Уилсон, Уильям Х.; Гилг, Илана С.; Дуарте, Эми; Огата, Хироюки (октябрь 2014 г.). «Развитие гена репарации несоответствия ДНК, MUT, в качестве диагностического маркера для обнаружения и филогенетического анализа мегавирусов водорослей» . Вирусология . 466–467: 123–128. doi : 10.1016/j.virol.2014.07.001 . PMID 25063474 .

[ref6-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Галлот-Лавалле, Люси; Pagarete, António; Legendre, Matthewu; Сантини, Себастьен; Санда, Рут-Энн; Гиммельбауэр, Хайнц; эксперты, Хироюки; Братбак, Гуннар; Клавери, Жан-Мишель (3 декабря 2015 г.). «474-килобаза PAIR Complete Genome Sequence CEV-01B, вирус, заражающий гаптолину (хрисохрулину) Эрину (Pynesusae) » генома Объявления 3 (6). Doi : 10.1128/ genomea.01413-1 PMC 4669402 26634761PMID

[ref7-7] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Галлот-Лавалле, Люси; Блан, Гийом; Клавери, Жан-Мишель; Макфадден, Грант (15 июля 2017 г.). «Сравнительная геномика вируса хрисохромулины Эрикины и других микроводолетов, инфицирующих большие вирусы ДНК, подчеркивают их сложные эволюционные отношения с известным семейством Mimiviridae» . Журнал вирусологии . 91 (14). doi : 10.1128/jvi.00230-17 . PMC 5487555 . PMID 28446675 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]