Инвертированная клада без повторов

Инвертированная клада без повторов
	Галега лекарственная
Научная классификация
Королевство:	Растения
Клэйд :	Трахеофиты
Клэйд :	покрытосеменные растения
Клэйд :	Эвдикоты
Клэйд :	Розиды
Заказ:	Фабалес
Семья:	Бобовые
Подсемейство:	Фабоиды
Клэйд :	Мезо-Papilionoideae
Клэйд :	Клада, накапливающая небелковые аминокислоты
Клэйд :	Хологалегина
Клэйд :	Инвертированная клада без повторов ; (Войцеховский и др . 2000, 2004 ) Войцеховский 2013 г.
Племена
	Астрагалея (син. Galegeae ) ; Нут ; Гедисареи ; Бобы ; трехлистные ; Глицинии ; Неуверенное сиденье Солодка Л. ; ;
Синонимы
	Galegeae sensu lato sensu Полхилл, 1981 г. ; Клада без ИК-излучения ; ИРЛК ; Умеренная травянистая клада ; ТГК ;

Клада инвертированными повторами без повторов ( IRLC ) представляет собой монофилетическую кладу подсемейства цветковых растений с Faboideae (или Papilionaceae). Faboideae включает большинство бобовых , выращиваемых в сельском хозяйстве . Название этой клады неофициально и не предполагает какого-либо определенного таксономического ранга , как имена, утвержденные ICBN или ICPN . ^{[ 3 ]} Клада характеризуется потерей одного из двух инвертированных повторов длиной 25 т.п.н. в пластидном геноме, которые встречаются у большинства наземных растений. ^{[ 6 ]} Это последовательно решается в молекулярной филогении . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Предполагается, что эта клада отделилась от других линий бобовых 39,0 ± 2,4 миллиона лет назад (в эоцене ). ^{[ 14 ]} Он включает несколько крупных родов умеренного пояса, таких как Astragalus , Hedysarum , Medicago , Oxytropis , Swainsona и Trifolium .

Описание

Эта клада состоит из пяти традиционных триб ( Cicereae , Fabeae , Galegeae , Hedysareae и Trifolieae ) и нескольких родов, традиционно относимых к трибе Millettieae : Afgekia , Callerya , Endosamara , Sarcodum , Wisteria и, возможно, Antheroporum . ^{[ 3 ]} Первые пять из этих родов были переданы трибе Wisterieae , так что в пересмотренном виде триба Millettieae выходит за пределы клады IRLC. ^{[ 4 ]} Клада определяется как:

«Наиболее инклюзивная коронная клада, демонстрирующая структурную мутацию в пластидном геноме (потеря одной копии области инвертированных повторов размером ~ 25 т.п.н.), гомологичную мутации, обнаруженной у Galega officinalis , Glycyrriza lepidota и Vicia faba , где эти таксоны являются современными видами. включен в коронную кладу, определенную этим именем». ^{[ 3 ]}

Использование

В эту кладу входят съедобные растения, такие как садовый горох, чечевица, нут, солодка, люцерна и другие.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Войцеховский М.Ф., Сандерсон М.Дж., Стил К.П., Листон А. (2000). «Молекулярная филогения «травянистых племен умеренного пояса» папилионоидных бобовых: подход супердеревьев» (PDF) . В Herendeen PS, Брюно А. (ред.). Достижения в систематике бобовых, Часть 9 . Кью, Великобритания: Королевский ботанический сад. стр. 277–298. ISBN 184246017X .
^ Перейти обратно: ^а ^б Войцеховский М.Ф., Лавин М., Сандерсон М.Дж. (2004). «Филогения бобовых (Leguminosae), основанная на анализе пластидного гена matK , позволяет выделить множество широко поддерживаемых субкладов внутри семейства» . Я Джей Бот . 91 (11): 1846–1862. дои : 10.3732/ajb.91.11.1846 . ПМИД 21652332 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Войцеховский МФ. (2013). «На пути к новой классификации Leguminosae: наименование клад с использованием нелиннеевской филогенетической номенклатуры» . S Afr J Бот . 89 : 85–93. дои : 10.1016/j.sajb.2013.06.017 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Комптон, Джеймс А.; Шрир, Брайан Д.; Кенивес3, Кальман; Форест, Феликс; Малакаси, Панайота; Савай Маттафа и Сиричаморн, Йоцавате (2019). « Группа Callerya пересмотрела определение и внесла поправки в Tribe Wisterieae (Fabaceae) на основе морфологии и данных последовательностей ДНК ядер и хлоропластов» . ФитоКлючи (125): 1–112. дои : 10.3897/phytokeys.125.34877 . ПМК 6610001 . ПМИД 31303810 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Перейти обратно: ^а ^б Кардосо Д., Пеннингтон Р.Т., де Кейроз Л.П., Боутрайт Дж.С., Ван Вик Б.Е., Войцеховский М.Ф., Лавин М. (2013). «Реконструкция глубоковетвистых связей папилионоидных бобовых» . S Afr J Бот . 89 : 58–75. дои : 10.1016/j.sajb.2013.05.001 . hdl : 10566/3193 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лавин М., Дойл Дж. Дж., Палмер Дж. Д. (1990). «Эволюционное значение потери инвертированного повтора хлоропластной ДНК в подсемействе Leguminosae Papilionoideae» (PDF) . Эволюция . 44 (2): 390–402. дои : 10.2307/2409416 . hdl : 2027.42/137404 . JSTOR 2409416 . ПМИД 28564377 .
^ Листон А. (1995). «Использование полимеразной цепной реакции для выявления потери инвертированного повтора в геноме хлоропластов бобовых» . В Crisp MD, Дойл Дж.Дж. (ред.). Достижения в систематике бобовых, Часть 7: Филогения . Кью, Великобритания: Королевский ботанический сад. стр. 31–40. ISBN 0947643796 .
^ Кесс Э, Винк М (1996). «Молекулярная эволюция Leguminosae: филогения трех подсемейств на основе rbcL -последовательностей». Биохим Сист Экол . 24 (5): 365–378. Бибкод : 1996BioSE..24..365K . дои : 10.1016/0305-1978(96)00032-4 .
^ Сандерсон М.Дж., Войцеховский М.Ф. (1996). «Уровни диверсификации в группе бобовых умеренного пояса: существует ли «так много видов» Astragalus (Fabaceae)?». Я Джей Бот . 83 (11): 1488–1502. дои : 10.2307/2446103 . JSTOR 2446103 .
^ Дойл Дж.Дж., Дойл Дж.Л., Балленджер Дж.А., Диксон Э.Э., Кадзита Т., Охаши Х. (1997). «Филогения гена хлоропластов rbcL у Leguminosae: таксономические корреляции и понимание эволюции клубеньков» . Я Джей Бот . 84 (4): 541–554. дои : 10.2307/2446030 . JSTOR 2446030 . ПМИД 21708606 .
^ Пеннингтон Р.Т., Лавин М., Ирландия Х., Клитгаард Б., Престон Дж., Ху Дж.М. (2001). хлоропласта «Филогенетические взаимоотношения базальных папилионоидных бобовых на основе последовательностей интрона trnL » . Системный бот . 26 (3): 537–556. doi : 10.1043/0363-6445-26.3.537 (неактивен 31 января 2024 г.). {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка )
^ МакМахон М.М., Сандерсон М.Дж. (2006). «Филогенетический суперматричный анализ последовательностей GenBank из 2228 папилионоидных бобовых» . Сист Биол . 55 (5): 818–836. дои : 10.1080/10635150600999150 . ПМИД 17060202 .
^ Кардозу Д., де Кейроз Л.П., Пеннингтон Р.Т., де Лима ХК, Фонти Э, Войцеховский М.Ф., Лавин М. (2012). «Возвращаясь к филогении папилионоидных бобовых: новые данные на основе тщательно отобранных линий с ранним ветвлением». Я Джей Бот . 99 (12): 1991–2013. дои : 10.3732/ajb.1200380 . ПМИД 23221500 .
^ Лавин М., Херендин П.С., Войцеховский М.Ф. (2005). «Анализ темпов эволюции Leguminosae предполагает быстрое диверсификацию линий в третичном периоде» . Сист Биол . 54 (4): 575–94. дои : 10.1080/10635150590947131 . ПМИД 16085576 .

Внешние ссылки

IRLC на Древе жизни. Архивировано 12 ноября 2013 г. в Wayback Machine.

[Wojciechowski1-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с Войцеховский М.Ф., Сандерсон М.Дж., Стил К.П., Листон А. (2000). «Молекулярная филогения «травянистых племен умеренного пояса» папилионоидных бобовых: подход супердеревьев» (PDF) . В Herendeen PS, Брюно А. (ред.). Достижения в систематике бобовых, Часть 9 . Кью, Великобритания: Королевский ботанический сад. стр. 277–298. ISBN 184246017X .

[Wojciechowski2-2] Перейти обратно: ^а ^б Войцеховский М.Ф., Лавин М., Сандерсон М.Дж. (2004). «Филогения бобовых (Leguminosae), основанная на анализе пластидного гена matK , позволяет выделить множество широко поддерживаемых субкладов внутри семейства» . Я Джей Бот . 91 (11): 1846–1862. дои : 10.3732/ajb.91.11.1846 . ПМИД 21652332 .

[Wojciechowski3-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Войцеховский МФ. (2013). «На пути к новой классификации Leguminosae: наименование клад с использованием нелиннеевской филогенетической номенклатуры» . S Afr J Бот . 89 : 85–93. дои : 10.1016/j.sajb.2013.06.017 .

[CompSchrKonyFore19-4] Перейти обратно: ^а ^б Комптон, Джеймс А.; Шрир, Брайан Д.; Кенивес3, Кальман; Форест, Феликс; Малакаси, Панайота; Савай Маттафа и Сиричаморн, Йоцавате (2019). « Группа Callerya пересмотрела определение и внесла поправки в Tribe Wisterieae (Fabaceae) на основе морфологии и данных последовательностей ДНК ядер и хлоропластов» . ФитоКлючи (125): 1–112. дои : 10.3897/phytokeys.125.34877 . ПМК 6610001 . ПМИД 31303810 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[Cardoso1-5] Перейти обратно: ^а ^б Кардосо Д., Пеннингтон Р.Т., де Кейроз Л.П., Боутрайт Дж.С., Ван Вик Б.Е., Войцеховский М.Ф., Лавин М. (2013). «Реконструкция глубоковетвистых связей папилионоидных бобовых» . S Afr J Бот . 89 : 58–75. дои : 10.1016/j.sajb.2013.05.001 . hdl : 10566/3193 .

[Lavin-6] Перейти обратно: ^а ^б Лавин М., Дойл Дж. Дж., Палмер Дж. Д. (1990). «Эволюционное значение потери инвертированного повтора хлоропластной ДНК в подсемействе Leguminosae Papilionoideae» (PDF) . Эволюция . 44 (2): 390–402. дои : 10.2307/2409416 . hdl : 2027.42/137404 . JSTOR 2409416 . ПМИД 28564377 .

[Liston-7] Листон А. (1995). «Использование полимеразной цепной реакции для выявления потери инвертированного повтора в геноме хлоропластов бобовых» . В Crisp MD, Дойл Дж.Дж. (ред.). Достижения в систематике бобовых, Часть 7: Филогения . Кью, Великобритания: Королевский ботанический сад. стр. 31–40. ISBN 0947643796 .

[Käss-8] Кесс Э, Винк М (1996). «Молекулярная эволюция Leguminosae: филогения трех подсемейств на основе rbcL -последовательностей». Биохим Сист Экол . 24 (5): 365–378. Бибкод : 1996BioSE..24..365K . дои : 10.1016/0305-1978(96)00032-4 .

[Sanderson-9] Сандерсон М.Дж., Войцеховский М.Ф. (1996). «Уровни диверсификации в группе бобовых умеренного пояса: существует ли «так много видов» Astragalus (Fabaceae)?». Я Джей Бот . 83 (11): 1488–1502. дои : 10.2307/2446103 . JSTOR 2446103 .

[Doyle-10] Дойл Дж.Дж., Дойл Дж.Л., Балленджер Дж.А., Диксон Э.Э., Кадзита Т., Охаши Х. (1997). «Филогения гена хлоропластов rbcL у Leguminosae: таксономические корреляции и понимание эволюции клубеньков» . Я Джей Бот . 84 (4): 541–554. дои : 10.2307/2446030 . JSTOR 2446030 . ПМИД 21708606 .

[Pennington-11] Пеннингтон Р.Т., Лавин М., Ирландия Х., Клитгаард Б., Престон Дж., Ху Дж.М. (2001). хлоропласта «Филогенетические взаимоотношения базальных папилионоидных бобовых на основе последовательностей интрона trnL » . Системный бот . 26 (3): 537–556. doi : 10.1043/0363-6445-26.3.537 (неактивен 31 января 2024 г.). {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка )

[McMahon-12] МакМахон М.М., Сандерсон М.Дж. (2006). «Филогенетический суперматричный анализ последовательностей GenBank из 2228 папилионоидных бобовых» . Сист Биол . 55 (5): 818–836. дои : 10.1080/10635150600999150 . ПМИД 17060202 .

[Cardoso2-13] Кардозу Д., де Кейроз Л.П., Пеннингтон Р.Т., де Лима ХК, Фонти Э, Войцеховский М.Ф., Лавин М. (2012). «Возвращаясь к филогении папилионоидных бобовых: новые данные на основе тщательно отобранных линий с ранним ветвлением». Я Джей Бот . 99 (12): 1991–2013. дои : 10.3732/ajb.1200380 . ПМИД 23221500 .

[Lavin2-14] Лавин М., Херендин П.С., Войцеховский М.Ф. (2005). «Анализ темпов эволюции Leguminosae предполагает быстрое диверсификацию линий в третичном периоде» . Сист Биол . 54 (4): 575–94. дои : 10.1080/10635150590947131 . ПМИД 16085576 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 5 ]

[ 4 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]