L17DE RNA MOTIF

L17 рибосомный белок вниз по течению элемента
L17 рибосомный белок вниз по течению элемента
	Консенсусная вторичная структура L17 Нижнего элемента РНК
Идентификаторы
Символ	L17de
RFAM	RF1708
Другие данные
РНК тип	Цис -регуляторный элемент
Домен (ы)	бактерии
PDB Структуры	PDBE

РНК -мотив нижнего элемента L17 (также называемый L17DE) представляет собой консервативную структуру РНК идентифицированную у бактерий биоинформатикой , . ^{[ 1 ]} Все известные элементы L17 вниз по течению были обнаружены непосредственно ниже по течению от генов, кодирующих субъединицу L17 рибосомы , и, следовательно, в 3 'нетранслируемых областях (3' UTR) этих генов. Элемент обнаружен в различных бактериях молочной кислоты и в роде Listeria .

Лидер рибосомного белка RNAs у бактерий обнаружено выше генов, кодирующих рибосомные субъединицы, т. Е. В их 5 -й неперечисленных областях . Они связывают белок, кодируемый смежным геном, и являются частью механизма обратной связи для регулирования численности соответствующих белков рибосомальной субъединицы. Хотя регуляция восходящего гена редко встречается у бактерий, нижестоящий элемент L17 позиционируется таким образом, чтобы выполнить регуляцию обратной связи из 3 'UTR.

Перекрытие транскрипта РНК было обнаружено с помощью микрочипов , которые перекрывают предсказанную РНК L17 нижестоящих элементов. ^{[ 2 ]} Перекрывающаяся РНК называлась SR79100.

Ссылки

^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
^ Перес Н., Тревиньо Дж., Лю З, Хо С.К., Бабицке П., Самби П. (2009). «Обще геном анализ небольших регуляторных РНК в Streppococcus группы A человека» . Plos один . 4 (11): E7668. Bibcode : 2009ploso ... 4.7668p . doi : 10.1371/journal.pone.0007668 . PMC 2765633 . PMID 19888332 .

Внешние ссылки

Страница для рибосомного белка L17 вниз по течению в RFAM

Эта молекулярной или клеточной биологии статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Weinberg2010-1] Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .

[2] Перес Н., Тревиньо Дж., Лю З, Хо С.К., Бабицке П., Самби П. (2009). «Обще геном анализ небольших регуляторных РНК в Streppococcus группы A человека» . Plos один . 4 (11): E7668. Bibcode : 2009ploso ... 4.7668p . doi : 10.1371/journal.pone.0007668 . PMC 2765633 . PMID 19888332 .

[ 1 ]

[ 2 ]