OpenPHACTS

Открыть ФАКТЫ
Формирование	2011
Тип	Государственно-частное партнерство
Цель	Семантическая совместимость для открытия лекарств посредством открытых инноваций
Членство	27 членских организаций
Ключевые люди	Энтони Джон Уильямс ; Кэрол Гобл ; Баренд Монс ; Герхард Эккер ;
Веб-сайт	www .openphacts .org ; github .с /openphacts ;

Open PHACTS (Open Pharmacological Concept Triple Store ) — это европейская инициатива государственно-частного партнерства между научными кругами, издателями, предприятиями, фармацевтическими компаниями и другими организациями, работающая над обеспечением лучшего, более дешевого и быстрого поиска лекарств . ^[1]^[2]^[3]^[4] Он был профинансирован Инициативой по инновационным лекарственным средствам . ^[5] выбран в рамках трех проектов по «разработке методов для общих стандартов и обмена данными для более эффективной разработки лекарств и лечения пациентов в будущем». ^[6]^[7]

Партнерство

Всего было задействовано 27 партнеров, в том числе:

Академия: Маастрихтский университет , Университет Сантьяго-де-Компостела , Венский университет , Манчестерский университет , Боннский университет , Швейцарский институт биоинформатики , Европейский институт биоинформатики , свободный университет Амстердамский , Датский технический университет , Гамбургский университет
Фармацевтические компании: Pfizer , Merck KGaA , Eli Lilly and Company , Novartis , GlaxoSmithKline , AstraZeneca.
Другие компании: ChemSpider , Biovia , Eagle Genomics, Entagen.
Издатели: Королевское химическое общество , Thomson Reuters.

Открытие лекарств

Открытое фармакологическое пространство, созданное консорциумом, предназначенное для поддержки открытых инноваций и собственных закрытых исследований по открытию лекарств. ^[8] путем устранения узких мест в разработке лекарств . ^[9]^[10] Ресурсы проекта находятся в публичном доступе на GitHub . ^[11]

Чтобы уменьшить препятствия на пути открытия лекарств в промышленности, научных кругах и малом бизнесе, консорциум Open PHACTS создал платформу Open PHACTS Discovery Platform. Эта платформа была в свободном доступе, объединяя фармакологические данные из различных информационных ресурсов и предоставляя инструменты и услуги для анализа этих интегрированных данных для поддержки фармакологических исследований.

Ссылки

^ Уильямс, Эй Джей ; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Уиллигхаген, Эль; Эвело, Коннектикут; Бломберг, Н.; Экер, Г .; Гобл, К. ; Монс, Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. дои : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . ПМИД 22683805 .
^ Экер, Г.Ф.; Уильямс-Джонс, Б. (2012). «Открытые инновации в открытии лекарств» . Молекулярная информатика . 31 (8): 519–520. дои : 10.1002/минф.201280004 . ПМИД 27477598 .
^ Грей, Аласдер Дж.Г.; Грот, Пол; Луазу, Антонис; Аскьер, Суне; Бреннинкмейер, Кристиан; Бургер, Кес; Чичестер, Кристина; Эвело, Крис Т.; Гобл, Кэрол ; Харланд, Ли; Петтифер, Стив ; Томпсон, Марк; Ваагмеестер, Андра; Уильямс, Энтони Джон (2014). «Применение подходов связанных данных к фармакологии: архитектурные решения и реализация». Семантическая сеть . 5 (2): 101–113. arXiv : 1005.2643 . дои : 10.3233/SW-2012-0088 .
^ Сиккарезе, П; Сойланд-Рейес, С; Белхаджаме, К; Грей, Эй Джей; Гобл, К; Кларк, Т (2013). «Онтология PAV: происхождение, авторство и версия» . Журнал биомедицинской семантики . 4 (1): 37. arXiv : 1304.7224 . дои : 10.1186/2041-1480-4-37 . ПМК 4177195 . ПМИД 24267948 .
^ «Открытые PHACTS в IMI - Инициатива в области инновационных лекарственных средств» .
^ Уотсон, Р. (2011). «Европа выделяет 172 миллиона евро на исследования инновационных лекарств». БМЖ . 342 : d1577. дои : 10.1136/bmj.d1577 . ПМИД 21393337 . S2CID 40608990 .
^ Гобл, К. ; Грей, AJG; Харланд, Л.; Карапетян К.; Лоизу, А.; Михайлов И.; Ранка, Ю.Н.; Сенгер, С.; Ткаченко В.; Уильямс, Эй Джей ; Уиллигхаген, Эль (2013). «Включение коммерческих и частных данных в открытую связанную платформу данных для открытия лекарств». Инженерия передовых информационных систем . Конспекты лекций по информатике. Том. 8219. стр. 65–80. дои : 10.1007/978-3-642-41338-4_5 . ISBN 978-3-642-41337-7 .
^ Мюллер, С.; Вайгельт, Дж. (2010). «Государственно-частное партнерство открытого доступа для открытия лекарств - новые подходы». IDrugs: Журнал по исследованию лекарственных средств . 13 (3): 175–180. ПМИД 20191434 .
^ Далглиш, Р.; Молеро, Э.; Кидд, Р.; Янсен, М.; Прошлое, Д.; Робл, А.; Монс, Б.; Диас, К.; Монс, А.; Брукс, Эй Джей (2012). «Устранение узких мест в обмене данными в науках о жизни» . Человеческая мутация . 33 (10): 1494–1496. дои : 10.1002/humu.22123 . ПМИД 22623360 .
^ Монс, Б .; Ван Хааген, Х.; Чичестер, К.; Хоэн, ПБ 'Т.; Ден Даннен, Джей Ти; Ван Оммен, Г.; Ван Маллиген, Э.; Сингх, Б.; Хофт, Р.; Роуз, М.; Хаммонд, Дж.; Кизель, Б.; Джардин, Б.; Вельтероп, Дж. ; Грот, П.; Шультес, Э. (2011). «Ценность данных» . Природная генетика . 43 (4): 281–283. дои : 10.1038/ng0411-281 . ПМИД 21445068 .
^ «Откройте PHACTS на GitHub» . Гитхаб . Проверено 10 июля 2012 г.

[1] Уильямс, Эй Джей ; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Уиллигхаген, Эль; Эвело, Коннектикут; Бломберг, Н.; Экер, Г .; Гобл, К. ; Монс, Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. дои : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . ПМИД 22683805 .

[2] Экер, Г.Ф.; Уильямс-Джонс, Б. (2012). «Открытые инновации в открытии лекарств» . Молекулярная информатика . 31 (8): 519–520. дои : 10.1002/минф.201280004 . ПМИД 27477598 .

[3] Грей, Аласдер Дж.Г.; Грот, Пол; Луазу, Антонис; Аскьер, Суне; Бреннинкмейер, Кристиан; Бургер, Кес; Чичестер, Кристина; Эвело, Крис Т.; Гобл, Кэрол ; Харланд, Ли; Петтифер, Стив ; Томпсон, Марк; Ваагмеестер, Андра; Уильямс, Энтони Джон (2014). «Применение подходов связанных данных к фармакологии: архитектурные решения и реализация». Семантическая сеть . 5 (2): 101–113. arXiv : 1005.2643 . дои : 10.3233/SW-2012-0088 .

[4] Сиккарезе, П; Сойланд-Рейес, С; Белхаджаме, К; Грей, Эй Джей; Гобл, К; Кларк, Т (2013). «Онтология PAV: происхождение, авторство и версия» . Журнал биомедицинской семантики . 4 (1): 37. arXiv : 1304.7224 . дои : 10.1186/2041-1480-4-37 . ПМК 4177195 . ПМИД 24267948 .

[5] «Открытые PHACTS в IMI - Инициатива в области инновационных лекарственных средств» .

[6] Уотсон, Р. (2011). «Европа выделяет 172 миллиона евро на исследования инновационных лекарств». БМЖ . 342 : d1577. дои : 10.1136/bmj.d1577 . ПМИД 21393337 . S2CID 40608990 .

[7] Гобл, К. ; Грей, AJG; Харланд, Л.; Карапетян К.; Лоизу, А.; Михайлов И.; Ранка, Ю.Н.; Сенгер, С.; Ткаченко В.; Уильямс, Эй Джей ; Уиллигхаген, Эль (2013). «Включение коммерческих и частных данных в открытую связанную платформу данных для открытия лекарств». Инженерия передовых информационных систем . Конспекты лекций по информатике. Том. 8219. стр. 65–80. дои : 10.1007/978-3-642-41338-4_5 . ISBN 978-3-642-41337-7 .

[8] Мюллер, С.; Вайгельт, Дж. (2010). «Государственно-частное партнерство открытого доступа для открытия лекарств - новые подходы». IDrugs: Журнал по исследованию лекарственных средств . 13 (3): 175–180. ПМИД 20191434 .

[9] Далглиш, Р.; Молеро, Э.; Кидд, Р.; Янсен, М.; Прошлое, Д.; Робл, А.; Монс, Б.; Диас, К.; Монс, А.; Брукс, Эй Джей (2012). «Устранение узких мест в обмене данными в науках о жизни» . Человеческая мутация . 33 (10): 1494–1496. дои : 10.1002/humu.22123 . ПМИД 22623360 .

[10] Монс, Б .; Ван Хааген, Х.; Чичестер, К.; Хоэн, ПБ 'Т.; Ден Даннен, Джей Ти; Ван Оммен, Г.; Ван Маллиген, Э.; Сингх, Б.; Хофт, Р.; Роуз, М.; Хаммонд, Дж.; Кизель, Б.; Джардин, Б.; Вельтероп, Дж. ; Грот, П.; Шультес, Э. (2011). «Ценность данных» . Природная генетика . 43 (4): 281–283. дои : 10.1038/ng0411-281 . ПМИД 21445068 .

[11] «Откройте PHACTS на GitHub» . Гитхаб . Проверено 10 июля 2012 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]