Bacteroides Dorei

Bacteroides Dorei
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Бактероидота
Сорт:	Бактероида
Заказ:	Bacteroidales
Семья:	Bacteroidaceae
Род:	Bacteroides
Разновидность:	Б. Дореи
Биномиальное название
	Bacteroides Dorei ; Bakir et al. 2006

Bacteroides Dorei является видом бактерий в родах Bacteroides , сначала изолированный в 2006 году. Это обнаружено в кишечных системах людей и животных. ^{[ 1 ]} Проводятся исследования, чтобы лучше понять отношения Bacteroides Dorei в отношении кишечной системы человека и аутоиммунного заболевания , диабета 1 типа (T1D). ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Биология и экология

Bacteroides Dorei -это грамма-негативные бактерии в форме стержня, которые способствуют нормальной функциональности кишечника. Он был выделен и дифференцирован от Bacteroides vulgatus с использованием секвенирования 16S рРНК и фенотипических тестов. ^{[ 3 ]} B. Dorei-это неформная, не мотильная и анаэробная бактерия с содержанием ДНК G+C 43%. Рост происходит оптимально при 37 ° С с отдельным размером клеток между 1,6-4,2 мкм на 0,8-1,2 мкм. Кроме того, колонии, прочитанные на агар Eggerth Gagnon (EG) с 5% -ным дородом для лошадей и инкубировали более 48 часов у 100% газа CO ₂ при 37 ° C, что привело к размеру колонии 2,0 мм и индивидуальной морфологии колоний циркулярной белой, белой, поднят и выпукленный. ^{[ 1 ]}

Таксономия

Bacteroides

79

94

76

51

97

94

100

	Б. Дореи 175 ^Т (= JCM 13471 ^Т(AB242142)

	B. Dorei 219 (= JCM 13472) (AB242143)

B. Vulgate ATCC 8482 ^Т (M58762)

B. Marseille Ccug 48901 ^Т (AY126616)

99

	B. Coprocola JCM 12979 ^Т (AB200224)

	B. Plebeius JCM 12973 ^Т (AB200217)

B. Helcogenes JCM 6297 ^Т (AB200227)

57

	B.Eggerthii NCTC 11155 ^Т (L16485)

	B. навоз ATCC 43183 ^Т (X83953)

	B. Uniformis ATCC 8492 ^Т (L16486)

B. intestinalis jcm 13265 ^Т (AB214328)

89

78

	B. Nordi ATCC BAA-9 ^Т (AY608697)

	B. ATCC зарплаты ATCCA-997 ^Т (AY608696)

B. fragilis atcc 25285 ^Т (M11656)

	B.Thetaiotaomicron ATCC 29148 ^Т (L16489)

	B.finegoldii JCM 13345 ^Т (AB222699)

B.Ovatus NCTC 11153 ^Т (L16484)

92

	B. Acidifaciens JCM 10556 ^Т (AB021164)

	B. Caccae ATCC 43185 ^Т (XB3951)

100

B. покрыто JCM 10003 ^Т (AB200228)

99

	B. Pyogenes JCM 6294 ^Т (AB200229)

	B. Denticanum B78 (AF319778)

B. coprosuis ccug 50528 ^Т (AF319778)

100

	B. Merdae ATCC 43184 ^Т (X83954)

	B. Distasonis ATCC 8503 ^Т (M86695)

100

	B. Capillosus atcc 29799 ^Т (AY136666)

	B. cellulosolvens atcc 35603 ^Т (L35517)

Provotella melaninogenica atcc 25845 ^Т (AY323525)

Дерево, приостанавливающее соседства, показывающее филогенетические положения изолятов 175T и 219 среди признанных членов родовых Bacteroides , основанных на последовательностях генов 16S рРНК, доступных в базах данных DDBJ/EMBL/GenBank. Масштабная полоса представляет 0,02 замены на положение нуклеотида. Значения начальной загрузки (> 50%) на основе 1000 репликаций перечислены в процентах в точках ветвления. ^{[ 1 ]}

Метаболизм

Bacteroides Dorei был протестирован на многочисленные метаболические тесты, рассматривая разные сахара. Рост клеток наблюдался через продукцию кислоты на следующих сахарах: глюкоза, сахароза, ксилоза, рамноза, лактоза, мальтоза, арабиноза, манноза и рафиноза, в то время как на следующих сахарах не наблюдалось рост, и не было выработки кислоты: целобиоза, салицин, трегалоза, трегалоза и отсутствие кислоты , маннитол, глицерин, мелезитоза и сорбитол. ^{[ 1 ]}

Медицинское значение

Предыдущие исследования показали, что люди, которые генетически предрасположены к различным аутоиммунным заболеваниям, имеют значительные различия в составе бактерий, чем негенетически предрасположенные люди. Эта разница в составе бактерий в системе кишечника все более важна в понимании аутоиммунных заболеваний, таких как диабет типа 1. В 2014 году исследователи рассмотрели раннее развитие бактериального состава в высоком генетическом риске, которые дети смотрят на раннее начало диабета 1 типа. Они взяли образцы стула 76 детей, которые смотрели на раннее развитие микробных сообществ с возрастом 4–6 месяцев до 2,2 года. Из 76 детей, 29 сероконвертированных в случае с аутоиммунными случаями T1D, из которых из 22 позже разработали T1D (случаи). Остальные 47 младенцев не сероконвертировали или не разработали T1D (контроль). Результаты метагеномного секвенирования показали значительно более высокий состав B. dorei и Bacteroides vulgatus в случаях по сравнению с контрольной группой до сероконверсия . Кроме того, данные показали, что B. Dorei достиг максимума через 7,6 месяца, почти за 8 месяцев до первой аутоантитела INSLET в случаях. Это значительное композиционное изменение предполагает, что увеличение количества B. Dorei является потенциальным показателем развития T1D. ^{[ 2 ]}

В дополнительных исследованиях рассматривались эпигенетика B. dorei и смогли продемонстрировать, что у 1 человека был B. dorei с GATC (ген), метилированием в то время как у другого человека B. Dorei не хватало метилирования GATC. Ученый взял образцы стула двух детей и секвенировал геномы B. dorei в образцах 105 и 439. Образец B. Dorei 105 имел 49 007 общего метилирования в геноме с 14,322 сайтами метилирования и в образце B. Dorei 439, было 38 203 метилирования и в образце B. Dorei 439, было 38 203 метилирования и в образце B. с 24 770 сайтами метилирования. Ключевым результатом является то, что образец 105 включает в себя ключевой ген, называемый Dammt ( ДНК метилтрансфераза ), в то время как образец 439 не имел этого гена. Кроме того, из 20 554 участков GATC в образце B. Dorei 105 было только 3 сайта, которые не были метилированы, тогда как образец B. Dorei 439 не имел 18 908 сайтов GATC, и ни один из участков GATC не был метилирован. Метилирование плотины и метилирование GATC могут быть значимыми факторами для микробной колонизации и функциональности в кишечной системе и влияет на многочисленные генные экспрессии транспортных процессов, таких как транспорт питательных веществ, действие антибиотиков к устойчивости к антибиотикам и перемещение энергии. Результаты показывают, что метилирование плотины и GATC B. Dorei 105 может иметь очень значительную экспрессию генов от B. dorei 439, которой не хватает метилирования GATC и может влиять на функциональность B. dorei в кишечном микробиоме . Предыдущие исследования показали, что мутанты метилирования плотины имеют повышенную восприимчивость к более высокой концентрации антибиотиков и меньше минимума. Это говорит о том, что процесс метилирования плотины играет значительную роль в повышении регуляции оттоков антибиотиков, что приводит к повышению устойчивости к антибиотикам. Кроме того, метилирование GATC демонстрирует важные микробные функции, такие как репарация ДНК, репликация и состав LPS. Метилирование мотива GATC путем отвода в патогенных бактериях, например, было показано, что вибрио -холера , иерсиния пестис и псевдотуберкулез увеличивают вирулентность и экспрессию генов по отношению к множественным операциям, как, восстановление несоответствия и рекордность ДНК обеспечивает патогенные бактерии против борьбы с антибиотиками, как, репарация несоответствия и репликация ДНК к патогенным бактериям против антибиотиков против антибиотиков против антибиотиков к антибиотикам против антибиотиков против антибиотиков против антибиотиков против антибиотиков против антибиотиков к антибиотикам. Полем Эти результаты показывают, почему необходимы будущие исследования для создания антибиотиков, которые предотвращают создание патогенетических бактерий. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Бакир, Массачусетс; Sakamoto, M.; Китахара, М.; Matsumoto, M.; Бенно, Ю. (2006). « Bacteroides Dorei Gen., Sp. Nov., Изолирован из человеческих фекалий» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (7): 1639–1643. doi : 10.1099/ijs.0.64257-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 16825642 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Дэвис Ричардсон, AG; Ардиссон, Ан; Dias, R.; Симелл, В.; Леонард, MT; Kemppainen, KM; Дрю, JC (2014). « Bacteroides Dorei доминирует в кишечном микробиомом до аутоиммунитета у финских детей с высоким риском развития диабета 1 типа» . Границы в микробиологии . 5 (678): 1–11. doi : 10.3389/fmicb.2014.00678 . ISSN 1664-302X . PMC 4261809 . PMID 25540641 .
^ Педерсен, RM; Мармолин, ES; Justesen, США (2013). «Дифференцировка видов бактероидов дореи от бактероидов vulgatus и бактероидов Ovatus от Bacteroides xylanisolvens - возвращается к основам». Анаэроб . 24 (декабрь): 1–3. doi : 10.1016/j.anaerobe.2013.08.004 . ISSN 1075-9964 . PMID 23994205 .
^ Леонард, MT; Дэвис-Ричардсон, Аг; Ардиссон, Ан; Kemppainen, KM; Дрю, JC; Ilonen, J.; Knip, M.; Симелл, О.; Toppari, J.; Вейджола, Р.; Hyöty, H.; Triplett, EW (2014). «Метитом кишечного микробиома: разрозненные паттерны метилирования плотины в кишечных бактероидах Dorei» . Границы в микробиологии . 5 : 361. DOI : 10.3389/fmicb.2014.00361 . ISSN 1664-302X . PMC 4101878 . PMID 25101067 .

Внешние ссылки

[1] Аутоантитела при диабете
[2] B. Dorei секвенированный геном
Штамм типа Bacteroides Dorei при бактериальном погружении - метадатабаза бактериального разнообразия

[Bakir2006-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Бакир, Массачусетс; Sakamoto, M.; Китахара, М.; Matsumoto, M.; Бенно, Ю. (2006). « Bacteroides Dorei Gen., Sp. Nov., Изолирован из человеческих фекалий» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (7): 1639–1643. doi : 10.1099/ijs.0.64257-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 16825642 .

[Davis-Richardson2014-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Дэвис Ричардсон, AG; Ардиссон, Ан; Dias, R.; Симелл, В.; Леонард, MT; Kemppainen, KM; Дрю, JC (2014). « Bacteroides Dorei доминирует в кишечном микробиомом до аутоиммунитета у финских детей с высоким риском развития диабета 1 типа» . Границы в микробиологии . 5 (678): 1–11. doi : 10.3389/fmicb.2014.00678 . ISSN 1664-302X . PMC 4261809 . PMID 25540641 .

[Pederson2013-3] Педерсен, RM; Мармолин, ES; Justesen, США (2013). «Дифференцировка видов бактероидов дореи от бактероидов vulgatus и бактероидов Ovatus от Bacteroides xylanisolvens - возвращается к основам». Анаэроб . 24 (декабрь): 1–3. doi : 10.1016/j.anaerobe.2013.08.004 . ISSN 1075-9964 . PMID 23994205 .

[Leonard2014-4] Леонард, MT; Дэвис-Ричардсон, Аг; Ардиссон, Ан; Kemppainen, KM; Дрю, JC; Ilonen, J.; Knip, M.; Симелл, О.; Toppari, J.; Вейджола, Р.; Hyöty, H.; Triplett, EW (2014). «Метитом кишечного микробиома: разрозненные паттерны метилирования плотины в кишечных бактероидах Dorei» . Границы в микробиологии . 5 : 361. DOI : 10.3389/fmicb.2014.00361 . ISSN 1664-302X . PMC 4101878 . PMID 25101067 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]