Депендопарвовирус

Депендопарвовирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Моноднавирия
Королевство:	Шотокувираэ
Тип:	Коссавирикота
Сорт:	Квинтовирицеты
Заказ:	Пикковивирусы
Семья:	Парвовирусиды
Подсемейство:	Парвовирины
Род:	Депендопарвовирус
Разновидность
	Посмотреть текст

Депендопарвовирус (ранее или группа аденоассоциированных вирусов ) — род подсемейства Parvovirinae семейства вирусов Dependovirus Parvoviridae ; ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} это вирусы группы II по Балтиморской классификации . Некоторые зависимые парвовирусы также известны как аденоассоциированные вирусы, поскольку они не могут продуктивно реплицироваться в клетке-хозяине клетки без коинфицирования вирусом -помощником, таким как аденовирус , герпесвирус или вирус коровьей оспы .

Разновидность

Существует одиннадцать признанных видов: ^{[ 3 ]}

Вирусология

Схематический рисунок вирусной частицы *депендопарвовируса (* поперечное сечение и вид сбоку)

Депендопарвовирусы имеют икосаэдрическую форму, размер 22 нм. ^{[ 4 ]} и состоят из 60 белков клиновидной формы (число триангуляции = 1). В каждом капсомере присутствуют три белка (VP1, VP2 и VP3). Каждый капсид состоит из 5 белков VP1, 5 VP2 и 50 белков VP3. Капсид не имеет оболочки. ^{[ 5 ]}

Геном представляет собой одну молекулу одноцепочечной ДНК длиной 4,7 тыс. нуклеотидов. Он имеет только две открытые рамки считывания . Открытая 3'-рамка считывания представляет собой структурный капсидный белок cap, который можно сплайсировать с образованием двух РНК: одна для белка 1 вириона (VP1), а другая в конечном итоге образует VP2 и VP3. Второй ген, Rep, можно смонтировать с четырьмя различными неструктурными регуляторными белками, которые способствуют репликации генома. Эти белки называются Rep 78, Rep68, Rep 52 и Rep 40 в зависимости от их молекулярной массы. ^{[ 4 ]}

За счет инвертированных терминальных повторов (ITR) на каждом конце генома Т-образная вторичная структура формируется . Комплементарные участки оставляют одноцепочечную 3'- гидроксильную группу для начала репликации. Эта 3'-гидроксильная группа используется в качестве праймера для синтеза ведущей цепи . Образуются как положительные, так и отрицательные смысловые цепи ДНК. Двухцепочечные промежуточные соединения образуются на протяжении всей репликации; это означает, что две нити, положительная и отрицательная, будут совмещены. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Диапазон хостов

Эти вирусы способны к репликации внутри всех позвоночных. Они ограничены только вирусом, которым они должны заразиться, также известным как вирус-помощник. Эти вирусы-помощники необходимы для репликации зависимого парвовируса. Распространенным вирусом-помощником у человека является аденовирус . ^{[ нужна ссылка ]}

Генная терапия

Депендопарвовирус недостаточно заразен, чтобы вызвать иммунный ответ ; это делает его хорошим вирусом для использования в качестве инструмента генной терапии. Генная терапия является возможным методом лечения различных расстройств и заболеваний генетического происхождения. вирусные векторы В настоящее время разрабатываются для транспортировки генов в клетки человека. Поскольку этот вирус не стимулирует иммунный ответ, его можно эффективно использовать несколько раз, не нейтрализуя его до заражения. ^{[ нужна ссылка ]} . Еще одна причина, по которой эти вирусы являются надежными векторами, — это известная точка вставки в геном. Этот вирус всегда вставляет свое содержимое в одно и то же место на 19-й хромосоме. ^{[ нужна ссылка ]} Такая предсказуемость может снизить вероятность проникновения в важную область, которая может нарушить нормальную функцию гена или увеличить риск развития рака. ^{[ 6 ]}

В настоящее время одной из проблем использования этого вируса в качестве терапевтического инструмента является тот факт, что его геном довольно мал. При длине генома менее 5 КБ количество генетического материала, который может поместиться в капсид, ограничено. В настоящее время ведется работа по увеличению объема информации, которую может доставить этот вектор. Это может быть достигнуто с помощью ITR, обнаруженных как на 5'-, так и на 3'-конце генома. Поскольку ITR имеют одинаковую последовательность, они оставят открытыми комплементарные цепи, если их удалить. Комплементарные цепи могут подвергаться рекомбинации и соединять два вставленных фрагмента размером 5 т.п.н. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Котмор, Сан-Франциско ; Бандже-МакКенна, М; Канути, М; Чиорини, Дж.А.; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Мицш, М; Модха, С; Ольястро, М; Пензес, Джей Джей; Пинтел, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Таттерсолл, П; Тейссен, П; и Консорциум отчетов ICTV (2019). «Профиль таксономии вируса ICTV: Parvoviridae» . Журнал общей вирусологии . 100 (3): 367–368. дои : 10.1099/jgv.0.001212 . ПМК 6537627 . ПМИД 30672729 .
^ «10-й отчет ICTV (2018)» .
^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 10 мая 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гонсалвес, М (2005). «Аденоассоциированный вирус: от дефектного вируса к эффективному вектору» . Вирусологический журнал . 2 (1): 43–60. дои : 10.1186/1743-422X-2-43 . ПМК 1131931 . ПМИД 15877812 .
^ Jump up to: ^а ^б Управление ICTVdB (2006). Бюхен-Осмонд, К. (ред.). «ICTVdB — Универсальная вирусная база данных, версия 4: Депендовирус» . Колумбийский университет, Нью-Йорк, США . Проверено 4 мая 2009 г.
^ Экскофон, К; и др. (2009). «Направленная эволюция аденоассоциированного вируса в инфекционный респираторный вирус» . Труды Национальной академии наук . 106 (10): 3865–3870. Бибкод : 2009PNAS..106.3865E . дои : 10.1073/pnas.0813365106 . ПМЦ 2646629 . ПМИД 19237554 .
^ Гош, А.; Юэ, Ю.; Лай Ю. и Дуань Д. (2008). «Гибридная векторная система расширяет возможности упаковки аденоассоциированных вирусных векторов трансген-независимым способом» (PDF) . Молекулярная терапия . 16 (1): 124–130. дои : 10.1038/sj.mt.6300322 . ПМИД 17984978 .

Внешние ссылки

ViralZone : депендопарвовирус .

[ICTV2019-1] Котмор, Сан-Франциско ; Бандже-МакКенна, М; Канути, М; Чиорини, Дж.А.; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Мицш, М; Модха, С; Ольястро, М; Пензес, Джей Джей; Пинтел, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Таттерсолл, П; Тейссен, П; и Консорциум отчетов ICTV (2019). «Профиль таксономии вируса ICTV: Parvoviridae» . Журнал общей вирусологии . 100 (3): 367–368. дои : 10.1099/jgv.0.001212 . ПМК 6537627 . ПМИД 30672729 .

[2] «10-й отчет ICTV (2018)» .

[3] «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 10 мая 2021 г.

[Gonçalves,_M_2005_43-60-4] Jump up to: ^а ^б ^с Гонсалвес, М (2005). «Аденоассоциированный вирус: от дефектного вируса к эффективному вектору» . Вирусологический журнал . 2 (1): 43–60. дои : 10.1186/1743-422X-2-43 . ПМК 1131931 . ПМИД 15877812 .

[ICTVdB_Management_2006-5] Jump up to: ^а ^б Управление ICTVdB (2006). Бюхен-Осмонд, К. (ред.). «ICTVdB — Универсальная вирусная база данных, версия 4: Депендовирус» . Колумбийский университет, Нью-Йорк, США . Проверено 4 мая 2009 г.

[6] Экскофон, К; и др. (2009). «Направленная эволюция аденоассоциированного вируса в инфекционный респираторный вирус» . Труды Национальной академии наук . 106 (10): 3865–3870. Бибкод : 2009PNAS..106.3865E . дои : 10.1073/pnas.0813365106 . ПМЦ 2646629 . ПМИД 19237554 .

[7] Гош, А.; Юэ, Ю.; Лай Ю. и Дуань Д. (2008). «Гибридная векторная система расширяет возможности упаковки аденоассоциированных вирусных векторов трансген-независимым способом» (PDF) . Молекулярная терапия . 16 (1): 124–130. дои : 10.1038/sj.mt.6300322 . ПМИД 17984978 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]