Бактероидальные

Бактероидальные
	Bacteroides biacutis анаэробно культивируют в кровяного агара среде .
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бактероидота
Сорт:	Бактероидии ; Война 2012
Заказ:	Бактероидальные ; Война 2012
Семьи
	« Аминобактериоидные » Mei et al. 2020 год ; Бактероидные ; Balneicellaceae Fadhlaoui et al. 2016 год ; Барнезиелловые ; Дисгономонадные ; Draconibacteriaceae Du et al. 2014 год ; Лентимикробные ; Маринифиловые ; Маринилабилиевые ; Мурибакуловые ; Odoribacteraceae Munoz et al. 2016 год ; Палудибактерии ; Порфиромонадовые ; Превотелловые Криг 2012 ; Проликсибактерии ; Рикенелловые ; Salinarimonadaceae Cole et al. 2018 год ; Салинивирговые ; Таннерелловые ; Тенуифиловые ; Уильямвитманиевые ; Роды не закреплены за семьей " Ка. Армантифилум " ; " Ка. Ординивакс " ; " Ка. Парапорфиромонада " ; ;
Синонимы
	Бактероидии: «Бактероидеция» Кавалер-Смит 2020 ; ; Бактероидальные: Маринабилиалес Ву и др. 2016 год ; ;

Bacteroidales — отряд бактерий . ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]} В частности, сюда входят роды Prevotella и Bacteroides , которые обычно встречаются в микробиоте кишечника человека .

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатурное положение. ^{[ 3 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 4 ]}

Полногеномная филогения ^{[ 6 ]}

на основе 16S рРНК ДП _12_2021 г. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

GTDB 07-RS207 по базе данных таксономии генома ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Бактероидальные

Одорибактерии

	Уильямвитманиевые

	Рикенелловые

Лентимикробные

Салинивирговые

Проликсибактерии

	Бальнейцелловые

	Маринифиловые

Маринилабилиевые

Порфиромонадовые

	Палудибактерии

	Дисгономонадные

Таннерелловые

	Мурибакуловые

	Барнезиелловые

	Превотелловые

	Бактероидные

	Салинивирговые

	Одорибактерии

	Маринифиловые

	Проликсибактерии

Уильямвитманиевые

	Ацетобактериоиды

	Тенуифиловые

«Копробактеровые»

	Барнезиелловые

	Мурибакуловые

Таннерелловые 2

	Таннерелловые

	Порфиромонадовые

	Палудибактерии

	Дисгономонадные

Бактероидные

П3

	« Ca. Limimorpha » Gilroy et al. 2021 год

	Lentimicrobiaceae Sun et al. 2016 год

	« Бактероидес периокалифорникус ».

	Tenuifilaceae Подосокорская и др. 2021 год

Williamwhitmaniaceae Pikuta et al. 2017 год

УБА932

	Acetobacteroides Su et al. 2014 год

	Rikenellaceae Krieg et al. 2012 год

Salinivirgaceae Ben Hania et al. 2017 год

Prolixibacteraceae Huang et al. 2014 (в т.ч. Draconibacteriaceae )

Marinifilaceae Iino et al. 2014 (в т.ч. Balneicellaceae ; Odoribacteraceae )

Marinilabiliaceae Ludwig et al. 2012 год

Paludibacteraceae Ormerod et al. 2022 год ^{[ 13 ]}

	Порфиромонадные Криг 2012

	Tannerellaceae Ormerod et al. 2022 год

	«Азобактериоидные»

	Dysgonomonadaceae Гарсиа-Лопес и др. 2020 год

	« Ca. Gallibacteroides » Gilroy et al. 2021 год

	«Копробактеровые»

« Ca. Caccoplasma » Gilroy et al. 2021 год

	Barnesiellaceae García-López et al. 2020 год

	Muribaculaceae Lagkouvardos et al. 2019 (в т.ч. «Гомеотермные»)

Bacteroidaceae Pribram 1933 (включая Prevotellaceae )

Примечания

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Криг НР (2010). «Отряд I. Bacteroidales ord. nov.». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 25.
^ Криг НР (2010). «Класс I. Класс Bacteroidia . Ноябрь». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 25.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Эузеби Ж.П., Парте AC. «Бактероидия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2021 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Сэйерс; и др. «Бактероидия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 г.
^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (19 октября 2017 г.). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). « Williamwhitmaniaceae Pikuta et al. 2017, поправки. Garcia-Lopez et al . Имена для жизни doi : 10.1601/tx.30875 (неактивен 17 апреля 2024 г.). {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка )
^ Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Х.П., Тиндалл Б.Дж., Гронов С., Войк Т., Кирпидес Н.К., Ханке Р.Л., Гёкер М. (2019). «Анализ 1000 геномов типовых штаммов улучшает таксономическую классификацию Bacteroidetes » . Передний микробиол . 10 :2083.дои : 10.3389 / fmicb.2019.02083 . ПМК 6767994 . ПМИД 31608019 .
^ «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ Ормерод, Кейт Л.; Вуд, Дэвид Л.А.; Лахнер, Нэнси; Геллатли, Шаан Л.; Дейли, Джошуа Н.; Парсонс, Джереми Д.; ДальМолин, Кристиана ГО; Палфриман, Робин В.; Нильсен, Ларс К.; Купер, Мэтью А.; Моррисон, Марк; Хансбро, Филип М.; Гугенгольц, Филип (7 июля 2016 г.). «Геномная характеристика некультивируемого семейства Bacteroidales S24-7, обитающего в кишечнике гомойотермных животных» . Микробиом . 4 (1): 36. дои : 10.1186/s40168-016-0181-2 . ПМЦ 4936053 . ПМИД 27388460 .

Эта Bacteroidota статья, связанная с , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Krieg2-1] Перейти обратно: ^а ^б Криг НР (2010). «Отряд I. Bacteroidales ord. nov.». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 25.

[Krieg1-2] Криг НР (2010). «Класс I. Класс Bacteroidia . Ноябрь». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 25.

[LPSN-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с Эузеби Ж.П., Парте AC. «Бактероидия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2021 г.

[NCBI-4] Перейти обратно: ^а ^б Сэйерс; и др. «Бактероидия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 г.

[5] Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (19 октября 2017 г.). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). « Williamwhitmaniaceae Pikuta et al. 2017, поправки. Garcia-Lopez et al . Имена для жизни doi : 10.1601/tx.30875 (неактивен 17 апреля 2024 г.). {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка )

[García-López-6] Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Х.П., Тиндалл Б.Дж., Гронов С., Войк Т., Кирпидес Н.К., Ханке Р.Л., Гёкер М. (2019). «Анализ 1000 геномов типовых штаммов улучшает таксономическую классификацию Bacteroidetes » . Передний микробиол . 10 :2083.дои : 10.3389 / fmicb.2019.02083 . ПМК 6767994 . ПМИД 31608019 .

[7] «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2021 г.

[8] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 23 февраля 2021 г.

[9] «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.

[about-10] «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[tree-11] "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[13] Ормерод, Кейт Л.; Вуд, Дэвид Л.А.; Лахнер, Нэнси; Геллатли, Шаан Л.; Дейли, Джошуа Н.; Парсонс, Джереми Д.; ДальМолин, Кристиана ГО; Палфриман, Робин В.; Нильсен, Ларс К.; Купер, Мэтью А.; Моррисон, Марк; Хансбро, Филип М.; Гугенгольц, Филип (7 июля 2016 г.). «Геномная характеристика некультивируемого семейства Bacteroidales S24-7, обитающего в кишечнике гомойотермных животных» . Микробиом . 4 (1): 36. дои : 10.1186/s40168-016-0181-2 . ПМЦ 4936053 . ПМИД 27388460 .

[ 2 ]

[ 1 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

Идентификаторы таксонов
Бактероидальные	Викиданные : Q3816293 Викивиды : Bacteroidales Кол-во : 8ZXVW Срок действия : 7850 ЕОКЗР : 1BTROO ГБИФ : 1203 iNaturalist : 152336 ИРМНГ : 12113 ИТИС : 956195 ЛПСН : бактероидальные NCBI : 171549 НЗОР: c27e39c2-7b7e-49ea-9602-dc23df58d44f Открытое Древо Жизни : 229093 ВОРМС : 559847
Бактероидии	Викиданные : Q3730841 Викивиды : Бактероидии Кол-во : 924DN Номер телефона : 46588133 ГБИФ : 7498440 ИРМНГ : 1119 ИТИС : 956134 ЛПСН : бактероидии НКБИ : 200643 НЗОР: cecac3f3-a775-4756-8f31-a306fe71523b Открытое Древо Жизни : 935525 ВОРМС : 559846