АТФ-конус
АТФ-конус | |||
---|---|---|---|
![]() мутантный белок r1 рибонуклеотидредуктазы e441q из Escherichia coli | |||
Идентификаторы | |||
Символ | АТФ-конус | ||
Пфам | PF03477 | ||
ИнтерПро | ИПР005144 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 7р1р / СКОПе / СУПФАМ | ||
|
В молекулярной биологии АТФ-конус представляет собой эволюционно мобильный АТФ-связывающий регуляторный домен , который встречается во многих белках, включая рибонуклеотидредуктазы , фосфоглицераткиназы и регуляторы транскрипции . [ 1 ]
В белке рибонуклеотидредуктазы R1 из Escherichia coli этот домен расположен на N-конце и состоит в основном из спиралей . [ 2 ] Он образует часть аллостерической эффекторной области и содержит центр общей аллостерической активности в щели, расположенной на кончике N-концевой области. [ 3 ] Этот сайт связывает либо АТФ (активирующий), либо дАТФ (ингибирующий), при этом основание связывается в гидрофобном кармане, а фосфаты связываются с основными остатками. субстрата связывание Считается, что с этим сайтом влияет на активность фермента изменяя относительные положения двух субъединиц рибонуклеотидредуктазы , .
Домен АТФ-конуса также является ключевой частью NrdR, который контролирует транскрипцию рибонуклеотидредуктаз у бактерий в ответ на уровни АТФ и дАТФ. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Аравинд Л., Вольф Ю.И., Кунин Е.В. (апрель 2000 г.). «АТФ-конус: эволюционно мобильный, АТФ-связывающий регуляторный домен». Дж. Мол. Микробиол. Биотехнология . 2 (2): 191–4. ПМИД 10939243 .
- ^ Улин У, Эклунд Х (август 1994 г.). «Структура белка рибонуклеотидредуктазы R1». Природа . 370 (6490): 533–9. дои : 10.1038/370533a0 . ПМИД 8052308 . S2CID 8940689 .
- ^ Эрикссон М., Улин У., Рамасвами С., Экберг М., Регнстрем К., Сьоберг Б.М., Эклунд Х. (август 1997 г.). «Связывание аллостерических эффекторов с белком рибонуклеотидредуктазы R1: уменьшение цистеинов активного центра способствует связыванию субстрата» . Структура . 5 (8): 1077–92. дои : 10.1016/S0969-2126(97)00259-1 . ПМИД 9309223 .
- ^ Розман Гринберг, Инна; Мартинес-Карранса, Маркель; Бимаи, Орнелла; Нуаирия, Гада; Шахид, Сахер; Лундин, Дэниел; Логан, Дерек Т.; Сьёберг, Бритт-Мари; Стенмарк, Пол (16 мая 2022 г.). «Механизм олигомеризации, чувствительный к нуклеотидам, который контролирует NrdR-зависимую транскрипцию рибонуклеотидредуктаз» . Природные коммуникации . 13 (1). дои : 10.1038/s41467-022-30328-1 . ISSN 2041-1723 . ПМК 9110341 . ПМИД 35577776 .