Таня Стадлер
Таня Стадлер | |
|---|---|
 Стадлер в 2023 году | |
| Рожденный | 1981 |
| Национальность | швейцарский , немецкий |
| Научная карьера | |
| Поля | Филогенетика |
| Учреждения | ETH Цюрих |
Таня Стадлер — математик и профессор вычислительной эволюции в Швейцарском федеральном технологическом институте ( ETH Zurich ). В настоящее время она является президентом Швейцарской научной консультативной группы по COVID-19 и заместителем председателя кафедры биосистемных наук и инженерии в ETH Zürich .
Карьера
[ редактировать ]Таня Стадлер изучала прикладную математику и статистику в Мюнхенском техническом университете , Кардиффском университете и Кентерберийском университете . [1] В 2008 году она продолжила обучение в Мюнхенском техническом университете, чтобы получить докторскую степень по теме «Эволюционирующие деревья – модели видообразования и вымирания в филогенетике» (совместно с профессором Анушем Таразом и профессором Майком Стилом). [2] После постдокторской работы у профессора Себастьяна Бонхёффера на кафедре системных наук об окружающей среде в ETH Zürich в 2011 году она была назначена младшим руководителем группы в ETH Zürich . В 2014 году она стала доцентом кафедры биосистемных наук и инженерии ETH Zürich. ETH Zürich , где она получила звание доцента в 2017 году и профессора в 2021 году. [3]
Исследовать
[ редактировать ]Научный вклад
[ редактировать ]Исследования Тани затрагивают основные вопросы наук о жизни с точки зрения эволюции, в частности макроэволюции , эпидемиологии , биологии развития и иммунологии . Ее исследовательские вопросы включают фундаментальные аспекты, такие как то, как процессы видообразования привели к нынешнему биоразнообразию , а также вопросы, непосредственно имеющие отношение к человеческому обществу, такие как распространение таких патогенов, как COVID-19 или Эбола . Таня оценивает эти вопросы, разрабатывая и применяя статистические филодинамические инструменты. [4] оценивать эволюционную и популяционную динамику на основе данных геномного секвенирования, одновременно возглавляя консорциумы по производству таких данных. Ее уникальный подход представляет собой инновационное сочетание математики , информатики и биологии .
Таня внесла большой теоретический вклад в область филодинамики , разработав статистические основы для использования процессов рождения и смерти в контексте филогенетических деревьев. [5] В частности, она заложила основы для учета выборки во времени в моделях рождения-смерти, что позволяет проводить последовательный анализ данных генетического секвенирования, собранных во время эпидемий, а также последовательный анализ ископаемых (собираемых последовательно во времени) и данных о современных видах. . [6]
Таня использовала эту структуру, например, для количественной оценки распространения ВГС, распространения Эболы во время вспышки 2014 года, оценки распространения вируса Зика , чтобы показать, что волны гриппа в городе в основном обусловлены характером поездок, а также для предоставления информации в режиме реального времени во время пандемии COVID-19. 19 пандемия . [7] [8] [9] В области макроэволюции Таня, в частности, исследовала влияние вымирания динозавров на диверсификацию млекопитающих. [10] Совсем недавно она внедряет статистическое древовидное мышление в биологию развития . [11]
В 2016 году ее группа основала «Укрощение ЗВЕРЯ». BEAST 2 — это широко используемая байесовская филогенетическая программная платформа, позволяющая делать выводы об эволюции и популяционной динамике на основе данных геномного секвенирования, для которых команда Тани предоставила множество пакетов. «Укрощение ЗВЕРЯ» — это одновременно серия международных семинаров и онлайн-ресурс, обучающий использованию BEAST 2. [12] [13]
В области эпидемиологии Таня в настоящее время возглавляет использование информации о сточных водах для понимания распространения патогенов. Она является главным исследователем проекта между ETH Zürich и Eawag . Ее команда оценивает репродуктивное число SARS-CoV-2 и гриппа из сточных вод и способствует пониманию динамики вариантов. [14]
Информационно-пропагандистская деятельность и политическое участие
[ редактировать ]Во время пандемии COVID-19 Таня была президентом Швейцарской национальной научной целевой группы по борьбе с COVID-19, консультируя власти и лиц, принимающих решения Швейцарии, с августа 2021 года до прекращения деятельности целевой группы в марте 2022 года. [15] Она начала занимать пост президента после того, как была членом, а затем возглавила группу данных и моделирования целевой группы. Она отвечала за еженедельное информирование федерального правительства Швейцарии и соответствующих органов о ситуации с пандемией. Кроме того, она представила научные идеи на брифингах всему федеральному правительству и членам исполнительной власти федерального и кантонального правительств, а также различным подразделениям швейцарского парламента .
Таня активно вносила в рабочую группу основные научные идеи. Ее ежедневные подсчеты репродуктивной численности стали ключевой частью мониторинга эпидемии. [16] Репродуктивные числа были использованы в национальном «Постановлении от 19 июня 2020 года о мерах по борьбе с эпидемией COVID-19 во время особой ситуации». Кроме того, информационная панель репродуктивного числа была выделена на первый план, когда департамент здравоохранения Южной Африки проинформировал мир о новом варианте Омикрона. Таня также возглавляет самую масштабную работу по секвенированию SARS-CoV-2 в Швейцарии, предоставляя результаты по появлению и распространению новых вариантов. [17] Благодаря этим усилиям были обнаружены первые бета-, гамма- и дельта-варианты в Швейцарии. [18] [19]
Платформа cov-spectrum разработана командой Тани и стала незаменимой для отслеживания вариантов SARS-CoV-2 . [20] Он широко используется для облегчения определения линии SARS-CoV-2 и используется в такой политике, как заседание консультативного комитета FDA, обсуждающее возможные штаммы SARS-CoV-2 для обновления вакцины. Во время вспышки mpox команда в течение нескольких дней запустила mpox-spectrum, чтобы отслеживать вновь распространяющийся вирус. [21]
Помимо консультирования правительства и информирования политиков, она стала активно участвовать в информировании общественности о ситуации с пандемией. Таня часто делилась научными открытиями в национальных новостях и национальных телешоу Швейцарии, а также на федеральных пресс-конференциях. [22]
Личная жизнь
[ редактировать ]Стадлер живет со своим партнером и двумя дочерьми в Базеле. [23]
Награды и почести
[ редактировать ]- 2008. Награда доктора философии ТУМ. [1]
- 2012. Премия Джона Мейнарда Смита Европейского общества эволюционной биологии. [24]
- 2013. ERC Стартовый грант [3]
- 2013. ЭТИ Лациса Премия [3]
- 2013. Зонты Премия [25]
- 2016. ЕТН Золотая Сова за преподавание [26]
- 2021: Премия SMBE за выдающиеся достижения в середине карьеры.
- 2021: Премия Каруса Немецкой национальной академии наук Леопольдина. [27]
- 2022: Премия Рёсслера [28]
- 2022: Высоко цитируемый исследователь Clarivate
- 2023: Член Немецкой национальной академии наук Леопольдина. [29]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Резюме Тани Стадлер» . Проверено 1 января 2020 г.
- ^ «Докторская диссертация Тани Стадлер» (PDF) . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б с «Премия ЭТХ Лациса 2013» . 8 ноября 2013 года . Проверено 30 декабря 2018 г.
- ^ Таня Стадлер (июль 2015 г.), «Как добраться до корня распространения эпидемии с помощью филодинамического анализа геномных данных», Trends in Microbiology , 23 (7): 383–386, doi : 10.1016/j.tim.2015.04.007 , PMID 26139467
- ^ Таня Стадлер (ноябрь 2009 г.), «О неполной выборке в рамках моделей рождения и смерти и связи с слиянием на основе выборки», Journal of Theoretical Biology , 261 (1): 58–66, Bibcode : 2009JThBi.261...58S , doi : 10.1016/j.jtbi.2009.07.018 , PMID 19631666
- ^ Таня Стадлер (июль 2014 г.), «Окаменелый процесс рождения и смерти для последовательной калибровки оценок времени дивергенции», PNAS , 111 (29): E2957–E2966, arXiv : 1310.2968 , Bibcode : 2014PNAS..111E2957H , doi : 10.1073/ pnas.1319091111 , PMC 4115571 , PMID 25009181
- ^ Таня Стадлер (декабрь 2012 г.), «График рождения и смерти показывает временные изменения эпидемического распространения ВИЧ и вируса гепатита С (ВГС)», PNAS , 110 (1): 228–233, doi : 10.1073/pnas.1207965110 , PMC 3538216 , ПМИД 23248286
- ^ Таня Стадлер (ноябрь 2020 г.), «Характеристика эпидемического распространения гриппа A/H3N2 в городе посредством филогенетики», PLOS Pathogens , 16 (11): e1008984, doi : 10.1371/journal.ppat.1008984 , PMC 7676729 , PMID 33211775
- ^ Tanja Stadler (февраль 2021 г.), «Происхождение и раннее распространение SARS-COV-2 в Европе», PNAS , 118 (9), BIBCODE : 2021PNAS..11812008N , DOI : 10.1073/PNAS.2012008118 , PMC 7936359 , PMID 33571105 .
- ^ Таня Стадлер (март 2021 г.), «Филогения млекопитающих показывает недавние изменения в темпах диверсификации», Proceedings of the National Academy of Sciences , 108 (15): 6187–6192, doi : 10.1073/pnas.1016876108 , PMC 3076834 , PMID 21444816
- ^ Таня Стадлер (март 2021 г.), «Филодинамика для клеточных биологов», Science , 371 (6526), doi : 10.1126/science.aah6266 , PMID 33446527 , S2CID 231606785
- ^ Таня Стадлер (июнь 2017 г.), «Укрощение ЗВЕРЯ», Systematic Biology , 67 (1): 170–174, doi : 10.1093/sysbio/syx060 , PMC 5925777 , PMID 28673048
- ^ Таня Стадлер (апрель 2019 г.), «BEAST 2.5: Передовая программная платформа для байесовского эволюционного анализа», PLOS Computational Biology , 15 (4): e1006650, Bibcode : 2019PLSCB..15E6650B , doi : 10.1371/journal.pcbi.1006650 , PMC 6472827 , PMID 30958812
- ^ Таня Стадлер (май 2022 г.), «Оценка эффективного репродуктивного числа SARS-CoV-2 на основе сточных вод», «Перспективы экологического здоровья » , 130 (5), doi : 10.1289/EHP10050 , PMC 9135136 , PMID 35617001
- ^ «Швейцарская национальная научная группа по борьбе с COVID-19» .
- ^ Скайр, Жереми; Хейсман, Яна С.; Ангст, Дэниел С.; Ли, Цзиньчжоу; Неер, Ричард А.; Маатуис, Марлос Х.; Бонхёффер, Себастьян; Стадлер, Таня (2022). «Оценка и всемирный мониторинг эффективного репродуктивного числа SARS-CoV-2» . электронная жизнь . 11 . doi : 10.7554/eLife.71345 . ПМЦ 9467515 . ПМИД 35938911 .
- ^ «Швейцарский консорциум по секвенированию SARS-CoV-2 (S3C)» .
- ^ Таня Стадлер (август 2022 г.), «Оценка и всемирный мониторинг эффективного репродуктивного числа SARS-CoV-2», eLife , 11 , doi : 10.7554/eLife.71345 , PMC 9467515 , PMID 35938911
- ^ Таня Стадлер (июнь 2022 г.), «Продвижение геномной эпидемиологии путем устранения узкого места биоинформатики: проблемы, принципы проектирования и пример Швейцарии», Epidemics , 39 , doi : 10.1016/j.epidem.2022.100576 , PMC 9107180 , PMID 35605437
- ^ «CoV-Spectrum: анализ глобальных данных о SARS-CoV-2 для выявления и характеристики новых вариантов» .
- ^ «спектр генов» .
- ^ "COVID-19 пандемия" .
- ^ «Фонд Die Datenjägerin ETH Zürich» . Фонд ETH Zürich (на немецком языке). 27 января 2023 г. Проверено 2 декабря 2023 г.
- ^ «Премия Джона Мейнарда Смита» . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ «Приз Зонта» . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ «ETH Золотая Сова» . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ «Леопольдина вручает медали Каруса Тане Стадлер и Доминику Брессеру» . Новости науки » idw (на немецком языке). 01.09.2021 . Проверено 2 декабря 2023 г.
- ^ Таня Стадлер получает премию Рёсслера. Новости ETH, ethz.ch. Проверено 23 июня 2022 г.
- ^ «Члены» . Национальная академия наук Леопольдина (на немецком языке). 29 июня 2023 г. . Проверено 2 декабря 2023 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ETH Zürch Кафедра биосистемных наук и инженерии – Группа вычислительной эволюции
- ГенСпектр
- Сточные воды РЭ
- Укрощение ЗВЕРЯ
- Подборка публикаций в прессе о творчестве Тани Стадлер
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
