буфер SB
Буфер SB представляет собой буферный раствор, используемый в в агарозном и полиакриламидном геле электрофорезе для разделения нуклеиновых кислот, таких как ДНК и РНК . «SB» является коммерческой торговой маркой Faster Better Media LLC для их проводящей среды на основе борной кислоты натрия (патент США № 7811437), которая основана на публикациях Броуди и Керна.
Он состоит из бората натрия , обычно 1–10 мМ при pH 8,0. Он имеет более низкую проводимость , дает более резкие полосы и может работать на более высоких скоростях, чем гели, изготовленные из буфера TBE или буфера TAE (5–35 В /см по сравнению с 5–10 В/см). При заданном напряжении будет выделяться тепло и, таким образом, гель будет нагреваться. Однако буфер SB имеет более низкую проводимость, чем TBE и TAE, и поэтому температура геля намного ниже, чем у буферов TBE или TAE. Следовательно, напряжение можно увеличить, чтобы ускорить электрофорез, чтобы прогон геля занимал лишь часть обычного времени. Последующие приложения, такие как выделение ДНК из срезов геля или Саузерн-блот -анализ, работают, как и ожидалось, с гелями бората натрия.
Буфер LB, содержащий борат лития, аналогичен борату натрия и обладает всеми его преимуществами, но позволяет использовать еще более высокие напряжения из-за более низкой проводимости ионов лития по сравнению с ионами натрия. [ 1 ] Однако борат лития несколько дороже.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Броуди-младший, Керн С.Е. (2004). «История и принципы проводящих сред для стандартного электрофореза ДНК». Анальный. Биохим . 333 (1): 1–13. дои : 10.1016/j.ab.2004.05.054 . ПМИД 15351274 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Борат натрия в качестве буфера для электрофореза
- Экономичные среды для быстрого и высокого разрешения небольших фрагментов ДНК с использованием электрофореза на основе полиакриламида.
- Анализ отжига олигонуклеотидов методом электрофореза в агарозных гелях с использованием проводящей среды бората натрия