АТГ3

Домен активного сайта белка, связанного с аутофагоцитозом
Домен активного сайта белка, связанного с аутофагоцитозом
Идентификаторы
Символ	Аутофагия_act_C
Пфам	PF03987
ИнтерПро	ИПР007135
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

N-концевой белок, связанный с аутофагоцитозом
N-концевой белок, связанный с аутофагоцитозом
Идентификаторы
Символ	Аутофагия_N
Пфам	PF03986
ИнтерПро	ИПР007134
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

С-концевой белок, связанный с аутофагоцитозом

Идентификаторы

Символ

Аутофагия_Cterm

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии связанный с аутофагией 3 (Atg3) представляет собой фермент E2, LC3 участвующий в процессе липидирования . ^{[ 1 ]} Это важно для аутофагии . Супербелковый комплекс Atg16L состоит из множества конъюгатов Atg12-Atg5. Atg16L играет E3-подобную роль в реакции липидирования LC3. Активированный промежуточный продукт LC3-Atg3 (E2) рекрутируется в место, где происходит липидирование. ^{[ 2 ]}

Atg3 катализирует конъюгацию Atg8 и фосфатидилэтаноламина (PE). Atg3 имеет альфа/бета-складку, а его основная область топологически аналогична каноническим ферментам E2 . Atg3 имеет две области, вставленные в центральную область, и еще одну с длинной альфа-спиральной структурой , которая выступает из основной области на 30 А. ^{[ 3 ]} Он взаимодействует с atg8 через промежуточную тиоэфирную связь между Cys-288 и C-концевым Gly atg8. Он также взаимодействует с С-концевой областью E1-подобного фермента atg7.

Аутофагоцитоз — это вызванный голоданием процесс, ответственный за транспорт цитоплазматических белков в лизосому/вакуоль. Atg3 представляет собой убиквитиноподобный модификатор, который топологически подобен каноническому ферменту E2. ^{[ 4 ]} Он катализирует конъюгацию Atg8 и фосфатидилэтаноламина. ^{[ 5 ]}

Atg3 состоит из трех доменов: N-концевого домена, каталитического домена и C-концевого домена. Каталитический домен содержит остаток цистеина HPC в мотиве , это предполагаемый остаток активного центра для распознавания субъединицы Apg5 аутофагосомного комплекса . ^{[ 6 ]} Небольшой С-концевой домен, вероятно, является отдельной областью связывания , обеспечивающей стабильность аутофагосомного комплекса . ^{[ 7 ]} Он несет в себе весьма характерный консервативный FLKF мотив последовательности .

Ссылки

^ Фудзита Н., Ито Т., Омори Х., Фукуда М., Нода Т., Ёсимори Т. (май 2008 г.). «Комплекс Atg16L определяет место липидирования LC3 для мембранного биогенеза при аутофагии» . Мол. Биол. Клетка . 19 (5): 2092–100. дои : 10.1091/mbc.E07-12-1257 . ПМК 2366860 . ПМИД 18321988 .
^ Нода Т., Фудзита Н., Ёсимори Т. (май 2008 г.). «Братья Уби воссоединились» . Аутофагия . 4 (4): 540–1. дои : 10.4161/авто.5973 . ПМИД 18398292 .
^ Ямада Ю., Сузуки Н.Н., Ханада Т., Ичимура Ю., Кумета Х., Фудзиока Ю., Осуми Ю., Инагаки Ф. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура Atg3, фермента белка-переносчика убиквитина (E2), связанного с аутофагией, который опосредует липидацию Atg8» . Ж. Биол. Хим . 282 (11): 8036–43. дои : 10.1074/jbc.M611473200 . ПМИД 17227760 .
^ Танида И, Танида-Мияке Э, Комацу М, Уэно Т, Коминами Э (апрель 2002 г.). «Человеческий гомолог Apg3p/Aut1p является подлинным ферментом E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и способствует конъюгации hApg12p с hApg5p» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13739–44. дои : 10.1074/jbc.M200385200 . ПМИД 11825910 .
^ Шлумпбергер М., Шеффелер Э., Штрауб М., Бредшнайдер М., Вольф Д.Х., Тумм М. (февраль 1997 г.). «AUT1, ген, необходимый для аутофагоцитоза у дрожжей Saccharomyces cerevisiae» . Дж. Бактериол . 179 (4): 1068–76. дои : 10.1128/jb.179.4.1068-1076.1997 . ПМК 178799 . ПМИД 9023185 .
^ Мизушима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (декабрь 2002 г.). «Мышиный Apg10 как фермент, конъюгирующий Apg12: анализ с помощью двухгибридного метода дрожжей, опосредованного конъюгацией». ФЭБС Летт . 532 (3): 450–4. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03739-0 . ПМИД 12482611 . S2CID 37247321 .
^ Мизушима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (май 2003 г.). «Роль системы конъюгации Apg12 в аутофагии млекопитающих» . Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 35 (5): 553–61. дои : 10.1016/S1357-2725(02)00343-6 . ПМИД 12672448 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR007134.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR007135.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR019461.

[pmid18321988-1] Фудзита Н., Ито Т., Омори Х., Фукуда М., Нода Т., Ёсимори Т. (май 2008 г.). «Комплекс Atg16L определяет место липидирования LC3 для мембранного биогенеза при аутофагии» . Мол. Биол. Клетка . 19 (5): 2092–100. дои : 10.1091/mbc.E07-12-1257 . ПМК 2366860 . ПМИД 18321988 .

[pmid18398292-2] Нода Т., Фудзита Н., Ёсимори Т. (май 2008 г.). «Братья Уби воссоединились» . Аутофагия . 4 (4): 540–1. дои : 10.4161/авто.5973 . ПМИД 18398292 .

[pmid17227760-3] Ямада Ю., Сузуки Н.Н., Ханада Т., Ичимура Ю., Кумета Х., Фудзиока Ю., Осуми Ю., Инагаки Ф. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура Atg3, фермента белка-переносчика убиквитина (E2), связанного с аутофагией, который опосредует липидацию Atg8» . Ж. Биол. Хим . 282 (11): 8036–43. дои : 10.1074/jbc.M611473200 . ПМИД 17227760 .

[pmid11825910-4] Танида И, Танида-Мияке Э, Комацу М, Уэно Т, Коминами Э (апрель 2002 г.). «Человеческий гомолог Apg3p/Aut1p является подлинным ферментом E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и способствует конъюгации hApg12p с hApg5p» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13739–44. дои : 10.1074/jbc.M200385200 . ПМИД 11825910 .

[pmid9023185-5] Шлумпбергер М., Шеффелер Э., Штрауб М., Бредшнайдер М., Вольф Д.Х., Тумм М. (февраль 1997 г.). «AUT1, ген, необходимый для аутофагоцитоза у дрожжей Saccharomyces cerevisiae» . Дж. Бактериол . 179 (4): 1068–76. дои : 10.1128/jb.179.4.1068-1076.1997 . ПМК 178799 . ПМИД 9023185 .

[pmid12482611-6] Мизушима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (декабрь 2002 г.). «Мышиный Apg10 как фермент, конъюгирующий Apg12: анализ с помощью двухгибридного метода дрожжей, опосредованного конъюгацией». ФЭБС Летт . 532 (3): 450–4. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03739-0 . ПМИД 12482611 . S2CID 37247321 .

[pmid12672448-7] Мизушима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (май 2003 г.). «Роль системы конъюгации Apg12 в аутофагии млекопитающих» . Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 35 (5): 553–61. дои : 10.1016/S1357-2725(02)00343-6 . ПМИД 12672448 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]