Энтони Джон Уильямс
Энтони Уильямс | |
---|---|
![]() | |
Рожденный | Энтони Джон Уильямс |
Национальность | Британский |
Альма-матер |
|
Известный | |
Награды | Премия Джима Грея в области электронной науки (2012) |
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | |
Диссертация | ЯМР высокого давления и релаксационные исследования систем алкильных цепей (1988) |
Докторантура | Дункан Дж. Гиллис [ нужна ссылка ] |
Веб-сайт | www |
Энтони Джон Уильямс — британский химик и эксперт в области спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) и хемоинформатики в Агентстве по охране окружающей среды США . [2] [3] Он является основателем веб-сайта ChemSpider , который был приобретен Королевским химическим обществом в мае 2009 года. Он научный блоггер. [4] и автор. [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Энтони Уильямс родился в Сент-Асафе , Уэльс , в июне 1964 года в семье Эрнеста Эдварда Уильямса, владельца строительной подрядной фирмы, и Эйрлис Элизабет Уильямс. У него есть старшая сестра Рэй. Он вырос в маленькой деревне недалеко от Кервиса .
Уильямс посещал начальную школу в Холивелле и Наннерхе до 1975 года. С одиннадцати лет он посещал школу Алун , где получил оценки A-level по математике , географии и химии .
Уильямс получил степень бакалавра наук по химии в Ливерпульском университете в 1985 году, написав студенческую диссертацию на тему «Спектроскопические исследования систем, связанных с витамином Е », где он применил как электронный парамагнитный резонанс (ЭПР), так и спектроскопию ядерного магнитного резонанса (ЯМР) для изучение молекул, сходных по строению с витамином Е.
Уильямс получил докторскую степень. Получил степень доктора химии, финансируемую Royal Dutch Shell , в Ройял Холлоуэй, Лондонский университет, в 1988 году и написал диссертацию под названием «ЯМР высокого давления и исследования релаксации систем алкильных цепей». [12] За эту работу он получил медаль Борна Лондонского университета и разработал объединяющую теорию моделирования данных релаксации ЯМР для изучения молекулярных движений алкильных цепей. [13] Он также использовал химический сдвиг ЯМР кобальта-59 для гексацианида кобальта (III) как датчик температуры и давления. [14] Во время работы над докторской диссертацией он заинтересовался персональными компьютерами и написал программы для обработки данных ЯМР-релаксации.
Уильямс продолжил свою работу в области спектроскопии в Национальном исследовательском совете (Канада), используя ЭПР-спектроскопию для проведения монокристаллических исследований металлоорганических соединений.
Карьера
[ редактировать ]В 1991 году Уильямс присоединился к Оттавскому университету в качестве менеджера центра ЯМР. Он продолжил свои личные интересы в области многоядерного ЯМР, проводя эксперименты 2D-ЯМР по изучению обмена селена в смешанно-галогенных системах. [15] Он также провел ЯМР-исследования кремния-29 и теллура-125 .
В 1992 году Уильямс уехал из Канады в Рочестер, штат Нью-Йорк, чтобы работать в компании Eastman Kodak в качестве руководителя технологии ЯМР. В Kodak он использовал свой предыдущий опыт изучения систем, связанных с алкильными цепями, для изучения мицелл . [16] Он участвовал в раннем внедрении жидкостной хроматографии (ЯМР) в компании и в разработке лаборатории открытого доступа , позволяющей химикам использовать роботизированные аналитические приборы для генерации данных. В компании Kodak он входил в группу из трех человек, которая разработала веб- систему управления лабораторной информацией (LIMS) под названием WIMS. [17] Интернет-система управления информацией, и это была первая в мире веб-система LIMS для управления химическими структурами и спектральными данными. В компании Kodak он получил два патента. [18] [19]
В 1997 году он начал работать в канадской молодой компании Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) в качестве старшего менеджера по продукции. Он отвечал за управление всей спектроскопией , структурными чертежами и номенклатурой ИЮПАК . [20] [21] продукты. В этой роли программное обеспечение для управления аналитическими данными было расширено и теперь включает поддержку масс-спектрометрии , инфракрасной спектроскопии , УФ-Вид-спектроскопии , хроматографии и других форм аналитических наук. Его научные интересы в то время включали разработку алгоритмов предсказания ЯМР ( [22] и [23] ) и, в частности, разработка программных подходов к компьютерному объяснению структур , так называемых CASE-систем. [24] [25] [26] [27] [28] [29] Инструменты CASE использовались для пересмотра структуры, в результате чего было продемонстрировано, что алгоритмы превосходят человеческую интерпретацию спектральных данных. [30] Работая в ACD/Labs, Уильямс участвовал в ряде новинок в отрасли. [ нужна ссылка ] включая
- создание химического словаря на Palm Computer и Pocket PC, [31]
- работа с Гэри Э. Мартином и другими коллегами над разработкой новых методов обработки ЯМР с использованием ковариационных подходов, [32] [33] [34] [35]
- внедрение подходов на основе нечеткой логики к компьютерному объяснению структур и 4) подходов к автоматизированной проверке структур. [36]
Работая в компании, он инициировал хобби-проект по объединению химических баз данных в Интернете. Этот проект назывался ChemSpider . Официально о ChemSpider было объявлено на встрече ACS в Чикаго в марте 2007 года с базой данных, содержащей более 10 миллионов соединений, полученных от PubChem .В 2007 году, когда он покинул ACD/Labs, он был главным научным сотрудником. Он стал независимым консультантом, работающим с рядом компаний-разработчиков программного обеспечения в области хеминформатики, таких как SimBioSys , а также с исследовательскими организациями для поддержки их усилий в области хеминформатики. Параллельно он продолжал развивать платформу ChemSpider с небольшой группой единомышленников, заинтересованных в разработке веб-систем для обслуживания химиков. [37] [38] Сайт представляет собой краудсорсинговое сообщество по химии, где химики размещают свои коллекции структур, спектральные данные и молекулярные свойства. Уильямс сосредоточен на просвещении сообщества по вопросам качества данных, связанных с химическими базами данных в Интернете. [39] [40]
В мае 2009 года Королевское химическое общество объявило о приобретении ChemSpider. [41] Уильямс присоединился к RSC в качестве вице-президента по стратегическому развитию ChemSpider.
В мае 2015 года он присоединился к Агентству по охране окружающей среды США для работы над разработкой веб-сайтов, обеспечивающих публичный доступ к данным EPA. [42] и инструменты для масс-спектрометрии . [43]
Уильямс внес свой вклад в мир «Мобильной химии». [44] внося свой вклад в разработку ChemMobi, приложения для iPhone для доступа к миллионам химических соединений и связанных с ними данных.
Уильямс является сторонником Open Notebook Science и судьей Open Notebook Science Challenge . Он работал с Жан-Клодом Брэдли над созданием веб-игры для обучения интерпретации спектральных данных с использованием краудсорсинговых данных спектроскопии, размещенных на ChemSpider . [45]
Пропаганда открытой науки
[ редактировать ]Уильямс представил журнал открытого доступа ChemSpider Journal of Chemistry, а команда разработчиков предоставила новую технологию онлайн-разметки (ChemMANTIS – Интегрированная система преобразования разметки и номенклатуры), позволяющую осуществлять краудсорсинговую разметку терминов, связанных с химией, связанных, где это возможно, с базой данных ChemSpider. . Уильямс является судьей конкурса Open Notebook Science Challenge . Он пропагандирует использование открытых данных , особенно спектральных данных, публикуется в журналах открытого доступа и является сторонником Open Notebook Science . [46] Уильямс является сторонником публикации в Интернете доклинических данных фармацевтической промышленности. [47] [48] [49] Уильямс тесно сотрудничал с Шоном Экинсом , выступая за предоставление обществу предконкурентных фармацевтических данных. Он также участвовал в анализе и обзоре открытых фармацевтических данных, предоставленных сообществу. [50] [51] [52]
Уильямс, который сам долгое время сотрудничает с Википедией, неоднократно подвергал сомнению требования к известности самой Википедии, сравнивая порнозвезд и ученых. [53] [54]
Награды и почести
[ редактировать ]Уильямс стал лауреатом премии Джима Грея в области электронной науки в 2012 году. [55] и награда «Выдающийся спикер года» Американского химического общества Северной Каролины в 2016 году. [56]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Уильямс, Эй Джей ; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Уиллигхаген, Эль; Эвело, Коннектикут; Бломберг, Н.; Экер, Г .; Гобл, К. ; Монс, Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. дои : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . ПМИД 22683805 .
- ^ Публикации Энтони Джона Уильямса, проиндексированные Google Scholar.
- ^ Персонал. «2014-БИТ-Брошюра» (PDF) . 2014 Всемирная выставка био-ИТ . Кембриджский институт медицинских технологий. стр. 3 (столбец 2) . Проверено 15 июня 2016 г.
Энтони Уильямс, доктор философии, вице-президент по стратегическому развитию; Руководитель отдела хеминформатики Королевского химического общества (RSC)
- ^ Веб-сайт ChemConnector
- ^ Практическая интерпретация спектров ЯМР P-31 и компьютерная проверка структуры, Луи Куин и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-9735913-0-9
- ^ Совместные вычислительные технологии для биомедицинских исследований , Шон Экинс, Мэгги Хапси и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-470-63803-3
- ^ Энтони Джона Уильямса Публикации из Europe PubMed Central
- ^ Энтони Уильямс на LinkedIn.com
- ^ Профиль Уильямса в Мендели
- ↑ Блог Энтони Уильямса ChemConnector. Архивировано 28 января 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ Публикации Энтони Джона Уильямса, индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Уильямс, Энтони Джон (1988). ЯМР высокого давления и релаксационные исследования алкилцепных систем (кандидатская диссертация). Университет Ливерпуля. (требуется подписка)
- ^ Братт, Пи Джей; Гиллис, генеральный директор; Сатклифф, Левый Хэмилтон; Уильямс, Эй Джей (1990). «ЯМР-релаксационные исследования внутренних движений: сравнение мицелл и родственных систем». Журнал физической химии . 94 (7): 2727. doi : 10.1021/j100370a001 .
- ^ Гиллис, генеральный директор; Сатклифф, Левый Хэмилтон; Уильямс, Эй Джей (2002). «Исследование ЯМР-спектроскопии кобальта-59 водного раствора K3\Co(CN)6] при переменной температуре и высоком давлении». Магнитный резонанс в химии . 40 : 57–64. дои : 10.1002/mrc.955 . S2CID 98518973 .
- ^ Милн, Дж.; Уильямс, Эй Джей (1992). «Обменные процессы в диселене и дигалогенидах селена и серы, Se2X2 и SeSX2 (X = Br, Cl). Исследование селена-77 2D-EXSY». Неорганическая химия . 31 (22): 4534. doi : 10.1021/ic00048a018 .
- ^ Анталек, Б.; Уильямс, Эй Джей; Гарсия, Э.; Текстер, Дж. (1994). «ЯМР-анализ переходов межфазной структуры, сопровождающих пороговый переход электрона в обратных микроэмульсиях». Ленгмюр . 10 (12): 4459. doi : 10.1021/la00024a014 .
- ^ Браун, Д.; Уильямс, А.; Маклафлин, Д. (1997). «Интернет-система управления информацией». TrAC Тенденции в аналитической химии . 16 (7): 370. doi : 10.1016/S0165-9936(97)00046-0 .
- ^ Фотоэмульсия с улучшенной светосилой. Патент США 6 040 129.
- ^ Способ производства дигидропиримидинов, патент США 5 576 432.
- ^ Уильямс, А.; Ерин, А. (1999). «Необходимость систематического наименования программных средств для обмена химической информацией» . Молекулы . 4 (9): 255. дои : 10.3390/40900255 .
- ^ Уильямс, А.; Ерин, А. (2008). «Автоматическая идентификация и преобразование химических названий в информацию для поиска по структуре». Химическая информационная добыча . п. 21. дои : 10.1201/9781420076509.pt2 . ISBN 978-1-4200-7649-3 .
- ^ Уильямс, А. (2000). «Последние достижения в области программного обеспечения для прогнозирования ЯМР и автоматического определения структуры». Текущее мнение об открытии и разработке лекарств . 3 (3): 298–305. ПМИД 19649862 .
- ^ Блинов К.А.; Смурный, Ю.Д.; Эльяшберг, Мэн; Чуранова Т.С.; Кваша, М.; Стейнбек, К.; Лефевр, бакалавр; Уильямс, Эй Джей (2008). «Проверка эффективности прогнозирования ЯМР 13C на основе нейронных сетей с использованием общедоступного источника данных». Журнал химической информации и моделирования . 48 (3): 550–555. дои : 10.1021/ci700363r . ПМИД 18293952 .
- ^ Эльяшберг, Мэн; Блинов К.А.; Молодцов, С.Г.; Уильямс, Эй Джей; Мартин, GE (2007). «Генерация нечеткой структуры: новый эффективный инструмент для компьютерного объяснения структур (CASE)». Журнал химической информации и моделирования . 47 (3): 1053–1066. дои : 10.1021/ci600528g . ПМИД 17385849 .
- ^ Эльяшберг, Мэн; Уильямс, Эй Джей; Мартин, GE (2008). «Компьютерные инструменты проверки и объяснения структуры при объяснении структуры на основе ЯМР». Прогресс в спектроскопии ядерного магнитного резонанса . 53 (1–2): 1–104. дои : 10.1016/j.pnmrs.2007.04.003 .
- ^ Смурный, Ю.Д.; Эльяшберг, Мэн; Блинов К.А.; Лефевр, бакалавр; Мартин, GE; Уильямс, Эй Джей (2005). «Компьютерное определение относительной стереохимии и 3D-моделей сложных органических молекул по 2D-спектрам ЯМР». Тетраэдр . 61 (42): 9980. doi : 10.1016/j.tet.2005.08.022 .
- ^ Мартин, GE; Хадден, CE; Рассел, диджей; Калузный, Б.Д.; Гвидо, JE; Духольке, ВК; Стимсма, бакалавр искусств; Таманн, Ти Джей; Крауч, RC; Блинов, К.; Эльяшберг, М.; Мартиросян, ЕР; Молодцов, С.Г.; Уильямс, Эй Джей; Шифф, Польша (2002). «Идентификация продуктов разложения сложного алкалоида с использованием технологии ЯМР-криозонда и ACD / определителя структуры». Журнал гетероциклической химии . 39 (6): 1241. doi : 10.1002/jhet.5570390619 .
- ^ Блинов, К.; Эльяшберг, М.; Мартиросян, ЕР; Молодцов, С.Г.; Уильямс, Эй Джей; Тэки, АН; Шараф, ММХ; Шифф, Польша; Крауч, RC; Мартин, GE; Хадден, CE; Гвидо, JE; Миллс, Калифорния (2003). «Хиндолинокриптотакиеин: выяснение новой структуры индолохинолинового алкалоида с помощью компьютерного определения структуры и 2D-ЯМР» . Магнитный резонанс в химии . 41 (8): 577. doi : 10.1002/mrc.1227 .
- ^ Эльяшберг, Мэн; Блинов К.А.; Мартиросян, ЕР; Молодцов, С.Г.; Уильямс, Эй Джей; Мартин, GE (2003). «Автоматическое выяснение структуры - преимущества симбиотических отношений между спектроскопистом и экспертной системой». Журнал гетероциклической химии . 40 (6): 1017. doi : 10.1002/jhet.5570400610 .
- ^ Эльяшберг, М.; Уильямс, Эй Джей; Блинов, К. (2010). «Структурная проверка натуральных продуктов с помощью систем компьютерного определения структуры (CASE)» . Отчеты о натуральных продуктах . 27 (9): 1296–1328. дои : 10.1039/C002332a . ПМИД 20480119 . S2CID 37849167 .
- ^ «Химические базы данных на ладони и в кармане» . Архивировано из оригинала 18 декабря 2010 года . Проверено 17 февраля 2011 г.
- ^ Блинов К.А.; Ларин Н.И.; Кваша, депутат; Мозер, А.; Уильямс, Эй Джей; Мартин, GE (2005). «Анализ и устранение артефактов в спектрах непрямого ковариационного ЯМР посредством несимметричной обработки». Магнитный резонанс в химии . 43 (12): 999–1007. дои : 10.1002/mrc.1674 . ПМИД 16144032 . S2CID 26808858 .
- ^ Блинов К.А.; Уильямс, Эй Джей; Хилтон, Б.Д.; Ирландия, Пенсильвания; Мартин, GE (2007). «Использование несимметричных косвенных ковариационных методов ЯМР для получения эквивалента данных HSQC-NOESY». Магнитный резонанс в химии . 45 (7): 544–546. дои : 10.1002/mrc.1998 . ПМИД 17437315 . S2CID 46106410 .
- ^ Мартин, GE; Ирландия, Пенсильвания; Хилтон, Б.Д.; Блинов К.А.; Уильямс, Эй Джей (2007). «Использование несимметричной косвенной ковариационной обработки для определения сетей связи 15N-13C». Магнитный резонанс в химии . 45 (8): 624–627. дои : 10.1002/mrc.2029 . ПМИД 17563910 . S2CID 34281811 .
- ^ Мартин, GE; Хилтон, Б.Д.; Ирландия, Пенсильвания; Блинов К.А.; Уильямс, Эй Джей (2007). «Применение несимметричных косвенных ковариационных методов ЯМР для расчета корреляционных спектров 13C↔15N HSQC-IMPEACH и 13C↔15N HMBC-IMPEACH» . Магнитный резонанс в химии . 45 (10): 883–888. дои : 10.1002/mrc.2064 . ПМИД 17729230 . S2CID 41359162 .
- ^ Голотвин, С.С.; Водопьянов Е.; Пол, Р.; Лефевр, бакалавр; Уильямс, Эй Джей ; Рутковске, РД; Спитцер, Т.Д. (2007). «Автоматическая проверка структуры на основе комбинации спектров 1D1H ЯМР и 2D1H-13C HSQC спектров». Магнитный резонанс в химии . 45 (10): 803–813. дои : 10.1002/mrc.2034 . ПМИД 17694570 . S2CID 25476827 .
- ^ Пенс, HE; Уильямс, А. (2010). «ChemSpider: Интернет-ресурс по химической информации». Журнал химического образования . 87 (11): 1123. Бибкод : 2010ЖЧЭд..87.1123П . дои : 10.1021/ed100697w .
- ^ Публичные базы данных соединений - Как ChemSpider изменил правила, сделав молекулы в Интернете бесплатными, Энтони Дж. Уильямс в книге «Совместные вычислительные технологии для наук о жизни», под редакцией Шона Экинса, Мэгги А.З. Хапси и Энтони Дж. Уильямса, представлено для публикации Wiley.
- ^ Уильямс, А. (2008). «Перспектива общедоступных/открытых химических баз данных». Открытие наркотиков сегодня . 13 (11–12): 495–501. дои : 10.1016/j.drudis.2008.03.017 . ПМИД 18549975 .
- ^ Уильямс, Эй Джей; Экинс, С. (2011). «Предупреждение о качестве и призыв к улучшению хранения общедоступных баз данных по химии». Открытие наркотиков сегодня . 16 (17–18): 747–750. дои : 10.1016/j.drudis.2011.07.007 . ПМИД 21871970 .
- ^ «для выполнения своей стратегической цели по распространению знаний среди химического сообщества и развитию химических наук»
- ^ Личный профиль Агентства по охране окружающей среды
- ^ Макихран, AD; Собус, младший; Уильямс, Эй Джей (2017). «Идентификация известных неизвестных с использованием информационной панели CompTox Chemistry Dashboard Агентства по охране окружающей среды США». Аналитическая и биоаналитическая химия . 409 (7): 1729–1735. дои : 10.1007/s00216-016-0139-z . ПМИД 27987027 . S2CID 31754962 .
- ^ Эй Джей Уильямс, Мобильная химия - химия в ваших руках и на вашем лице, Мир химии, май 2010 г.
- ^ Брэдли, Джей Си; Ланкашир, Р.Дж.; Ланг, АСД; Уильямс, Эй Джей (2009). «Призрачная игра: использование открытых данных и краудсорсинга для образования» . Журнал хеминформатики . 1 (1): 9. дои : 10.1186/1758-2946-1-9 . ПМК 3225864 . ПМИД 20298527 .
- ^ Брэдли, Джей Си; Оуэнс, К.; Уильямс, А. (2008). «Химический краудсорсинг и наука с открытыми тетрадями» . Предшественники природы . дои : 10.1038/npre.2008.1505.1 .
- ^ Экинс, С.; Уильямс, Эй Джей (2010). «Доконкурентные доклинические данные ADME/Tox: разместите их бесплатно в Интернете, чтобы облегчить построение вычислительных моделей и помочь в разработке лекарств» . Лаборатория на чипе . 10 (1): 13–22. дои : 10.1039/b917760b . ПМИД 20024044 .
- ^ А. Дж. Уильямс, В. Ткаченко, К. Липински, А. Тропша и С. Экинс, Бесплатные онлайн-ресурсы, обеспечивающие краудсорсинг, Drug Discovery World Winter 2009/10, 33-39
- ^ Экинс, С.; Уильямс, Эй Джей (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатств или золото дураков?». Открытие наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. дои : 10.1016/j.drudis.2010.08.010 . ПМИД 20732447 .
- ^ Экинс, С.; Уильямс, Эй Джей (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатств или золото дураков?». Открытие наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. дои : 10.1016/j.drudis.2010.08.010 . ПМИД 20732447 .
- ^ Экинс, С.; Уильямс, Эй Джей (2010). «Метаанализ закономерностей молекулярных свойств и фильтрация общедоступных наборов данных об «хитов» противомалярийных препаратов и лекарств» . МедХимКомм . 1 (5): 325. дои : 10.1039/C0MD00129E .
- ^ Уильямс, Эй Джей ; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Уиллигхаген, Эль; Эвело, Коннектикут; Бломберг, Н.; Экер, Г .; Гобл, К. ; Монс, Б. (2012). «Открытые ФАКТЫ: семантическая совместимость для открытия лекарств» . Открытие наркотиков сегодня . 17 (21–22): 1188–1198. дои : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . ПМИД 22683805 .
- ^ «» Почему порнозвезды в Википедии более заметны, чем ученые? Блог ChemConnector» .
- ^ «Почему в Википедии порнозвезды более заметны, чем учёные? | Wikimedian in Residence» . Архивировано из оригинала 28 марта 2012 года . Проверено 8 декабря 2011 г.
- ^ Премия Джима Грея в области электронной науки, Энтони Уильямс
- ^ Премия «Выдающийся спикер года» NC ACS, Энтони Уильямс