VHS белковый домен

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

VHS
VHS
	Кристаллическая структура VHS и Fyve Tandem Domains of HRS, белка, участвующего в переносе мембран и трансдукции сигнала
Идентификаторы
Символ	VHS
Pfam	PF00790
PFAM клан	CL0009
InterPro	IPR002014
УМНЫЙ	VHS
Краткое содержание	1elk / scope / supfam
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии VHS домен белка составляет приблизительно 140 остатков . Его название- аббревиатура, полученная из его возникновения в V PS-27, H RS и S Tam. Это домен, обычно встречающийся на N-конце многих белков. ^{[ 1 ]}

Функция

Считается, что домены VHS очень важны в везикулярном обороте, в частности, помогают мембранному таргетированию и роли распознавания груза. ^{[ 1 ]}

Структура

Разрешение кристаллической структуры VHS-домена Drosophila HRS и человека Tom1 показало, что он состоит из восьми спиралей, расположенных в двухслойном супергелис. ^{[ 2 ]} Существование консервативных участков остатков на поверхности домена предполагает, что домены VHS могут участвовать в распознавании и стыковке белка белка . В целом, сходство последовательностей является низкой (около 25%) среди членов семейства домена.

Классификация

Основываясь на регионах, окружающих домен, VHS-протеины можно разделить на 4 группы: ^{[ 1 ]}

STAM / EAST / STAM2 (HBP), который совместно использует доменную композицию VHS SH3- - ITAM и носите один или два мотива-убиквитин-взаимодействия
Белки с C-концевым к VHS с доменным доменом ( InterPro ), которые также несут один или два мотива убиквитина-взаимодействия
Белки GGA с доменной композицией VHS-GAT (GGA и TOM1) гомологический домен
VHS -домен один или в сочетании с доменами, отличными от перечисленных выше

Домен VHS всегда обнаруживается на N-конце белков, что позволяет предположить, что такая топология важна для функции. Считается, что домен играет общую мембранную роль нацеливания/распознавания груза в везикулярном обороте. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Лохи О., Поусу А., Мао Й, Квиочо Ф., Лехто В.П. (2002). "VHS Domain - Фебс Летт 513 (1): 19–2 doi : 10.1016/s0014-5793 (01) 0287-2 PMID 11911875 . 10894998S2CID
^ Мао Y, Никденко, два X, Lloyd TE, Wu Mn, Bellen H, Quiocho FA (февраль 2000 г.). «Кристаллическая структура VHS и Fyve Tandm Domas HRS, который является белком, участвующим в переносе мембран и трансдукции сигнала » Ячейка 100 (4): 447–5 Doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80680-7 PMID 10693761 S2CID 4979735
^ Мисра С., Бич Б.М., Херли Дж. Х. (сентябрь 2000 г.). «Структура VHS -домена человеческого Tom1 (цель MYB 1): понимание взаимодействия с белками и мембранами». Биохимия . 39 (37): 11282–90. doi : 10.1021/bi0013546 . PMID 10985773 .

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR002014

[pmid11911875-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Лохи О., Поусу А., Мао Й, Квиочо Ф., Лехто В.П. (2002). "VHS Domain - Фебс Летт 513 (1): 19–2 doi : 10.1016/s0014-5793 (01) 0287-2 PMID 11911875 . 10894998S2CID

[pmid10693761-2] Мао Y, Никденко, два X, Lloyd TE, Wu Mn, Bellen H, Quiocho FA (февраль 2000 г.). «Кристаллическая структура VHS и Fyve Tandm Domas HRS, который является белком, участвующим в переносе мембран и трансдукции сигнала » Ячейка 100 (4): 447–5 Doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80680-7 PMID 10693761 S2CID 4979735

[pmid10985773-3] Мисра С., Бич Б.М., Херли Дж. Х. (сентябрь 2000 г.). «Структура VHS -домена человеческого Tom1 (цель MYB 1): понимание взаимодействия с белками и мембранами». Биохимия . 39 (37): 11282–90. doi : 10.1021/bi0013546 . PMID 10985773 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]