Шон Экинс

Шон Экинс
Шон Экинс
	Шон Экинс в 2020 году
Рожденный	Клитхорпс , Англия
Национальность	Британский, Американский
Альма-матер	Университет Абердина ; Университет Ноттингем Трент
Известный	ADME/Tox Модели ; Фармакофоры ; Новые технологии для фармацевтических исследований и разработок
	Научная карьера
Поля	Фармакология ; Хеминформатика ; Научное сотрудничество ; Альтернативы испытаниям на животных
Учреждения	Сотрудничество в области химии ; Международное общество по изучению ксенобиотиков ;
Докторские консультанты	Габриэль М. Хоксворт и М. Дэнни Берк

Шон Экинс — британский фармаколог и эксперт в области ADME/Tox , компьютерной токсикологии и хеминформатики в Collaborations in Chemistry, подразделении компании корпоративных коммуникаций Collaborations in Communications. Он также является редактором четырех книг и серии книг John Wiley & Sons .

Биография

Шон Экинс — научный руководитель с более чем двадцатитрехлетним обширным опытом разработки лекарств. Он родился в Клитхорпсе , Англия, 2 марта 1970 года в семье Джона Экинса и Элси Мэй Экинс. Он вырос в Гримсби . Экинс учился в начальной и средней школе Эдвард-Стрит, а затем в школе Хэвлока. Затем Экинс получил степень магистра наук в области прикладной биологии в Ноттингемском Трентском университете (бывший Политехнический институт, 1988–1991), который окончил в 1991 году с сэндвич-годом (1989–1990) в фармацевтической компании Servier в Фулмере, Великобритания, где его интерес к открытию лекарств был учредил. Затем Экинс получил степень магистра клинической фармакологии (1991–1992) в Абердинском университете , защитив диссертацию на тему «Рассуждения об относительной роли цитохрома P450 и флавинсодержащей монооксигеназы в метаболизме S12363». ^{[ 1 ]} затем он получил докторскую степень в области клинической фармакологии в Абердинском университете в 1996 году при финансовой поддержке компании «Сервье» и написал диссертацию на тему «Поддержание и криоконсервация метаболизма ксенобиотиков в прецизионных срезах печени. Оценка альтернативы модели in vitro изолированным гепатоцитам». ". Во время работы над докторской диссертацией у него появился интерес к компьютерному прогнозированию взаимодействия лекарств в качестве альтернативы использованию моделей на животных.

С 1996 по 1998 год Экинс продолжал свои исследования в качестве постдока в лабораториях Eli Lilly and Company , характеризуя малоизвестный CYP2B6 , и применял вычислительные методы к этому ферменту. Он собрал данные Ki о взаимодействии лекарств для других P450 и создал фармакофоры. Он создал наборы тестов для проверки моделей, которые в конечном итоге были опубликованы. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он опубликовал плодотворные идеи о том, как такие модели можно использовать для составления профиля библиотек соединений для предсказания лекарственного взаимодействия. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

В конце 1998 года Экинс присоединился к Pfizer и продолжил свой интерес к прогнозированию лекарственного взаимодействия и свойств ADME. В 1999 году он переехал в Лилли, чтобы создать группу прогнозирования ADME/Tox. В период с 1999 по конец 2001 года он разработал фармакофоры и статистические модели для различных белков, включая P-гликопротеин , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} PXR ^{[ 13 ]} и ферменты. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

В декабре 2001 года он начал работать в молодой компании Concurrent Pharmaceuticals (ныне Vitae Pharmaceuticals ). ^{[ 16 ]} в качестве заместителя директора по компьютерному открытию лекарств. Он отвечал за разработку вычислительных моделей для ADME/Tox и интересующих целей. За это время у него появился интерес к полифармакологии белков ADME/Tox. В 2004 году он присоединился к компании GeneGo (теперь принадлежащей Thomson Reuters ) в качестве вице-президента по вычислительной биологии и разработал продукт MetaDrug (заявка на патент подана). ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}

В 2005 году он получил степень доктора наук. степень доктора наук в Абердинском университете, защитив диссертацию на тему «Вычислительные модели и модели in vitro для прогнозирования взаимодействия лекарств у людей».

С 2006 по 2016 год Экинс консультировал несколько компаний, в том числе Collaborative Drug Discovery .

В 2011 году Экинс стал соучредителем компании Phoenix Nest, работающей над лечением синдрома Санфилиппо.

В 2015 году Экинс основал Collaborations Pharmaceuticals, частную компанию, которая проводит исследования и разработки инновационных методов лечения множества редких и инфекционных заболеваний. Collaborations Pharmaceuticals сотрудничает с учеными и компаниями для выявления и перевода активов ранней доклинической стадии на клиническую стадию.

Экинс также проводил независимые и совместные исследования по таким темам, как фармакофоры для переносчиков лекарств, хемоинформатика для прогнозирования перекрестной реактивности иммуноанализа, модели для изучения коэволюции ядерных рецепторов и лигандов, вычислительные модели для агонистов и антагонистов PXR, а также анализ больших наборов данных. и данные краудсорсинга.

Сделать фармацевтические данные открытыми

В 2010 году Шон Экинс был соавтором основополагающих статей об обмене данными и повышении открытости фармацевтических данных:

1. О давно назревшей необходимости сделать доклинические данные ADME/Tox предконкурентными. ^{[ 21 ]}

2. как можно использовать краудсорсинг в фармацевтической отрасли ^{[ 22 ]}

вычислительными моделями фармакоэкономики 3. как научное сообщество может поделиться ^{[ 23 ]}

4. какие инструменты все еще необходимы в химинформатике и насколько важны будут методы обмена моделями ^{[ 24 ]}

5. Как фармацевтические компании могли бы использовать молекулярные дескрипторы и алгоритмы с открытым исходным кодом, которые облегчили бы обмен вычислительными моделями с академическим сообществом и сообществом забытых болезней. ^{[ 25 ]}

Эта работа важна, поскольку она была первой заметной пропагандой широкого спектра подходов к обеспечению доступности доклинических и постмаркетинговых данных и моделей, а также демонстрации осуществимости таких подходов. Экинс работал в консультативной группе ChemSpider и предоставил в базу данных массив наборов фармацевтических данных, чтобы сделать их доступными для сообщества.

Исследования туберкулеза и малярии

Работая в компании Collaborative Drug Discovery (финансируемой Фондом Билла и Мелинды Гейтс ), он анализировал данные, предоставленные в открытый доступ фармацевтической промышленностью. В частности, это были малярии данные скрининга от GlaxoSmithKline для более чем 13 000 соединений. В результате этой работы научному сообществу было дано важное предостережение относительно принятия таких данных за чистую монету. ^{[ 26 ]} Эти данные сравнивались с другими данными по малярии и туберкулезу. ^{[ 27 ]}

Кроме того, он предоставил анализ очень больших библиотек данных о туберкулезе, которые подчеркивают важные физико-химические свойства. ^{[ 28 ]}^{[ 29 ]}

Экинс подчеркнул пробелы в исследованиях туберкулеза, особенно в том, как можно интегрировать химинформатику и другие вычислительные инструменты для повышения эффективности. ^{[ 30 ]} и предоставил примеры того, как вычислительные методы могут использоваться для скрининга соединений, активных против туберкулеза. ^{[ 31 ]}

В феврале 2011 года Экинс начал участвовать в проекте MM4TB в рамках Collaborative Drug Discovery. ^{[ 32 ]} под руководством профессора Стюарта Коула. ^{[ 33 ]}

Научные мобильные приложения

Экинс совместно с Энтони Джоном Уильямсом разработал Wiki под названием Science Mobile Applications. ^{[ 34 ]} запущен 21 июня 2011 г. ^{[ 35 ]} Первоначально это возникло из-за желания отслеживать приложения по химии. ^{[ 36 ]} (для отправленной статьи), а затем «Приложения для науки в классе химии». ^{[ 37 ]}

Качество базы данных

Используя свои блоги, Экинс и Энтони Уильямс предупредили научное сообщество через несколько дней после выпуска браузера NCGC NPC. ^{[ 38 ]} что в структурах молекул были существенные ошибки. Эти наблюдения были позже опубликованы в редакционной статье в журнале Drug Discovery Today. ^{[ 39 ]}

Сотрудничество Фармацевтика

В 2015 году Шон основал Collaborations Pharmaceuticals, чтобы развивать сотрудничество и проекты, возникшие в результате применения подходов машинного обучения. Проекты охватывали такие забытые заболевания, как туберкулез , болезнь Шагаса , а также редкие заболевания, такие как болезнь Баттена , синдром Питта Хопкинса и другие. На сегодняшний день они получили 8 статусов орфанных лекарств от 5 редких или забытых заболеваний и широко опубликовали свои результаты в рецензируемых журналах. [SE1] На сегодняшний день компания получила финансирование на сумму более 7,6 млн долларов США в виде грантов NIH и DOD.

Исследования Эболы

С 2014 года Шон занимается открытием лекарства от Эболы , опубликовав 19 статей . Одним из них было первое использование модели машинного обучения для выявления соединений, активных против Эболы (здесь) . [SE2] В результате были идентифицированы три активных соединения ( тилорон , хинакрин и пиронаридин которые впоследствии были протестированы in vivo и оказались активными на мышах (Статьи 1 , 2 , 3 ). ) in vitro , активность против Эболы у морской свинки. Эти молекулы также показали активность против Марбурга и связывают гликопротеин Эболы .

Исследование болезни Шагаса

В 2015 году Шон разработал модель машинного обучения для прогнозирования активности молекул против T.Cruzi , паразита, вызывающего болезнь Шагаса . Пиронаридин был одной из нескольких молекул, обладающих активностью in vitro и in vivo.

Исследование SARS-CoV-2

В 2020 году три молекулы, обладающие активностью против Эболы, были протестированы против SARS-CoV-2 и представляли потенциальный интерес, поскольку было показано, что тилорон ингибирует MERS и, как хорошо известно, ингибирует другие вирусы .

Программные продукты

Компания Collaborations Pharmaceuticals Inc. разработала несколько программных продуктов, включая Assay Central®, MegaTox®, MegaTrans® и MegaPredict®, которые используют обработку данных и машинное обучение для создания моделей, важных для открытия лекарств и вычислительного ADME/Tox.

Редакции

Экинс редактировал или был соредактером 4 книг для Wiley, в том числе: «Компьютерные приложения в фармацевтических исследованиях и разработках» (2006 г.), «Вычислительная токсикология: оценка рисков для фармацевтических и экологических химикатов» (1007 г.), «Эффективность лекарств, безопасность и открытие биологических препаратов» (2009 г.) и Совместные вычислительные технологии для биомедицинских исследований (2011 г.) Все книги тесно связаны с вычислительными технологиями и их применением в фармацевтических исследованиях и разработках.

Его последняя изданная книга — «Вычислительная токсикология: оценка риска для химических веществ» , которая является продолжением более ранней книги «Вычислительная токсикология: оценка риска для фармацевтических и экологических химикатов».

Патенты

Экинс является изобретателем четырех выданных патентов США. ^{[ 40 ]} и ^{[ 41 ]}

Ссылки

^ Экинс, С.; и др. (1993). «Роль цитохрома P4503A в метаболизме производного a-аминофосфоната барвинка S12363 микросомами печени человека» . Бр Дж Клин Фармакол . 36 (2): 165П–166П. дои : 10.1111/j.1365-2125.1993.tb04214.x . ПМЦ 1364582 . ПМИД 8398587 .
^ Экинс, Дж. Х.; Брави, С.; Бинкли, Г.; Гиллеспи, С.; Ринг, Дж.С.; Викель, Б.Дж.; Райтон, Ю.А. (1999). «Трех- и четырехмерный количественный анализ взаимосвязи структуры и активности ингибиторов CYP3A4» . Дж. Фармакол. Эксп. Там . 290 : 429–438.
^ Экинс, С.; и др. (1999). «Трех- и четырехмерный анализ взаимосвязи структуры и активности (3D / 4D-QSAR) ингибиторов CYP2D6». Фармакогенетика . 9 (4): 477–489. ПМИД 10780267 .
^ Экинс, С.; и др. (1999). «Трехмерно-количественный анализ взаимосвязи структуры и активности субстратов CYP2B6». Фармэкспертиза . 288 (1): 21–29. ПМИД 9862748 .
^ Экинс, Г. Викель Дж. Х.; Брави, С.; Райтон, Ю.А. (1999). «Трёхмерный количественный анализ взаимосвязи структуры и активности (3D-QSAR) субстратов CYP3A4» . J Pharmacol Exp Ther . 291 : 424–433.
^ Экинс, С.; Райтон, Ю.А. (1999). «Роль CYP2B6 в метаболизме ксенобиотиков человека». Препарат Метаб Ред . 31 (3): 719–754. дои : 10.1081/dmr-100101942 . ПМИД 10461547 .
^ Экинс, С. и др. (2000)Прогнозирование лекарственного взаимодействия in silico с использованием фармакофоров: парадигма на следующее тысячелетие. В книге «Восприятие, разработка и использование фармакофоров при разработке лекарств» (Гюнер, О.Ф., ред.), стр. 269–299, IUL.
^ Экинс, С.; и др. (2000). «Прогресс в прогнозировании параметров ADME человека in silico». J Фармаколические токсиколовые методы . 44 (1): 251–272. дои : 10.1016/s1056-8719(00)00109-x . ПМИД 11274894 .
^ Экинс, С.; и др. (2002). «Применение трехмерных количественных соотношений структура-активность ингибиторов и субстратов P-гликопротеина». Мол Фармакол . 61 (5): 974–981. дои : 10.1124/моль.61.5.974 . ПМИД 11961114 . S2CID 7619918 .
^ Экинс, С.; и др. (2002). «Трехмерные количественные взаимоотношения структура-активность ингибиторов P-гликопротеина». Мол Фармакол . 61 (5): 964–973. дои : 10.1124/моль.61.5.964 . ПМИД 11961113 . S2CID 8018230 .
^ ХЭРГ
^ http://jpet.aspetjournals.org/content/301/2/427.full.pdf+html?sid=99bffa04-48cb-4cbf-bac6-d94e568b5b31 Экинс, С. Крамб, В. Дж. Саразан, Р. Д. Викель, Дж. Х. и Ригтон, С.А. (2002)Трехмерная количественная структура-активность для ингибирования калиевого канала hERG (человеческий ген, связанный с эфиром-а-гого). J Pharmacol Exp Ther 301, 427-434
^ Экинс, С.; Эриксон, Дж. А. (2002). «Фармакофор для лигандов прегнан-X-рецепторов человека». Препарат Метаб Диспос . 30 (1): 96–99. дои : 10.1124/dmd.30.1.96 . ПМИД 11744617 . S2CID 20521103 .
^ Экинс, С. и др. (2002)Фармакофорное понимание активных центров ферментов CYP3A. Приложение Фармаколог 44, 114.
^ Этелл, Британская Колумбия; и др. (2002). «Количественные соотношения структура-активность для глюкуронидирования простых фенолов с помощью экспрессируемых человеческих UGT1A6 и UGT1A9». Метаб. препарата. Диспос . 30 (6): 734–738. дои : 10.1124/dmd.30.6.734 . ПМИД 12019203 . S2CID 18689723 .
^ «Concurrent Pharmaceuticals меняет название на Vitae Pharmaceuticals и получает финансирование в размере 34 миллионов долларов» . biospace.com . 19 октября 2005 г. Проверено 23 мая 2014 г.
^ Экинс, С.; и др. (2005). «Вычислительный прогноз метаболизма лекарств у человека». Экспертное мнение о препарате Метаб Токсикол . 1 (2): 303–324. дои : 10.1517/17425255.1.2.303 . ПМИД 16922645 . S2CID 32612412 .
^ Экинс, С. и др. (2005)Системная биология: применение в открытии лекарств. В «Справочнике по открытию лекарств» (Гад, С., ред.), стр. 123–183, Wiley.
^ Экинс, С.; и др. (2005). «Новый метод визуализации сетей рецепторов ядерных гормонов, связанных с метаболизмом лекарств». Препарат Метаб Диспос . 33 (3): 474–481. дои : 10.1124/dmd.104.002717 . ПМИД 15608136 . S2CID 25141855 .
^ Экинс, С.; и др. (2005). «Методы: применение системной биологии к абсорбции, распределению, метаболизму, выделению и токсичности». Тенденции Pharmacol Sci . 26 (4): 202–209. дои : 10.1016/j.tips.2005.02.006 . ПМИД 15808345 .
^ Экинс, С; Уильямс, Эй Джей (2010). «Доконкурентные доклинические данные ADME/Tox: разместите их бесплатно в Интернете, чтобы облегчить построение вычислительных моделей для помощи в разработке лекарств» . Лаборатория на чипе . 10 (1): 13–22. дои : 10.1039/b917760b . ПМИД 20024044 .
^ Экинс С. и Уильямс А.Дж., Обращение к сотрудникам: краудсорсинг фармацевтических исследований, Pharm Res, 27: 393-395, 2010.
^ Арнольд Р.Дж.Г. и Экинс С., Время сотрудничества в области экономики здравоохранения среди модельного сообщества, PharmacoEconomics, 28(8):609-613, 2010 г.
^ Экинс С., Гупта Р., Гиффорд Э., Бунин Б.А., Уоллер К.Л., Химическое пространство: недостающие части в хеминформатике, Pharm Res, 27: 2035-2039, 2010
^ Гупта, Риши Р.; Гиффорд, EM; Листон, Т; Уоллер, CL; Хохман, М; Бунин, Б.А.; Экинс, С. (2010). «Использование вычислительных инструментов с открытым исходным кодом для прогнозирования метаболической стабильности человека и дополнительных свойств ADME/Tox». Препарат Метаб Диспос . 38 (11): 2083–2090. дои : 10.1124/dmd.110.034918 . ПМИД 20693417 . S2CID 8095030 .
^ Экинс, Шон; Джон Уильямс, Энтони (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатства или золото дураков?». Обнаружение наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. дои : 10.1016/j.drudis.2010.08.010 . ПМИД 20732447 .
^ Экинс С. и Уильямс AJ, 2010 Метаанализ закономерностей молекулярных свойств и фильтрация общедоступных наборов данных о противомалярийных «хитах» и лекарствах, MedChemComm 1: 325-330,
^ Экинс, С; Брэдфорд, Дж; Доул, К; Спектор, А; Грегори, К; Блондо, Д; Хохман, М; Бунин, Б.А. (2010). «Совместная база данных и вычислительные модели для открытия лекарств от туберкулеза». Мол БиоСист . 6 (5): 840–851. дои : 10.1039/b917766c . ПМИД 20567770 .
^ Экинс, С; Канеко, Т; Липински, Калифорния; Брэдфорд, Дж; Доул, К; Спектор, А; Грегори, К; Блондо, Д; Эрнст, С; Ян, Дж; Гончаров Н.; Хохман, М; Бунин, Б.А. (2010). «Анализ и фильтрация попаданий очень большой библиотеки соединений, проверенных на микобактерию туберкулеза». Мол Биосист . 6 (11): 2316–2324. дои : 10.1039/c0mb00104j . ПМИД 20835433 .
^ Экинс, С; Фрейндлих, Дж. С.; Цой, я; Саркер, М; Талкотт, К. (2011). «Вычислительные базы данных, пути и инструменты хеминформатики для открытия лекарств от туберкулеза» . Тенденции в микробиологии . 19 (2): 65–74. дои : 10.1016/j.tim.2010.10.005 . ПМК 3034835 . ПМИД 21129975 .
^ Ламичхане, Гьяну; Фрейндлих, Джоэл С.; Экинс, Шон; Викрамаратне, Уэйв; Нолан, Скотт Т.; Бишай, Уильям Р. (1 февраля 2011 г.). «Незаменимые метаболиты микобактерий туберкулеза и их мимики» . мБио 2 (1): e00301–00310. дои : 10.1128/mBio.00301-10 . ISSN 2150-7511 . ПМК 3031304 . ПМИД 21285434 .
^ «Проект ММ4ТБ» . Архивировано из оригинала 27 июля 2011 года . Проверено 3 марта 2011 г.
^ «UPCOL – Cole Lab – Кафедра микробного патогенеза» . Проверено 5 августа 2023 г.
^ Вики SciMobileApps
^ Анонс Wiki-сайта SciMobileApps
^ «Комментарий» . Проверено 5 августа 2023 г.
^ Уильямс, Энтони Дж. (2011). «Смартфоны — мощный инструмент на уроках химии» . Журнал химического образования . 88 (6): 683–686. Бибкод : 2011JChEd..88..683W . дои : 10.1021/ed200029p .
^ «Развитие штатива» .
^ Уильямс, Эй Джей; Экинс, С. (сентябрь 2011 г.). «Предупреждение о качестве и призыв к улучшению хранения общедоступных баз данных по химии». Препарат Дисков. Сегодня . 16 (17–18): 747–50. дои : 10.1016/j.drudis.2011.07.007 . ПМИД 21871970 .
^ Патент США № 6564152: Экинс С. и Смит Б.Дж., «Фармакофорные модели, методы скрининга и идентификация ингибирующей активности цитохрома P-450 антагонистов рецептора нейрокинина-1». [1]
^ Патент США № 6489094: Экинс С., Келли К.Г., Джонсон Д.Л., «Способ и устройство для подготовки проб для тестирования взаимодействия лекарств» [2] .

Внешние ссылки

[1] Экинс, С.; и др. (1993). «Роль цитохрома P4503A в метаболизме производного a-аминофосфоната барвинка S12363 микросомами печени человека» . Бр Дж Клин Фармакол . 36 (2): 165П–166П. дои : 10.1111/j.1365-2125.1993.tb04214.x . ПМЦ 1364582 . ПМИД 8398587 .

[2] Экинс, Дж. Х.; Брави, С.; Бинкли, Г.; Гиллеспи, С.; Ринг, Дж.С.; Викель, Б.Дж.; Райтон, Ю.А. (1999). «Трех- и четырехмерный количественный анализ взаимосвязи структуры и активности ингибиторов CYP3A4» . Дж. Фармакол. Эксп. Там . 290 : 429–438.

[3] Экинс, С.; и др. (1999). «Трех- и четырехмерный анализ взаимосвязи структуры и активности (3D / 4D-QSAR) ингибиторов CYP2D6». Фармакогенетика . 9 (4): 477–489. ПМИД 10780267 .

[4] Экинс, С.; и др. (1999). «Трехмерно-количественный анализ взаимосвязи структуры и активности субстратов CYP2B6». Фармэкспертиза . 288 (1): 21–29. ПМИД 9862748 .

[5] Экинс, Г. Викель Дж. Х.; Брави, С.; Райтон, Ю.А. (1999). «Трёхмерный количественный анализ взаимосвязи структуры и активности (3D-QSAR) субстратов CYP3A4» . J Pharmacol Exp Ther . 291 : 424–433.

[6] Экинс, С.; Райтон, Ю.А. (1999). «Роль CYP2B6 в метаболизме ксенобиотиков человека». Препарат Метаб Ред . 31 (3): 719–754. дои : 10.1081/dmr-100101942 . ПМИД 10461547 .

[7] Экинс, С. и др. (2000)Прогнозирование лекарственного взаимодействия in silico с использованием фармакофоров: парадигма на следующее тысячелетие. В книге «Восприятие, разработка и использование фармакофоров при разработке лекарств» (Гюнер, О.Ф., ред.), стр. 269–299, IUL.

[8] Экинс, С.; и др. (2000). «Прогресс в прогнозировании параметров ADME человека in silico». J Фармаколические токсиколовые методы . 44 (1): 251–272. дои : 10.1016/s1056-8719(00)00109-x . ПМИД 11274894 .

[9] Экинс, С.; и др. (2002). «Применение трехмерных количественных соотношений структура-активность ингибиторов и субстратов P-гликопротеина». Мол Фармакол . 61 (5): 974–981. дои : 10.1124/моль.61.5.974 . ПМИД 11961114 . S2CID 7619918 .

[10] Экинс, С.; и др. (2002). «Трехмерные количественные взаимоотношения структура-активность ингибиторов P-гликопротеина». Мол Фармакол . 61 (5): 964–973. дои : 10.1124/моль.61.5.964 . ПМИД 11961113 . S2CID 8018230 .

[11] ХЭРГ

[12] ttp://jpet.aspetjournals.org/content/301/2/427.full.pdf+html?sid=99bffa04-48cb-4cbf-bac6-d94e568b5b31 Экинс, С. Крамб, В. Дж. Саразан, Р. Д. Викель, Дж. Х. и Ригтон, С.А. (2002)Трехмерная количественная структура-активность для ингибирования калиевого канала hERG (человеческий ген, связанный с эфиром-а-гого). J Pharmacol Exp Ther 301, 427-434

[13] Экинс, С.; Эриксон, Дж. А. (2002). «Фармакофор для лигандов прегнан-X-рецепторов человека». Препарат Метаб Диспос . 30 (1): 96–99. дои : 10.1124/dmd.30.1.96 . ПМИД 11744617 . S2CID 20521103 .

[14] Экинс, С. и др. (2002)Фармакофорное понимание активных центров ферментов CYP3A. Приложение Фармаколог 44, 114.

[15] Этелл, Британская Колумбия; и др. (2002). «Количественные соотношения структура-активность для глюкуронидирования простых фенолов с помощью экспрессируемых человеческих UGT1A6 и UGT1A9». Метаб. препарата. Диспос . 30 (6): 734–738. дои : 10.1124/dmd.30.6.734 . ПМИД 12019203 . S2CID 18689723 .

[16] «Concurrent Pharmaceuticals меняет название на Vitae Pharmaceuticals и получает финансирование в размере 34 миллионов долларов» . biospace.com . 19 октября 2005 г. Проверено 23 мая 2014 г.

[17] Экинс, С.; и др. (2005). «Вычислительный прогноз метаболизма лекарств у человека». Экспертное мнение о препарате Метаб Токсикол . 1 (2): 303–324. дои : 10.1517/17425255.1.2.303 . ПМИД 16922645 . S2CID 32612412 .

[18] Экинс, С. и др. (2005)Системная биология: применение в открытии лекарств. В «Справочнике по открытию лекарств» (Гад, С., ред.), стр. 123–183, Wiley.

[19] Экинс, С.; и др. (2005). «Новый метод визуализации сетей рецепторов ядерных гормонов, связанных с метаболизмом лекарств». Препарат Метаб Диспос . 33 (3): 474–481. дои : 10.1124/dmd.104.002717 . ПМИД 15608136 . S2CID 25141855 .

[20] Экинс, С.; и др. (2005). «Методы: применение системной биологии к абсорбции, распределению, метаболизму, выделению и токсичности». Тенденции Pharmacol Sci . 26 (4): 202–209. дои : 10.1016/j.tips.2005.02.006 . ПМИД 15808345 .

[21] Экинс, С; Уильямс, Эй Джей (2010). «Доконкурентные доклинические данные ADME/Tox: разместите их бесплатно в Интернете, чтобы облегчить построение вычислительных моделей для помощи в разработке лекарств» . Лаборатория на чипе . 10 (1): 13–22. дои : 10.1039/b917760b . ПМИД 20024044 .

[22] Экинс С. и Уильямс А.Дж., Обращение к сотрудникам: краудсорсинг фармацевтических исследований, Pharm Res, 27: 393-395, 2010.

[23] Арнольд Р.Дж.Г. и Экинс С., Время сотрудничества в области экономики здравоохранения среди модельного сообщества, PharmacoEconomics, 28(8):609-613, 2010 г.

[24] Экинс С., Гупта Р., Гиффорд Э., Бунин Б.А., Уоллер К.Л., Химическое пространство: недостающие части в хеминформатике, Pharm Res, 27: 2035-2039, 2010

[25] Гупта, Риши Р.; Гиффорд, EM; Листон, Т; Уоллер, CL; Хохман, М; Бунин, Б.А.; Экинс, С. (2010). «Использование вычислительных инструментов с открытым исходным кодом для прогнозирования метаболической стабильности человека и дополнительных свойств ADME/Tox». Препарат Метаб Диспос . 38 (11): 2083–2090. дои : 10.1124/dmd.110.034918 . ПМИД 20693417 . S2CID 8095030 .

[26] Экинс, Шон; Джон Уильямс, Энтони (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатства или золото дураков?». Обнаружение наркотиков сегодня . 15 (19–20): 812–815. дои : 10.1016/j.drudis.2010.08.010 . ПМИД 20732447 .

[27] Экинс С. и Уильямс AJ, 2010 Метаанализ закономерностей молекулярных свойств и фильтрация общедоступных наборов данных о противомалярийных «хитах» и лекарствах, MedChemComm 1: 325-330,

[28] Экинс, С; Брэдфорд, Дж; Доул, К; Спектор, А; Грегори, К; Блондо, Д; Хохман, М; Бунин, Б.А. (2010). «Совместная база данных и вычислительные модели для открытия лекарств от туберкулеза». Мол БиоСист . 6 (5): 840–851. дои : 10.1039/b917766c . ПМИД 20567770 .

[29] Экинс, С; Канеко, Т; Липински, Калифорния; Брэдфорд, Дж; Доул, К; Спектор, А; Грегори, К; Блондо, Д; Эрнст, С; Ян, Дж; Гончаров Н.; Хохман, М; Бунин, Б.А. (2010). «Анализ и фильтрация попаданий очень большой библиотеки соединений, проверенных на микобактерию туберкулеза». Мол Биосист . 6 (11): 2316–2324. дои : 10.1039/c0mb00104j . ПМИД 20835433 .

[30] Экинс, С; Фрейндлих, Дж. С.; Цой, я; Саркер, М; Талкотт, К. (2011). «Вычислительные базы данных, пути и инструменты хеминформатики для открытия лекарств от туберкулеза» . Тенденции в микробиологии . 19 (2): 65–74. дои : 10.1016/j.tim.2010.10.005 . ПМК 3034835 . ПМИД 21129975 .

[31] Ламичхане, Гьяну; Фрейндлих, Джоэл С.; Экинс, Шон; Викрамаратне, Уэйв; Нолан, Скотт Т.; Бишай, Уильям Р. (1 февраля 2011 г.). «Незаменимые метаболиты микобактерий туберкулеза и их мимики» . мБио 2 (1): e00301–00310. дои : 10.1128/mBio.00301-10 . ISSN 2150-7511 . ПМК 3031304 . ПМИД 21285434 .

[32] «Проект ММ4ТБ» . Архивировано из оригинала 27 июля 2011 года . Проверено 3 марта 2011 г.

[33] «UPCOL – Cole Lab – Кафедра микробного патогенеза» . Проверено 5 августа 2023 г.

[34] Вики SciMobileApps

[35] Анонс Wiki-сайта SciMobileApps

[36] «Комментарий» . Проверено 5 августа 2023 г.

[37] Уильямс, Энтони Дж. (2011). «Смартфоны — мощный инструмент на уроках химии» . Журнал химического образования . 88 (6): 683–686. Бибкод : 2011JChEd..88..683W . дои : 10.1021/ed200029p .

[38] «Развитие штатива» .

[39] Уильямс, Эй Джей; Экинс, С. (сентябрь 2011 г.). «Предупреждение о качестве и призыв к улучшению хранения общедоступных баз данных по химии». Препарат Дисков. Сегодня . 16 (17–18): 747–50. дои : 10.1016/j.drudis.2011.07.007 . ПМИД 21871970 .

[40] Патент США № 6564152: Экинс С. и Смит Б.Дж., «Фармакофорные модели, методы скрининга и идентификация ингибирующей активности цитохрома P-450 антагонистов рецептора нейрокинина-1». [1]

[41] Патент США № 6489094: Экинс С., Келли К.Г., Джонсон Д.Л., «Способ и устройство для подготовки проб для тестирования взаимодействия лекарств» [2] .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ WorldCat
Национальный	Германия Израиль Соединенные Штаты Нидерланды
академики	Google Академика ОРЦИД Давайте опубликуем Идентификатор исследователя Скопус
Другой	ИдРеф