Golld RNA Motif

Гольлд
Гольлд
	Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательностей 3 'половины гигантской, богато украшенной, полученной из озера и лактобациллальских (GOLLD) РНК
Идентификаторы
Символ	Гольлд
RFAM	RF02032
Другие данные
РНК тип	Ген
ТАК	SO: 0001263
PDB Структуры	PDBE

Гигантская, богато украшенная, полученная на озере и лактобациллальской (GOLLD) РНК представляет собой консервативную РНК- структуру, присутствующую в бактериях . Golld RNA были первоначально обнаружены на основе метагеномных последовательностей ДНК , выделенной из озера Гатун в Панаме. ^{[ 1 ]} Однако, как известно, они присутствуют по меньшей мере у восьми штаммов культивируемых бактерий. РНК GOLLD чрезвычайно большие по сравнению с другими РНК с консервативной, сложной вторичной структурой и в среднем примерно 800 нуклеотидов. Такие большие, сложные РНК часто являются рибозимами , хотя биохимическая функция Golld RNA остается неизвестной. Открытие больших РНК, таких как Голлд РНК среди бактерий, которые в основном некультируются в лабораторных условиях, позволяют предположить, что многие другие необычно крупные РНК могут быть обнаружены у бактерий, которые еще не были изучены. ^{[ 1 ]}

РНК Golld в Lactobacillus Brevis ATCC 367 была изучена экспериментально. ^{[ 1 ]} Эта РНК Golld, по -видимому, кодируется профагом , и его транскрипция увеличивается во время литического цикла фага . Следовательно, эта РНК Golld, по -видимому, служит функции, которая полезна для фага во время этого процесса. Golld RNA часто расположены вблизи трансферных РНК (ТРНК), и в некоторых случаях предсказывается, что тРНК находится внутри самой структуры РНК Golld. Однако биологическая причина, лежащая в основе этой ассоциации, не понята. ^{[ 1 ]}

Недавно обнаруженная крупная бактериальная РНК, названная РНК -мотивом ROOL , разделяет свойства с GOLLD RNAS. В дополнение к относительно большим размерам и высокой степени структурной сложности этих мотивов РНК, они оба иногда расположены только в профагах и часто расположены поблизости с тРНК. Тем не менее, последовательность и структуры Golld и ROOL RNA не связаны.

Модель RFAM РНК Golld использует только 3 'половину Golld, так как эта область полной РНК очень последовательна по своей структуре.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериальных метагеномов» . Природа . 462 (7273): 656–659. Bibcode : 2009natur.462..656W . doi : 10.1038/nature08586 . PMC 4140389 . PMID 19956260 .

Эта молекулярной или клеточной биологии статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[zasha-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериальных метагеномов» . Природа . 462 (7273): 656–659. Bibcode : 2009natur.462..656W . doi : 10.1038/nature08586 . PMC 4140389 . PMID 19956260 .

[ 1 ]